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吴玉乾

作品数:5 被引量:18H指数:3
供职机构:重庆大学生命科学学院更多>>
发文基金:化学生物传感与计量学国家重点实验室开放基金中国烟草总公司科技项目重庆市应用基础研究项目更多>>
相关领域:农业科学理学医药卫生更多>>

文献类型

  • 4篇期刊文章
  • 1篇科技成果

领域

  • 3篇农业科学
  • 1篇医药卫生
  • 1篇理学

主题

  • 2篇烟草
  • 1篇支持向量
  • 1篇支持向量机
  • 1篇植物
  • 1篇生物合成
  • 1篇生物合成途径
  • 1篇生物信息
  • 1篇生物信息学
  • 1篇生物信息学分...
  • 1篇生物序列
  • 1篇偏最小二乘
  • 1篇偏最小二乘法
  • 1篇禽流感
  • 1篇禽流感病
  • 1篇禽流感病毒
  • 1篇转录
  • 1篇转录因子
  • 1篇线性判别分析
  • 1篇向量
  • 1篇向量机

机构

  • 5篇重庆大学
  • 1篇第三军医大学
  • 1篇湖南大学
  • 1篇西南大学
  • 1篇宜宾学院

作者

  • 5篇吴玉乾
  • 3篇舒茂
  • 3篇杨善彬
  • 3篇梅虎
  • 3篇李志良
  • 2篇张巧霞
  • 2篇周鹏
  • 2篇张梦军
  • 2篇田菲菲
  • 2篇梁桂兆
  • 2篇周原
  • 2篇杨力
  • 2篇夏庆友
  • 1篇仝建波
  • 1篇何留
  • 1篇孙家英
  • 1篇程廷才
  • 1篇仇亮加
  • 1篇夏之宁
  • 1篇王贵学

传媒

  • 1篇高等学校化学...
  • 1篇中国烟草科学
  • 1篇中国科学(B...
  • 1篇烟草科技

年份

  • 1篇2014
  • 1篇2010
  • 1篇2008
  • 2篇2007
5 条 记 录,以下是 1-5
排序方式:
植物类萜代谢及其在烟草中的研究进展被引量:3
2010年
类萜是从植物中分离出的一类类异戊二烯物质,其中挥发萜类物质直接影响着植物的芳香品质。对烟草类萜生物合成及其代谢调控的最新研究进展进行了综述,探讨了代谢过程中的关键酶基因及操纵类萜生物合成途径以提高产量的几种可能的策略,展望了通过基因工程改良烟草香气品质的可行性和重要性。
牛维环谢小东程廷才吴玉乾夏庆友
关键词:烟草生物合成途径
生物序列表征体系构建及定量结构功能预测研究
梁桂兆李志良杨善彬周原周鹏梅虎舒茂田菲菲杨力张巧霞张梦军吴玉乾
随着人类基因组计划的实施与完成,生物序列(肽、蛋白质、核酸等)数目呈“指数”增长,在当今全球每天测出以千万计数碱基对核酸序列,从中翻译出以十万计的可能蛋白质序列时代,已不可能用实验办法逐一确定其结构和功能。鉴于此,近年对...
关键词:
关键词:生物序列
烟草ABF转录因子基因的克隆与生物信息学分析被引量:4
2014年
为获得烟草AREB/ABF(ABA响应元件结合蛋白/ABRE结合因子)家族转录因子基因序列,进一步提高烟草的抗渗透胁迫能力,通过同源比对和RT-PCR技术,从烟草品种红花大金元中克隆到烟草AREB/ABF家族转录因子NtABF1(GenBank登录号为KF736849),NtABF2(GenBank登录号为KF736850)基因编码序列,并进一步利用生物信息学分析软件对这两个转录因子的蛋白理化性质、高级结构和生物学功能进行了预测。结果表明:NtABF1基因开放阅读框(Open Reading Frame,ORF)长999 bp,编码332个氨基酸,蛋白分子量36.45 kDa,等电点9.04;NtABF2基因ORF长1305 bp,编码433个氨基酸,蛋白分子量46.92kDa,等电点9.35。NtABF1和NtABF2均为含有BRLZ(Basic Region and Leucine Zipper)保守结构域的亲水蛋白,不含信号肽与跨膜结构。其高级结构均以α螺旋和无规则卷曲为主,β转角和延伸链含量较少。在亚细胞水平上,NtABF1和NtABF2均定位于细胞核。磷酸化位点分析表明,两蛋白均含有丝氨酸,苏氨酸和酪氨酸等激酶识别位点。进化分析和多序列比对结果表明,NtABF1与AtAREB3的进化关系最近,序列相似性达54.49%;NtABF2与SlAREB1,StABF1和StABF的亲缘关系较近,序列相似性分别为83.63%,83.52%和83%。功能预测结果显示,NtABF1和NtABF2均为转录调控因子。
杨玲吴玉乾谢晓东王根洪夏庆友
关键词:烟草分子克隆生物信息学
支持向量机和线性判别分析用于禽流感病毒编码蛋白识别被引量:3
2007年
以支持向量机(SVM)和线性判别分析(LDA)对200条禽流感病毒、100条B型流感和100条C型流感病毒蛋白共400条为训练集样本,从表征序列的200个整体与局部变量中以逐步(stepwise)方法选取24个变量作为LDA模型的输入建立线性识别模型,病毒蛋白总识别率达99.8%,留一法交互检验总识别率为99.4%.从原始200变量中经主成分分析得16个主成分作为SVM的输入,以径向基核函数(RBF)SVM建立非线性识别模型,病毒蛋白总识别率为99.8%,留一法交互检验总识别率为99.2%.以100条禽流感、50条B型流感和50条C型流感病毒编码蛋白质共200条为测试集样本,得LDA模型,对其总识别正确率为95.4%,SVM模型对其总识别正确率为96.5%.识别结果表明,两个模型都可较好识别禽流感病毒蛋白,并且SVM对禽流感病毒蛋白的识别结果优于LDA.
梁桂兆陈泽聪杨善彬梅虎周原舒茂杨力杨胜喜郑小林陈国华周鹏田菲菲廖春阳吴世容李根容李德静何留甘孟瑜高剑坤陈国平王贵学龙莎景举华曾晖张巧霞张梦军杨娟仝建波王娇娜刘永红李波仇亮�
关键词:禽流感病毒
氨基酸描述子VHSEH用于多肽定量序效建模研究被引量:8
2008年
从20种天然氨基酸的171个物化性质出发,按照疏水、立体和电性特征及氢键贡献将其分类后,分别进行主成分分析,得到一个新描述子VHSEH(Principal component score vector of hydrophobic,steric,electronic properties and,hydrogen bonds contributions).对后叶催产素的结构进行了表征,并以偏最小二乘法及D-优化划分样本建立了PLS定量序效关系模型,得到复相关系数R2分别为0.958和0.957,Q2分别为0.903和0.845,约高于VHSE描述子模型值;对抗菌肽进行了结构表征,建立了PLS和OSC-PLS模型,其R2分别为0.84和0.995,Q2分别为0.546和0.926,较SZOTT描述子结果好;对58个血管紧张素转化酶抑制剂进行QSAM研究,得到R2,Q2及RMS分别为0.877,0.838和0.361.研究结果表明,VHSEH描述子信息量大,物化意义明确,结果更易解释.
杨善彬夏之宁舒茂梅虎吕凤林张梅吴玉乾李志良
关键词:偏最小二乘法
共1页<1>
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