孙大光
- 作品数：7 被引量：26H指数：2
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- 发文基金：福建省农业科学院科技创新团队建设基金公益性行业(农业)科研专项福建省省级财政专项更多>>
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- 柑橘黄龙病株不同部位内生细菌群落结构的多样性被引量：16
- 2011年
- 采用PCC(Pearson correlation coefficient)、系统聚类和多样性指数研究了柑橘黄龙病(citrus huanglongbing,HLB)植株不同部位叶片、枝条及其根部内生细菌的相互关系及其群落结构多样性。结果表明,从供试柑橘中分离得到26株内生细菌(叶片10株,枝条14株,根部2株)隶属于10个属19个种。Nested-PCR结果显示,柑橘植株不同空间叶片中,黄龙病病原的阳性检出率为58.3%。用LSD法比较显示,柑橘内生细菌在不同器官的分布量大小依次为根>叶>枝条。上、中、下不同部位叶片和枝条内生细菌分布量差异不显著,而东、西、南、北不同方位的叶片和枝条内生细菌分布量差异显著(P<5%)。柑橘内生细菌之间的PCC分析表明,Bacillus pumilus和Bacillus sp.与柑橘黄龙病病原菌呈显著负相关,Bacillus sp.和Bacillus pumilus与Bacillussubtilis呈显著正相关。Bacillus brevis和Escherichia hermannii与Bacillus vesiculariss存在显著正相关。对柑橘不同器官内生细菌的PCC分析表明,同种器官的内生细菌之间呈正相关,不同器官的内生细菌之间呈负相关。以内生细菌在各器官的分布量为指标分析不同器官之间的相关性,结果表明,叶片与枝条呈正相关,PCC为0.55,叶片与根部、枝条与根部均呈负相关,PCC分别为-0.19和-0.13。16S rDNA序列聚类分析表明,柑橘内生细菌可分为两大类,第Ⅰ大类为革兰氏阳性菌,第Ⅱ大类为革兰氏阴性菌。第Ⅰ大类又可以分为芽孢杆菌属和短小杆菌属两个亚类,第Ⅱ大类也可以分两个亚类。对柑橘黄龙病病原与叶片内生细菌进行聚类分析,可以分为三类,第Ⅰ类特征为内生细菌存在所有部位的叶片;第Ⅱ类特征为内生细菌与黄龙病病原菌存在负相关性;第Ⅲ类特征为内生细菌只存在特定部位叶片。当马氏距离为27.23时,可将柑橘黄龙病内生细菌群落结构聚为3类,第Ⅰ类特点是在不同部位叶片均有分布,为完全分布类型,且�
- 刘波郑雪芳孙大光阮传清范国成段永平
- 关键词：柑橘黄龙病内生细菌多样性群落结构
- 柑橘黄龙病植株内生菌PLFAs多态性研究被引量：10
- 2012年
- 采用磷脂脂肪酸(PLFAs)生物标记法,分析柑橘黄龙病株不同部位及健康状态叶片内生菌群落结构。结果表明,从柑橘黄龙病植株叶片共检测到42种PLFAs,其中完全分布的生物标记有9种,不完全标记有33种。对PLFAs进行聚类分析表明,柑橘黄龙病株不同部位叶片内生菌PLFAs可以分为2大类群,类群I特点为脂肪酸生物标记均为不完全分布,类群Ⅱ的特点为脂肪酸生物标记在被检测的柑橘黄龙病植株的大部分叶片中均有分布。柑橘黄龙病株不同部位及健康状态叶片内生菌PLFAs组成及含量存在差异。总体来看,不同朝向中,东面叶片内生菌PLFAs含量最大;不同高度中,下部叶片内生菌PLFAs含量最大;不同健康状态中,带有黄龙病原叶片内生菌PLFAs含量比健康植株叶片更大。