周柯 作品数:11 被引量:60 H指数:4 供职机构: 河南省农业科学院 更多>> 发文基金: 河南省科技攻关计划 国家玉米产业技术体系建设专项 更多>> 相关领域: 农业科学 更多>>
玉米葡萄糖转运蛋白基因ZmGLUT-1表达特征分析及互作预测 2020年 葡萄糖转运蛋白(GLUT1)通过维持细胞膜两侧的葡萄糖浓度来维护细胞的稳定,在植物抗逆境方面起重要作用。从郑36自选系中克隆了1个GLUT1基因,暂时命名为ZmGLUT-1,该基因含有1 263bp的开放阅读框,编码420个氨基酸;对启动子顺式元件分析,发现该基因含有响应逆境胁迫、激素信号传导、光刺激应答等多种结合位点;蛋白序列分析表明,该蛋白属于疏水性蛋白,含有12个跨膜结构域,主要以α螺旋结构存在,亚细胞定位于质膜上;qRT-PCR结果表明该基因属于组成型表达基因,且在叶尖和胚中高表达,同时发现该基因受脱落酸(ABA)和PEG胁迫下调表达,而复水后表达虽有上升但无法达到正常水平;互作蛋白分析发现,或许ZmGLUT-1与互作蛋白构成调控网络,通过催化和跨膜转运糖类、脂质、激素等物质,来参与细胞代谢物的合成与降解,维护细胞的稳定性,以此来维护植物的生长发育。以上研究表明ZmGLUT-1基因与干旱胁迫和ABA诱导相关。 张新 曹丽茹 魏良明 张前进 周柯 王振华 鲁晓民关键词:玉米 葡萄糖转运蛋白 鉴定玉米杂交种郑单958种子纯度的SSR标记筛选 被引量:18 2008年 利用SSR标记技术,选用50对SSR引物以玉米杂交种郑单958及其父母本DNA为材料,筛选出了4对在杂交种中呈现双亲互补带型的引物。研究表明:这4对引物均可用于玉米杂交种郑单958种子的纯度鉴定。 李艺 铁双贵 朱位红 齐建双 卢彩霞 孙建军 周柯关键词:玉米杂交种 SSR标记 种子纯度 玉米新品种郑单7167的选育 2022年 郑单7167是河南省农业科学院粮食作物研究所以郑642为母本、郑638为父本杂交育成的玉米单交种。2018-2019年参加河南省金粮联合体夏玉米品种区域试验,2年平均产量为10329kg/hm^(2),比对照郑单958增产6.3%;2019年参加河南省金粮联合体夏玉米品种生产试验,平均产量为10485kg/hm^(2),比对照郑单958增产6.1%。郑单7167于2020年9月通过河南省农作物品种审定委员会审定,审定编号:豫审玉20200019,其主要特点是高产、稳产、优质、抗病性较强,适宜河南省夏播种植。 王利锋 王浩 周柯 曹言勇 李晶晶 杨继伟 贾腾蛟 李会勇关键词:玉米 选育 优质蛋白玉米赖氨酸含量测定方法比较分析 被引量:8 2008年 对两组样品同时采用染料结合法(DBL法)、茚三酮显色法、近红外光谱分析法(NILS)和氨基酸分析仪法对赖氨酸含量进行测定,并进一步对其中一组样品用赖氨酸添加法对染料结合法和茚三酮显色法进行比较分析。结果表明,4种方法在两组样品的赖氨酸含量测定大小之间趋势相同,即茚三酮显色法>近红外光谱分析法>染料结合法>氨基酸分析仪法。在赖氨酸添加实验中,茚三酮显色法测得添加工业赖氨酸的混合样品赖氨酸含量的增加值基本与赖氨酸的添加量相当,染料结合法对3个处理测试结果赖氨酸含量差异不大。 齐建双 铁双贵 孙建军 卢彩霞 朱卫红 周柯关键词:优质蛋白玉米 赖氨酸含量 DNA指纹图谱在玉米杂交种真伪及纯度鉴定中的应用 被引量:13 2007年 讨论了玉米DNA指纹图谱的不一致性和外部性状表现之间的对等性或等价性,并对DNA分子标记技术信息的稳定性与真实性进行了分析。