徐青
- 作品数：36 被引量：214H指数：9
- 供职机构：北京交通大学更多>>
- 发文基金：国家自然科学基金长江学者和创新团队发展计划北京市自然科学基金更多>>
- 相关领域：农业科学医药卫生生物学建筑科学更多>>
- MSAP荧光检测初始数据的自动分析研究被引量：1
- 2014年
- 目的:建立能够实现甲基化敏感扩增多态性(MSAP)荧光检测初始数据自动分析的方法。方法:以17周龄的北京油鸡为实验材料,应用荧光标记的MSAP方法对肌肉组织基因组DNA甲基化水平进行检测,对获得的MSAP荧光检测初始数据通过直接取整法、整区间放置法和半区间放置法等3种计算机处理方法进行分析和比较。结果:对于MSAP荧光检测初始数据的自动转换,半区间放置法与标准的人工转换方法最接近(P>0.05),整区间放置法次之(P>0.05),而直接取整法与标准的人工转换方法差异最大,达到显著水平(P<0.05)。结论:整区间放置法和半区间放置法适用于MSAP荧光检测初始数据的自动分析,建立了基于半区间放置法的在线自动分析软件MSAP Analyst,可实现MSAP荧光检测初始数据的自动分析。
- 陈秋博邹智元李金龙张竞涛徐青
- 关键词：甲基化甲基化敏感扩增多态性荧光检测北京油鸡
- 北京油鸡MSAP毛细管电泳荧光检测技术的建立被引量：4
- 2014年
- 采用毛细管电泳荧光检测技术,对北京油鸡肌肉组织基因组进行甲基化敏感扩增片段多态性(Methylation sensitive amplified polymorphism,MSAP)检测。通过对基因组DNA用量、预扩产物稀释倍数、选择性引物浓度、Mg2+浓度、dNTPs浓度和电泳内标量等6个主要参数进行分析和优化,建立了适合北京油鸡基因组DNA甲基化分析的MSAP毛细管电泳荧光检测技术。重复实验表明,建立的毛细管电泳荧光标记的MSAP检测技术能够自动地、高通量地分析北京油鸡基因组的DNA甲基化状态,也适用于其他动植物基因组的DNA甲基化研究。
- 李金龙唐韶青邹智元王海潮徐青
- 关键词：MSAP毛细管电泳荧光标记北京油鸡
- 冷热应激对牛PBMC和MDBK细胞活力及HSP70表达的影响被引量：6
- 2018年
- 以奶牛原代培养细胞PBMC（peripheral blood mononuclear cells）和商业化细胞系MDBK（madin-darby bovine kidney）为细胞模型，采用MTS、实时荧光定量PCR（quantitative real-time PCR）及Western blot等方法检测不同程度的冷热应激对牛PBMC和MDBK细胞活力及HSP70表达水平的影响，分析不同温度的冷热应激条件下细胞活力和HSP70表达变化的规律，以及不同类型细胞应答冷热应激的差异。结果显示，冷应激和热应激均会使细胞活力降低，应激强度越大，细胞活力越低；冷热应激会调控细胞中HSP70的表达水平，重度冷应激（10℃）下调HSP70的表达，而热应激则上调HSP70的表达，但若超过细胞耐受极限度HSP70表达开始下降；HSP70表达水平应对冷热应激的变化与细胞的类型和冷热应激强度有关。结果表明，冷热应激会降低细胞活力，调控细胞HSP70的表达水平，HSP70的表达变化能够反映细胞冷热应激的强度，可作为评价奶牛冷热应激反应的潜在分子标记在奶牛个体中进行深入研究。
- 康玲胡丽蓉李玮鄢新义亓建刚徐青王雅春
- 关键词：冷热应激HSP70细胞活力
- 牛凝固血基因组DNA提取方法的比较及优化被引量：2
- 2013年
