陈小林
- 作品数:25 被引量:35H指数:4
- 供职机构:广西农业科学院更多>>
- 发文基金:国家现代农业产业技术体系建设项目广西农业科学院基本科研业务专项项目国家科技支撑计划更多>>
- 相关领域:农业科学更多>>
- 基于特异序列的亚洲炭疽菌PCR检测引物及快速检测方法
- 本发明公开了基于特异序列的亚洲炭疽菌PCR检测引物及快速检测方法。本发明通过比较亚洲炭疽菌(Colletotrichum asianum)和其他种炭疽菌基因组的方法所得到的亚洲炭疽菌的特异性分子靶标序列SEQ ID NO...
- 李其利鲁萌萌唐利华黄穗萍陈小林马立安郭堂勋莫贱友
- 水稻响应白叶枯病菌侵染的转录组分析被引量:1
- 2023年
- 【目的】分析白叶枯病菌(Xanthomonas oryzae pv.oryae,Xoo)侵染不同时间点的水稻转录组数据,了解其响应侵染过程中抗病相关基因的表达情况,为明确水稻对白叶枯病菌感病机制以及培育新的抗白叶枯病水稻品种提供理论参考。【方法】以含有广谱抗性基因Xa23的水稻品系CBB23为试验材料,对其叶片接种高致病性的野生型Xoo菌株N3-1,将接种0、48和72 h水稻样品总RNA进行转录组测序(RNA-Seq)。以|log2Fold Change|≥1,且错误发现率(False discovery rate,FDR)<0.01为标准筛选差异表达基因(Differentially expressed genes,DEGs),并进行GO功能注释和KEGG通路富集分析;通过实时荧光定量PCR(qRT-PCR)验证RNA-Seq结果的可靠性。【结果】RNA-Seq转录组测序结果共获得约54.63 Gb Clean data,样品平均数据量约为6.07 Gb,Q30碱基准确率在94.34%及以上。与对照组0 h相比,水稻CBB23在接种48和72 h两个时间点分别鉴定出2361和2117个DEGs,其中48 h上调基因1650个、下调基因711个,72 h上调基因1440个、下调基因677个。GO富集结果表明,水稻的DEGs显著富集于芳香族氨基酸的代谢及二萜类的生物合成。KEGG通路富集结果表明,DEGs富集于苯丙氨酸和苯丙素类的生物合成。DEGs的分析结果表明,SWEET基因家族中的OsSWEET14基因在接种后表达明显升高,而白叶枯病抗性基因Xa23在接种后几乎没有表达。对转录因子中的WRKY家族进行分析,发现与Xoo抗病相关的WRKY转录因子表达明显下降。钙依赖蛋白激酶(CDPK)表达明显升高,丝裂原活化激酶(MAPK)表达不变。qRT-PCR的基因表达检测结果与RNA-Seq结果趋势基本一致。【结论】水稻CBB23在抵御白叶枯病菌菌株N3-1侵染过程中的氨基酸代谢及次级代谢过程明显增强;感病基因OsSWEET14在侵染过程中被诱导表达,可能是水稻中被调控的关键感病基因之一。与抗病相关的转录因子表达既有上调也有下调。表明水稻在响应病原
- 张宇张宇陈小林陈小林李其利唐利华郭堂勋郭堂勋
- 关键词:水稻转录组白叶枯病
- 水稻白叶枯病抗性基因Xa21的分子生物学研究进展被引量:7
- 2014年
- 由黄单胞杆菌水稻致病变种Xanthomonas oryzae pv.oryzae(Xoo)引起的白叶枯病是水稻重要细菌性病害之一。迄今,已有7个水稻白叶枯病抗性基因被克隆。Xa21是第一个被克隆的白叶枯病抗性基因,因具有广谱抗性而受到广泛的关注。对Xa21的发现、定位及克隆、表达特征、编码产物XA21的生化特性、作用与调控以及XA21介导的免疫反应模式等方面的研究结果进行综述,并对今后的研究方向进行展望。
- 陈小林颜群高利军高汉亮
- 关键词:水稻白叶枯病抗性基因XA21
- 二甲基三硫醚在抑制火龙果溃疡病菌中的应用
- 本发明涉及二甲基三硫醚在抑制火龙果溃疡病菌中的应用。本发明通过室内毒力测定确定了二甲基三硫醚对不同病原菌表现出不同程度的抑制作用,其中对玉米立枯丝核菌和葡萄灰霉病菌抑制效果最好,其次为火龙果溃疡病菌和水稻稻瘟病菌,因此说...
