廖玲洁 作品数:79 被引量:328 H指数:11 供职机构: 中国疾病预防控制中心性病艾滋病预防控制中心 更多>> 发文基金: 国家科技重大专项 国家自然科学基金 艾滋病和病毒性肝炎等重大传染病防治专项 更多>> 相关领域: 医药卫生 建筑科学 自动化与计算机技术 石油与天然气工程 更多>>
HIV耐药对低病毒载量的AIDS病人治疗预后的影响 被引量:3 2012年 目的探索艾滋病病毒(Human immunodeficiency virus,HIV)病毒载量<1 000拷贝/mL的病人的耐药情况,以及耐药对后期治疗效果的影响。方法从安徽、河南等7个地区选取97例病毒载量大于检测限,同时<1 000拷贝/mL的血浆样本,采用实验室自制(in house)方法扩增pol区的蛋白酶和反转录酶基因区,片段长度1.3kb,测得序列并经编辑后,提交至Stanford HIV Drug Resistance Database(http://hivdb.Stanford.edu),分析耐药位点与耐药程度。结果在耐药毒株出现的初期,非核苷类反转录酶抑制剂是主要耐药药物,特别是对其中奈韦拉平(Nevirapine,NVP)的耐药是导致病人耐药的主要因素。在病毒载量>150拷贝/mL<1 000拷贝/mL的病人中,随着治疗时间延长,其耐药位点增加,耐药谱扩大(耐受药物种类与>1 000拷贝/mL的治疗失败病人相似)。结论在条件允许的情况下,应关注病毒反弹早期还处于低病毒载量的病人,其耐药检测结果可以有效预测后期的治疗失败和耐药发生。 王允琮 邢辉 廖玲洁 马鹏飞 赵全壁 崔卫国 苏斌 阮玉华 邵一鸣我国主要HIV-1流行株耐药基因型检测方法的研究 被引量:2 2012年 目的研究针对中国主要HIV-1流行株优化的实验室自建耐药基因型实验室自建检测方法(in—house)的扩增效果及检测敏感度。方法选取中国主要流行亚型的B、CRF07-BC、CRF01-AE亚型各10份样本,这些样本为2007—2009年本实验室采集采自河南、新疆、湖南三地已接受抗病毒治疗患者的样本,并已确定亚型。选用生物梅里埃公司的NuclisensEasyQ方法对选取的30份样本的病毒载量平行进行3次病毒载量检测,取平均值作为载量数值。对每份样本用HIV阴性血浆进行5个浓度的梯度稀释,稀释为〉1000、401~1000、101~400、50~100和〈50拷贝/ml5个浓度梯度。提取核酸后,进行RT—PCR和巢式PCR扩增,对扩增结果进行统计扩增结果,确定每种亚型的扩增效果和最低检测限。随机选取12份样本的初浓度和最低浓度进行测序,对测序结果进行耐药结果分析和序列一致性分析。结果所选样本的病毒载量介于2.03×102~5.92×104拷贝/ml之间。自建的In—house法对载量50—1000拷贝/ml范围的样本仍可达到较高的扩增效果(86%)。样本稀释前后耐药位点相似,序列一致性在97%以上,在低病毒载量时优势病毒株的检测则更敏感。结论自建的实验室方法的灵敏度较高,对低病毒载量水平的样本仍有较高的扩增效果。 牛建丽 邢辉 廖玲洁 钟平 马鹏飞 王允琮 赵全壁 邵一鸣关键词:抗病毒治疗 病毒载量 基因型 聚合酶链反应 广西2004——2019年初始抗病毒治疗儿童HIV感染者生长发育情况分析 被引量:1 2022年 目的 了解初始抗病毒治疗儿童HIV感染者的生长发育情况及其影响因素。方法 采用回顾性队列研究方法,从国家艾滋病抗病毒治疗信息系统下载广西2004—2019年初始抗病毒治疗儿童HIV感染者数据库。