何翔
- 作品数：36 被引量：163H指数：8
- 供职机构：广东省疾病预防控制中心更多>>
- 发文基金：国家高技术研究发展计划国家自然科学基金国家科技重大专项更多>>
- 相关领域：医药卫生农业科学生物学自动化与计算机技术更多>>
- 苏云金杆菌毒蛋白基因克隆和工程菌株构建
- 陈启民耿运琪马明刘淑红王金忠陈晨何翔刘子敬刘坤李冬颖
- 将地衣芽孢杆菌（B.licheniformis）的热稳定α-淀粉酶基因通过原生质体转化的方法引入Bt.ken-Ag，构建成高效工程菌株，解决了发酵液中淀粉固形物含量高和粘度大的问题。以pUC19为母体，加入pUC4K的K...
- 关键词：
- 关键词：苏云金芽孢杆菌毒蛋白生物杀虫剂
- 贵州省HIV-1毒株基因亚型变异特征分析被引量：4
- 2011年
- 目的分析贵州省人类免疫缺陷病毒1型(HIV-1)毒株亚型的变异特征,为获得性免疫缺陷综合征(艾滋病,AIDS)防治提供科学依据。方法收集贵州省1998、2002、2007年HIV-1感染者190例,采集血液样品,采用巢式聚合酶链反应(nested PCR)扩增env基因并进行测序分析,与国际标准亚型毒株和其他地区阳性株进行对比,根据[同源性、离散率等]分析HIV-1毒株亚型的变异特征。结果贵州省HIV-I毒株经变异产生3种新亚型毒株,B、B'、C亚型通过基因重组变异为CRF 07-BC、CRF08-BC流行性重组亚型毒株;E亚型毒株变异成了CRF01-AE重组亚型毒株;3种亚型毒株分别占当年核酸检测阳性数的63.41%、36.59%、52.10%;CRF07-BC、CRF08-BC与来源于印度的C.IN.92.同源,CRF01-AE与从欧美传入泰国的01AE.TH90.同源;变异后的BC亚型组内基因离散率为(0.049±0.007)%,AE亚型的组内基因离散率为(0.064±0.008)%。结论贵州省的HIV-1毒株具有高度变异特性;HIV-I变异毒株在传播和流行中较易形成当地流行的优势毒株。
- 孙显光邢辉李志坚何翔申莉梅邵一鸣
- 河北省不同途径感染人群HIV-1基因亚型分析被引量：8
- 2011年
- 目的了解河北省不同途径感染人群艾滋病病毒Ⅰ型(HIV-1)亚型分布特点。方法从感染者的血浆样品中提取病毒RNA,反转录后采用套式聚合酶链反应(Nested PCR)扩增HIV-1 gag和env基因的部分片段,对PCR产物直接进行核苷酸序列测定,所获序列与各亚型国际参考株序列比对,进行系统进化树分析,确定基因型。结果对154份HIV-1感染者的样品进行扩增,得到了146份样品的HIV-1基因片段。发现6种HIV-1亚型和重组型,其中B’亚型61例(41.8%),CRF01_AE 59例(40.4%),CRF07_BC 16例(11.0%),CRF08_BC 6例(4.1%),C亚型和B01重组株各2例(1.4%)。血液途径传播为B’亚型,男男性行为传播以CRF01_AE和B'亚型为主。结论河北省不同途径感染人群HIV-1亚型分布具有明显的人群特征。血液途径传播者为单一B’亚型,性传播人群中亚型分布较广。
- 赵翠英李巧敏李保军赵宏儒路新利李岩王莹莹邢辉何翔
- 关键词：基因亚型
- 宿主HLA限制性的CTL选择压力对于HIV进化的影响
- 2009年
- 在宿主免疫选择压力的作用下,病毒为了生存改变自身的结构而不断进化。人白细胞抗原(HLA)限制的细胞毒性T细胞(CTL)反应,在控制人类免疫缺陷病毒(HIV)感染过程中发挥重要作用,是宿主体内驱动HIV进化的一种主要选择压力。该文简要综述了HLA限制性的CTL反应对病毒的控制作用,及目前在人群水平上HLA限制性的CTL反应,对HIV进化影响的研究进展。
