王梓炫 作品数:23 被引量:59 H指数:5 供职机构: 青岛大学 更多>> 发文基金: 国家自然科学基金 山东省自然科学基金 青岛市医药科研指导计划 更多>> 相关领域: 医药卫生 农业科学 更多>>
阿尔茨海默病circRNA的差异表达及生物信息学分析 2024年 目的:通过生物信息学方法,探讨阿尔茨海默病(AD)患者外周血中差异表达的环状RNA (circRNA)的生物学功能。方法:通过基因表达综合数据库(GEO)获取AD相关的数据集GSE186929,筛选AD患者外周血中差异表达的circRNAs,应用Circinteractome和miRDB数据库来预测circRNA靶向的miRNA,应用Starbase、miWalk、TargetScan8.0在线靶基因预测网站预测靶基因,利用jvenn获得靶基因合集,对差异表达的靶基因进行分析。运用David工具进行基因本体论(GO)和分析和京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路分析。通过String在线网站构建蛋白互作(PPI)网络,应用Cytoscape筛选出3个关键基因。结果:共筛选出47个差异表达的circRNAs,其中13个下调,34个上调,选取最具有显著性差异的has_circRNA_0001928进一步预测miRNA,选取数据库中预测效果都较好的miR-142-5p进行靶基因预测,获得63个靶基因。GO和KEGG富集分析显示靶基因参与RNA转录、细胞分裂、基因表达调控等功能以及调节干细胞多能性的信号通路、脂质和动脉粥样硬化信号通路、人类巨细胞病毒感染等信号通路。3个关键基因为PUM2、OTUD4、RANBP2。结论:circRNA及其靶基因可能在AD的发病机制中发挥重要作用,circRNA可能是AD潜在的生物标志物和治疗靶点。Objective: To investigate the biological functions of differentially expressed circular RNAs (circRNAs) in the peripheral blood of Alzheimer’s disease (AD) patients by bioinformatics methods. Methods: AD-related dataset GSE186929 was obtained from Gene Expression Omnibus (GEO), screening for differentially expressed circRNAs in the peripheral blood of AD patients, applying Circinteractome and miRDB databases to predict circRNA-targeted miRNAs, and applying Starbase, miWalk, TargetScan8.0 online target gene prediction website to predict target genes, and used jvenn to obtain target gene ensembles to analyze differentially expressed target genes. Gene ontology (GO) and analysis a 张鑫 闫林娜 王梓炫关键词:生物信息学 阿尔茨海默病 CXC基序趋化因子10在脑胶质瘤中的表达及其临床意义 被引量:5 2021年 目的探讨CXC基序趋化因子10(CXCL10)在脑胶质瘤中的表达及其对脑胶质瘤发生、发展与预后的影响。方法分别利用生物信息学中国脑胶质瘤基因组图谱(CGGA),癌症基因组图谱(TCGA)、MetaScape、TIMER等数据库分析CXCL10在胶质瘤中的表达水平、对患者的预后意义、GO功能注释、KEGG通路富集及胶质瘤纯度的相关性。进一步收集2019年3至11月在广西医科大学第二附属医院诊断胶质瘤的患者34例临床胶质瘤组织标本,应用Western印迹和免疫组化验证其相关性。结果CGGA和TCGA数据库分析显示,CXCL10在胶质瘤中随着世界卫生组织(WHO)分级的增高表达水平升高(CGGA:F=86.69,P<0.01;TCGA:F=68.17,P<0.01)。