- 唐利华李其利苏映丹赵江郭堂勋黄穗萍莫贱友陈小林
- 广西水稻白叶枯病菌致病型的初步鉴定被引量:8
- 2015年
- 【目的】明确广西水稻白叶枯病菌致病型的分布和分化,为生产上该病害的综合防控提供理论依据。【方法】采用水稻白叶枯病菌中国鉴别寄主(金刚30、特特普、南粳15、爪哇14、IR26)对2013年从广西南宁、东兴、防城港、钦州、岑溪等地水稻病区分离得到的29株水稻白叶枯病菌进行致病型初步鉴定,同时采用部分近等基因系对5株南宁分离菌株致病性进行进一步分析。【结果】29株菌株在5个鉴别寄主上均出现感病反应,均为SSSSS模式,为强致病菌;5株南宁分离菌株能使目前抗谱最广的水稻材料CBB23感病。【结论】广西水稻白叶枯病菌致病力出现极大分化,需加强对该病害的防控及水稻抗病材料的筛选利用工作。
- 陈小林颜群高利军韦善富李道远高汉亮
- 关键词:水稻白叶枯病菌致病型
- 暹罗炭疽菌的特异性PCR检测引物及其应用
- 本发明公开了暹罗炭疽菌的特异性PCR检测引物及其应用。特异性检测引物FS13/RS15、FS13/RS13或FS13/RS11是基于ApMAT序列设计的。本发明中的三组关于暹罗炭疽菌的特异性检测引物具有特异性强、稳定性好...
- 李其利鲁萌萌唐利华黄穗萍陈小林郭堂勋
- 基于特异序列的亚洲炭疽菌PCR检测引物及快速检测方法
- 本发明公开了基于特异序列的亚洲炭疽菌PCR检测引物及快速检测方法。本发明通过比较亚洲炭疽菌(Colletotrichum asianum)和其他种炭疽菌基因组的方法所得到的亚洲炭疽菌的特异性分子靶标序列SEQ ID NO...
- 李其利鲁萌萌唐利华黄穗萍陈小林马立安郭堂勋莫贱友
- 文献传递
- 广西番木瓜炭疽病的病原菌鉴定
- 2023年
- 番木瓜(Carica papaya L.)是番木瓜科(Caricaceae)番木瓜属(Carica)植物,在我国种植广泛,具有重要的经济价值。由炭疽菌(Colletotrichum spp.)引起的番木瓜炭疽病,是一种重要的采后病害,严重影响番木瓜果实的品质和产量[1]。2019年3月,在广西南宁西乡塘区的番木瓜种植园观察到具有典型炭疽病症状的成熟番木瓜果实,发病率达到30%。发病初期症状表现为水渍状斑点,逐渐变为深褐色,后期病部凹陷,在潮湿温暖的条件下,病变部位会出现橘红色分生孢子团。
- 张玉杰孙文秀唐利华黄穗萍莫贱友郭堂勋陈小林黄辉晔李其利
- 关键词:番木瓜果实番木瓜科病原菌鉴定采后病害
- 广西稻瘟病菌生理小种鉴定及遗传多样性分析被引量:9
- 2017年
- 【目的】明确广西稻瘟病菌生理小种组成及遗传结构,为今后水稻抗病品种的选育和布局提供依据。【方法】利用我国7个稻瘟病菌鉴别品种和SSR对广西2012~2014年分离获得的稻瘟病菌单孢菌株分别进行生理小种鉴定和遗传多样性分析。【结果】2012-2014年分离获得的142株稻瘟病菌菌株分成ZA、ZB、ZC、ZD、ZE、ZF、ZG 7群24个生理小种,其中优势种群为ZB,出现频率67.61%,优势生理小种为ZB_9和ZB_(13),出现频率均为19.01%。运用UPGMA法对其中107个菌株进行遗传多样性分析,在0.88的相似水平上划分为14个遗传宗谱。其中,宗谱L01为优势宗谱,占供试菌株比例为44.86%;其次为宗谱L03、L06和L11,占供试菌株比例分别为19.63%、13.08%和10.28%。对每个遗传宗谱所包含的菌株及对应生理小种进行统计,发现稻瘟病菌遗传宗谱与生理小种之间未存在相关性。【结论】2012-2014年广西稻瘟病菌优势种群为ZB,优势生理小种为ZB9和ZB13,其遗传宗谱与生理小种之间未存在相关性。
- 陈小林颜群李瑞芳李焜华韦善富黄凤宽韦丽丽
- 关键词:水稻稻瘟病菌生理小种SSR
- 同一适宜生态区拟引种广西的玉米品种抗病性鉴定与分析被引量:2
- 2022年
- 2016~2019年对62个热带亚热带类型区和西南春玉米类型区的各省审定拟引种广西的玉米品种进行6种主要病害的抗病性鉴定,明确拟引种广西的玉米品种对广西玉米产区主要病害的抗病水平。结果表明,参试品种对纹枯病、南方锈病、大斑病、小斑病、穗腐病和茎腐病的抗性,表现中抗及以上的比例分别为27.9%、30.6%、66.1%、50.0%、68.9%和69.4%。不同年份间引种品种抗病性呈现一定的相似性,个别年份特殊除外,表现感和高感纹枯病及南方锈病的品种比例均高于其他4种病害,都在60.0%以上;不同省份审定的引种品种抗病性亦显示一定的相似性,表现感和高感纹枯病及南方锈病的品种比例高于其他4种病害。鉴定结果表明,在同一适宜生态区的各省审定品种中选择品种引种广西时,应特别注意避免或谨慎引种高感纹枯病和南方锈病的品种,以规避或减少因病害危害造成损失,保障引种生产安全。
- 晏卫红覃嘉明李焜华陈小林张龙婷
- 关键词:玉米引种抗病鉴定纹枯病