- 周晓兰洪坤学何翔邵一鸣
- 关键词：人类免疫缺陷病毒人白细胞抗原
- 适用于中国HIV-1分型的gag基因引物及其应用被引量：18
- 2009年
- 目的对中国流行的主要HIV-1毒株进行遗传特征分析，确定适用于中国HIV分子流行病学调查的gag基因扩增引物。方法从HIV序列数据库下载CRF07_BC、CRF08_BC、C亚型及M组参考毒株的gag全长序列，经序列比对后设计gag基因扩增引物；获得的基因片段采用邻接法构建系统进化树，评价不同片段用于分析和确定HIV-1亚型的可靠性，并检测部分样本以评定效果。结果目前我国常用的gag基因306／c-gag引物扩增片段（HXB2836～1507）构建的系统进化树中，CRF07_BC、C亚型进化簇的Bootstrap值分别为70％和59％，其可靠性较低，难以形成较为稳定的进化簇用于病毒亚型判断。而利用设计的gag基因GUX／GDX引物扩增片段（HXB2781～1861）构建的系统进化树中，CRF07_BC、CRF08_BC和C亚型序列能够独立成簇，其Bootstrap值分别为99％、99％和77％，具有较高的可靠性。在实际应用中，新设计的引物具有较高的扩增阳性率和测序成功率，获得序列形成B、C亚型和CRF01_AE、CRF07_BC、CRF08_BC等5个大的进化簇，其Bootstrap值均超过80％。即使仅用下游引物GDX测序获得的较短片段亦能获得较为可靠的系统进化树。结论GUX／GDX引物扩增获得的gag基因片段可以构建较为可靠的系统进化树，用于区分和判断我国流行的主要HIV-1毒株亚型，尤其是BC重组毒株和C亚型毒株。该方法在我国HIV分子流行病学调查和研究中有广泛的应用价值。
- 辛若雷冯毅程春林胡园园孟哲峰邢辉邵一鸣何翔
- 关键词：HIV-1流行病学分子基因GAG
- 全国主要HIV毒株的基因变异和流行特征研究及数据库建立
- 邵一鸣邢辉洪坤学冯毅陈健平尚红钟平张伟王哲秦光明万卓越羊海涛赵全壁袁霖何翔
- 2001年1月～2005年12月，在科技部基础性研究课题、国家973课题、卫生部艾滋病应用性研究课题资助下，进行了研究。一、方法：应用流行病学调查、基因和遗传分析、生物学和免疫学等技术，对全国31个省(市、自治区)随机抽...
- 关键词：
- 关键词：艾滋病HIV毒株基因变异数据库
- 209例HIV-1阳性静脉吸毒者中HCV基因型研究被引量：4
- 2015年
- 目的了解2007—2012年广东省内HIV-1感染的静脉吸毒者（IDUs）中HCV基因型的种类和亚型分布情况。方法对2007—2012年HIV-1抗体阳性IDUs样本进行HCV抗体检测,对HCV抗体阳性样本提取RNA,用反转录巢式聚合酶链反应方法扩增HCV核心基因Core片段和非结构基因NS5B片段,目的片段测序后通过分子系统发育树进行基因型分析。结果 209份样本分别来自惠州、东莞、阳江、云浮、清远、佛山、中山和江门,以阳江和东莞为主,占36.84%（77/209）,以男性为主,占93.78%（196/209）,年龄在18-49岁之间。HCV抗体阳性166份,阳性率为79.4%。进化树显示样本序列分别与标准株1a、1b、2a、3a、3b和6a等6种亚型聚集在一起,la、lb、2a、3a、3b、6a基因亚型构成比分别为10.6%、9.9%、1.4%、22.7%、11.3%、44.0%。结论 6a是广东省内被检测HIV-1感染IDUs中HCV主要流行亚型,其次为3a亚型。
- 况轶群黄旭和颜瑾周平平于国龙鄢心革刁丽梅何翔
- 关键词：HIV感染基因型
