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常义斌
作品数:
1
被引量:3
H指数:1
供职机构:
北京大学基础医学院病原生物学系
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发文基金:
广西省自然科学基金
国家自然科学基金
国家高技术研究发展计划
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相关领域:
农业科学
医药卫生
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合作作者
朱永红
北京大学基础医学院病原生物学系
王玲
北京大学基础医学院病原生物学系
李凌君
北京大学基础医学院病原生物学系
吉彦莉
北京大学基础医学院病原生物学系
庄辉
北京大学基础医学院病原生物学系
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中华微生物学...
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2008
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猪戊型肝炎病毒株swGX32全基因组序列分析
被引量:3
2008年
目的分析从广西地区分离的1株猪戊型肝炎病毒swGX32全基因组序列并比较其与其他分离株的差异。方法设计PCR引物,用巢式反转录聚合酶链反应法(RT—nPCR)分段扩增戊型肝炎病毒(HEV)株swGX32全基因序列,用cDNA末端快速扩增法(RACE)扩增其末端序列,对扩增产物进行克隆和测序,并对拼接后的基因组进行序列和进化分析。结果除3’polyA尾巴外,swGX32全长7240nt,ORF1与ORF2重叠4nt,ORF3包含在ORF2序列中。swGX32全基因序列与HEV1—4型核苷酸序列的同源性分别为:73%-74%、73%、74%-75%,83%-94%,其中与中国人源HEV株JKO—ChiSai98C同源性最高,达94%。全基因序列进化分析显示,swGX32位于HEV基因4型分枝上,ORF2部分核苷酸序列进化分析显示,swGX32与JKO—ChiSai98C同在HEV4a亚型分枝上。结论猪HEV swGX32在全基因组结构及分子进化上均与人HEV JKO—ChiSai98C有密切关系,为揭示戊型肝炎是一种人兽共患病提供了分子生物学依据。
吉彦莉
李凌君
韦献飞
王玲
常义斌
唐荣兰
朱永红
庄辉
关键词:
戊型肝炎病毒
基因型
人畜共患病
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