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上海地区散发布氏杆菌感染的细菌学及分子鉴定被引量：6: 2006年; 目的本研究对我院的1例散发布氏杆菌病患者进行细菌学及分子生物学的分析,并在国内首次尝试了用数目可变串联重复单元(VNTR)分子指纹分析法对其进行了基因分型并和国际流行株进行了分子流行病学比较分析。方法对临床疑似布氏杆菌病病例作血液细菌培养与生化鉴定,进一步作布氏杆菌特异性基因片段的序列分析鉴定以及利用布氏杆菌基因组中的8个位点构建VNTR指纹图谱,参照国际布氏杆菌VNTR数据库,构建布氏杆菌基因系统树。结果用细菌学方法确定散发疑似布氏杆菌病病例体内分离到的为布氏杆菌,通过基因序列分析进一步得到证实,但不能鉴定到生物种和生物型。对分离株作VNTR指纹分析提示该散发布氏杆菌病为猪2型布氏杆菌感染所致。结论通过传统细菌培养方法与布氏杆菌VNTR指纹分析可用于我国布氏杆菌病分子流行病学的系统调查。; 孟成艳金嘉琳阮斐怡雷建强陈澍张文宏; 关键词：布氏杆菌分子鉴定

导管保留法诊断导管相关性血流感染的研究被引量：10: 2012年; 目的研究保留静脉导管时诊断导管相关性血流感染(CRBSI)的检验方法,为减少临床不必要的静脉导管拨除提供实验室诊断依据。方法从2009年11月起,华山医院中心重症监护室临床医生根据患者的临床表现将患者分为需要保留导管者和拔除导管者,保留导管者分别从外周静脉和中心静脉导管各抽血1套(1瓶厌氧培养和1瓶需氧培养)进行血培养,另外再分别抽取3 mL血进行血定量培养,必须拔除导管时,拔出导管并采集2套外周静脉血送检。结果 50例保留导管送检病例中,27例检出细菌生长,其中临床加实验室综合判定为CRBSI 10例,导管保留法正确判定8例,2例判定为定植;综合判定为定植者7例,导管保留法正确判定6例,1例阴性;1例污染。血定量培养仅见在加有中和剂的巧克力平板上有细菌生长。结论分别从外周和中心静脉抽血进行血培养和血定量培养能够可以准确检出CRBSI及导管细菌定植。; 蒋晓飞骆俊刘红阮斐怡祝禾辰; 关键词：血流感染血培养导管相关性血流感染

金黄色葡萄球菌对替考拉宁药敏试验分析: 艾芙琪杜昕王艳艳阮斐怡韩立中蒋晓飞

从胆汁中分离出一株“嗜水气单胞菌”: 1989年; 嗜水气单胞菌是属于弧菌科气胞单菌属、它可引起人类霍乱样腹泻。从胆汁中培养出此菌仅见外省有过报导。去年2月份我们从胆汁中也分离出一株气单胞菌，鉴定结果如下。; 谢忆虹舒特华阮斐怡; 关键词：胆汁弧菌科嗜水气单胞菌腹泻霍乱

马耳他布鲁菌病一例报道被引量：16: 2010年; 马逸珉阮斐怡蒋晓飞; 关键词：生物安全病原学诊断

多重耐药阴沟肠杆菌临床分离株ESBLs基因型别和分子流行病学分析被引量：10: 2006年; 目的了解引起医院感染的阴沟肠杆菌临床菌株ESBLs的分布及流行情况,为控制ESBLs流行提供依据。方法连续收集了27株不重复的对头孢他啶或头孢噻肟耐药的阴沟肠杆菌临床菌株,采用系列ESBLs特异性引物进行PCR,并对PCR产物测序;同时采用ERIC2引物进行rep-PCR。结果对头孢他啶或头孢噻肟耐药的阴沟肠杆菌临床菌株中最为流行的ESBLs是CTX-M-3样(13株阳性,占48%);在我国首次发现肠杆菌科细菌中有VEB-1样β-内酰胺酶流行;产ESBLs阴沟肠杆菌大多具有克隆相关性,它们在流行过程中又分别获得了不同的ESBLs耐药基因。结论上海华山医院引起医院感染的阴沟肠杆菌ESBLs产生率高,是阴沟肠杆菌对β-内酰胺类药物耐药的重要原因。; 刘红蒋晓飞阮斐怡李敏艾芙琪马逸珉洪秀华吕元; 关键词：阴沟肠杆菌 Β-内酰胺酶类

血液肿瘤患者化疗后院内血行感染细菌分布特点及药敏分析被引量：1: 2009年; 目的了解血液肿瘤化疗患者院内血行感染细菌分布特点及药物敏感性。方法采用Kirby-Bauer法进行药敏试验，分析血液中分离得到的56株细菌。结果革兰阴性菌（G-）占69．64％，革兰阳性菌（G＋）占30．36％。以大肠埃希菌最为常见（37．50％），其次为肺炎克雷伯菌（10．71％）。葡萄球菌全部为耐甲氧西林葡萄球菌，仅对万古霉素敏感。结论血液肿瘤化疗患者院内血行感染仍以G-菌为主；大肠埃希菌最常见；葡萄球菌全部为耐甲氧西林葡萄球菌，仅对万古霉素100％敏感。; 冷海燕柏岚陈字艾芙琪谢彦晖阮斐怡许小平; 关键词：血液肿瘤细菌感染血液

