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芹菜核酸内切酶CELI基因的克隆及其表达分析被引量：5: 2014年; CELI是一种单链特异性核酸酶(singlestrand specific nuclease),主要应用于清除DNA或RNA双链分子存在的单链。测定不同品种芹菜中CELI基因非生物胁迫诱导表达情况,以进一步研究芹菜中核酸内切酶的功能及应用。以芹菜(Apium graveolens L.)为试验材料,分别从‘六合黄心芹’和‘文图拉’中克隆出核酸内切酶CELI基因序列。通过生物信息学的方法对所得序列进行分析,通过实时定量PCR方法进行该基因在芹菜中表达分析。结果表明:来源于2种芹菜的CELI基因核苷酸序列高度保守,基因全长均为891 bp,分别编码296个氨基酸。2种芹菜的CELI基因核苷酸序列之间共有20个位点不同,导致3个氨基酸位点发生改变。2种芹菜该酶的蛋白质相对分子质量分别为33.88×103和33.92×103,pI值分别为6.51和6.37。进化分析显示,芹菜中的CELI与同属于伞形科的欧芹进化关系最近,伞形科CELI进化上更接近于菊科。实时定量PCR分析表明,芹菜中CELI基因在根、茎、叶、花不同组织及不同品种之间的表达量有明显差异。对2种芹菜分别进行4℃、38℃、0.2 mol·L-1NaCl、200 g·L-1PEG处理2 h,表达分析显示,4种处理条件下芹菜中CELI基因表达量有明显差异,其中PEG处理表达量呈明显下降趋势。结论:通过逆境处理后的基因表达分析发现,芹菜中CELI基因对非生物胁迫有响应,‘六合黄心芹’中CELI基因的诱导表达量大于‘文图拉’。; 田畅王枫蒋倩徐馨琰刘君熊爱生; 关键词：芹菜核酸内切酶实时定量PCR 基因克隆

芹菜中6-磷酸甘露糖还原酶基因的克隆、进化和表达分析: 2013年; 以2个芹菜品种‘津南实芹’和‘美国西芹’为试材,采用RT-PCR技术分别获得6-磷酸甘露糖还原酶(M6PR)cDNA序列。序列分析表明:来源于2个芹菜品种的6-磷酸甘露糖还原酶基因核苷酸序列全长均为930 bp,编码309个氨基酸;预测其蛋白质相对分子质量为35×103,pI值为6.38。空间结构分析显示:M6PR蛋白由11个α-螺旋和13条β-延伸主链组成,中间形成1个疏水穴;催化四分体(Asp、Tyr、Lys和His)分布于疏水穴内部,具有催化活性。进化分析显示:芹菜M6PR与卷柏、小立碗藓、云杉等远古物种的醛-酮还原酶(AKR)相似性较高。实时定量PCR表达分析表明:M6PR基因主要在芹菜的茎中表达,具有明显的组织特异性。; 蒋倩王枫侯喜林马静李梦瑶熊爱生; 关键词：芹菜基因克隆进化实时定量PCR 基因表达

水芹和旱芹营养器官结构和叶片光合特性的比较分析被引量：3: 2014年; 以水芹品种‘南京八卦洲水芹’和旱芹品种‘六合黄心芹’为材料,采用盆栽的方法,对其营养器官结构和不同光照强度下叶片光合特性进行了比较研究。结果表明:水芹根系维管束比旱芹发达;水芹叶柄为中空结构,有较大的髓腔,而旱芹结构致密,无髓腔;旱芹叶片维管束和韧皮部细胞发达,木质部导管细胞数目较多,而水芹维管束相对不发达,木质部和韧皮部细胞较少。当光照强度为90μmol·m-2·s-1时,旱芹的净光合效率(Pn)、气孔导度(Gs)、胞间CO2浓度(Ci)、蒸腾速率(Tr)分别是水芹的1.45、1.81、1.49和1.69倍;当光照强度为270μmol·m-2·s-1时,旱芹的Pn、Gs、Ci和Tr分别是水芹的1.77、1.61、1.71和1.46倍。在一定光照强度范围内,旱芹和水芹的Pn与Gs、Tr呈正相关,与Ci呈负相关,并且旱芹的Pn要高于水芹。表明2种芹菜的光合特性与叶片的维管束、韧皮部、木质部导管相关。; 贾晓玲余徐润王枫李岩蒋倩熊爱生; 关键词：水芹旱芹营养器官光合特性

