李洪涛 作品数:29 被引量:52 H指数:4 供职机构: 广西医科大学 更多>> 发文基金: 国家自然科学基金 广西科技厅资助项目 广西壮族自治区自然科学基金 更多>> 相关领域: 医药卫生 生物学 更多>>
涂阴肺结核病人血清蛋白组学研究及SHBG蛋白验证 被引量:3 2016年 目的利用蛋白质组学方法发现和验证涂阴肺结核的候选血清标志物。方法采用i TRAQ标记结合MALDI-TOF/MS筛选30例健康对照者和30例涂阴肺结核患者血清的差异表达蛋白,通过生物信息学分析差异蛋白之间的相互作用;对差异蛋白SHBG进一步ELISA验证,应用SPSS 20.0统计软件绘制ROC曲线。结果三次独立重复实验一共筛选和鉴定置信度在95%以上蛋白283种;以正常人血清为对照,涂阴肺结核患者血清中有差异表达蛋白31种(P<0.05),其中17个蛋白表达上调,14个蛋白表达下调;蛋白相互作用发现SHBG等12种蛋白处于相互作用网络关键节点;ELISA验证结果显示涂阴肺结核组血清SHBG蛋白浓度高于正常对照组和肺炎组(P<0.001),与蛋白组学筛选和鉴定的结果一致;以SHBG检测值绘制的ROC曲线下的面积是0.92(P<0.001),其诊断涂阴结核病的灵敏度和特异度分别是87.14%和85.11%。结论 i TRAQ标记结合MALDI-TOF/MS技术筛选和鉴定到的12种关键节点蛋白可能是涂阴结核病潜在标志物,SHBG是值得进一步研究的肺结核候选血清标志物。 周颖 李翠萍 何晓 李洪涛 臧宁 郑艳燕 何敏关键词:蛋白质组学 同位素标记 胆癌潜在治疗靶点凝溶胶蛋白gelsolin(GSN)抑制肝癌细胞凋亡的作用机制研究 周怡 李洪涛 臧宁 李刚 邓小芳 刘坤 方芳 GSN蛋白是一种钙调节的肌动蛋白结合蛋白,包含782个氨基酸,分子量约为90KD,亚细胞定位在细胞质和细胞骨架,也可分泌至胞外。GO分析指出GSN主要通过分解细胞组分参与细胞凋亡过程;Richard等在Jurkat 细胞...关键词:关键词:肝癌 细胞凋亡 肿瘤治疗 室间隔缺损生物标志物血清蛋白质组学分析 被引量:5 2013年 目的应用同位素标记相对和绝对定量(iTRAQ)技术结合液相色谱串联基质辅助激光解析电离飞行时间质谱(LC-MALDI-TOF/TOF MS)方法筛选潜在的室间隔缺损血清标志蛋白,探索室间隔缺损的发病机制。方法收集室间隔缺损患者和与之相匹配的健康对照组、房间隔缺损患者血清各20例,组内等量混合后利用安捷伦公司生产的多重亲和去除系统(MARS)去除14种高丰度蛋白,iTRAQ试剂标记后应用二维液相色谱分离,经质谱鉴定进行相对定量和生物信息学分析。结果质谱鉴定出置信度>95%的蛋白质共329种,其中表达量有明显差异的蛋白质36种包括富含半胱氨酸的酸性分泌蛋白、脂联素等。室间隔缺损组较健康对照组和房间隔缺损组表达量均上调>1.2倍的蛋白有21种,下调<0.83倍的蛋白有16种。结论筛选出一系列室间隔缺损相关的差异性蛋白,为进一步探索室间隔缺损发病机制奠定基础。 仇小强 张永波 曾小云 何敏 周怡 罗蓉 李洪涛 余红平关键词:室间隔缺损 血清标记物 蛋白组学 质谱 血清SHBG蛋白作为肺结核病人血清标志物及其应用 一种血清SHBG(Sex?hormone-binding?globulin)蛋白作为肺结核病人血清标志物及其应用,所述血清SHBG蛋白在涂阴、涂阳肺结核和耐多药肺结核病人血清中表达水平明显增高,可利用iTRAQ结合MAL... 何敏 李翠萍 何晓 李洪涛 臧宁文献传递 不明原因人复发性早期流产母-胎界面关键蛋白的鉴定与应用研究 杨小丽 郭培奋 江莉 李洪涛 覃健 李刚 胡任统 冯志强 张成东 自然流产发病各个环节具体体制不明,导致治疗针对性不强。临床上多采用综合性治疗策略,即将各种可能有效的治疗方法尽数给患者使用,包括传统的孕酮与绒毛膜促性腺激素的治疗,还包括中医药治疗,新的治疗方法还有治疗高凝状态(阿司匹林...关键词:关键词:自然流产 蛋白质组学 一种非同位素标记肽段加入法结合MRM的蛋白质定量方法 本发明公开了一种非同位素标记肽段加入法结合质谱多反应监测技术(MRM)的蛋白质定量方法,包括以下步骤:S1:MRM‑MS方法的建立与优化;首先通过UNIPROT数据库获取蛋白的全部序列,然后通过Skyline软件建立和优... 