杨行海
- 作品数：61 被引量：82H指数：6
- 供职机构：广西农业科学院更多>>
- 发文基金：广西壮族自治区自然科学基金广西农业科学院基本科研业务专项项目广西农业科学院科技发展基金更多>>
- 相关领域：农业科学生物学自动化与计算机技术文化科学更多>>
- 水稻糯性相关基因的全基因组关联分析被引量：7
- 2016年
- 利用1 090 071个SNP标记,对419份广西地方稻种资源核心种质的糯性进行全基因组关联分析。结果表明,运用混合线性模型,在P<4.72×10^(–8)(4.72E–8)水平下,检测到45个与糯性显著关联的SNP位点,均位于第6号染色体上。通过筛选显著关联位点上、下游各150 kb区域内的基因,共找到305个候选基因,其中包含2个与淀粉合成酶相关的Wx和SSIIa基因;同时在第6号染色体5.69–5.89 Mb区域发现4个与糯性显著关联的SNP位点,该区域可能是影响水稻(Oryza sativa)糯性的重要候选区域。
- 杨行海农保选夏秀忠张宗琼曾宇刘开强邓国富李丹婷
- 关键词：水稻全基因组关联分析糯性候选基因
- 广西不同品种有色稻米营养及功能性成分比较分析
- 2023年
- 【目的】比较广西不同品种类型有色稻米的营养及功能性成分差异,为广西有色稻米开发利用提供理论依据。【方法】选取广西巴马县的6个主栽有色稻地方品种(红米4个、黑米2个)为试验材料,以白米为对照,采用食品安全国家标准方法和试剂盒检测方法,测定有色稻地方品种糙米的19种营养成分和6种功能性成分,并对其进行统计分析、色差值分析和相关分析,明确不同品种有色稻米的差异和优势成分。【结果】有色稻米的膳食纤维、蛋白质、维生素B2(V_(B2))、维生素E(V_(E))、花色苷和黄酮等6种营养及功能性成分含量均显著高于白米(P<0.05,下同),分别高出18.9%~44.6%、27.0%~90.4%、9.1%~134.0%、29.2%~109.1%、197.7%~565.8%和10.8%~42.1%,其他成分因品种类型不同而存在差异。营养成分中,那乙短秆黑糯、那乙高秆黑糯和坡帮红米的氨基酸组成较平衡合理,必需氨基酸/非必需氨基酸比值在54.40%~55.75%,较接近联合国粮农组织/世界卫生组织(FAO/WHO)模式(60.00%);那乙短秆黑糯和那乙高秆黑糯的脂肪含量分别较白米高22.6%和17.0%;4个红米品种的直链淀粉含量较白米高18.8%~82.0%;龙威红米和那乙高秆黑糯具有更丰富的矿质元素,铜(Cu)、锰(Mn)、锌(Zn)和硒(Se)含量均显著高于白米;那乙高秆黑糯的维生素较丰富,维生素B1(V_(B1))、V_(B2)、维生素C(V_(C))和VE等4种维生素含量均显著高于白米。功能性成分中,2种黑米和龙威红米、龙威红粳米较丰富,但不同品种的最优势成分各不相同,那乙短秆黑糯的花色苷含量较白米高565.8%,原花青素和β-胡萝卜素含量分别是白米的26.8和20.5倍,那乙高秆黑糯的甾醇总量较白米高10.5%,龙威红粳米的γ-氨基丁酸(GABA)含量较白米高25.6%,龙威红米的黄酮含量较白米高42.1%。有色稻米与白米色泽相差越大,色差总色度值(△E)越大,红米△E为18.63~27.37,黑米△E为32.62~33.52,与米粒视觉
- 曾宇农保选夏秀忠林波杨行海张宗琼李丹婷
- 关键词：营养成分色差值
- 栽培种西番莲基因组序列及比较基因组分析被引量：2
- 2020年
- 栽培种西番莲是中国南方广泛种植的果树,但是其基因组信息尚不清楚,严重制约了西番莲分子遗传学研究。本研究利用高通量测序得到的14.1 Gb原始数据及165.7 Mb组装到Scaffold水平、代表栽培种西番莲基因组的序列进行生物信息学分析。结果表明,西番莲基因组中含有大量的简单序列重复(simple sequence repeats,SSR)。通过与木薯和桃树基因组比对,西番莲基因组有23053个预测基因。利用NR、Swiss Port、KEGG、InterPro、Pfam和GO数据库,西番莲预测基因能比对到282个植物基因组上。利用GO数据对注释基因的功能进行归类,即Biological process、Cellular component和Molecular function,再细化为41个二级功能,大部分基因与碳水化合物、有机酸、脂等代谢途径相关。KEGG通路富集将基因功能分为5大类19个二级功能,众多基因与新陈代谢通路相关,其中最大一类是碳水化合物代谢相关基因。通过基因家族的聚类分析,栽培种西番莲12767个基因可以聚类到9868个基因家族中,平均每个家族包含有1.29个基因,同时有291个特有基因家族。在进化关系中,栽培种西番莲与毛果杨和蓖麻的亲缘关系较近。本研究为西番莲的基因功能研究和分子育种奠定基础。