芹菜NHL-like蛋白基因克隆与表达分析被引量：2: 2014年; 植物生长发育过程中会遭遇各种病原物的攻击,植物为了应对这些危害并适应外界的生存竞争,逐渐演化出了复杂的防御机制。NHL基因家族庞大,部分NHL基因受病原物诱导后会过量表达,增强植物对多种病原菌的抗性,是与植物防御机制密切相关的蛋白。本研究以津南实芹和美国西芹2个芹菜品种为试验材料,分别克隆出NHL-like蛋白基因AgNHL。序列分析表明,上述2种芹菜的AgNHL基因序列均含636 bp的开放阅读框,编码211个氨基酸。2种芹菜碱基序列,只有第36位不同,津南实芹为T,美国西芹为C,2种碱基序列相似性高达99.84%,编码的氨基酸序列相同。进化分析显示,2种芹菜的NHL-like蛋白与葡萄、大豆等植物的相似度较高,在第80～185氨基酸间含一个LEA-2蛋白保守结构域。荧光定量PCR结果表明,AgNHL基因主要在芹菜茎中表达,根中表达量最低,有明显组织特异性,品种差异也很显著。对2种芹菜分别进行4℃低温、38℃高温、20%PEG处理、0.2 mol/L NaCl处理2 h表达分析显示,低温、盐处理下该基因表达量明显上升。; 李岩王枫谭国飞贾晓玲蒋倩熊爱生; 关键词：芹菜基因克隆荧光定量PCR

胡萝卜营养器官结构和叶片光合特性被引量：2: 2013年; 以黑田五寸胡萝卜为材料,对其块根、茎、叶肉、叶脉进行树脂切片,观察细胞结构,并测定不同光照度对胡萝卜叶片光合特性的影响。结果表明:胡萝卜块根细胞中内含物较少,并含淀粉粒,茎的结构由外至内分别是表皮、外皮层、皮层薄壁细胞、维管束。叶片栅栏组织细胞呈柱状排列,海绵组织细胞排列较为松散,维管束周围有一圈维管束鞘细胞,且维管束鞘细胞中含有少量的叶绿体。光照度明显影响胡萝卜叶片的净光合速率、蒸腾速率、胞间二氧化碳浓度和气孔导度。不同光照度下胡萝卜叶片净光合速率、蒸腾速率、气孔导度的变化趋势大致相同,在一定范围内都随光照度增加而增加,随后趋于平缓。胞间二氧化碳浓度变化趋势相反,随着光照度的增加而显著降低。; 李岩余徐润王枫贾晓玲蒋倩熊爱生; 关键词：胡萝卜营养器官结构光照度光合特性

芹菜非特异性脂转移蛋白基因的克隆与表达分析被引量：6: 2012年; 以芹菜(Apium graveolens)‘六合黄心芹’、‘津南实芹’和‘美国西芹’为试验材料,采用RT-PCR技术分别获得其cDNA序列。序列分析表明:来源于3个芹菜品种的非特异性脂转移蛋白(Non-specific lipid transfer protein,nsLTP)基因核苷酸序列高度保守,全长357bp,编码118个氨基酸,起始密码子ATG之后含有27个氨基酸残基的信号肽序列,推测其成熟的蛋白含91个氨基酸残基,预测其蛋白质分子量为11.75kD,pI值为9.36。芹菜的nsLTP蛋白主要由α-螺旋和随机卷曲组成。空间结构上分析显示,芹菜nsLTP蛋白中H1区域明显分为H1a和H1b两个亚区域,而模板碧桃中H1区域为一个连续的螺旋结构,存在明显的差异。进化分析显示,芹菜nsLTP与香石竹、大洋洲滨藜等植物的nsLTP相似性较高,在保守位置具有8个半胱氨酸残基。实时定量PCR表达分析表明,该基因主要在芹菜的茎以及茎尖生长活跃中心表达,具有明显的组织特异性。; 蒋倩王枫侯喜林王镇李梦瑶马静刘梦叠熊爱生; 关键词：芹菜基因克隆实时定量PCR 基因表达

芹菜韧皮部蛋白基因的分离与表达分析被引量：3: 2013年; 韧皮部蛋白在维持植物形态、物质转运以及植物伤口保护等方面起着重要作用。本研究以地域来源和性状特性差异均较大的2个芹菜品种六合黄心芹和美国西芹为试验材料,利用RT-PCR技术获得这2种芹菜韧皮部蛋白基因的cDNA序列。结果显示:这2种芹菜来源的韧皮部蛋白基因全长均为546 bp,编码181个氨基酸。两者核苷酸序列有3个位点的不同,分别为:88G/A、399T/C和489T/C;在氨基酸序列上有1个位点的不同,为30T/A。预测其蛋白质分子量为19 kD,pI值为9.18。六合黄心芹和美国西芹的韧皮部蛋白与忽地笑等植物的韧皮部蛋白相似度较高,在保守位置分别具有5个亮氨酸残基和4个色氨酸残基。实时定量PCR表达分析表明,该基因主要在芹菜的茎和根等部位表达,具有明显的组织特异性。; 马静王枫侯喜林蒋倩李梦瑶施忆熊爱生; 关键词：芹菜实时定量PCR 基因克隆

