高祥刚
- 作品数：87 被引量：333H指数：11
- 供职机构：辽宁省海洋水产科学研究院更多>>
- 发文基金：国家自然科学基金辽宁省海洋与渔业厅科研计划项目辽宁省科学技术计划项目更多>>
- 相关领域：农业科学生物学经济管理文化科学更多>>
- 文蛤肠、外套膜和肝胰脏组织cDNA文库构建及其ESTs序列分析被引量：7
- 2010年
- 利用SMART cDNA文库构建试剂盒构建了文蛤(Meretrix meretrix)肠、外套膜和肝胰脏组织的cDNA文库。经测定原始文库滴度分别为2.10×106、1.70×106和1.60×106,重组率高于95%,肠组织文库插入片段长度均大于1000bp,外套膜和肝胰脏组织文库的插入片段长度大于1kb的占87.5%,文库质量符合标准要求。随机选取文库的3168个克隆进行5′端测序,获得高质量表达序列标签(Expressed Sequence Tags,ESTs)3029个(肠:1005,外套膜:1019,肝胰脏:1005),测序成功率95.58%。经质量控制和拼接得到1796个单基因簇(Unigene),其中306个叠联群(Contigs),1490个单一序列(Singletons)。通过Blastx搜索比对、查询和注释分析,共得到已知基因696个(肠:216,外套膜:235个;肝胰脏:245个),占总数38.75%。在1796个单基因簇(Unigene)发现微卫星序列55条,这些存在微卫星位点的序列占整个ESTs数据库的3.1%。
- 高祥刚李云峰宋文涛王健傅立元刘卫东鲍相渤赫崇波
- 关键词：文蛤CDNA文库表达序列标签
- 虾夷扇贝酚氧化酶基因克隆及表达特性研究被引量：1
- 2015年
- 酚氧化酶是一种含铜的金属酶，广泛分布于微生物、动植物及人体中。该酶在无脊椎动物先天免疫防御中起着重要的作用。用分子克隆技术得到了虾夷扇贝酚氧化酶cDNA基因全序列，并利用Real‐TimePCR方法分析了酚氧化酶基因在虾夷扇贝不同组织中表达概况以及鳗弧菌注射后不同时段的相对表达量。试验得到的酚氧化酶基因全长1850bp，其包括长为1470bp的开放阅读框，编码489个氨基酸，5’UTR和3’UTR分别为37bp和343bp。实时定量分析研究显示，酚氧化酶基因在肝胰腺、外套膜、肾、闭壳肌、鳃和血中均有表达，其中外套膜表达最高。鳗弧菌注射后6h，酚氧化酶基因表达量显著低于对照组，而注射后12～36h，酚氧化酶基因表达量显著高于对照组，表明该基因可能在免疫过程中发挥重要作用。
- 史井运鲍相渤张振宇高祥刚蒲红双赫崇波孔繁东刘卫东
- 关键词：虾夷扇贝酚氧化酶克隆基因表达
- 文蛤胞内铜锌超氧化物歧化酶基因的克隆与序列分析被引量：3
- 2010年
- 文蛤(Meretrix meretrix)是我国重要的滩涂养殖贝类之一,由于病害等原因,特别是红肉病的蔓延,文蛤增养殖业的发展受到严重制约。铜锌超氧化物歧化酶(Cu/Zn-SOD)是活性氧清除酶系中最重要的酶,在生物体内参与清除氧自由基,防御分子损伤和机体衰老等诸多生物事件。通过构建SMART全长cDNA文库和RACE的方法,克隆得到了文蛤胞内Cu/Zn-SOD(icCu/Zn-SOD)的全长cDNA序列。生物学软件分析表明,该序列全长为1383bp,5′UTR为45bp,3′UTR为876bp,开放阅读框长度为462bp,编码153个氨基酸,Cu原子分别与His46、His48、His63、His119配位,Zn则与His63、His71、His80和Asp83配位,半胱氨酸Cys57和Cys145之间形成唯一的链内二硫键。蛋白质结构中心是由8条反向平行的β折叠围成的圆桶状结构。文蛤icCu/Zn-SOD与紫贻贝等其它9种海洋贝类的Cu/Zn-SOD具有较高的同源性。
- 朱丹李宏俊高祥刚苏浩赫崇波
- 关键词：文蛤铜锌超氧化物歧化酶表达序列标签
