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李国辉
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2
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供职机构:
中国科学院大连化学物理研究所
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发文基金:
国家高技术研究发展计划
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相关领域:
自动化与计算机技术
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合作作者
迟学斌
中国科学院计算机网络信息中心
张宝花
中国科学院计算机网络信息中心
魏帆
中国科学院计算机网络信息中心
金钟
中国科学院计算机网络信息中心
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NWCHEM软件在生物体系中的应用
生物体系结构和功能比较复杂,对其进行简单的振动柔性分析,研究构象变化以及原子分子之间相互作用势的精确度问题等都非常费时费力。我们可以将研究体系分割成合适的小片段后,使用量子化学程序进行精确计算,再采用MFCC结合RE...
张宝花
李国辉
魏帆
刘倩
金钟
迟学斌
关键词:
并行计算
多肽
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NWCHEM软件在生物体系中的应用
2011年
生物体系结构和功能比较复杂,对其进行简单的振动柔性分析,研究构象变化以及原子分子之间相互作用势的精确度问题等都非常费时费力。我们可以将研究体系分割成合适的小片段后,使用量子化学程序进行精确计算,再采用MFCC结合REMD技术来研究生物体系精确作用问题。本文使用NWCHEM软件计算不同规模大小的"多肽"体系在深腾7000的不同架构节点上随处理器核数的加速效率,以确定大生物体系分割研究片段的大小和计算采取的处理器核数,并以此分析NWCHEM软件在生物体系研究中的适用性。
张宝花
李国辉
魏帆
刘倩
金钟
迟学斌
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并行计算
多肽
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