- 吴艳艳刘洁云田青兰黄永才黄伟华夏秀忠杨行海牟海飞
- 关键词：基因组基因注释系统进化生物信息学
- 广西地方稻种资源的收集与鉴定评价被引量：6
- 2021年
- 【目的】收集鉴定广西地方稻种资源,为广西地方稻种资源保护和利用提供科学依据。【方法】2015─2019年,通过“第三次全国农作物种质资源普查与收集行动”项目的实施,对广西61个县(区、市)188个乡(镇)265个村(屯)的地方稻种资源进行系统调查和收集,对收集资源的分布特点和种质类型进行分析,对各表型性状进行鉴定评价。【结果】从广西各地收集地方稻种资源476份。从水平分布来看,广西地方稻种资源在广西四大稻作区均有分布,稻种资源主要集中分布于融水、上思、凤山、资源、隆林和东兰等6个经济相对不发达的边远地区。从垂直分布上分析,稻种资源主要分布在0~400 m的低海拔地区,收集资源232份,占收集总数的48.74%。广西地方稻种资源多样性丰富,包含籼稻、粳稻、早稻、中晚稻、粘稻、糯稻、水稻、陆稻、深水稻及有色稻等类型,且多数的农艺性状具有较丰富的变异类型。收集及鉴定评价出香糯、米粉特用、大穗、大粒等珍稀特异地方稻种资源9份。【结论】广西地方稻种资源多样性丰富,且普遍具有株高较高、穗粒数多、结实率高的特点。收集、鉴定评价出珍稀特异地方稻种资源9份,可用于产业开发及育种。
- 张宗琼杨行海李丹婷邓国富郭辉梁云涛徐志健曾宇夏秀忠农保选
- 关键词：水稻
- 一种低世代水稻整精米率选择方法
- 本发明公开了一种低世代水稻整精米率选择方法，包括如下步骤：(1)、稻谷脱壳；通过砻谷机将稻米材料进行脱壳，得到待测低世代水稻的糙米，并分选出重量相同的多个实验组；(2)、适度损伤；将步骤(1)中多个实验组的糙米经过数粒仪...
- 蒋显斌陈玉冲邓国富李丹婷张宗琼徐志健梁云涛梁树辉夏秀忠冯锐陈灿农保选杨行海郭辉曾宇罗同平陈传华
- 西番莲内参基因及其筛选方法和应用
- 本发明提供一种西番莲内参基因及其筛选方法和应用，属于分子生物学领域。利用RNA‑Seq测序数据分析表达量高度、稳定的基因作为候选内参基因，根据西番莲基因的表达量值，选择了5个表达量高(FPKM≈850)的基因，并进行引物...
- 吴艳艳黄伟华刘洁云田青兰杨行海牟海飞
- 文献传递
- 基于水稻褐飞虱抗性基因Bph14的PARMS标记与应用
- 本发明公开了基于水稻褐飞虱抗性基因Bph14的PARMS标记与应用，具体是基于水稻褐飞虱抗性基因Bph14第1外显子SNP非同义突变的功能性PARMS标记与应用，本发明利用一代测序检测Bph14在高抗褐飞虱材料Y009和...
- 阎勇陈彩虹粟学俊杨行海韦宇李冬秀梁曼玲
- 文献传递
- 一种水稻种子发芽率检测设备
- 本发明涉及水稻检测技术领域的一种水稻种子发芽率检测设备，本发明一种水稻种子发芽率检测设备，包括实验箱，实验箱上设置有用于将待测水稻种子中碎粒去除的去除机构；去除机构包括工作台模块，工作台模块包括固定连接在实验箱上的安装座...
- 曾宇王教领李丹婷农保选杨行海夏秀忠张宗琼陈灿梁树辉蒋显斌
- 植物多基因控制性状的单基因分离群体构建方法
- 本发明涉及生物技术领域，特别涉及植物多基因控制性状的单基因分离群体构建方法，本发明所公开的一种水稻多基因控制性状的单基因分离群体构建方法，该方法针对开关基因控制的相关性状，通过对后代基因的定向筛选，能够快速、高效、准确地...
- 杨行海张宗琼夏秀忠农保选李丹婷邓国富曾宇吴艳艳许娟高菊梁海福张月雄
- 文献传递
- 水稻氮肥利用效率基因OsNPF3.1及应用
- 本发明提供了水稻氮肥利用效率基因OsNPF3.1及应用，包括水稻氮肥利用效率基因OsNPF3.1，其核酸序列如SEQ ID NO：1所示。含基因OsNPF3.1的生物材料。基因OsNPF3.1或生物材料在调控植物株高、生...
- 杨行海李丹婷张宗琼农保选夏秀忠曾宇吴艳艳蓝远芬荘洁
- 文献传递
