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一种EBV捕获探针和获得样本中EBV基因组序列信息的方法: 本发明提供了一种EBV捕获探针和获得样本中EBV基因组序列信息的方法。本发明设计的捕获探针对与EBV感染相关的各种疾病，如淋巴瘤、鼻咽癌、胃癌等，以及含EBV的细胞系(C666、Raji、snu179)，捕获效率都相对较...; 曾益新贝锦新冯丽娜刘稳升左晓宇郭允苗彭柔君; 文献传递

一种用于HLA基因分型的试剂盒和方法: 本发明提供了一种用于HLA基因分型的试剂盒和一种HLA基因分型的方法，所述试剂盒包括用于扩增HLA‑B基因的2号外显子和3号外显子的引物，和用于扩增HLA‑B基因的4号外显子的引物；所述用于扩增HLA‑B基因的2号外显子...; 贝锦新冯丽娜左晓宇刘稳升; 文献传递

基于本地化的日本血吸虫序列分析平台的构建及信号转导分子的筛选: 日本血吸虫病仍然是我国重点防治的传染病之一，日本血吸虫基因组计划对于疫苗研制、新药物开发以及揭示血吸虫与宿主相互作用的分子机制均具有重要的意义。自1994年WHO正式启动血吸虫基因组计划以来，人们在cDNA文库、EST、...; 刘稳升; 关键词：日本血吸虫基因组信号转导分子; 文献传递

用于鼻咽癌发病风险预测的试剂盒及基因芯片: 本发明涉及一种用于鼻咽癌发病风险预测的试剂盒以及相应的基因芯片。所述的试剂盒包括：检测人基因组的7个SNP位点的PCR扩增引物和单碱基延伸引物，所述7个SNP位点是rs1412829、rs1572072、rs284216...; 曾益新崔倩贾卫华贝锦新徐淼刘稳升; 文献传递

基于基因组学的日本血吸虫序列分析平台的构建及应用: 2007年; 【目的】构建基于基因组学的日本血吸虫序列分析平台。【方法】基于工作站和Linux操作系统,利用公开的日本血吸虫或相关资源,收集有关生物信息学序列分析工具,并自行编写相关软件实现多种资源的有机整合。【结果】构建了本地化的日本血吸虫序列分析平台,在此基础上,自主设计了日本血吸虫EST序列的电子延伸系统、基于日本血吸虫EST数据库的同源全长cDNA序列检索系统和序列自动注释系统等。【结论】所构建的序列分析平台不仅可以完成常规的序列分析工作,还可成功地完成EST序列的电子延伸,同源全长cDNA序列的检索以及序列的自动注释,它可对大规模日本血吸虫序列进行快速、方便、高效的分析,为充分利用血吸虫基因组开展疫苗研究和新药开发提供了有效的技术手段。; 刘稳升胡斐吕志跃郑焕钦袁衡新吴忠道; 关键词：日本血吸虫基因组

日本血吸虫特异性膜蛋白的筛选及其中sj15蛋白编码序列的克隆被引量：2: 2007年; 目的:筛选日本血吸虫可能的特异性膜蛋白,并根据筛选结果在日本血吸虫成虫中尝试克隆某一可能具有免疫保护功能的预测蛋白的编码序列,为血吸虫病防治研究寻找新的疫苗候选分子或药物靶标。方法:以"Schistosoma japonicum"和"membrane or tegument"为关键词,在公共数据库NCBI进行查找并下载数据,建立本地化的日本血吸虫膜蛋白序列数据库,与本实验室建立的曼氏血吸虫、人类、大鼠及小鼠蛋白质数据库等进行多序列比对,筛选日本血吸虫特异性膜蛋白,同时通过CBS网站相应分析工具软件预测目的蛋白的特征和功能。针对其中可能有免疫保护功能的预测蛋白的预测编码序列设计引物,采用RT-PCR技术从日本血吸虫成虫中扩增出该编码序列,并克隆入pGEX-4T-1构建原核表达重组质粒。结果:共检索到153个理论推测的日本血吸虫膜蛋白序列,筛选出28个可能的日本血吸虫特异性膜蛋白;成功从日本血吸虫成虫中扩增出相对分子质量为15 000的预测蛋白的预测编码序列,暂命名为sj15基因,同时成功构建pGEX-4T-1-sj15重组质粒。结论:成功筛选出多个日本血吸虫特异性膜蛋白;从日本血吸虫成虫中成功克隆出GenBank公布的预测的sj15基因,证实了成虫中该预测基因的存在,并成功构建原核表达载体,为进一步的功能研究奠定了基础。; 张双民张莉滟刘稳升吕志跃郑焕钦吴忠道; 关键词：膜蛋白质类生物信息学