此外,不同朝向中,南面叶片真菌/细菌值最大,革兰氏阳性菌和革兰氏阴性菌的比值(G+/G)较大;不同高度叶片中,真菌/细菌值差异不明显,G+/G值差异明显,上部最大,下部次之,中部最小;不同健康状态中,健康叶片的真菌/细菌值高于黄龙病株叶片。对柑橘黄龙病株不同部位及健康状态叶片内生菌多样性研究表明,不同朝向和不同健康状态的叶片内生菌种群多样性指数差异显著,不同高度的叶片内生菌种群多样性指数差异不显著。主成分分析表明,主成分1和主成分2基本上能把柑橘黄龙病株不同朝向叶片内生菌种群区分开来。对柑橘黄龙病株不同部位及健康状态叶片进行聚类,结果表明带有黄龙病原的叶片聚为一类,不带黄龙病原的健康叶片分聚为两类,其中,不同朝向的叶片分聚在不同的亚类群中,表明柑橘黄龙病株内生菌PLFAs分布与叶片健康状态和叶片朝向均有紧密关系,与叶片健康状态关系更为密切。
- 郑雪芳刘波孙大光朱育菁段永平夏育陆阮传清肖荣凤
- 关键词：柑橘黄龙病植物内生菌磷脂脂肪酸
- 柑橘黄龙病原16SrDNA序列异质性分析
- 孙大光郑雪芳刘波阮传清范国成Hall D.段永平
- 关键词：柑橘黄龙病巢式PCR系统进化分析
- 柑橘黄龙病原16SrDNA序列异质性分析
- 本研究采用Nested-PCR技术检测柑橘不同部位叶片黄龙病病原携带情况,通过DNA测序构建系统发育树比较不同地区柑橘黄龙病病原菌之间的进化关系,并分析不同地区的柑橘黄龙病病原菌16S rDNA的序列差异性。结果表明:阳...
- 孙大光郑雪芳刘波阮传清范国成Hall D.段永平
- 关键词：柑橘黄龙病巢式PCR系统进化分析
- 文献传递
- 柑橘黄龙病植株内生细菌群落结构多样性的研究
- 本文主要研究顺昌柑橘黄龙病发病情况,通过PCC（Pearson correlation coefficient）分析柑橘内生细菌与柑橘黄龙病病原之间的相关性,并采用PLFAs （phospholipid fatty ac...
- 孙大光
- 关键词：柑橘黄龙病内生细菌多样性群落结构PLFAS
- 柑橘黄龙病株不同部位内生细菌群落结构的多样性
- 采用磷脂脂肪酸((PLFAs)方法，分析同一果园台湾软枝杨桃(20年树龄)和荔枝乌叶品种(巧年树龄)种植区的土壤微生物群落结构.土壤样品采自水平距离植株0.5m，1.0 m，1.5 m，离地面10-20cm的土层。结果表...
- 刘波郑雪芳孙大光阮传清范国成Hall D.段永平
- 关键词：柑橘黄龙病内生细菌多样性群落结构
- 柑橘黄龙病病原菌的鉴定及16S rDNA序列分析被引量：1
- 2011年
- 采用Nested-PCR技术检测顺昌果园红心柚树中柑橘黄龙病病原的携带情况,通过黄龙病病原菌16S rDNA测序和构建系统发育树比较不同类型柑橘黄龙病原菌之间的进化关系,采用特异引物扩增16S rDNA片段鉴别不同黄龙病病原菌,结合限制性内切酶酶切确定该红心柚园黄龙病病原的类型,并分析不同类型柑橘黄龙病病原16S rDNA序列差异性。结果表明:所取的12株红心柚树叶片样品中有7株树的叶片中检测出黄龙病病原,黄龙病病原的阳性检出率为58.33%,其中4个为显性性状,3个为隐性性状。柑橘黄龙病病原菌16SrDNA进化分析及限制性内切酶XbaI酶切结果表明,顺昌柑橘黄龙病病原菌属于亚洲型。不同类型柑橘黄龙病病原菌16SrDNA的序列差异性分析表明,亚洲种与非洲种的差异性为2.75%,非洲种与美洲种的差异性为3.90%,亚洲种与美洲种的差异性为3.44%。
- 孙大光郑雪芳刘波阮传清夏育陆段永平
- 关键词：柑橘黄龙病RDNA系统进化分析