- 基因文库构建及其在鱼类遗传研究上的应用被引量：8
- 2008年
- 综述了基因文库的类型以及鱼类基因文库的构建及其应用。通过构建cDNA表达文库不但可以保护濒危珍稀生物资源,而且可以提供构建分子标记连锁图谱的所用探针;cDNA文库的构建将在鱼类分子生物学方面起到更多的作用。
- 刘星仇雪梅高祥刚赫崇波
- 关键词：基因组基因文库CDNA文库鱼类
- 不同苗种来源的中国虾夷扇贝群体的遗传多样性分析被引量：3
- 2009年
- 虾夷扇贝(Mizuhopecten yessoensis)于1982年从日本引入中国并展开规模化养殖。由于引入的亲贝数目有限,使虾夷扇贝在人工育苗养殖过程中群体遗传多样性水平下降。本研究使用7对微卫星引物对日本原种贝(♀、♂)自交后的子代群体(RZ)、国内种贝(♀、♂)自交后的子代群体(DZ)、日本原种贝(♂)与国内种贝(♀)的杂交群体(ZH)和国内自然海区(中国旅顺月亮湾)天然繁殖群体(HC)4个不同的虾夷扇贝群体的遗传多样性进行了研究。实验结果表明,4个群体的平均有效等位基因数为3.2～3.8,平均期望杂合度为0.6718～0.7017,日本野生群体做为种贝繁殖的苗种(RZ)与中国养殖群体相比,遗传多样性水平较高,除了DZ群体外其他群体的遗传多样性并无显著的变化。
- 刘莹刘卫东李文姬鲍相渤张明李云峰高祥刚赫崇波
- 关键词：微卫星种质资源杂交
- 辽东湾斑海豹(Phoca largha)线粒体D-loop区异质型研究初探被引量：2
- 2009年
- 采用PCR技术和DNA克隆测序技术,随机测定了3头斑海豹mtDNA控制区(D-loop区)CSB-3上、下游1000 bp左右的序列,每头斑海豹任选14个克隆菌斑进行测序,结果所得序列均无重复,得到42个单倍型。结合GenBank已发表的斑海豹mtDNA控制区序列(Phoca largha,AM181031),通过ClustalX1.83、MEGA3.1和FastPCRv3.6等生物信息学软件进行序列比对,发现我国珍稀保护动物斑海豹个体内线粒体DNA(mtDNA)的控制区CSB-3之后存在异质型现象,且存在数目不等的串联重复序列。从分子水平进行了不同类型重复序列变化规律的研究,初探了mtDNA控制区异质型在斑海豹中的存在情况。
- 高祥刚孙凡越李云峰鹿志创韩家波赫崇波
- 关键词：斑海豹MTDNA控制区串联重复序列异质型
- 基于环境DNA宏条形码技术的辽东湾典型围海养殖池塘内水母多样性研究
- 2022年
- 研究使用环境DNA宏条形码技术(eDNA metabarcoding)检测辽东湾东北部河口区围海养殖池塘水母种类多样性,探索适用于水母种类物种鉴定和监测的新方法。利用环境DNA宏条形码技术,分别基于18S rDNA和COI宏条形码检测了辽东湾东北部河口区围海养殖池塘水母种类多样性,通过水样采集、过滤、eDNA提取、遗传标记扩增、测序与生物信息分析的环境DNA宏条形码标准化分析流程,从围海养殖池塘7个采样点中获得可检测的采样点数据。结果显示,基于18S rDNA宏条形码检测出8种水母种类,其中钵水母纲大型水母2种、水螅水母总纲小型水母6种;基于COI宏条形码技术共检测出19种水母种类,其中钵水母纲大型水母5种、水螅水母总纲小型水母14种;两种DNA条形码标记都显示养殖种类海蜇(Rhopilema esculentum)为优势种。研究结果表明,环境DNA宏条形码技术作为一种新兴的生物多样性监测手段可用于快速检测水母种类多样性,在水母类物种鉴定、监测及早期预警中有较大的应用潜能。
- 李玉龙鲍相渤李轶平周遵春付杰高祥刚陈百灵李云峰
- 关键词：水母
- 一种刺参养殖装置
- 本实用新型公开一种刺参养殖装置，包括框架、附着板和网箱，框架和附着板位于网箱内，框架和网箱活动连接，框架与附着板连接，附着板垂直于框架，附着板并列排布。框架为起到漂浮作用的塑料框架，支撑整个装置漂浮于水面。这是一种结构简...
