施丽梅 作品数:12 被引量:35 H指数:4 供职机构: 中国科学院南京地理与湖泊研究所湖泊与环境国家重点实验室 更多>> 发文基金: 江苏省自然科学基金 国家自然科学基金 国家重点基础研究发展计划 更多>> 相关领域: 环境科学与工程 医药卫生 生物学 更多>>
与微囊藻胞外多糖降解相关的微生物菌群分析 被引量:5 2009年 从铜绿微囊藻培养液中提取胞外多糖,化学分析显示其为含8.3%蛋白质的酸性杂多糖.以胞外多糖为碳源接种自然水体的菌群进行富集培养,分析胞外多糖的微生物降解过程及降解菌的组成.结果表明,接种太湖水华期微生物富集菌群后,多糖立即开始被降解,大约在18d后多糖降解过程显著减慢,37d后仍有一部分多糖未能被降解.这些结果说明在自然界中微囊藻胞外多糖是可以被微生物降解的.比较不同水体的菌群对多糖的降解能力后显示,降解菌群只存在于微囊藻水华暴发的阶段.变性梯度凝胶电泳(DGGE)结果显示在整个降解过程中,降解菌群的组成未发生显著变化.对DGGE条带中的DNA片段进行序列分析和系统发育分析表明降解菌群包含以下几类:鞘氨醇单胞菌属(Sphingomonas)3个,褐螺菌属(Phaeospirillum)1个,假单胞菌属(Pseudomonas)1个,红环菌科(Rhodocyclaceae)1个,Hylemonella(无译名)1个,分枝杆菌属(Mycobacterium)1个. 蔡元锋 施丽梅 李朋富 邢鹏 于洋 孔繁翔关键词:微囊藻 胞外多糖 降解 变性梯度凝胶电泳 菌群 γ-亚麻酸对实验性大鼠动脉粥样硬化形成初期的影响 被引量:5 2008年 目的:探讨γ-亚麻酸(GLA)对实验性大鼠动脉粥样硬化形成初期的影响及其作用机制。方法:采用GLA作为受试物,将60只健康成年雄性SD大鼠,随机分为正常组、模型组、阳性药洛伐他汀组0.9 mg.kg-1.d-1、多烯康组250 mg.kg-1.d-1、GLA高、低剂量组(375,187.5 mg.kg-1.d-1)。光学显微镜检测HE染色的主动脉壁病理改变,测定TC,TG,HDL-C,LDL-C含量。结果:GLA可在一定程度上抑制高脂饲料诱导的SD大鼠主动脉血管壁病理变化,降低SD大鼠血清TC,TG,LDL-C水平,升高血清T-AOC活力,降低HL,LPL的含量,NOS活力降低,NO含量下降。结论:GLA可以有效调节血脂,改善血管病变,该作用与其调节脂蛋白脂酶、肝脂酶活性,影响NO及其合酶的形成和表达,提高机体总抗氧化能力相关。 施丽梅 葛海涛 孔秀芹 蔡元锋 李朋富 刘志礼 孔令东关键词:Γ-亚麻酸 动脉粥样硬化 脂酶 一氧化氮 抗氧化 蓝藻衰亡窗口期的界定方法 本发明提供了一种蓝藻衰亡窗口期的界定方法,全年逐月从湖泊原位取样,对野外湖水样本中的微囊藻样品和室内处于对数生长期的纯培养微囊藻样品进行RNA提取纯化,测定<I>nblA</I>基因相对表达量,并测定野外湖水样本中溶解性... 史小丽 于洋 陈开宁 施丽梅温度对铜绿微囊藻群体培养体系中细菌群落组成及稳定性的影响 被引量:2 2021年 微囊藻藻际细菌影响微囊藻的生长及其水华的生消.然而特定微囊藻群体中藻际细菌群落组成对温度变化的响应规律仍不清楚.本文把一株从太湖分离得到的群体铜绿微囊藻,置于不同温度(15、20、25和30℃)下进行培养,分析各培养体系中不同粒径附生或游离细菌群落组成的异同.结果表明:温度显著影响微囊藻群体(>20μm)附生、单细胞小群体(3~20μm)附生和游离(0.2~3μm)细菌群落的组成(PERMANOVA,P<0.01),Sphingomonadales、Pseudomonadales和Cytophagales分别是3组细菌群落中的最优势菌目,相对丰度分别为21.35%、19.74%和33.44%.