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药效团检索设计新的HIV-1蛋白酶抑制剂被引量：1: 2000年; 通过对自建的未开发化合物三维结构库进行药效团检索,得到了4个对HIV-1蛋白酶有抑制活性的化合物,通过构象分析发现包含药效团的构象处于优势构象,而且4个结构都含有带两个邻位羟基的苯环和一个间位羰基的药效团以及公共子结构.通过计算发现它们的疏水参数都很小.在考虑满足包含药效团的结构特征和有适中的疏水参数两个因素的前提下,设计出了新的具有潜在抑制HIV-1蛋白酶活性的化合物.它们的结构都比检索得到的四个化合物更为简单。; 陈海峰袁身刚罗时玮董喜城姚建华杨铄郑崇直; 关键词：药效团构象分析

皂甙的三维定量构效关系研究被引量：7: 2000年; 针对目标分子柔性大的特点,在比较分子场分析(CoMFA)方法中采用交叉验证相关系数平方R^2引导的构象选择法.对12个皂甙分子的生物活性进行了三维定量构效关系研究.探讨了几种探针对构效关系结果的影响,并选择了一种较合理的“复合”探针方案.应用该复合探针构建CoMFA模型,发现影响药效的立体场与静电场的贡献分别为40％和4O％,其它能量项的贡献为20％.该模型交叉验证的相关系数平方R^2为0.653,非交叉验证的R^2为0.991,方差比F(4,7)值130.195(即置信度99％以上),活性预计的标准偏差与极差比(s/Δγ)为4.2％,表明模型具有较好的预测能力.根据该模型,预计在指定位置添加位阻较大的基团活性值提高将会比较明显.; 谷妍陈敏伯董喜城陈海峰曾宝珊冯传莉俞飙惠永正; 关键词：三维定量构效关系 COMFA 生物活性皂甙

含氟农药的比较分子场分析研究被引量：16: 2000年; 用比较分子场分析(CoMFA)方法对112种含氟农药分子的生物活性及毒性同时进行了定量构效关系研究.用78个化合物作为训练集,以距离比较方法(DISCO)确认的药效团为叠合规则构建CoMFA模型,发现影响活性的立体场与静电场的贡献分别为60.4％和39.6％,影响毒性的立体场与静电场的贡献分别为59.2％和40.8％.药效模型与毒效模型在交叉验证时的相关系数平方(R^2)分别为0.652和0.611,非交叉验证的R^2分别为0.982和0.977,方差比F(8,69)值分别为463.6及362.9,活性和毒性的标准偏差-极差比s/Δγ值分别为3.6％和2.9％.,表明模型具有较好的自预测能力.对测试组34个化合物进行了活性和毒性的预测,活性与毒性预测的标准偏差-极差比s/Δγ值分别为10.4％和6.4％.最后,还建立了一个由97个化合物构建的扩大的模型,各种统计量得到了进一步提高.并预计了一个活性较高且毒性很低的新化合物.; 谷妍董喜城陈海峰陈敏伯张世相袁身刚郑崇直; 关键词：3D-QSAR 含氟农药生物活性

异喹啉类化合物抑制肥大细胞脱颗粒活性的3D—QSAR研究被引量：1: 2001年; 对一组抑制肥大细胞脱颗粒的异喹啉类化合物的活性及毒性进行了3D-QSAR研究,采用距离比较法(DISCO)得到了它们的药效团模型,通过选择不同的叠合方式,建立了相关性很好的比较分子力场分析(CoMFA)模型,其交叉验证参数Rcv2分别为0.654和0.662,非交叉验证的相关系数分别为0.990与0.983,通过查阅统计量F表,表明活性及毒性模型的置信度都大于99%,显示模型具有较强的预测能力.并在此基础上进行了新活性先导化合物的设计,得到了预测活性高以及预测毒性低的新结构,合成实验正在进行之中.; 陈海峰李强曾宝珊董喜城袁身刚陈敏伯郑崇直孙仁山程天民粟永萍刘荣卿; 关键词：3D-QSAR COMFA 肥大细胞脱颗粒药效团模型比较分子力场分析

抗小麦赤霉病类含氟农药的3D-QSAR研究被引量：9: 2000年; 用CoMFA方法对一组含氟农药分子的抗小麦赤霉病活性进行了定量构效关系研究.发现影响药效的立体场与静电场的贡献分别为90.3％和9.7％,立体场的影响是占主导性的.该模型非交叉验证的相关系数(r^2)为0.991,F值是297.524,标准偏差(S)为0.015,表明模型具有较好的预测能力.根据该模型,设计并预测了几个新的化合物,其活性都在0.96以上,经过研究表明在预测结构的某些位置添加位阻较大的基团,活性提高比较明显.; 陈海峰董喜城谷妍柴鸽庆张世相袁身刚陈敏伯郑崇直; 关键词：三维定量构效关系 COMFA 含氟农药小麦赤霉病

高能量密度材料的分子设计被引量：5: 2000年; CERIUS2 program was employed on an Indigo2 SGI workstation to investigate the vacuum and crystal structures of the high energy density materials (HEDM). Over 20 known HEDM were first studied with an emphasis on the enthalpy of formation, optimal lattice forms, crystal lattice energy and crystal density. On the basis of the study, about 20 potential HEDM were designed.; 董喜城陈敏伯柴鸽庆袁身刚郑崇直; 关键词：分子设计计算机辅助设计

有机精细化学品的计算机辅助分子设计及软件开发: 袁身刚郑崇直陈敏伯姚建华陈海峰董喜城张伟琪袁琼杨铄冯传莉荔建锋欧阳政罗时玮刘映晖王源张玉珍成小林谷妍; 该项目瞄准了精细化学品分子设计的SAR/QSAR研究工具软件、三维结构数据库和组合化学模拟系统三个主攻方向，取得了一系列拥有自主知识产权的成果，为我国精细化学品工业提供了解决“生产什么”问题的技术平台。所开发的软件都吸取...; 关键词：; 关键词：分子设计

一种新的De Novo生物活性分子设计方法被引量：1: 2000年; 由药效团进行虚拟活性结构生成与3D-QSAR模型相结合,筛选出有前途的结构多样性的化合物,并从中寻找活性先导化合物,是一种新的分子设计方法.采用这种方法对抗小麦赤霉病类含氟农药进行了研究,共生成了53个虚拟活性结构,通过3D-QSAR模型筛选出其中10个活性较高的结构,在活性最高的化合物基础上进行了结构修饰,得到了活性更高巨毒性较低的理想化合物.研究结果表明这种方法能突破原模型化合物结构模式的局限,可以找到结构新颖的活性先导化合物,是一种非常有前途的分子设计方法,而且具有较高的筛选效率.; 陈海峰谷妍董喜城荔建锋张世相袁身刚陈敏伯郑崇直; 关键词：3D-QSAR 含氟农药分子设计药效团

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