认为大多数玉米SSR标记并非基因内标记,同时玉米的基因组序列极其庞大,因此,个别SSR引物多态性并不能辨别被测自交系或单交种;目前,生产上改良品种较多,改良品种与被改良品种之间极为相近,这就难以利用SSR标记将其区分。提出在构建玉米杂交种与亲本的DNA指纹图谱、筛选SSR引物时,尽量选择重要农艺性状的基因内标记或与其紧密连锁的标记,从而增加杂交种纯度及真伪辨别的准确性和有效性,经多次反复摸索建立了最佳技术体系。 朱卫红 齐建双 铁双贵 卢彩霞 孙建军 李艺 周柯关键词:玉米 杂交种 指纹图谱 核心引物 快速CTAB法提取玉米种子胚基因组DNA 被引量:16 2008年 提出了一种从玉米种子胚中快速提取基因组DNA的新方法。经过紫外分光光度计、琼脂糖凝胶电泳及聚丙烯酰胺凝胶电泳检测表明,该方法所提DNA纯度高,完整性好,完全可以满足SSR-PCR分析的需要。该方法具有安全、经济、快速、方便的特点,有较强的实用性。 李艺 铁双贵 朱卫红 齐建双 卢彩霞 孙建军 周柯关键词:玉米 DNA提取 SSR标记 玉米籽粒氮含量遗传位点挖掘及候选基因预测 2024年 玉米籽粒氮含量与品质紧密相关,其遗传机制的解析对玉米品质育种具有重要意义。本研究以252份玉米自交系为关联群体,利用贝叶斯信息与连锁不平衡迭代嵌套式模型(BLINK,bayesian-informationandlinkage-disequilibrium iteratively nested keyway)、固定随机循环概率模型(FarmCPU,fixed and random model circulating probability unification)、一般线性模型(GLM,general linear model)、混合线性模型(MLM,mixed linear model)、多位点混合线性模型(MLMM,multiple loci mixed model)和逐步排它性混合线性模型(SUPER,settlement of MLM under progressively exclusive relationship)等方法分别对其籽粒氮含量进行全基因组关联分析。共鉴定到13个与籽粒氮含量显著关联的SNP(P<3.64E-07)。BLINK、FarmCPU、GLM、MLM、MLMM和SUPER方法分别检测到6个、3个、7个、4个、2个和4个SNP位点。其中,S3_8879213在5种方法中均能检测到,S9_146173702在4种方法中均能检测到,S5_114774030和S7_182217338在3种方法中均能检测到,S1_10906326和S1_177528813在2种方法中均能检测到。共挖掘25个相关候选基因,其中Zm00001eb275080和Zm00001eb330700可能是影响玉米籽粒氮含量的重要候选基因。 王利锋 王森 蔡齐宗 王浩 周柯 杨继伟 李晶晶 贾腾蛟 张站壹 王景 李会勇关键词:玉米 籽粒 氮含量 全基因组关联分析 候选基因 玉米子粒氮浓度全基因组关联分析 2023年 利用253份玉米自交系为关联群体,利用一般线性模型(GLM)、混合线性模型(MLM)、固定和随机模型交替概率统一(FarmCPU)和基因组相关预测集成工具(GAPIT),分别对其子粒氮浓度进行全基因组关联分析。结果表明,共鉴定25个与子粒氮浓度显著关联的SNP(P<1.72E-05)。其中,GLM、FarmCPU和GAPIT方法分别检测到12、15和1个位点。S3_202120604、S1_2007087 47和S5_10258682在GLM和FarmCPU两种方法中均能检测到。