在3组细菌群落中都存在一些核心优势细菌类群,其丰度相对稳定,对温度变化不敏感.其中在微囊藻群体附生细菌群落中,优势菌属Brevundimonas和OPB56在20~30℃之间培养时其相对丰度较为稳定;单细胞小群体附生细菌群落中的核心优势菌属Mariniradius相对丰度也是在20~30℃之间较为稳定,而Gemmobacter相对丰度在4种温度下均较为一致;游离细菌群落中的核心优势菌属Porphyrobacter相对丰度在20~30℃之间时也相对稳定.另外,在15℃时,单细胞小群体附生和游离细菌群落的多样性都达到最高,总体细菌群落物种相关性网络复杂度最高,但合作性关联最弱.该研究结果对于深入了解微囊藻群体的藻菌关系有重要意义. 方道艳 施丽梅 李朋富 蔡元锋 张民 史小丽 吴庆龙 于洋关键词:细菌群落 温度 附生细菌 太湖 水华初期蓝藻颗粒有机物在不同菌群作用下分解释放营养盐的过程研究 被引量:8 2017年 蓝藻水华为富营养化湖泊制造了大量有机物,这些藻源有机物的分解影响了水体中的营养盐循环。通过室内模拟附生细菌(A),附生细菌与游离细菌(AF),及附生细菌与底泥细菌(AS)三个实验组作用下蓝藻颗粒有机物(POM)在黑暗条件下长期(132天)分解过程,监测颗粒态有机碳(POC)、氮(PON)、磷(POP)、硝酸盐(NO_3~–)、磷酸盐(PO_4^(3–))、溶解性有机碳(DOC)等浓度的变化,揭示蓝藻颗粒有机物的分解和营养盐释放规律。结果表明,在整个降解过程中,叶绿素a(Chla)浓度在培养第28天时降低至最低水平,在三个实验组中Chla分解速率随时间的变化而增大,平均分解速率为:(0.15±0.06)mg/(L·d)。而POC,PON,POP的分解大致分为两个阶段,快速分解大都在28天以内,而后为缓慢降解,且分解速率明显低于Chla,平均分解速率分别为(0.03±0.03)mg/(L·d),(0.04±0.05)mg/(L·d),(0.03±0.02)mg/(L·d),且呈现随着时间变化而降低的趋势。三者之间及其在三个实验组之间的分解速率并无显著性差异。A、AF、AS三个实验组中,POC的最大分解量分别为82.30%、81.90%、63.14%;PON的最大分解量分别为92.85%、91.68%、73.27%;POP的最大分解量分别为93.50%、91.25%、70.11%,表明了POC的转化量小于PON和POP,AS实验组中POM的分解量最低,说明了底泥微生物对藻源有机物具有较低的分解量。此外,随着藻源有机物的降解,水体中NO_3~–、PO_4^(3–)、DOC的最大值出现在Chla完全降解之后,分别是初始值的2.36倍、2.13倍、2.64倍,说明了藻源颗粒有机物的分解将显著增加水体中的营养盐。 黄亚新 张小倩 张小倩 孔繁翔 孔繁翔 卢亚萍关键词:蓝藻水华 营养盐 浅水湖泊越冬蓝藻种源清除窗口期的确定方法 本发明提供了一种浅水湖泊越冬蓝藻种源清除窗口期的确定方法,其特征在于:采用蓝藻在复苏过程中有三个关键功能基因:藻蓝蛋白合成基因(PC‑IGS)、伪空胞合成基因(gvpC)和藻毒素合成基因(mcyA),这三个基因的表达与蓝... 史小丽 于洋 张民 阳振 陈开宁 施丽梅文献传递 太湖梅梁湾水华微囊藻基因型组成和产毒微囊藻丰度的变化 被引量:11 2009年 采用基于ITS序列的PCR-DGGE方法分析了太湖梅梁湾水华暴发过程中(6-11月)微囊藻的不同基因型组成的变化,同时利用针对微囊藻毒素合成酶基因mcyA和微囊藻特异性的16SrDNA部分核苷酸序列的引物,应用实时荧光定量PCR方法(qRT-PCR)分析水华样品中产毒微囊藻与总微囊藻的量,通过两者的比值反映产毒微囊藻丰度.