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王英亚
作品数:
1
被引量:39
H指数:1
供职机构:
南京林业大学
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发文基金:
国家林业公益性行业科研专项
国家自然科学基金
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相关领域:
农业科学
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合作作者
李淑娴
南京林业大学
张新叶
湖北省林业科学研究院
尹佟明
南京林业大学
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1篇
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农业科学
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1篇
桉树
1篇
微卫星
1篇
EST序列
机构
1篇
南京林业大学
1篇
湖北省林业科...
作者
1篇
王英亚
1篇
尹佟明
1篇
张新叶
1篇
李淑娴
传媒
1篇
植物学报
年份
1篇
2010
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1
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桉树EST序列中微卫星含量及相关特征
被引量:39
2010年
通过对桉树属(Eucalyptus)的10000条EST序列进行分析,在其中的1499条序列上共发现1775个微卫星重复序列。含有微卫星的EST序列约占序列总数的15%。此外,还发现桉树EST序列所含微卫星长度的变异速率与重复单元长度呈负相关;微卫星的丰度与重复单元长度也呈负相关(三碱基重复微卫星除外)。在桉树EST序列中,重复单元长度为三碱基的微卫星最为丰富。三碱基重复单元微卫星的过度富集可能是由于遗传密码选择所致。在微卫星的丰度及长度变异方面,桉树EST序列与杨树(Populus trichocarpa)基因组注释的转录序列随重复单元长度的变化呈现出相同的规律,但桉树EST序列中微卫星频率及三碱基重复微卫星的含量显著偏低,推测含微卫星的基因表达丰度极有可能低于不含微卫星的基因。通过对发现的所有微卫星位点进行引物设计,并对设计的引物进行PCR检测,结果表明所设计的引物具有极高的扩增成功率。
李淑娴
张新叶
王英亚
尹佟明
关键词:
桉树
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