王雪梅
- 作品数：3 被引量：3H指数：1
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- 水溶液分子对赖氨酸电子结构的等效势被引量：3
- 2006年
- 要可靠计算在水溶液中的蛋白质分子的电子结构,需要构造水溶液分子对蛋白质分子电子结构的等效势.赖氨酸属于亲水的氨基酸,在中性水溶液中带正电荷(Lys+).通过基于密度泛函理论的第一性原理、全电子、从头计算,构造了水溶液分子对赖氨酸(Lys+)电子结构的等效势.首先用“自由团簇计算法”计算了一个含赖氨酸和水分子系统的电子结构,通过调节水分子的空间位置,求得能量最低的赖氨酸与水分子的相对空间构型.然后以此空间构型为基础,用“团簇埋入自洽计算法”计算赖氨酸在以水分子为外势条件下的电子结构.最后再用“团簇埋入自洽计算法”计算赖氨酸在用偶极子代替水分子时的电子结构,调节偶极子的极矩和位置,使得以偶极子为外势和以水分子为外势的赖氨酸的电子结构尽量接近,即得到了用偶极子势模拟的水溶液分子对赖氨酸(Lys+)的等效势.计算结果显示,水溶液分子对赖氨酸电子结构的主要影响是使各能级整体上移了约0.5032eV,并使Fermi面上的能隙增大了89%.简单的偶极子势可以模拟水溶液分子对赖氨酸电子结构的影响.
- 李春杰郑浩平王雪梅
- 关键词：赖氨酸电子结构水分子
- 水分子对半胱氨酸电子结构的等效势
- 电子结构是理解物质性质和功能的基础。“团簇埋入自洽计算法(SCCE)”可在保持计算精度的前提下极大地降低计算量，使蛋白质分子电子结构的第一性原理、全电子、从头计算成为可能。已有三个蛋白质分子的电子结构被算出。但由于计算条...
- 王雪梅
- 关键词：半胱氨酸水分子电子结构等效势
- 文献传递
- 水溶液分子对蛋白质电子结构等效势的理论计算研究
- 通过基于密度泛函理论的第一性原理、全电子、从头计算,构造了水溶液分子对半胱氨酸和赖氨酸电子结构的等效势.计算结果显示,水分子对半胱氨酸电子结构的主要影响是使半胱氨酸各能级整体下移了约0.032Ry,并使费密面上的能隙增大...
- 郑浩平王雪梅李春杰
- 关键词：水分子半胱氨酸赖氨酸电子结构
- 文献传递