芹菜过敏原蛋白Api g 1基因的克隆与表达分析被引量：7: 2013年; 以2个芹菜(Apium graveolens)品种‘津南实芹’和‘美国西芹’为试验材料,分别克隆出过敏原蛋白Api g 1基因。序列分析表明,‘津南实芹’和‘美国西芹’中的过敏原蛋白基因Api g 1均含有1个480 bp的开放阅读框及1个148 bp的内含子,分别编码159个氨基酸,二者有2个核苷酸位点的差异,编码的氨基酸有1个位点差异。‘津南实芹’和‘美国西芹’的过敏原蛋白Api g 1与胡萝卜、欧芹等植物的过敏原蛋白相似度较高,在保守区域有7个甘氨酸残基,空间结构上由3个螺旋和7个折叠组成。实时定量PCR表达分析显示,该基因在主根中表达较高,茎其次,其他部位表达较弱,具有明显的组织特异性。; 李梦瑶王枫侯喜林蒋倩王镇马静熊爱生; 关键词：芹菜 API 克隆实时定量PCR 基因表达

3个芹菜品种Agnp-G3PDH基因的克隆及其序列和表达特性分析被引量：5: 2014年; 从芹菜(Apium graveolens Linn.)品种‘六合黄心芹’(‘Liuhe Huangxinqin’)、‘津南实芹’(‘Jinnan Shiqin’)和‘文图拉’(‘Ventura’)中分别克隆获得非磷酸化甘油醛-3-磷酸脱氢酶基因Agnp-G3PDH。3个品种的AgnpG3PDH基因序列均包含1个全长1 491 bp的开放阅读框(ORF),编码496个氨基酸;存在84个碱基位点差异,导致14个氨基酸位点改变。由该基因编码的‘六合黄心芹’、‘津南实芹’和‘文图拉’的Agnp-G3PDH蛋白的理论相对分子质量分别为53 201.6、53 051.4和52 960.3,理论等电点分别为pI 7.49、pI 7.86和pI 8.12,氨基酸组成中碱性氨基酸数量大于酸性氨基酸数量;该蛋白质具有亲水性与疏水性双重特性,均为疏水性蛋白。多重比对结果表明:3个品种Agnp-G3PDH基因编码的氨基酸序列同源性达到99.09%,具有高度保守性;且与其他11种植物npG3PDH的氨基酸序列的相似度也较高。在基于np-G3PDH基因编码的氨基酸序列进化树上,3个芹菜品种聚在同一分支中,并与杨柳科(Salicaceae)种类毛果杨(Populus trichocarpa Torr.&Gray)聚在一起,表明它们的np-G3PDH进化关系较近。实时定量PCR分析结果表明:在3个芹菜品种的不同组织中Agnp-G3PDH基因的相对表达水平均有明显差异,其中,在‘津南实芹’的叶、‘文图拉’的花和‘六合黄心芹’的根中该基因的相对表达水平最高;经高温(38℃)、低温(4℃)和干旱(20%PEG)胁迫处理后3个品种Agnp-G3PDH基因的相对表达水平均极显著高于或低于对照,但经盐(0.2 mol·L-1NaCl)胁迫处理后仅品种‘津南实芹’Agnp-G3PDH基因的相对表达水平显著高于对照,品种‘六合黄心芹’和‘文图拉’Agnp-G3PDH基因的相对表达水平与对照无显著差异。表明该基因的表达具有组织特异性且与品种间的抗逆性差异有关。; 田畅蒋倩王枫李梦瑶贾晓玲熊爱生; 关键词：芹菜同源性非生物胁迫

水芹基因组研究及非生物胁迫下的响应因子分析: 水芹(Oenanthe javanica (BI.)DC.)是一种具有药用价值的多年生水生植物，隶属于伞型科水芹属，且富含蛋白质、膳食纤维、维生素和矿质元素。此外，水芹病虫害发生较少，对不同环境适应能力强。目前对水芹的研...; 蒋倩; 关键词：水芹内参基因非生物胁迫; 文献传递

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