结果表明,在发生水华的不同时期,微囊藻的基因型组成发生了变化,其中以8月末、9月和10月的基因型最多,基因型M5和M10存在于整个水华发展过程中.共检测到12种主要的基因型,每个基因型在水华的不同时期所占的比例互不相同.实时荧光定量PCR结果显示从6月到10月,产毒微囊藻的丰度呈增大的趋势,从0.75%增加到32.16%,而11月产毒微囊藻的丰度显著下降. 施丽梅 蔡元锋 杨华林 李朋富 孔繁翔 孔令东关键词:DGGE 水华 蓝藻衰亡窗口期的界定方法 本发明提供了一种蓝藻衰亡窗口期的界定方法,全年逐月从湖泊原位取样,对野外湖水样本中的微囊藻样品和室内处于对数生长期的纯培养微囊藻样品进行RNA提取纯化,测定<I>nblA</I>基因相对表达量,并测定野外湖水样本中溶解性... 史小丽 于洋 陈开宁 施丽梅文献传递 微囊藻群体总RNA提取方法的比较 被引量:1 2018年 微囊藻群体富含多糖类物质是影响微囊藻RNA提取的关键因素.为了获得高质量的微囊藻群体总RNA,对比分析4种针对多糖含量较高的方法——方法 1 PGTX-bead法、方法 2 CTAB-bead法、方法 3 Fast RNAPro Blue Kit和方法 4RNeasy Mini Kit对微囊藻群体总RNA的提取效果.采用琼脂糖凝胶电泳检测微囊藻群体RNA的完整性,Nanodrop ND1000分光光度计检测RNA纯度及浓度,并采用q PCR检测DNA污染情况.结果表明,4种方法都能从微囊藻群体中提取获得RNA,并在去除DNA后都可以进行RT-PCR等后续实验.方法 1 PGTX-bead提取的RNA产量最高,纯度好,DNA污染小,成本低,适合从微囊藻群体中大量提取RNA;方法 2 CTAB-bead提取的RNA样品产量也较高,但DNA污染严重,适合需要同时提取DNA和RNA的样本;方法 3 Fast RNAPro Blue Kit和方法 4 RNeasy Mini Kit提取的RNA产量都较低,但方法 4操作简单,耗时短,所检测目的基因的相对表达量较高,更适合从少量的微囊藻群体中提取总RNA. 高胜玲 黄亚新 黄亚新 卢亚萍 施丽梅 孔繁翔关键词:RNA提取 多糖 微囊藻伪空胞gvpA、gvpC与其物理性状之间相关性分析 被引量:2 2011年 为了探究gvpA基因拷贝数和gvpC基因内保守重复序列的作用,利用3株微囊藻包括铜绿微囊藻FACHB910、FACHB930以及惠氏微囊藻FACHB929为材料;测量了伪空胞长度、伪空胞直径、相对气体含量、表观压强、临界压强和细胞膨压等性状,分析了gvpA基因拷贝数目、gvpC基因内保守重复序列与这些性状之间的相关性.结果表明,gvpA基因拷贝数目与伪空胞相对气体含量呈极显著线性相关,相关系数为0.999;gvpA基因拷贝数目与伪空胞直径呈极显著负相关,相关系数为-0.861;gvpC基因内保守重复序列与伪空胞直径呈极显著正相关,相关系数0.911,与伪空胞相对气体含量、表观压强、临界压强呈极显著负相关,相关系数分别为-0.851、-0.999、-0.928.故推测:同一藻种内,gvpA基因拷贝数是影响伪空胞相对气体含量的主要因素;伪空胞的直径不仅受到gvpC基因内保守重复序列数量影响,而且还可能受到gvpA基因拷贝数调控. 张永生 孔繁翔 于洋 张民 史小丽 施丽梅关键词:微囊藻