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包其郁: 作品数：102 被引量：413H指数：12; 供职机构：温州医科大学更多>>; 发文基金：浙江省自然科学基金温州市科技局科研基金浙江省科技计划项目更多>>; 相关领域：医药卫生生物学农业科学政治法律更多>>

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CD14基因多态性与儿童特应性疾病的相关性被引量：7: 2007年; 目的研究脂多糖受体基因（CD14）多态性在温州地区汉族儿童中的分布特征及其与特应性疾病的关联。方法特应征组113例，病例入选符合下列标准：（1）年龄2～12岁的汉族儿童；（2）临床诊断为哮喘、过敏性鼻炎或特应性皮炎；（3）血清总IgE升高；（4）血清特异性IgE阳性。选取2～12岁正常体检儿童79例为对照组。应用免疫荧光法测定血清总IsE，UniCAP系统测定sIgE。应用测序法测定两组儿童CD14基因序列，寻找多态位点，调查多态位点的分布特征，比较两组儿童多态位点的基因型频率和等位基因频率，比较不同基因型的血浆IgE水平。结果（1）特应征组和对照组儿童均发现CD141—159多态性，以TT基因型为主，未发现其他多态位点。其中对照组儿童TT、TC、CC3种基因型频率分别为57．0％、28．0％和15．0％，特应征组儿童TT、TC、CC3种基因型频率分别为46.9％、35．4％和17．7％，按Hardy-Weinberg平衡吻合度检验，差异无统计学意义（x^2=3．462，P〉0．05）。两组的基因型频率和等位基因频率分布差异无统计学意义（x^2=1．918，P〉0．05）。（2）不同性别间基因型频率差异无统计学意义（x^2=3．458，P〉0．05）。（3）经对数转换，CD14/—159CC基因型、TC基因型和TT基因型的血清IgE分别为（2500±460）IU／L、（2400±460）IU／L、（2520±460）IU／L，方差分析差异无统计学意义（F=0．807，P〉0．05）。结论（1）温州地区汉族儿童存在CD141—159多态性，未发现CD14基因其他多态位点。温州地区汉族儿童CD141—159基因型以TT为主。（2）未发现CD141—159基因型和特应征发病及IgE水平之间的关联。; 张海邻倪丽艳包其郁陈志敏李昌崇

长片段水稻细菌人工染色体DNA的亚克隆文库的构建被引量：5: 2000年; 利用超声波振断法将水稻细菌人工染色体 (BAC)基因组文库———Nipponbare库中的一个BAC克隆 (E5 0 )振断 ,产生许多大小不同的DNA随机片段 ,回收其中 1 7～ 3 5kb的片段 ,并将这些随机片段克隆入质粒载体pUC18。; 王世全李平翟文学王文明朱立煌包其郁; 关键词：细菌人工染色体水稻基因文库

Solexa测序法在肺炎克雷伯菌质粒基因组测序中的应用: 2010年; Solexa测序方法以单分子阵列技术为基础，具有所需样品量少、高通量、高精确性、拥有简单易操作的自动化平台和功能强大等特点。可以同时检测上亿个核苷酸片段，在同一个芯片或几个芯片上花费很少的成本（只需常规方法的1％）就可测试全基因组。与传统的Sanger测序技术相比，无需建库与克隆挑取的工作，且每次反应只要7．5h，即可得到1亿个核苷酸序列，测序速度是传统Sanger方式的100倍。Solexa测序技术为目前遗传分析和功能基因组等研究领域提供了全新的应用方案。; 李劲松钱菊娣周铁丽包其郁; 关键词：基因组测序肺炎克雷伯菌测序法质粒测序技术功能基因组

螺旋藻抗逆相关功能基因组研究: 包其郁王慧利丁力李佩珍卢俊婉许腾高国辉; 该项目对具有自主知识产权的螺旋藻材料进行全基因组测序和功能注释；利用基因组、转录组和蛋白质技术，测定不同培养条件下螺旋藻基因表达谱的差异，进行螺旋藻抗逆(抗盐碱、耐高温、耐强光)相关的功能基因组研究；利用模式蓝细菌遗传转...; 关键词：; 关键词：螺旋藻基因表达遗传育种

2株SARS相关冠状病毒主要结构蛋白基因的多态性分析: 2006年; 目的:分析2株SARS相关冠状病毒(Severeacuterespiratorysyndrome-associatedcoronavirus,SARS-CoV)HK21378和BJ104的主要结构蛋白基因序列的多态性以及蛋白质结构变化与功能的关系。方法:提取组织培养物中的SARS-CoV基因组RNA,对RT-PCR产物进行测序;以GZ02为参照序列,对蛋白质编码序列进行基因多态性分析和蛋白质结构与功能关系分析。结果:①与SARS-CoVGZ02株相比较,HK21378和BJ104主要结构蛋白编码序列共有14个变异位点,其中9个变异位点为两者共有3,个变异位点见于HK21378,2个变异位点见于BJ104;与GenBank数据库已发表的103株SARS-CoV基因组数据比较,变异位点22901(T→G)为BJ104特有,未见于已发表的其他SARS-CoV基因组中;在14个多态位点中,有5个多态位点为同义突变,其余9个为非同义突变。②14个变异位点中有11个变异发生在S蛋白编码区,其碱基变异频率为3.7/kb;2个见于M蛋白编码区,其碱基变异频率为3.0/kb;1个见于N蛋白编码区,碱基变异频率为0.8/kb;而E蛋白编码区未见变异位点。结论:SARS-CoV的主要结构蛋白编码区容易发生变异,尤其是膜表面S蛋白和M蛋白编码区。; 齐艳包其郁田薇徐建成; 关键词：SARS相关冠状病毒结构蛋白基因多态性