根据中国儿童生长发育标准计算Z评分,趋势性分析采用Cox-Stuart检验,广义估计方程用于分析HAZ(height-for-age Z-score)≥-2和WAZ(weight-for-age Z-score)≥-2的影响因素。结果 共计943例儿童HIV感染者进入队列。基线和治疗后第1、2、5、10年的HAZ中位数分别为-2.47、-2.14、-1.94、-1.55、-1.23,WAZ中位数分别为-1.85、-1.40、-1.30、-1.21、-1.09。经Cox-Stuart趋势检验,HAZ和WAZ随治疗时间均呈上升趋势(P<0.05)。基线和治疗后第1、2、5、10年HAZ≥-2的比例分别为38.1%、46.5%、51.6%、66.8%和74.6%,WAZ≥-2的比例分别为57.1%、76.9%、81.1%、85.8%和89.2%。经CoxStuart趋势检验,HAZ≥-2和WAZ≥-2的比例随治疗时间均呈上升趋势(P<0.05)。多因素广义估计方程分析结果显示,与HAZ≥-2的关联性因素有初始抗病毒治疗年龄为3~7岁(a OR=0.71,95%CI:0.53~0.94)、初始抗病毒治疗年龄为>7岁(a OR=0.66,95%CI:0.47~0.93)、治疗前CD4+T淋巴细胞计数<200个/μL(a OR=0.64,95%CI:0.47~0.87)、治疗前WHO临床分期为Ⅲ/Ⅳ期(a OR=0.74,95%CI:0.56~0.97)以及治疗时间(a OR=1.01,95%CI:1.01~1.01);与WAZ≥-2的关联性因素有男性(a OR=0.72,95%CI:0.53~0.97)、治疗前WHO临床分期为Ⅲ/Ⅳ期(a OR=0.63,95%CI:0.45~0.86)以及治疗时间(a OR=1.01,95%CI:1.01~1.01)。结论 抗病毒治疗有效改善了儿童HIV感染者的生长发育状况,但治疗后第10年仍有较大比例的儿童生长发育迟缓,需加强抗病毒治疗工作人员培训和儿童HIV感染者父母宣传教育以提高抗病毒治疗效果并合理指导儿童营养。 周业胜 罗柳红 林玫 陈宏利 黄精华 朱秋映 陈欢欢 刘秀 沈智勇 李剑军 冯毅 李丹 廖玲洁 邢辉 邵一鸣 阮玉华 蓝光华关键词:儿童 艾滋病病毒 抗病毒治疗 生长发育 山西省太原市MSM人群HIV-1毒株传播与耐药特征研究 被引量:1 2023年 目的了解山西省太原市男男同性性行为(man who sex with man,MSM)人群新报告I型艾滋病病毒(human immunodeficiency virus-1,HIV-1)感染者毒株传播与耐药特征。方法对山西省太原市2016—2021年MSM人群中部分新报告HIV-1感染者进行调查和采样,提取病毒RNA并扩增获得pol区序列,对序列进行亚型判定、耐药位点和分子网络分析,通过SAS 9.4对数据进行分析。结果共获得505条序列,发现流行的主要亚型为CRF01_AE(44.0%,222/505)和CRF07_BC(37.6%,190/505);2019—2021年较2016—2017年CRF01_AE亚型占比下降13.9%(P=0.007)。该人群的治疗前耐药率为4.6%(23/505),针对非核苷类反转录酶抑制剂和核苷类反转录酶抑制剂的耐药位点,2019—2021年种类有所增加。在1.5%基因距离下构建分子网络,入网率为45.9%(232/505),发现一个含耐药位点G190A的传播簇。logistic回归分析显示,CRF07_BC与CRF79_0107亚型、未婚感染者的入网率较高(P<0.05)。