梁翠
- 作品数:4 被引量:15H指数:2
- 供职机构:沈阳农业大学园艺学院更多>>
- 发文基金:国家自然科学基金国家教育部博士点基金辽宁省教育厅高等学校科学研究项目更多>>
- 相关领域:农业科学更多>>
- 大白菜SSR遗传图谱构建及叶球相关性状的QTL定位
- 以大白菜结球小的DH系‘501’和结球大的自交系‘601’为亲本,通过杂交和自交获得由142个F单株构成的作图群体以及相应的F家系。以含有微卫星单一基因序列开发的UGMS标记以及前人开发的SSR标记作为锚定标记,应用Jo...
- 葛宇王涛梁翠王娜朴钟云
- 关键词:大白菜QTL定位
- 文献传递
- 人参单一基因微卫星标记的分析被引量:10
- 2011年
- 【目的】利用人参单一基因(unigene)序列,研究人参转录区SSR的分布特征;开发单一基因微卫星(UGMS)标记,并比较人参UGMS与基因组SSR标记(G-SSR)在分布频率、多态性及通用性等方面的不同,为人参等五加科药用植物的鉴定、遗传图谱的建立等研究奠定基础。【方法】利用NCBI公共数据库的7 649条人参EST序列,筛选出含有SSR的单一基因序列,并分析人参SSR的分布;根据这些序列以及包含SSR的人参基因组序列合成的引物扩增人参不同品种和其它五加科植物。【结果】检测到总长度为2.72 Mb的4 869个单一基因。其中,488个单一基因分布有724个SSR,占人参EST的10.02%,SSR的分布密度为3.75 Kb。一至三核苷酸重复分布频率分别为29.28%、48.06%和19.06%。非编码区和编码区重复序列分别以AT/TA和AAG/CTT为主。在合成的100对UGMS和44对G-SSR引物中,分别有86和44对能够扩增出人参的PCR产物,其多态率分别为42.0%和43.2%。人参UGMS对五加科西洋参、三七和刺五加植物的通用性分别为100%、87.2%和75.6%;G-SSR分别为95.5%、72.7%和40.9%。【结论】人参基因中SSR发生频率较高,并以二核苷酸重复为主。不同基因区域内的SSR分布具有非随机性。UGMS在揭示种内多态性方面不及G-SSR,但具有较高的种间通用性。
- 吴天姝梁翠李宏博朴钟云
- 关键词:人参基因组SSR
- 芸薹属A基因组单一基因微卫星分布及其通用性研究
- 单一基因微卫星(UGMS)标记有别于EST-SSR标记,具有染色体位点单一的优点,适用于分析和评价基因的变异。一套高效的、可转移的、通用UGMS核心引物的筛选对于芸薹属A基因组种质资源的鉴定、杂种优势群划分、遗传多样性分...
- 梁翠葛宇曹睿王哲黎瑞源孟金陵朴钟云
- 关键词:芸薹属
- 大白菜叶片毛刺基因BrLt的EST-SSR定位被引量:5
- 2010年
- 本研究以叶面光滑无毛刺大白菜‘501’为母本,叶面有毛刺‘601’为父本构建了F2代作图群体及其F3家系,其表型鉴定结果表明,大白菜叶片毛刺性状是由单显性基因(BrLt)控制的(χ2=3.86,P<0.05)。通过分离群体分组分析(BSA)法,筛选出与BrLt基因连锁的1个SSR标记cnu_m400a,以及基于表达序列标签(EST)序列的2个EST-SSR标记,sau_um072和sau_um160。以139株F2个体为作图群体,并以cnu_m400a为锚定标记,将BrLt基因定位于芸薹种A6连锁群。sau_um072、sau_um160和cnu_m400a位于BrLt基因的同一侧,遗传距离分别为2.7cM、3.3cM和7.2cM。BrLt基因的定位将为图位克隆该基因以及研究大白菜叶片毛刺的形成机理奠定基础。
- 王涛葛宇王娜梁翠朴钟云
- 关键词:大白菜SSR标记