- 为筛选出一种从牛凝固血中高效获得基因组DNA的方法,本研究选择64个凝固血样,分别进行匀浆破碎和手动剪碎的预处理,结合酚-氯仿抽提和试剂盒提取方法,提取基因组DNA,并选择抗凝血作为参照,对试验耗时、DNA数量和质量进行比较。结果表明:通过对牛凝血块进行匀浆破碎预处理,不仅缩短了蛋白酶K的消化时间,而且获得了高质量基因组DNA,浓度和纯度均达到抗凝血提取效果(P>0.05)。酚-氯仿提取法相比试剂盒法,虽然得到更多量的DNA,但是DNA质量下降,而且试验耗时增加。本研究证实,匀浆破碎预处理后的牛凝固血样可以作为高质量基因组DNA的样本来源,并可替代抗凝血,解决生产中抗凝血不易获得和采集的问题。
- 刘莉莉王雅春赵萌张旭吴宏军刘爱荣王东升俞英徐青
- 关键词：基因组DNA匀浆
- 冷热应激对北京地区荷斯坦牛产奶性能及血液生化指标的影响被引量：30
- 2018年
- 【目的】分析冷热应激对北京地区荷斯坦牛产奶性能和血液生化指标的影响,评估可指示荷斯坦牛冷热应激反应的候选血液生化指标,为该地区奶牛的生产管理及耐应激个体选育提供理论依据。【方法】本试验以北京市三元绿荷金银岛牧场的健康泌乳荷斯坦牛为研究对象,连续监测了热应激期(2014年8月份)、非应激期(2014年11月份)和冷应激期(2015年1月份)牛舍THI,并分别采集了178头、120头和126头荷斯坦牛的血样,测定了14种血液生化指标,同时收集了试验个体的7项产奶性能数据,采用SAS9.2中的MIXED模型分析了荷斯坦牛在冷热应激下产奶性能和血液生化指标的变化规律,并通过Logistic过程分析了荷斯坦牛在冷热应激下显著变化的血液生化指标指示奶牛个体冷热应激反应的准确性。【结果】牛舍8月份的平均温度为31.80℃,平均THI达到了81.57,且该月THI大于78持续时间超过8 h的天数达到了21 d,表明本试验群体在8月份长期处于中度热应激状态;11月份的平均温度为12.76℃,该月平均THI为55.43,表明本试验群体在11月份处于非应激状态;1月份的平均温度为-6.70℃,平均THI为25.63,且该月有21 d的温差大于12℃,表明试验群体在1月份处于较严重的冷应激状态。与非应激期比较,热应激下荷斯坦牛AMY下降了1.34 kg,奶样中FP、PP、F/P和SP极显著降低(P<0.01),LP显著降低(P<0.05),SCS则极显著增加(P=0.01);血清中GH、LD、PRL和SOD极显著升高(P<0.01),而BUN、CRP、LDH、LPO、NE和K^+极显著降低(P<0.01);ROC曲线分析显示PRL、GH和CRP的AUC值大于0.80,分别为0.91、0.85和0.83。与非应激期比较,冷应激下荷斯坦牛AMY下降了1.13 kg,奶样中FP和SP极显著下降(P<0.01),F/P显著下降(P<0.05),SCS则极显著增加(P<0.01);血清中COR、CORT和K^+极显著升高(P<0.01),而CRP、DA、GH、PRL和SOD极显著降低(P<0.01),ATCH显著降低(P<0.05);ROC曲线分析显示仅SOD的AUC值大于
- 胡丽蓉康玲王淑慧李玮鄢新义罗汉鹏董刚辉王新宇王雅春徐青
- 关键词：荷斯坦牛冷热应激产奶性能血液生化指标
- Dynamin家族在阿尔茨海默病模型小鼠脑组织中的表达差异分析
- 阿尔茨海默病(Alzheimer's disease,AD)是一种以认知功能障碍和记忆减退为主要临床特征的神经退行性疾病.Dynamin家族是一类GTP酶分子,在突触囊泡的循环中起到了关键作用.先前研究发现该家族...