CXCL10高表达的患者总生存率明显下降(χ^(2)=148.1,P<0.05)。在接受放疗或化疗的Ⅳ级胶质瘤患者中,CXCL10低表达患者总生存率明显优于高表达患者(放疗组:χ^(2)=6.714,P<0.05;化疗组:χ^(2)=5.618,P<0.05)。GO和KEGG分析表明与CXCL10共表达的基因主要富集在细胞因子介导的信号通路、调节适应性免疫反应及炎症反应等生物学过程中。TIMER数据库分析显示CXCL10与胶质瘤肿瘤细胞纯度负相关[低级别胶质瘤(LGG):r=-0.129;胶质母细胞瘤(GBM):r=-0.165;P<0.05]。同时,临床样本分析也显示CXCL10在胶质瘤中表达升高并随级别升高而表达升高(均P<0.05)。结论CXCL10在胶质瘤中表达升高,且随恶性程度的增高而升高,胶质瘤组织中CXCL10高表达与患者不良预后相关。 张强强 熊静 卢冬林 王梓炫 孙苏园 刘文其关键词:胶质瘤 预后 生物信息学 散发性重症肌无力患者267例维生素D受体基因多态性 被引量:4 2011年 目的探讨中国汉族人维生素D受体(VDR)基因FokI和ApaI位点多态性与重症肌无力(MG)的关系。方法采用聚合酶链反应.限制性内切酶片段多态性(PCR—RFLP)法检测VDR基因FokI和ApaI位点的多态性,比较基因型和等位基因在健康对照组及各MG亚组中的分布,并观察其与MG严重程度和激素短期疗效的关系。结果FokI和ApaI位点的基因型和等位基因频率在MG组和对照组间以及MG各亚组间的分布差异无统计学意义。FokI位点的基因型和等位基因频率在激素短期疗效好和疗效差组间的分布差异亦无统计学意义;但ApaI位点的A等位基因频率在两组间差异有统计学意义,疗效好者(55/186,29.6%)高于疗效差者(7/48,14.6%,OR=2.46,95%CI1.04—10.43,妒:4.400,P=0.036);激素短期疗效好者中携带基因型AA及Aa的频率(48/93,51.6%)高于疗效差者(7/24,29.2%,OR=2.59,95%C10.98—14.60,X^2=3.858,P=0.049)。结论在我国汉族人散发性MG患者的VDR基因中,未发现FokI和ApaI变异位点显著增加MG的患病风险,但携带ApaI位点的A等位基因的MG患者激素短期疗效可能较好。 王梓炫 李海峰 孙亮 谢琰臣 王淑霞 徐昕 韩继兰 郑雪平 周晓斌 张华 姚如永 杨泽关键词:重症肌无力 多态现象 一种老年患者康复病床 本发明提供一种老年患者康复病床,包括:床本体、前板、后板和升降机构,使用时,所述升降机构能够通过电机实现启动所述推块将前板进行升起或降落,进一步实现所述前板能够根据升降机构的启动实现与后板之间的角度调节目的,从而实现了护... 王志宏 郑雪平 王梓炫 王宗秋文献传递 老年心力衰竭患者合并认知障碍的研究进展 被引量:6 2021年 老年心力衰竭患者常出现认知障碍。本文从心输出量减少、肾功能损害、心房颤动、炎症反应、神经调节、抑郁症及高同型半胱氨酸等多个方面探讨了老年心力衰竭患者发生认知障碍可能病理机制,并概况认知障碍对心力衰竭的影响,以便提高临床医师对老年心力衰竭患者出现认知障碍的认识和诊疗水平。 刘彤云 吕文静 王媚 邢昂 韩莹 王梓炫关键词:心力衰竭 一种老年患者康复护理装置 本发明提供一种老年患者康复护理装置,包括:挂钩和托盘,所述支架的上方设有托盘,所述托盘上用于放置监测块,所述支架的下方安装在监控机构上,所述监控机构上分别设置有两组支架,其中一组支架用于挂设输液袋,另一组支架的托盘上方用... 王志宏 郑雪平 王梓炫 王宗秋文献传递 阿尔茨海默病患者血液中miRNA-3200-3p生物信息学分析 2024年 目的:通过生物信息学方法,探讨阿尔茨海默病(AD)患者血液中差异表达微小RNA (miRNA)的生物学功能。方法:通过基因表达综合数据库(GEO)获取AD相关的数据集GSE46579,筛选AD患者血液中差异表达miRNAs,运用在线数据库TargetScan、miRDB及Starbase预测所选miRNA的靶基因,通过GSE97760数据集筛选差异表达基因,对差异表达靶基因进行分析。运用R软件进行基因本体论(GO)和分析和京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路分析。通过String在线网站构建蛋白互作(PPI)网络,利用Cytoscape筛选5个关键基因。