张存芳
- 作品数：9 被引量：47H指数：5
- 供职机构：中国科学院西北高原生物研究所更多>>
- 发文基金：国家自然科学基金中国科学院知识创新工程重要方向项目更多>>
- 相关领域：生物学农业科学更多>>
- 高原裸裂尻鱼头部轮廓形状及其变异的几何形态测量分析被引量：17
- 2017年
- 为了明确描述高原裸裂尻鱼的表型多样性,运用现代几何形态测量法,基于高原裸裂尻鱼头部轮廓的形态坐标数据,对其5个地理种群的样本做了定量分析。结果主要如下:(1)主成分分析(PCA)和典型变量分析(CVA)显示,5个地理种群的样本的变异主要位于口型特征、下吻部形状、下颌骨形状、下颌锐利角质程度和头部形状等性状。(2)基于主成分分析、典型变量分析和聚类分析,高原裸裂尻鱼三个亚种(班公湖亚种、玛法木湖亚种和指名亚种)相互分开,在PC1轴上从负值到正值依次排列,从而确定了高原裸裂尻鱼亚种划分的有效性。(3)通过形态差异的显著性检验,基于马氏距离和普氏距离分析了高原裸裂尻鱼各地理种群之间的形态变异距离,根据差异显著性将该5个地理种群的高原裸裂尻鱼分为湖泊型亚种和河流型亚种,随后的聚类分析同样支持该结果。总之,通过几何形态测量法,准确描述了高原裸裂尻鱼头部轮廓的形态多样性,按照外形的差异,将5个地理种群分为两种生态型,并推测该差异主要是由于所生活的水体环境和食物差异所造成。对高原裸裂尻鱼形态差异的识别和研究,能为其生态学研究和物种多样性保护提供相应指导,丰富微进化理论。
- 王贺崐元汤永涛李国刚张仁意冯晨光童超刘思嘉张存芳田菲赵凯
- 关键词：主成分分析地理变异
- 新疆斑重唇鱼的分子系统地理学研究
- 裂腹鱼亚科(schizothoracinae)的濒危物种斑重唇鱼(Diptychus maculatus)在我国主要分布于新疆天山以南的塔里木河水系和天山以北的伊犁河水系。我们选用线粒体基因组中的16S r RNA基因和...
- 李国刚汤永涛张仁意童超冯晨光张存芳赵凯
- 关键词：系统地理学
- 文献传递
- 青海湖裸鲤线粒体DNA D-loop区的遗传多样性及其遗传分化研究被引量：6
- 2013年
- 为了科学有效地保护青海湖裸鲤的种质资源,对青海湖裸鲤的遗传多样性及种群结构进行研究是尤为重要。本研究采用PCR技术对青海湖裸鲤的4个种群（青海湖、可鲁克湖、甘子河、草搭连）155个个体的mtDNA D-loop区部分序列进行扩增,得到了754 bp的核苷酸序列。采用MEGA 5.05和DnaSP 5.10.1软件对序列进行分析,结果显示：155个个体中共检测出34个单倍型,单倍型多样性（Hd）为0.906±0.013,核苷酸多样性（Pi）为0.00556±0.00034。其中可鲁克湖种群的单倍型多样性0.422±0.093和核苷酸多样性0.00272±0.00066均低于其他3个种群,且该种群内的平均遗传距离（0.00276）低于群体间的遗传距离0.00522~0.00709。通过群体分化指数（Fst）和基因流（Nm）分析显示,可鲁克湖种群与其他3个种群之间有着明显的遗传分化（Fst〉0.26327,Nm〈0.69959）,且与甘子河种群分化程度最显著（Fst=0.45854,P〈0.01;Nm=0.29521）。但是系统发育树并未显示出明显的单系群,可能是水系间地理隔离格局的形成时间较晚。研究结果表明：青海湖裸鲤具有较高的遗传多样性,种群间出现了一定程度的遗传分化,特别是可鲁克湖种群已经高度分化,但其遗传多样性水平很低,应优先对其进行保护。
- 张仁意李国刚汤永涛张存芳赵凯
- 关键词：青海湖裸鲤遗传分化
- 青藏高原东北部边缘高原鳅属鱼类的多样性与分布格局被引量：10
- 2017年
- 为了了解青藏高原东北部边缘地区高原鳅属(Triplophysa)鱼类的多样性和分布格局,本文基于2012–2015年的野外调查数据,对该地区高原鳅属鱼类的分布情况进行了调查。结果发现:与历史记录相比,部分物种的分布区已经萎缩或破碎化。物种在整个区域的分布很不均匀,其中洮河、大通河和黑河的中上游是高原鳅分布较集中的地区;同时这3条河也有着较高的多样性水平。海拔梯度上,物种丰富度呈现随海拔上升先增后减的单峰分布模式,在2,200–2,400 m海拔区间最高;且峰值点出现在两个物种丰富的群落的过渡区,很好地印证了Lomolino对物种密度海拔分布的预测。多样性指数的海拔回归分析获得与物种丰富度的海拔分布相一致的结果。结合已有报道,我们认为这种中间海拔最大的单峰分布模式可能是青藏高原及其周边地区物种多样性分布的普遍规律。因而,中海拔地区需要优先保护。
