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王英亚

作品数:1 被引量:39H指数:1
供职机构:南京林业大学更多>>
发文基金:国家林业公益性行业科研专项国家自然科学基金更多>>
相关领域:农业科学更多>>

文献类型

  • 1篇中文期刊文章

领域

  • 1篇农业科学

主题

  • 1篇桉树
  • 1篇微卫星
  • 1篇EST序列

机构

  • 1篇南京林业大学
  • 1篇湖北省林业科...

作者

  • 1篇王英亚
  • 1篇尹佟明
  • 1篇张新叶
  • 1篇李淑娴

传媒

  • 1篇植物学报

年份

  • 1篇2010
1 条 记 录,以下是 1-1
排序方式:
桉树EST序列中微卫星含量及相关特征被引量:39
2010年
通过对桉树属(Eucalyptus)的10000条EST序列进行分析,在其中的1499条序列上共发现1775个微卫星重复序列。含有微卫星的EST序列约占序列总数的15%。此外,还发现桉树EST序列所含微卫星长度的变异速率与重复单元长度呈负相关;微卫星的丰度与重复单元长度也呈负相关(三碱基重复微卫星除外)。在桉树EST序列中,重复单元长度为三碱基的微卫星最为丰富。三碱基重复单元微卫星的过度富集可能是由于遗传密码选择所致。在微卫星的丰度及长度变异方面,桉树EST序列与杨树(Populus trichocarpa)基因组注释的转录序列随重复单元长度的变化呈现出相同的规律,但桉树EST序列中微卫星频率及三碱基重复微卫星的含量显著偏低,推测含微卫星的基因表达丰度极有可能低于不含微卫星的基因。通过对发现的所有微卫星位点进行引物设计,并对设计的引物进行PCR检测,结果表明所设计的引物具有极高的扩增成功率。
李淑娴张新叶王英亚尹佟明
关键词:桉树
共1页<1>
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