- 中国南方四省区流行的HIV-1 CRF01_AE病毒株基因特征研究被引量：18
- 2009年
- 目的分析中国南方四省区HIV-1感染者中流行CRF01_AE病毒株的遗传特征。方法从广东、广西、江西和湖南省（自治区）2006年新报告HIV-1感染者的血浆样本中提取病毒RNA，用反转录／巢式PCR方法扩增gag和env基因片段，对获得的CRF01_AE病毒株核酸序列进行系统进化分析，并通过计算基因距离和Entropy核苷酸多态性差异方法分析毒株的遗传特征。结果从210例CRF01_AE病毒株感染者中，发现四省区流行的CRF01_AE病毒株存在2个主要的流行簇。流行簇Ⅰ共有123例样本，未发现与之直接相关的国际参考毒株。流行簇Ⅱ共有57例样本，与越南CRF01AE病毒株关系密切，且存在不同时间样本的混杂。gag和env基因遗传距离分析结果表明，流行簇Ⅰ内基因遗传多样性均明显小于流行簇Ⅱ；核苷酸多态性分析结果显示，在gag基因片段42个位点核苷酸组成具有显著差异，env基因片段40个位点核苷酸组成存在显著差异；流行簇Ⅰ相对于流行簇Ⅱ多态性减少的位点上有61个，多态性增加的位点有21个。结论在中国南方四省区流行的CRF01_AE病毒株中首次观察到2个独立的流行簇。流行簇I病毒株为该地区最主要的CRF01_AE病毒株，其流行时间相对较短，在人群中所占比例较多，可能是病毒在流行过程中形成的具有传播优势的病毒株。流行簇Ⅱ病毒与来自于越南的CRF01_AE病毒株有较高同源性，且存在与越南病毒株问的多次传播。
- 程春林冯毅何翔林鹏梁淑家易志强贺健梅胡园园邢辉范雁吴士良邵一鸣
- 关键词：病毒株HIV-1进化分析
- 新疆伊犁州艾滋病病毒分子流行病学调查
- 2014年
- 目的了解新疆伊犁哈萨克自治州(伊犁州)当前流行的HIV毒株亚型种类、人群分布特征及相关危险因素,对利用核酸技术检测新发感染的方法进行初步评价并开展HIV病毒分子流行病学调查。方法应用套式聚合酶链反应(PCR)对289份HIV-1感染者淋巴细胞富集液进行RNA提取、扩增、测序、基因型分析和亚型确定。结果经检测获得基因型样本246份,其中CRF07_BC毒株243份,占98.8%;CRF01_AE毒株2份,占0.8%;B'毒株1份,占0.4%;核酸检测新发感染阳性扩增率为84.8%。结论 CRF07_BC仍然是当前伊犁州艾滋病病毒感染者的优势毒株,在HIV确认样本时,核酸检测新发感染的方法获得了较高的阳性扩增率。
- 董永慧张艺王莉何翔阮玉华佐合拉.吐尔地刘伟关晓霞赵杰
- 关键词：艾滋病病毒核酸检测基因扩增
- 静脉注射吸毒感染者体内HIV-1CRF07_BC的准种变异特征被引量：4
- 2013年
- 为了研究静脉注射吸毒者(IDU)体内HIV-1CRF07_BC病毒准种变异和遗传多样性特征,本文采用单基因组扩增(SGA)技术分别从6份CRF07_BC感染者血浆获得HIV-1病毒准种env基因gp120片段序列11～28条,采用构建系统进化树的方法进行聚类分析,描述感染者血浆中CRF07_BC病毒准种的变异特征;运用Simplot软件、分段系统进化树和对平均两两比对基因距离进行遗传多样性作图(Diversity plot)的方法分析病毒准种间的重组。系统进化树分析结果显示仅1个病例具有较高的遗传同质性,而其他5个病例的遗传异质性较高,主要表现为系统进化树上形成2～4个次级进化簇。此外,有3个病例存在病毒准种间的重组。本研究表明SGA技术能有效地分析感染者体内病毒准种复杂的变异特征。
- 辛若雷马泽芹程春林邢辉洪坤学阮玉华李佳卢红艳邵一鸣何翔
- 关键词：人类免疫缺陷病毒病毒准种