- 苏浩赫崇波高磊高祥刚李云峰鲍相渤
- 文献传递
- 文蛤养殖群体和野生群体遗传多样性的AFLP分析被引量：24
- 2008年
- 应用AFLP标记技术对辽宁和山东沿海文蛤（Meretrix meretrix）养殖群体和野生群体的遗传多样性进行分析。采用7对AFLP引物组合对5个群体（3个野生群体，2个养殖群体）150个个体进行扩增，共得到364个的位点。5个群体内的多态位点比例为84．3945％～87．6465％，总多态位点比例为99．6300％。群体的Nei’s基因多样性指数（H）为0．2301～0．2634；群体的Shannon多样性指数为0．3617～0．4248，群体间的遗传距离为0．0394～0．1609，群体内个体间的遗传距离为0．2592～0．5360。辽宁大洼野生群体和山东河口野生群体的多态位点比例、Shannon多样性指数和群体内遗传距离均高于辽宁盘山和辽宁庄河养殖群体，辽宁庄河野生群体的遗传多样性处于中等水平。用UPGMA方法构建的群体系统进化树显示，辽宁庄河野生群体单独成为一支，辽宁大洼野生群体与庄河养殖群体聚到一起，辽宁盘山养殖群体与山东野生群体聚到一起，但是用这5个群体的150个个体进行的聚类结果显示，所有个体基本是随机交叉聚类，不能形成明显的类群分支。分子变异分析（AMOVA）表明，文蛤群体94．04%的变异来源于群体内，群体间的变异仅占5．96％。以上结果表明，文蛤群体内遗传多样性非常丰富，群体间相似性较大，且存在较强的基因交流。[中国水产科学，2008，15（2）：215-221]
- 赫崇波丛林林葛陇利刘卫东周遵春高祥刚
- 关键词：文蛤AFLP
- 仿刺参线粒体全基因组序列结构及比较研究被引量：6
- 2012年
- 利用已构建的仿刺参cDNA文库得到的线粒体DNA(mtDNA)相关基因序列设计扩增引物,测定了大连仿刺参线粒体基因组全序列,并对其进行了基因构成和进化分析。仿刺参线粒体基因组序列长16 109bp,其基因构成与其他后口动物基本一致,包括37个基因(2个rRNA基因、22个tRNA基因和13个蛋白质编码基因)和3个主要的非编码区。在其37个基因中,ND6、tRNASer(AGN)、tRNAGln、tRNAAla、tRNAVal、TrnaAsp位于L链上,其余均位于H链上。在13个蛋白质编码基因中,除ND1的起始密码子为GTG外,其余均以ATG作为起始密码子;除Cytb以"T"作为终止密码子外,其他蛋白质基因均具有完全的终止密码子,且在已知的棘皮动物线粒体蛋白质基因中,部分基因的起始和终止密码子表现出一定的纲内特异性。比较分析了大连、青岛、威海仿刺参线粒体基因组,三者的基因组成和排列相同,碱基组成相近,蛋白质编码基因的起始和终止密码子完全一致,但存在核苷酸和氨基酸序列的差异。三者的控制区序列存在多个插入/缺失和SNP位点。根据COI、Cytb和ND4计算了三者之间的遗传距离为0.006～0.018,遗传距离分析和系统进化关系分析都显示青岛仿刺参和威海仿刺参的关系较大连仿刺参更近。
- 李云峰李梦遥王健高祥刚赫崇波周遵春杨爱馥
- 关键词：仿刺参线粒体DNA线粒体基因组单核苷酸多态性系统进化
