李敬源
- 作品数:4 被引量:28H指数:2
- 供职机构:华南理工大学生物科学与工程学院更多>>
- 发文基金:国家自然科学基金更多>>
- 相关领域:环境科学与工程生物学农业科学更多>>
- 典型对虾养殖水体中参与硝化与反硝化过程的微生物群落结构被引量:20
- 2012年
- 【目的】本研究旨在分析典型虾塘养殖水体中参与氮循环关键过程的菌群多样性,为指导实际对虾养殖水体中NH 4+和NO 2-的微生物降解、水体氮素污染控制以及虾塘养殖氮素循环的有效管理提供科学依据。【方法】使用聚合酶链式反应及变性梯度凝胶电泳技术(Polymerase Chain Reaction-Denaturing Gradient GelElectrophoresis,PCR-DGGE)从8个不同地点的虾塘水样中确定代表性水样,以此为典型水样进行研究,构建了氨单加氧酶基因(amoA)、亚硝酸盐氧化还原酶基因(nxrA)、亚硝酸盐还原酶基因(nirS)的克隆文库。利用限制性片段长度多态性(Restriction Fragment Length Polymorphism,RFLP)技术将克隆文库进行酶切分析。【结果】通过序列多态性分析,表明amoA基因克隆文库中所有序列都属于变形杆菌门β亚纲(β-Proteobacteria),分别为亚硝化单细胞菌属(Nitrosomonas)(81%)和亚硝化螺旋菌属(Nitrosospira)(19%)2个属。nxrA基因克隆文库检测到α-Proteobacteria和δ-Proteobacteria两个亚纲,其中硝化杆菌属(Nitrobacter)是优势菌群,占整个文库的92%,仅有一个类群属于δ亚纲的脱硫杆菌科(Desulfobacteraceae)(8%)。nirS基因文库群落结构相对于amoA和nxrA基因文库较复杂,分别为α-Proteobacteria、β-Proteobacteria亚纲和Actinobacteria,序列分析表明,25%的类群为固氮弧菌属(Azoarcus),25%的类群为(Polymorphum),20%的类群为需氧去氮菌属(Thauera),10%的类群为(Sophophora),10%的的类群为链霉菌属(Streptomyces),5%的类群为(Brachymonas),5%的类群为(Ruegeria)。【结论】典型虾塘养殖水环境中氮素循环关键过程的菌群多样性丰富,其中亚硝化单胞菌属(Nitrosomonas)和硝化杆菌属(Nitrobacter)分别是此环境中主要的氨氧化作用推动者和亚硝酸盐氧化作用推动者,而在反硝化重要环节中,固氮弧菌属等多种菌群都起着推动作用。
- 李敬源林炜铁罗剑飞田国梁
- 关键词:PCR-DGGE克隆文库系统发育树
- 虾塘养殖水中氮素迁移酶基因的多样性分析及异养氨氧化细菌的筛选
- 氨氧化作用、亚硝酸盐氧化作用和反硝化作用是氮循环的三个关键过程,其中amoA基因、nxrA基因和nirS基因是这三个过程关键酶的编码基因。对虾养殖塘水体是一个复杂的生物硝化系统,分析虾塘养殖水体中参与氮循环关键过程的菌群...
- 李敬源
- 关键词:克隆文库系统发育树
- 对虾养殖水环境宏基因组Fosmid文库的构建被引量:2
- 2011年
- 采用包埋法提取大片段基因组DNA,通过低熔点琼脂糖酶法回收40kb左右的DNA,经补平磷酸化、与pCC2FOS载体连接、体外包装和转染EP1300-T1R,构建对虾养殖水环境Fosmid文库。对文库进行鉴定,该文库平均插入片段大小约35kh,共保存8000个克隆,包括了大概8×10^8个微生物细胞。用几丁质酶筛选平板对文库进行初步筛选,筛选到4个阳性克隆子。本试验构建Fosmid文库,初步获取了对虾养殖生态系统的微生物遗传信息,对于从虾池原位环境鉴定并筛选具有潜在益生作用的功能微生物意义重大。
- 李会琴林炜铁蔡小龙李敬源唐水水
- 关键词:养殖水体FOSMID文库几丁质酶
- 放线菌L74溶藻物质的分离及其溶藻特性被引量:6
- 2011年
- 为了得到溶藻物质并进行溶藻特性的研究,采用离心、乙醇沉淀和有机溶剂萃取的方法从发酵液中粗提得到溶藻物质,再通过硅胶吸附柱层析和透析进行精制,并采用试管试验法对其进行分析。研究溶藻物质的pH稳定性、热稳定性以及对藻类抗氧化酶系统的影响。该菌株的溶藻物质具有较大极性,且分子量小于3 kD;经化学法鉴定,基本确定为糖苷类物质、内酯类物质和萜类物质中的一种或几种的组合;具酸碱稳定性,但对热敏感,随着处理温度的升高,溶藻效果逐渐下降,当温度超过90°C处理1 h后,活性几乎全部丧失;会使藻细胞的丙二醛含量明显上升且维持在较高水平,抗氧化酶系统中的SOD、POD和CAT在初期明显上升,但在后期剧烈下降。
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- 关键词:稳定性抗氧化酶