莫帮辉
- 作品数：7 被引量：137H指数：6
- 供职机构：中国科学院成都计算机应用研究所更多>>
- 发文基金：国家自然科学基金国家质检总局科技计划项目国家重点基础研究发展计划更多>>
- 相关领域：生物学医药卫生农业科学更多>>
- 实蝇科昆虫mtDNA-COI基因序列分析及系统发育研究被引量：7
- 2009年
- 将自测的实蝇科6种和从GenBank中检索到的12属40种的mtDNA-COI基因编码区序列片段进行同源性比较,构建分子系统树.在获得的657 bp序列中,变异位点41.4%、简约位点35.62%,A+T含量为64.7%,转换与颠换的比值为0.868.分子系统树表明:果实蝇属、合腹寡鬃实蝇属为最先分化出来的属,是较为原始的类群;其次是按实蝇属、凤实蝇属、绕实蝇属,腊实蝇属为较晚分化出来的属.按实蝇属、果实蝇属及合腹寡鬃实蝇属是近缘的;绕实蝇属和腊实蝇属是近缘的.
- 范京安顾海丰陈世界莫帮辉温演庆何万兴刘伟曾晓茂
- 关键词：实蝇科系统发育
- DNA条形码识别V.有害生物鉴定的利器被引量：3
- 2008年
- 赵明谭玲莫帮辉卿立燕曾晓茂
- 关键词：DNA条形码DNA芯片有害生物检验检疫
- DNA条形码识别 Ⅵ：基于微型DNA条形码的果实蝇物种鉴定被引量：25
- 2009年
- 选用双翅目实蝇科12属36种55个样本为材料,将其DNA条形码(mtDNACOI基因648bp)与微型DNA条形码(mtDNACOI基因50～200bp)数据进行比较分析,探讨微型DNA条形码对果实蝇物种鉴定的可行性.采用虚拟实验(Silico analysis),将BOLD数据库中49个样本的序列分别拆成648bp、160bp、50bp三个片段,通过构建NJ树,并进行遗传距离分析,得出每个片段鉴定物种的准确性依次为100%、94%、84%.同时做了实体实验(Empirical test),得到了果实蝇属6个物种的COI序列,将其与虚拟实验中的49个样本序列合并,以DNA-barcode指定序列5’端160bp序列为分析基础,通过遗传距离分析,得出其鉴定物种的准确性为94%,验证了虚拟实验结果.即微型DNA条形码(Minimalistbarcode)鉴定果实蝇物种的准确性与DNA条形码基本一致,均可作为果实蝇物种鉴定的有效依据.
- 范京安顾海丰陈世界莫帮辉温演庆何万兴刘伟曾晓茂
- 关键词：实蝇科COI基因DNA条形码物种鉴定
- DNA条形码识别 Ⅲ.媒介蚊类DNA条形码芯片的初步研究被引量：27
- 2008年
- 目的利用DNA条形码信息研制DNA芯片,建立快速高效的医学媒介蚊类鉴定方法。方法以蚊科5属15种,共30个样本为研究材料,获取其DNA条形码信息(COⅠ基因片段序列),采用基因块motif技术,搜索15个样本的同源保守基因序列,制作虚拟DNA条形码芯片。虚拟电子杂交30个样本,应用软件Bio-Edit计算属、种及种内个体间的同一性,应用phylip3.66软件以最大简约法分别对杂交结果和原序列进行聚类分析比较。结果选择78个DNA片段制作一张虚拟DNA条形码芯片,计算属间的平均同一性为0.75,同一属内种间的平均同一性为0.84,种内个体间的平均同一性为0.98,聚类分析结果一致。结论研制的虚拟DNA芯片能够鉴定本研究中的15种蚊虫,利用DNA条形码信息,设计DNA芯片在理论上可行。
- 赵明谭玲莫帮辉刘伟王仕应曾晓茂
- 关键词：DNA条形码DNA芯片蚊虫
- DNA条形码识别——DNA条形码与DNA芯片识别蚊媒准确性的比较被引量：24
- 2007年
- 〔目的〕比较DNA条形码和DNA芯片这2种技术平台在口岸医学媒介蚊类识别中的准确性。〔方法〕以20种媒介蚊类的线粒体COI基因序列信息为分析对象,采用NJ邻接法计算公认的DNA条形码区域在物种识别中的准确性,采用DNA芯片技术分析2种长度探针在物种水平识别中的差异。〔结果〕DNA条形码的准确性为98.5%,数据集中95%物种的唯一序列最短长度为50bp左右;DNA芯片的准确性为90%～98.4%,25bp探针比55bp探针更具优势。〔结论〕DNA条形码和DNA芯片都能够准确地识别20种媒介蚊类,DNA条形码芯片技术有望在口岸出入境检验检疫领域得到应用。
- 欧阳小艳莫帮辉余华丽何建伟赵明曾晓茂
- 关键词：DNA条形码DNA芯片蚊媒监测
- DNA条形码在蛤蚧真伪品鉴定中的前景被引量：10
- 2010年
- 蛤蚧作为重要的动物药材,在咳嗽、哮喘、胆结石及性功能障碍上有治疗功效。由于药材蛤蚧原动物大壁虎(Gekkogecko)物种数量逐年减少,不能满足中药市场的需求而出现了众多伪品。文章概述了近二十年来蛤蚧及其伪品的鉴别研究情况,介绍了传统性状、显微、理化和现代分子生物学技术等鉴定方法,并比较总结了各种方法在蛤蚧真伪品鉴定中的特点。在此基础上,引入物种识别学科前沿-DNA条形码(DNABarcoding)技术,并阐述了其在蛤蚧真伪品鉴定中的优势和应用前景。
- 夏云胡陆军莫帮辉缪剑华徐永莉张月云曾晓茂李力
- 关键词：蛤蚧DNA条形码中药鉴定
- DNA条形码识别Ⅰ.DNA条形码研究进展及应用前景被引量：68
- 2008年
- DNA条形码(DNA Barcoding)是近年来生物分类学中引人注目的发展热点。本文综述了DNA条形码的发展历史、识别原理以及公共数据库,并讨论了DNA条形码在检疫检验领域的应用前景。DNA条形码与DNA芯片技术的结合,将推动传统物种鉴定方法的更新,可在检疫检验领域中实现非专家检定,这对进出口口岸生物监测具有重要的理论意义和应用价值。
- 莫帮辉屈莉韩松何建伟赵明曾晓茂
- 关键词：DNA条形码DNA芯片