- 徐青
- 关键词：阿尔茨海默病AD模型小鼠DYNAMIN免疫治疗
- 应用MSAP方法检测鸡不同组织基因组的甲基化状态被引量：17
- 2011年
- 以白洛克肉鸡和白来航蛋鸡及其杂交F1代基因组为实验材料,应用甲基敏感扩增片段多态性方法(Methylation sensitive amplified polymorphism,MSAP)检测了鸡肌肉、心脏、肝脏和肾脏4个不同组织基因组在CCGG位点的甲基化状态,分析了不同组织的DNA甲基化水平及组织特异性甲基化模式。研究发现:肌肉组织的甲基化水平约为29.7%,肝脏组织约为27.5%,心脏组织约为27.5%,肾脏组织约为26.1%;在鸡3个不同群体及其中3个不同组织间,基因组甲基化程度差异显著(P<0.05);在检测的4个组织中,CCGG序列的全甲基化位点少于半甲基化位点,与植物的相关研究不一致;分离及鉴定了2个组织特异的甲基化片段。结果表明:鸡不同组织基因组的甲基化状态是不同的,同一组织的甲基化水平在不同的群体是不同的,而不同组织甲基化水平的排序在不同的群体是不一致的。这些结果揭示遗传效应可能影响个体的组织甲基化水平。
- 徐青张沅孙东晓王雅春唐绍青赵萌
- 关键词：基因组甲基化MSAP
- 重度冷应激对三河牛血液生化指标及相关基因表达的影响被引量：12
- 2015年
- 本研究旨在检测与牛冷应激反应相关的生化指标,筛选参与牛冷应激反应的相关基因。以内蒙古三河牛为研究对象,对30头青年牛进行室外-32℃冷应激处理3h,采集冷应激前后试验个体血样,检测血液生化指标及基因表达量的变化。冷应激3h后,试验个体T3、T4及ACTH3个血液生化指标极显著升高(P<0.01)。mRNA差异显示方法(DDRT)检测到基因LIN54和KLF12在冷应激后表达量降低,荧光定量RT-PCR验证了冷应激后2个基因表达下调(LIN54下调显著(P<0.05),KLF12下调极显著(P<0.01))的结果。筛选到的2个基因分别属于LINC和KLF家族,LINC参与有丝分裂基因的活化,KLF参与细胞增殖和凋亡。T3、T4及ACTH 3项生化指标可以初步作为衡量三河牛冷应激反应强弱的侯选指标在大群体中进行验证,筛选到的2个基因,可作为参与三河牛冷应激反应的重要侯选基因,进一步研究2个基因在牛冷应激反应中的作用机制,综合这些生化指标及侯选基因表达的变化,用于评价个体冷应激反应的强度,在三河牛抗冷应激育种中将具有更广泛的应用价值。
- 李玮刘蕤马尧李金龙吴宏军刘爱荣俞英徐青王雅春
- 关键词：冷应激三河牛生化指标基因表达MRNA差异显示
- 鸡DNA甲基化组织特异性及亲本与子代甲基化差异性研究
- 本文对鸡DNA甲基化组织特异性及亲本与子代甲基化差异性进行了研究。结果如下：
(1)为了更准确灵敏地检测基因组水平的DNA甲基化状态，使用荧光标记替代甲基敏感扩增片段多态性(MSAP)方法中的同位素标记，优化了...
- 徐青
- 关键词：基因甲基化杂交育种表观遗传
- 文献传递
- 一种检测鸡基因组甲基化的新方法:F-MSAP被引量：5
- 2005年
- 以2个品种鸡亲本及其F1代基因组为实验材料,使用荧光标记替代甲基敏感扩增片段多态性(methylationsensitiveamplifiedpolymorphism,MSAP)方法中的同位素标记,优化了实验条件,建立了荧光标记的甲基敏感扩增片段多态性方法(fluorescentlabeledmethylationsensitiveamplifiedpolymorphism,F-MSAP).结果显示,鸡个体基因组的甲基化模式分为3种,甲基化片段约占40%;F1代与亲本比较,F1代甲基化多态模式约有95%来自亲本,变异的甲基化位点约5%,虽然变异的甲基化位点数量少但种类多,共发现14种甲基化程度减弱型,12种甲基化程度增强型.结果表明,F-MSAP是一种有效地检测鸡基因组甲基化的方法,可以用于其他真核生物尤其是基因组复杂、甲基化多态性丰富的高等动植物基因组甲基化研究.
- 徐青孙东晓张沅
- 关键词：MSAP荧光标记基因组植物基因组种鸡扩增片段同位素标记