结果:共筛选出56个差异表达miRNAs,其中42个下调,14个上调。23个靶基因与差异表达基因重叠。GO和KEGG富集分析显示miRNA-3200-3p靶基因参与DNA分子结构与功能变化、神经元发育和突触传递等功能,以及流体剪切应力与动脉粥样硬化信号通路和丁酸代谢等信号通路。miRNA-3200-3p调控的5个关键基因为SRSF1、CHD1、ZRANB2、PURA和KDM5C。结论:miRNA-3200-3p可能在AD的发病机制中发挥重要作用,miRNA-3200-3p可能是AD潜在的生物标志物和治疗靶点。 闫林娜 张鑫 王梓炫关键词:阿尔茨海默病 MIRNA 生物信息学 GEO 维生素D受体基因Tru9I位点多态性与重症肌无力的相关性 被引量:5 2012年 目的探讨维生素D受体(VDR)基因Tru9I位点多态性与重症肌无力(MG)的关系。方法采用聚合酶链反应一限制性内切酶片段(PCR-RFLP)多态性方法检测2006年12月至2010年7月于青岛大学医学院附属医院和北京友谊医院神经科诊治的MG患者和健康对照组VDR基因Tru9I位点的多态性,并观察其与MG易感性、严重程度和激素近期疗效的相关性。应用SPSS17.0统计软件进行统计学分析。结果在发病年龄≥15岁的患者中,女性TT基因型和tt基因型比例低于对照组女性,而Tt基因型高于对照组女性,差异有统计学意义(x2=8.847,P=0.012)。因t等位基因为变异型,故将携带t等位基因的基因型(Tt+tt)合并,发现女性Tt+tt比例(58/139,41.7%)高于对照组女性(56/189,29.6%),差异有统计学意义(OR=1.70,95%CI1.07—3.41,x2=5.169,P=0.023)。女性t等位基因的比例(61/278,21.9%)高于对照组女性(65/378,17.2%),但差异无统计学意义(P〉0.05)。不同严重程度和不同激素短期疗效的MG患者基因型及等位基因频率的差异无统计学意义(P〉0.05)。结论VDR基因Tru91位点多态性可能与发病年龄≥15岁的女性MG发病风险相关。 韩继兰 李海峰 谢琰臣 孙亮 王梓炫 徐昕 王淑霞 王芹芹 高翔 姚如永 周晓彬关键词:重症肌无力 维生素D受体 基因多态性 冬凌草甲素对大鼠脑出血后继发性脑损伤的保护机制 被引量:5 2020年 目的探讨冬凌草甲素(Ori)对大鼠脑出血(ICH)后继发性脑损伤的神经保护作用及其机制。方法将大鼠随机分为假手术组、ICH组、溶剂组以及Ori低、中、高剂量组,其中后5组大鼠采用右侧基底核区注射胶原酶的方法制备ICH模型。Ori低、中、高剂量组分别给予5、15、25 mg/kg的Ori腹腔注射,溶剂组腹腔注射等体积的生理盐水。手术或药物处理72 h后进行神经行为学检测,之后处死大鼠提取脑组织,通过测量脑含水量评价脑水肿情况,采用Fluoro Jade-C染色检测神经元损伤情况,采用Western blot检测核因子κB(NF-κB)、红系衍生的核转录相关因子2(Nrf2)和血红素加氧酶-1(HO-1)的表达,采用酶联免疫吸附试验检测促炎因子肿瘤坏死因子(TNF)-α、白细胞介素(IL)-1β和IL-6的表达,采用免疫荧光染色检测Nrf2和HO-1的表达。结果Ori中、高剂量组神经行为学评分、变性神经元的数量、脑含水量均较ICH组和溶剂组明显下降。ICH组和溶剂组大鼠脑组织NF-κB、Nrf2和HO-1的蛋白表达均较假手术组升高,经中、高剂量Ori处理后NF-κB表达降低,而Nrf2和HO-1表达进一步升高,差异均有显著性(F=15.17~61.18,P<0.05)。经中剂量Ori处理后ICH大鼠脑内TNF-α、IL-1β和IL-6的表达下降(F=24.53~69.26,P<0.05)。结论Ori可减轻ICH后神经元的损伤和脑水肿程度,促进神经功能的恢复,具有神经保护作用,其机制可能是通过促进Nrf2/HO-1抗氧化信号通路和抑制NF-κB炎症通路来减轻ICH后脑损伤。 熊静 卢冬林 王梓炫 邢昂关键词:冬凌草素 脑出血 氧化性应激 神经保护 阿尔茨海默病患者血清中铁,锌和铜水平的验证性研究及荟萃分析 目的 评价阿尔茨海默病(AD)患者血清中铁,锌和铜水平异常变化情况.首次对AD患者的血清锌水平进行meta分析,并且纳入新近发表研究对既往AD患者血清铁和铜水平的meta分析进行补充.方法 对83位AD患者和83位对照的... 王梓炫 郁金泰 谭兰