- 冯晨光童超张仁意李国刚王贺崐元汤永涛张存芳赵凯
- 关键词：青藏高原多样性海拔梯度
- 鲤在低温胁迫下肝胰腺转录组测序分析被引量：6
- 2018年
- 检测低温耐受与低温敏感鲤品种低温胁迫下的差异表达基因,探究鲤低温适应的分子应答过程。低温胁迫后对松浦镜鲤及荷包红鲤肝胰腺进行转录组测序,并对表达差异基因进行功能、通路富集分析。通过差异表达分析,共获得10 521个差异表达基因,其中5 246个基因仅在低温耐受品种发生表达变化。功能、通路富集分析将差异基因显著富集在包括糖酵解/糖质新生代谢途径在内的144个代谢途径。选取5个基因进行qRT-PCR验证,定量结果与RNA-seq结果相关性达0.89。研究结果表明低温胁迫会显著改变鲤肝胰腺的转录活动,编码糖酵解/糖质新生途径的多个关键酶基因在低温耐受品种的表达量显著高于低温敏感品种,推测这些基因功能有助于其长期低温适应。
- 刘思嘉田菲田菲张存芳赵凯
- 关键词：肝胰腺转录组测序
- 滩羊微卫星标记多态性及与体尺性状关联分析被引量：5
- 2019年
- 滩羊是我国特有的蒙古羊品种,肉质鲜美但生长缓慢。通过筛选的29 个高多态性微卫星标记,对宁夏盐池滩羊种羊场基础母羊群体用随机抽样法检测了96 个成年个体,测量了体重和体尺数据,分析了其微卫星标记遗传多样性、群体遗传结构及分子标记与表型的相关关系。结果显示,微卫星标记平均等位基因数9.5,平均有效等位基因数4.5,平均期望杂合度0.72,平均观测杂合度0.64,平均多态信息含量0.69;滩羊基础母羊群体保持了丰富的遗传多样性;关联分析结果显示MAF33 与滩羊的体高、胸深显著相关,BMS1788 与荐高、胸围显著相关,而BL41、BMS835、BOVILS56、MAF33 和BMS500 与管围极显著关联。这些标记对未来滩羊的分子辅助育种有所帮助。
- 李标张瑞莹王小琪张存芳段子渊
- 关键词：滩羊微卫星位点遗传多态性体尺
- 一种由Crispr/Cas9诱导的鳞片缺失斑马鱼模式及建立方法
- 本发明涉及一种由Crispr/Cas9诱导的鳞片缺失斑马鱼模式，该模式是指包含EDA基因外显子4位点碱基插入的鳞片缺失斑马鱼。同时，本发明还公开了该模式的建立方法和应用。本发明建立的鳞片缺失斑马鱼模式在皮肤附件相关基因功...
- 张存芳赵凯童超刘思嘉汤永涛冯晨光张仁意李国刚
- 文献传递
- 不同生境下青海湖裸鲤(Gymnocypris przewalskii)两亚种鳃形态差异及其功能适应被引量：4
- 2013年
- 该研究比较观察青海湖裸鲤(Gymnocypris przewalskii)两亚种(青海湖裸鲤指名亚种(Gymnocypris przewalskii przewalskii)和青海湖裸鲤甘子河亚种(Gymnocypris przewalskii ganzihonensis))鳃的形态及显微结构。结果显示,指名亚种的第一鳃弓鳃耙数多、密集且较长,而甘子河亚种则耙数少、稀疏且短;两者的鳃丝间距及鳃小片间距无明显差异,指名亚种的鳃丝较长;指名亚种扁平上皮细胞形态以不规则椭圆形为主,鳃丝表面有黏液细胞,其上分布的氯细胞数量多于甘子河亚种,而甘子河亚种扁平上皮细胞的形态以六边形为主,鳃丝表皮未观察到黏液细胞。由此推测,青海湖裸鲤两亚种鳃形态的差异与其食性和栖息环境相适应。
- 张仁意李国刚张存芳汤永涛赵凯
- 关键词：青海湖裸鲤生境扫描电镜
- 一种由Crispr/Cas9诱导的鳞片缺失斑马鱼模式及建立方法
- 本发明涉及一种由Crispr/Cas9诱导的鳞片缺失斑马鱼模式，该模式是指包含EDA基因外显子4位点碱基插入的鳞片缺失斑马鱼。同时，本发明还公开了该模式的建立方法和应用。本发明建立的鳞片缺失斑马鱼模式在皮肤附件相关基因功...
- 张存芳赵凯童超刘思嘉汤永涛冯晨光张仁意李国刚
- 文献传递