结论2016—2021年太原市MSM人群中HIV-1新报告感染者有9种亚型,CRF01_AE、CRF07_BC和CRF79_0107三种亚型占比超过90%;亚型和耐药位点种类均有增加趋势,并且出现本地传播簇,需加强当地MSM人群的监测与干预。 梅林 王栋 郝静静 赵启玉 冯毅 车晓文 阮玉华 王蕾 甘梦泽 郑姗 廖玲洁 邢辉关键词:HIV-1 基因亚型 耐药分析 中国艾滋病病毒耐药监测回顾与展望 被引量:2 2023年 截至2021年底,全球有3 840万存活的HIV感染者,约75%的感染者接受ART[1]。HIV耐药在1989年首次被报道[2],是导致ART失败的重要原因[3]。我国免费ART在2002年开启[4],HIV耐药监测随后在2003年开展,耐药监测为ART的可持续发展、保证艾滋病防治效果提供了科学支撑。 廖玲洁 邢辉关键词:艾滋病 艾滋病病毒 抗病毒治疗 耐药 2018年我国部分省份抗病毒治疗前HIV-1整合酶抑制剂耐药流行情况 被引量:6 2021年 目的了解我国2018年部分省份抗病毒治疗前HIV感染者中整合酶抑制剂的耐药株流行情况。方法在我国不同区域的6个省份,收集部分2018年抗病毒治疗前HIV感染者血浆样本,提取病毒基因组核糖核酸,RT-PCR扩增整合酶基因片段并测序,利用进化树和HIVdb数据库,分别进行HIV亚型及耐药分析,并比较不同亚型间整合酶抑制剂相关的耐药遗传屏障差异。结果共获得序列755条,其中流行重组亚型CRF07_BC占35.9%(271例)、CRF01_AE为34.3%(259例)、CRF08_BC占15.1%(114例)、CRF55_01B占2.8%(21例)和B′_(CN)占1.7%(13例),其他重组亚型占10.2%(77例);整合酶抑制剂相关耐药突变的样本有6例,耐药率为0.8%(6例),其中1例对拉替拉韦(RAL)高度耐药,其余5例均对艾维雷韦和RAL低度耐药。相比欧美B亚型标准株HXB2,我国CRF01_AE、CRF07_BC、CRF08_BC和CRF55_01B亚型共有24个固有突变位点;与欧美B亚型比较,CRF07_BC在T66K位点上具有较高耐药遗传屏障,CRF01_AE、CRF08_BC和CRF55_01B在G140S、G140C位点上具有较高的耐药遗传屏障。结论我国2018年部分省份治疗前人群HIV-1整合酶抑制剂耐药毒株流行水平较低,主要流行重组亚型相比欧美B亚型具有较高的耐药遗传屏障。 宋畅 周佳佳 董敖渤 康瑞华 阮玉华 邵一鸣 冯毅 廖玲洁 邢辉关键词:艾滋病病毒 整合酶 新疆伊犁州未经抗病毒治疗的HIV-1感染者耐药传播水平调查 被引量:1 2018年 目的了解新疆伊犁哈萨克自治州(简称伊犁州)未经抗逆转录病毒治疗的HIV-1感染者耐药毒株传播水平。方法以2013年1—6月和2014年1—6月新诊断的HIV-1感染者为研究对象,抽血分离血浆后检测基因型耐药性,应用Stanford HIV Drug Resistance Database(http://hivdb.stanford.edu)的在线耐药序列分析软件分析病毒亚型和耐药突变情况。结果共收集401例感染者的样本及信息,检测到335份样本的基因序列,扩增率83.5%,335份样本中耐药22例、耐药率6.6%;病毒亚型以CRF07-BC为主(95.8%),其次还有B亚型(0.9%)及CRF01-AE(3.3%)。