Bin1.06、Bin3.07、Bin5.04、Bin1.07和Bin5.02可能是影响子粒氮浓度的重要区段。共挖掘30个相关候选基因,其中Zm00001d031747、Zm00001d031749、Zm00001d031753、Zm00001d043502和Zm00001d01339等可能是影响玉米子粒氮浓度的关键候选基因。 王利锋 王浩 周柯 杨继伟 曹言勇 李晶晶 贾腾蛟 李会勇关键词:玉米 子粒 氮浓度 全基因组关联分析 水稻白化复绿突变体白784的生理特性分析及基因精细定位 被引量:4 2015年 为探讨水稻白化复绿突变体白784的生理特性和相关遗传机制,研究了不同温度处理下白784的表型和生理特性,结果表明,白化表型受温度控制,20、22、24℃低温处理使白784叶片的色素合成不同程度受阻,叶片呈白化表型;与对照相比,白784的叶绿素a、b和类胡萝卜素含量显著下降,20℃处理(10d)白784叶绿素a、叶绿素b较对照分别下降95.18%(P〈0.01)、86.86%(P〈0.01):22℃处理(14d)白784叶绿素a、叶绿素b、类胡萝卜紊较对照分别下降96.19%(P〈0.01)、93.25%(P〈0.01)、92.76%(P〈0.01);24℃处理(12d)白784叶绿素a、叶绿素b、类胡萝卜素较对照分别下降86.17%(P〈0.05)、91.67%(P〈0.01)、95.30%(P〈0.01);26℃处理(12d)白784叶色绿化,叶绿素a、b和类胡萝卜素含量较对照分别下降27.63%、25.70%、27.17%(P〉0.05):28℃处理(12d)白784叶色与正常无异,叶绿素a、b和类胡萝卜素含量较对照差异不显著;表明24~26℃是白784叶色白化的敏感温度。同时构建F2作图群体(白784×郑州早粳),进行遗传分析和基因定位,结果表明,该突变体温敏白化性状受1对隐性核基因控制;利用424个SSR分子标记将Abt6初步定位在水稻第6号染色体上,位于标记RM5988~RM6071,与标记的遗传距离分别为2.4、9.7cM;进一步扩大F2群体,在F2、F3群体白化单株中寻找目标区段发生重组的个体。利用InDel标记分析目标区段杂合单株的标记基因型,将Abt6定位在InDel标记Y15420~Y15648.标记间物理距离约278kb。 王付华 王亚 王青林 尹海庆 王生轩 陈献功 孙建军 王越涛 付景 白涛 周柯关键词:水稻 玉米转录因子ZmSBP3基因的功能分析及互作网络预测 被引量:1 2020年 SBP家族是植物特有的一类转录调控因子,参与植物多种激素信号传导,与植物生长发育及逆境胁迫基因的表达相关。本研究从耐旱型玉米自选系‘郑7541’克隆一个与干旱相关的SBP家族因子基因,暂时命名为ZmSBP3。该基因的开放阅读框为978 bp,翻译325个氨基酸。蛋白分析表明该蛋白无跨膜域,属于高亲水性蛋白,含有17个丝氨酸和6个苏氨酸磷酸化位点,亚细胞定位于细胞核。顺式元件分析发现,该基因上游启动子区含有与植物生长发育、形态建成、植物光反应、激素信号传导及逆境胁迫等结合位点。复合进化树结合保守motif分析发现, ZmSBP3蛋白序列与柳枝稷、高粱和谷子不仅同源性较高,且在相同的氨基酸位置含有相同的motif。qRT-PCR表明该基因属于组成型表达基因,在幼叶、幼胚和幼胚乳中高表达,且其受干旱胁迫的正向诱导表达。预测的互作功能蛋白主要通过调节植物的细胞发育、参与激素介导的信号等途径,来调控植物对逆境的胁迫应答和生长发育等过程。 张新 曹丽茹 魏良明 魏良明 张前进 魏昕 周柯 陈建飞 王振华 王振华关键词:玉米 干旱胁迫