黄东萍 仇小强 龙静铧 曾小云 李洪涛文献传递 利用亲和层析法检测乙酰化蛋白的研究 2012年 目的建立一种快速、相对定量检测乙酰化蛋白方法,并初步应用其检测药物作用后Jurkat细胞乙酰化总蛋白水平。方法用不同浓度的曲古菌素A(TSA)诱导Jurkat细胞蛋白高乙酰化后,利用抗乙酰化赖氨酸抗体亲和层析柱富集纯化乙酰化总蛋白,经酸洗脱后固定于酶标板,ELISA法检测乙酰化蛋白相对总量,并用基质辅助激光解吸电离串联飞行时间质谱仪(MALDI—TOF/TOF)分析验证其成分;同法检测不同浓度的没食子酸、大黄素、单乙酰化大黄素A三种药物作用Jurkat细胞后乙酰化总蛋白水平的变化,筛查诱导Jurkat细胞蛋白乙酰化药物。结果1μmol/LTSA作用于4×10^5Jurkat细胞24h,乙酰化总蛋白相对水平最高。MALDI—TOF/TOF分析显示,TSA诱导Jurkat细胞产生的乙酰化蛋白共有22种,其中15种为乙酰化组蛋白。没食子酸、大黄素、单乙酰化大黄素A作用Jut-kat细胞后所导致的乙酰化程度不同,以1μmol/L浓度TSA为阳性对照组,无药物为空白对照组,35.09μmol/L和17.54μmol/L大黄素处理的Jurkat细胞乙酰化蛋白相对水平分别为4.3%和14.2%;1.47μmol/L和2.94μmol/L没食子酸处理组乙酰化蛋白相对水平分别为28.7%和11.5%;152.91μmol/L和30.58μmol/L单乙酰化大黄素组分别为22.O%和3.6%;其中1.47μmol/L没食子酸所诱导的乙酰化蛋白水平最高。结论初步建立了活细胞基础上纯化富集并检测乙酰化总蛋白水平的方法,该法可快速、简便的筛选以组蛋白去乙酰化酶为靶点的抗癌药物。 郑力 钟艳平 萧浩 周怡 罗蓉 李洪涛 李刚 廖明 何敏关键词:组蛋白类 曲古菌素A 色谱法 亲和 JURKAT iTRAQ结合MALDI-TOF/MS检测涂阴肺结核患者血清差异蛋白 被引量:4 2015年 目的利用差异蛋白质组学方法检测涂阳和涂阴肺结核患者血清差异表达蛋白,以发现涂阴肺结核相关的潜在标志物,为临床治疗提供参考依据。方法分析2011年医院的住院患者39例临床资料,采用iTRAQ标记结合MALDI-TOF/MS筛选30例痰涂片阴性和9例痰涂片阳性的肺结核患者血清的差异表达蛋白,并进行生物信息学分析,数据采用SPSS 17.0软件进行统计分析。结果 3次独立重复试验一共筛选和鉴定到344种蛋白质,其中置信度在>95.0%有271种蛋白质;与涂阳肺结核患者血清蛋白多肽图谱相比,涂阴肺结核患者血清中11种蛋白表达水平显著增高,7种蛋白表达降低(P<0.05);生物信息学分析发现差异蛋白主要定位在细胞外,参与酶抑制剂活性和应激反应过程。结论涂阴和涂阳肺结核患者血清蛋白多肽图谱存在明显差异;处于关键节点上的6个蛋白可能与涂阴结核病的发生发展有密切联系。 胡水秀 李翠萍 何晓 李洪涛 周怡 臧宁 郑艳燕 何敏关键词:肺结核 差异蛋白 血清SHBG蛋白作为肺结核病血清标志物及其应用 一种血清SHBG(Sex hormone‑binding globulin)蛋白作为肺结核病人血清标志物及其应用,所述血清SHBG蛋白在涂阴、涂阳肺结核和耐多药肺结核病人血清中表达水平明显增高,可利用iTRAQ结合MAL... 何敏 李翠萍 何晓 李洪涛 臧宁文献传递 细胞间黏附分子1的MRM-MS测定方法建立与优化 被引量:1 2018年 目的建立并优化室间隔缺损潜在生物标记物细胞间黏附分子1(ICAM-1)MRM-MS测定方法。方法借助Uni Prot数据库和辅助软件Skyline建立ICAM-1多重反应监测质谱定量(MRM-MS)方法,进一步筛选其各肽段及母子离子对,并通过改变MS的碰撞能量CE值和去簇电压DP值进一步优化其MRM质谱扫描方法。结果从ICAM-1的11个肽段88对离子对中优选出3个肽段9对离子对作为ICAM-1的定量依据。采用优化后的MRMMS进行检测,10个血清样本中ICAM-1蛋白含量为(318.40±97.20)ng/m L,与经酶联免疫法测定的结果(330.30±130.24)ng/m L相比差异无统计学意义(P>0.05)。结论借助Uni Prot数据库和辅助软件Skyline,经过多个循环可以建立并优化ICAM-1蛋白的MRM-MS测定方法。 黄东萍 李洪涛 曾小云 龙静铧 臧宁 周怡 仇小强关键词:ICAM-1