多重耐药性大肠埃希菌质粒谱与ESBLs基因型分析被引量：19: 2006年; 目的分析临床耐药大肠埃希菌质粒谱与基因型间关系,确定超广谱β-内酰胺酶e(xtended spectrum bata lactarnase,ESBLs)基因在细菌质粒谱上的座位。方法分离鉴定菌株,通过KB-法药敏实验确认产ESBLs菌株。凝胶电泳检测菌体质粒,并应用PCR技术扩增ESBLs基因。结果分离到产ESBLs细菌128株,检出率为78.0%,针对12种抗生素,产ESBLs细菌的耐药率在29%～71%之间;128株大肠埃希菌含11类不同谱型的质粒群,其中较大质粒(23kb、9.4kb)出现频率高(71.1%、26.6%);PCR分型结果显示,单独携带TEM型ESBLs基因的菌株比例为24.2%,SH V型为19.5%,CTXM-型为53.1%,携带两种基因型以上的占18.8%。CTXM-型中三个亚型CTXM--24、CTXM--22型和CTXM--3型比例分别是32.0%、28.1%和17.2%。结论质粒谱中,某些分子量相同或相近的较大质粒能稳定存在于菌体内并能导致相应耐药性的产生和播散。定位这类质粒上ESBLs基因的差异导致了菌株耐药性的不同。; 张洁包其郁张洪勤李佩珍豆长明张寿国; 关键词：大肠埃希菌 Β-内酰胺酶耐药性质粒

医院感染革兰阴性杆菌中整合子介导耐药及水平播散机制研究被引量：14: 2008年; 目的研究整合子在医院感染革兰阴性杆菌中的分布及其与病原菌耐药的相关性，探讨Ⅰ类整合子与临床耐药播散的关系。方法运用K—B法检测临床株的耐药表型，纸片扩散法检测产超广谱β-内酰胺酶（ESBLs），PCR扩增筛选含整合子的临床菌株，接合传递实验、套式PCR、质粒谱分析及DNA测序研究携带耐药基因的Ⅰ类整合子与耐药播散的关系。结果66．4％的医院感染革兰阴性杆菌Ⅰ类整合子阳性，未检测出Ⅱ、Ⅲ类整合子；Ⅰ类整合子可变区扩增片段大小从0．7～2．3kb，编码对氨基糖苷类、磺胺类抗菌药物和氯霉素耐药的基因；整合子阳性组中ESBLs、多药耐药菌均明显高于阴性组；整合子可通过质粒在不同菌属间水平传播。结论Ⅰ类整合子在医院感染革兰阴性杆菌中广泛分布，可通过质粒在不同菌属间水平传播，在耐药基因传播中起重要作用，应引起临床足够的重视。; 李劲松钱菊娣项领张寿国王垂桥包其郁; 关键词：医院感染革兰阴性杆菌整合子耐药

PCR和PCR扩增产物斑点杂交技术检测人乳头瘤病毒敏感性比较: 1999年; 陈柏坤包其郁张洪勤陈波蓓; 关键词：HPV 斑点杂交

高通量混合基因测序预测志贺菌属新型耐药基因研究: 2014年; 目的通过高通量测序结合生物信息学分析,预测110株志贺菌属中与耐药基因库序列相似度差异较大的潜在新型耐药基因。方法 110株志贺菌属来源于2006年6月-2011年6月温州地区不同医院腹泻患者粪便标本,采用碱裂解法提取志贺菌属的混合基因DNA,Illumina HiSeq 2000高通量测序;通过基于同源比对核心算法的基因分析,挖掘与已知耐药基因遗传变异较大、相似性较低的潜在新型耐药基因。结果 110株志贺菌属中福氏志贺菌30株、宋氏志贺菌80株,福氏、宋氏志贺菌高通量测序总碱基数分别为4.9和3.5Gb;志贺菌属高通量测序数据信息挖掘,分别获得潜在的耐药片段宋氏志贺菌255个和福氏志贺菌272个,分布于712条Unigene中;GO和COG蛋白功能数据库注释,发现其分子功能绝大多数与转运(21.3%)、催化(25.2%)、结合(25.2%)和转录调控(9.3%),福氏志贺菌denovo组装后预测发现外排泵基因mdt操纵子。结论研究提出的基于同源比对的核心算法,可以有效地预测与参考耐药基因序列相似性较低的基因,为新型耐药基因的发现提供了思路。; 靳春雷宋智健周铁丽包其郁李劲松; 关键词：志贺菌属测序

传染性非典型肺炎患者不同病程粪便标本中SARS-CoV的分离与鉴定: 2004年; 目的:从粪便标本中分离并鉴定SARS-CoV. 方法:粪便浸出液接种Vero-E6细胞,盲传至出现明显的细胞病变效应(CPE),并能稳定传代.采用电镜法和RT- PCR技术鉴定细胞培养物中的SARS-CoV(本实验均在BSL-3实验室完成). 结果:大部分样本用Vero-E6细胞盲传3代后发现明显的CPE,并能稳定传代.电镜负染检查,出现CPE的细胞可查见病毒颗粒;培养物上清RT-PCR扩增均为阳性.粪便样本直接用RT-PCR检测,阳性率仅为50%,细胞培养的检出率为73%. 结论:采用细胞培养结合RT-PCR技术检测粪便标本SARS- CoV比粪便标本直接RT-PCR的阳性率高.; 田薇邓亚军吴清发王绪敏杨玲张峰刘晨辉包其郁汪建杨焕明刘明旭; 关键词：传染性非典型肺炎粪便标本 SARS-COV

包其郁

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