目的对青海省2013年手足口病（Hand,Foot and Mouth Disease;HFMD）的病原谱和人肠道病毒A组71型（Human Enterovirus Group A Type 71,HEV_（A71））的基因特征进行分析。方法对青海省2013年送检的HFMD标本,用荧光定量逆转录-聚合酶链反应（Reverse Transcription-Polymerase Chain Reaction,RT-PCR）方法进行筛查,对HEV_（A71）阳性标本进行病毒分离,对分离到的病毒提取核酸,用RT-PCR方法对VP1编码区进行扩增及核苷酸序列测定和整理分析,并与HEV_（A71）各基因型和基因亚型的代表株序列构建亲缘关系进化树。结果对青海省2013年分离的62株HEV_（A71）进行VP1编码区核苷酸序列测定后,分析发现它们在VP1编码区核苷酸水平和氨基酸水平的同源性分别为95.5%-100.0%和99.0%-100.0%。与其他各基因型和基因亚型的HEV_（A71）代表株构建的亲缘进化树中显示,青海省HEV_（A71）分离株与C4亚型代表株聚为一簇,属于C4基因亚型C_（4a）进化分支。与2008年、2012年在青海省分离的HEV_（A71）在核苷酸和氨基酸水平的同源性分别为95.8%-97.5%和99.0%-99.7%。结论2013年,C_（4a）亚型HEV_（A71）在青海省持续传播并占有绝对优势,且存在两条传播链的流行。
目的对陕西省2009～2012年肠道病毒71型（Enterovirus Type 71，EV71）的分子流行病学特征进行研究。方法采用体外逆转录-聚合酶链反应（Reverse Transcriptase-Polymerase Chain Reaction，RT—PCR），对陕西省2009—2012年分离白手足口病（Hand，Foot and Mouth Disease，HFMD）病例的38株EV71进行衣壳蛋白（Capsid Protein）VP1编码区基因序列扩增。通过双脱氧末端终止法（Sanger法）测序，获得VP1编码区核苷酸序列。采用软件Sequeneher5．0和MEGA5．0对序列进行生物信息学分析。结果陕西省2009～2012年流行的EV71与C4基因型C4a分支具有最高的核苻酸序列同源性，为93．4％～99．4％；与C4a分支代表株在亲缘性关系树上具有最近的进化关系。陕西省EV71具有较高核苷酸和氨基酸序列同源性，分别为93．3％～100％（平均97．3％）和98．3％～100％（平均99．4％）。但相同年代和不同年代EV71毒株间的核苷酸序列平均差异随年代逐渐增大。结论陕西省2009～2012年流行的EV71均属于C4基因亚型C4a分支，为中国近年来流行的优势基因亚型。陕西省EV71具有较高的基因同源性，但基因多态性随着时间逐渐增大。进一步阐明EV71在陕西省的变异变迁规律，需继续开展并加强EV71的分子流行病学监测。
目的研究太原市手足口病（Hand，Foot and Mouth Disease，HFMD）患者中，肠道病毒A71型（Enterovirus Type A71，EVA71）的分子进化特征。方法采集太原市HFMD患者的咽拭子和粪便标本，采用荧光定量逆转录-聚合酶链反应（Reverse Transcription—Polymerase Chain Reaction，RT—PCR）方法检测EV核酸。然后随机选取11株EVA71阳性标本进行衣壳蛋白（Capsid Protein）VP，编码区基因扩增、核苷酸序列测定和分析，与其他48株各基因型和基因亚型的EV71代表株构建基因亲缘性关系树。结果太原市11株EVA71均属于C4基因亚型C4a进化分支，但11株EVA71在VP1编码区核苷酸和氨基酸的同源性分别为95．7％～100．0％和99．0％～100．0％。在亲缘进化树中显示，这些EVA71处在不同的簇中，表现为11株EVA71至少属于3条病毒传播链。结论太原市流行的EVA71属于C4基因亚型C4a进化分支，并且存在多个传播链。与中国其他地区流行的EVA71在基因亲缘关系和流行时间关系上都很接近，说明太原市EVA71不是独立进化的，而是与中国其他地区流行的EVA71在共同进化。
