冯继东
- 作品数:8 被引量:78H指数:3
- 供职机构:北京农业大学更多>>
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- 海南快生根瘤菌I66的部分16S rRNA序列测定被引量:3
- 1994年
- 与豆科植物共生固氮的根瘤菌目前有4个属、10个种.包括Rhizobium(6个种),Sinorhizobium(2个种),Azorhizobium(1个种)和Bradyrhizobium(1个种).其中多数是近年来采用现代分类技术分析后建立的,而且新的类群还在不断被发现.在以前的根瘤菌数值分类及DNA-DNA杂交研究中,我们确定了海南慢生型根瘤菌属于大豆慢生根瘤菌种(B.japonicum).而海南快生型根瘤菌的分类地位则较为分散.其中一些菌株属于已知各根瘤菌种,另有4株银合欢根瘤菌和13株来自不同寄主的菌株分别构成具有独立的分类地位的两个菌群(第2群和第4群)(待发表).为了进一步明确它们的分类地位,我们依据国际系统细菌学委员会根瘤菌分委员会的建议,利用Young等建立的聚合酶链反应(PCR)及测序技术,对第4群的代表菌株166的部分16SrRNA基因片段进行了扩增和测序.
- 汪恩涛李英波阎大来冯继东陈文新
- 关键词:根瘤菌
- 枯草芽孢杆菌amy-3突变是sacQ基因失活造成的证据(简报)
- 1995年
- amy-3基因突变是美国 Stephen Ortlepp 博士在枯草芽孢杆菌菌株 SO113中发现的一种突变,它使 SO2113菌株不能产生有活性的淀粉酶。在当时已存在另外两种突变,它们也使淀粉酶基因失活。按照发现的先后,Stephen Ortlepp 的发现是第三个突变点。当时并不知道这个突变是什么性质,不能确切说明 amy-3是属于基因缺失、倒转或外来 DNA 插入。我们在实验中发现,这个突变实际上不是淀粉酶基因本身有什么变化,而是 sacQ 基因变化造成的。sacQ 基因是在芽孢杆菌属中普遍存在的一个基因。
- 任立明冯继东陈永福
- 关键词:枯草芽孢杆菌
- 一种中国发生的真菌传小麦花叶病毒RNA-13'末端核苷酸序列分析被引量:27
- 1995年
- 以采自河南的真菌传小麦花叶病毒(FWMV-C)为材料,抽提病毒RNA,合成互补DNA(cDNA)。对杂交筛选所得cDNA克隆进行亚克隆及序列分析,结果表明,亚克隆pGSI含有一个长度为891个核苷酸的不完整开放阅读框架(ORF)和长度为258个核苷酸的3'末端非编码区(NTR),并带有Poly(A)尾序。此段序列与大麦黄花叶病毒(BaYMV)及法国报道的一种小麦梭条花叶病毒(WSSMV-F)的RNA-13'末端分别具有67.6%和69.9%的同源性。由所测序列编码区(1-891nt)可推导产生296个氢基酸,并与WSSMV-F及BaYMV外壳蛋白氨基酸序列分别具有75.9%和71%的同源性。此结果表明,FWMV-C为另外一种不同于WSSMV-F的大麦黄花叶病毒组(Baymovirus)病毒,所测基因组片段应为RNA-13'末端序列,其中可能包括了病毒全长外壳蛋白编码区域。
- 于嘉林晏立英冯继东李大伟蔡祝南刘仪
- 关键词:小麦花叶病毒RNA核苷酸
- 猪FSHβ亚基基因5′端调控区的PCR克隆测序及变异分析被引量:39
- 1996年
- 通过PCR扩增了包括二花脸猪、梅山猪、约克夏猪、香猪、长白猪5个品种卵泡刺激素(FSH)β亚基基因5′端调控区片段,其中二花脸猪及约克夏猪扩增片段为(+3~-1000)1003bp,梅山猪、香猪、长白猪扩增片段为(+3~-493)496bp,并把其分别克隆在pGEM-3Zf(+)载体的SmaI位点上。测序结果表明二花脸猪、长白猪、约克夏猪之间有几个碱基变化,发现一微卫星位点,即梅山猪与香猪在-360位置多出4个AT重复,对这些变异作了进一步分析。
- 赵要风李宁陈永福冯继东吴常信
- 关键词:FSHΒ亚基基因PCR家畜繁殖率
- 16SrRNA基因测序确定根瘤菌的系统发育被引量:7
- 1995年
- 采用聚合酶链反应和DNA测序技术分析了两个新根瘤菌群的代表菌株的部分16SrRNA基因序列,并对所得序列进行了聚类分析。在系统发育树状图中,菌株sh22623所代表的根瘤菌群与菜豆根瘤菌、豌豆根瘤菌及发根土壤杆菌等构成一个亚群,另一个菌群的代表菌株sh19312与土壤杆菌的3个种构成一亚群。这些结果初步确定了两菌群的系统发育地位,并揭示了根瘤菌与土壤杆菌两属间进化上的密切关系。
- 汪恩涛曲春枫冯继东牛天贵陈文新
- 关键词:根瘤菌系统发育基因测序
- 原噬菌体PBSX阻遏基因及其温度敏感型等位基因的克隆分析被引量:1
- 1995年
- 本研究利用聚合酶链式反应技术,成功地克隆了枯草芽孢杆菌缺陷型原噬菌体PBSX阻遏基因及其温度敏感型等位基因。核苷酸序列分析发现,野生型及其温度敏感型阻遏基因之间的碱基变异较大,但却存在几乎完全相同的开放读框,尤其是开放读框orfⅠ,可能编码着113个氨基酸的阻遏蛋白,并且还推定了开放读框的启动区和核糖体结合位点。通过互补实验,证实了野生型阻遏基因的产物能够抑制温度诱导PBSX原噬菌体,表明克隆的基因有着正常的生物活性。
- 李宁陈永福冯继东
- 关键词:噬菌体
- 枯草芽孢杆菌amy-3基因突变是sacQ基因失活造成的证据被引量:1
- 1995年
- amy-3是枯草芽孢杆菌的一个基因突变类型,它造成产淀粉酶的表型丧失。本实验初步证明,克隆的 sacQ 基因转入 amy-3枯草芽孢杆菌菌株 SO113后,可以恢复其淀粉酶活性。表明这个突变没有使淀粉酶结构基因发生改变,突变可能发生在调控基因。
- 任立明冯继东陈永福
- 关键词:枯草芽孢杆菌基因
- 华癸根瘤菌的系统发育地位
- 1994年
- 16S rRNA 序列测定是细菌分类学的基本方法之一,其序列差异是确定细菌属间及属上系统发育关系的主要标准。本文根据国际系统细菌学委员会根瘤菌分委员会的建议,采用聚合酶链反应扩增了华癸根瘤菌(Rhizobium huakuii)模式菌株103的16S rRNA 基因中约260个碱基的一个片段,并对其进行了序列测定。所得序列与其他已知根瘤菌种、属的相应片段进行了比较。结果表明,华癸根瘤菌与豌豆根瘤菌和苜蓿根瘤菌两种及与其他属的碱基差异在6.9%~14.1%(17~35个碱基),相当于根瘤菌科内已知属间的差异。结合表型特征,我们认为该种可能代表了根瘤科的一个新属。
- 李英波汪恩涛冯继东陈文新
- 关键词:根瘤菌RRNA序列系统发育