布氏杆菌分子亚型分析方法的建立与应用研究被引量：3: 2006年; 目的应用高变八聚体寡核苷酸指纹(hypervariable octameric oligonucleotide finger_prints,HOOF_Prints)分析法对我国的布氏杆菌进行亚型和分子流行病学的研究。方法根据布氏杆菌8个数目可变串联重复单元(variable number of tandem repeats,VNTR)位点序列设计8对特异性的引物,用PCR方法扩增两株临床分离株并测序,得到8个位点的重复次数,进一步与国际上已公布的布氏杆菌VNTR数据进行比对及构建基因树,从而建立布氏杆菌亚型的分型方法。结果通过基因树得到我院两例布氏杆菌,均属猪二型,与我国流行的牛种与羊种布氏杆菌菌型存在基因型上的差异。结论HOOF_Prints分析法可在分子水平分析我国布氏杆菌的流行特点。; 孟成艳金嘉琳阮斐怡雷建强陈澍张文宏; 关键词：布氏杆菌指纹分析

新的细胞壁锚定蛋白编码基因sasX在金黄色葡萄球菌中的分布被引量：11: 2011年; 目的研究细胞壁锚定蛋白编码基因sasX在金黄色葡萄球菌中的分布及对细菌耐药性的影响.方法随机收集上海华山医院2004、2007和2010年从金黄色葡萄球菌感染的住院患者标本中分离鉴定的金黄色葡萄球菌共300株,收集同时期社区健康人群的鼻咽拭子分离鼻腔内定植的金黄色葡萄球菌170株.按照国际通用的MLST以及葡萄球菌A蛋白序列分析（spa typing）方法进行克隆株的鉴定分析.通过苯唑西林MIC值测定方法对MRSA进行检测.采用PCR结合测序方法对金黄色葡萄球菌携带sasX基因情况进行分析,采用纸片琼脂扩散法药敏试验分析临床sasX阳性和sasX阴性金黄色葡萄球菌对抗菌药物的耐药性.结果 300株从金黄色葡萄球菌感染的住院患者标本中分离到的致病性金黄色葡萄球菌克隆分型以ST239（110株,36.7％）和ST5（122株,40.7％）为主.2004至2010年,sasX基因在致病性的金黄色葡萄球菌中的阳性率从17％上升至39％,sasX基因在健康人鼻腔内分离的金黄色葡萄球菌中阳性率平均为0.59％.ST239中sasX的阳性率从47.2％上升至83.8％.携带sasX基因的MRSA百分率从26.4％上升至50.8％,携带sasX基因的MSSA的比率只约占10％.sasX基因阳性组对部分目前临床常用的抗菌药物的耐药性高于sasX基因阴性组.结论 sasX基因主要存在于医院环境内致病性的金黄色葡萄球菌中,SasX可能是金黄色葡萄球菌在医院环境内持续感染毒力因子之一,sasX基因的存在与细菌的耐药有关.; 杜昕宋燕田月如阮斐怡吕元李敏; 关键词：细菌蛋白质类

新的细胞壁锚定蛋白SasX对金黄葡萄球菌生物膜形成和毒力的影响被引量：6: 2011年; 目的研究新的细胞壁锚定蛋白SasX对金黄葡萄球菌生物膜形成及毒力的影响.方法采用基因敲除及基因互补技术获得耐甲氧西林金黄葡萄球菌（MRSA） ST-239 HS770 sasX基因突变株及基因互补株,应用半定量生物膜形成试验检测sasX基因突变前后对金黄葡萄球菌生物膜形成的影响,使用小鼠皮肤脓肿形成模型研究SasX对金黄葡萄球菌毒力的影响.结果采用pKOR1质粒构建重组质粒并成功获得sasX基因敲除株.与野生株相比,突变株HS770△sasX生物膜形成能力明显减弱（P＜0.05）,互补表达株HS770△sasX（pRBsasX）生物膜形成能力无明显统计学差异（P＞0.05）.与野生株相比,突变株HS770△sasX初始黏附能力明显减弱（P＜0.05）,互补表达株HS770△sasX（pRBsasX）初始黏附能力无明显统计学差异（P＞0.05）.HS770和HS770△sasX接种小鼠后均形成明显的脓肿,PBS对照组小鼠皮肤表面未见脓肿产生.细菌接种后第2天小鼠皮肤脓肿面积达到最大,随着接种时间的延长小鼠皮肤脓肿面积逐渐缩小.但是从接种后第1天开始,HS770接种组小鼠皮肤脓肿形成面积在同一时间点上明显大于HS770△sasX接种组（P＜0.05）.结论采用pKOR1质粒进行基因敲除可以明显提高目的基因的敲除效率.SasX可以通过影响细菌的初始黏附从而影响生物膜的形成,SasX是金黄葡萄球菌在医院环境内持续感染重要的毒力因子.; 杜昕宋燕胡锦辉阮斐怡吕元李敏; 关键词：金黄葡萄球菌生物膜毒力因子

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阮斐怡

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