表达序列标签大规模序列分析策略及方法被引量：3: 2007年; 为了充分挖掘现有的庞大EST数据资源所蕴含的生物学信息，系统的分析方法对其研究显得尤为重要。该文参照目前广泛运用的3种EST数据分析系统，系统地介绍EST的序列分析方法，主要包括EST的序列分析前处理、序列的聚类拼接以及注释，旨在为EST序列分析提供参考。; 刘稳升吴忠道; 关键词：EST 序列聚类

一种用于HLA基因分型的试剂盒和方法: 本发明提供了一种用于HLA基因分型的试剂盒和一种HLA基因分型的方法，所述试剂盒包括用于扩增HLA-B基因的2号外显子和3号外显子的引物，和用于扩增HLA-B基因的4号外显子的引物；所述用于扩增HLA-B基因的2号外显子...; 贝锦新冯丽娜左晓宇刘稳升; 文献传递

家族性和散发性鼻咽癌患者的危险因素及肿瘤家族史的比较被引量：8: 2009年; 目的研究广东地区家族性鼻咽癌患者与散发性鼻咽癌患者发病因素间存在的差异及其一级亲属恶性肿瘤发病情况，为鼻咽癌患者家庭成员的遗传咨询和筛查策略提供依据。方法选取2005年10月至2007年10月中山大学肿瘤防治中心收治的广东籍新发鼻咽癌患者作为研究对象，共收集1877例鼻咽癌患者，包括181例家族性鼻咽癌患者和1696例散发病例。对两组患者的人口学特征、临床特征、危险因素及一级亲属肿瘤家族史进行比较分析，并对家族性鼻咽癌患者受累一级亲属的分布及其与先证者发病的时间间隔进行分析。结果1877例鼻咽癌患者中181例（9．64％）有一级亲属受累；在受累的一级亲属中有58．49％（124／212）为同胞，41．51％（88／212）为父母。同胞与先证者发病的时间间隔为（7．40±5．41）年，而父母与先证者发病的平均时间间隔为（15．55±10．61）年，两者间差异有统计学意义（t=-5．78，P〈0．01）。两组患者确诊时80％以上临床分期已进入晚期（Ⅲ期以上）。无论是患病前还是儿童时期，两组在咸鱼（OR=1．01；95％CI：0．59～1．75VSOR=1．31；95％CI：0．92～1．86）、腌菜（OR=0．93；95％CI：0．58～1．49vs OR=1．12；95％CI：0．80～1．57）、酱类（OR=0．37；95％CI：0．14～1．01vs OR=1．61；95％CI：0．99～2．48）、新鲜水果（OR=0．87；95％a：0．60～1．26vs OR=0．65；95％CI：0．20～2．12）、腊味（OR=1．26；95％CI：0．87～1．83 vs OR=1．28，95％CI：0．71～2．30）等饮食因素方面差异均无统计学意义（P值均〉0．05）。两组患者在吸烟（OR=0．99；95％CI：0．68～1．45）及其一级亲属患其他肿瘤的风险方面（OR=0．85；95％CI：0．56～1．28）差异也无统计学意义（P值均〉0．05）。结论在中国广东地区的鼻咽癌患者中，家族性鼻咽癌约占9．64％。在高发家系中，同胞; 罗翔宇刘稳升陈丽珍冯启胜曾益新贾卫华; 关键词：鼻咽肿瘤系谱

用于鼻咽癌发病风险预测的试剂盒及基因芯片: 本发明涉及一种用于鼻咽癌发病风险预测的试剂盒以及相应的基因芯片。所述的试剂盒包括：检测人基因组的7个SNP位点的PCR扩增引物和单碱基延伸引物，所述7个SNP位点是rs1412829、rs1572072、rs284216...; 曾益新崔倩贾卫华贝锦新徐淼刘稳升; 文献传递

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