结论伊犁州未经抗病毒治疗的HIV感染者中有HIV耐药毒株传播;为保证抗病毒治疗的效果,需加强感染者在抗病毒治疗开始前与后耐药基因突变检测,针对HIV耐药传播和发生的原因积极采取措施。 佐合拉.吐尔地 廖玲洁 郑薇薇 王莉 马媛媛 关晓霞 邢辉关键词:HIV 抗病毒治疗 HIV-1 CRF08_BC亚型感染者治疗前耐药和多态性位点分析 被引量:3 2023年 目的了解我国HIV-1 CRF08_BC感染者治疗前耐药情况与基因多态性特征。方法采用横断面调查方法,收集2018年全国治疗前耐药调查中的HIV感染者血浆样本,提取RNA,扩增蛋白酶和逆转录酶(PR/RT)区基因片段并测序,利用HIVdb软件进行耐药判定,使用χ2检验分析治疗前耐药与非耐药感染者氨基酸位点突变的差异,利用CorMut R包分析耐药位点与多态性位点间突变共变异情况,运用HIV-TRACE软件构建分子传播网络。结果共获得来自25个省市的465个CRF08_BC感染者的HIV序列,总耐药率为17.8%(83/465),非核苷类逆转录酶抑制剂(NNRTIs)、核苷类逆转录酶抑制剂(NRTIs)、蛋白酶类抑制剂(PIs)耐药率分别为16.6%(77/465)、1.1%(5/465)、0.9%(4/465),其中利匹韦林(RPV)的耐药率最高(15.7%,73/465)。位点E138A耐药突变的频率最高(11.6%,54/465),有6个多态性位点(S162C、K102Q、T200A、V179E、I202V、T200M)与E138A具有协同突变关系。分子传播网络显示,含有E138耐药突变位点的感染者在云南和四川地区聚集成簇,其中云南临沧聚集程度最高。结论我国CRF08_BC感染者针对二代NNRTIs药物RPV的耐药比例较高,E138A耐药突变与多态性位点的协同突变是否会对HIV耐药程度和复制适应性产生影响,还需进一步验证。 张佳欣 胡婧 宋畅 董敖渤 李苗苗 冯毅 阮玉华 邢辉 廖玲洁关键词:多态性位点 南宁16~25岁HIV感染者中多亚型流行毒株及耐药传播现状 被引量:1 2015年 目的通过对广西壮族自治区南宁市2013-2014年HIV新发感染者毒株基因特征的研究,了解当地HIV毒株流行现状及耐药毒株传播情况。方法采集当年新确证1625岁且未接受抗病毒治疗的部分HIV-1感染者血浆样本,提取病毒RNA,通过扩增HIV-1 pol区片段,进行测序和耐药突变分析。结果2年共获得pol区序列124条,主要以CRF01AE为主(62.1%,77/124);其次也发现了CRF07BC、CRF08BC、CRF5501B和B亚型等多种亚型毒株。共有9例样本(7.3%)出现了耐药突变,其中6例为异性传播,3例为同性传播,5例针对蛋白酶类抑制剂(PIs),2例针对非核苷类抑制剂(NNRTIs),另有2例针对核苷类抑制剂(NRTIs)发生耐药突变。结论当地流行毒株主要为CRF01AE,在南宁首次发现多例CRF5501B重组亚型。广西南宁HIV-1新发感染者耐药传播水平目前超过5%,应引起高度重视,需进一步加强对新近感染者传播性耐药株的监测。 张晶 梁淑家 滕涛 农全兴 李峥 周月姣 李扬 栾苑 阮玉华 庞贤武 廖玲洁 沈智勇 邵一鸣 王露 邢辉关键词:HIV 基因序列 北京男男性行为者HIV-1基因多样性及相关因素研究 被引量:3 2020年 目的了解北京男男性行为者(MSM)1型艾滋病病毒(HIV-1)基因多样性情况及影响因素。方法对北京HIV阳性MSM采用横断面调查,通过建立的基于Illumina平台的二代测序技术(NGS),综合两个部分pol基因区片段和一个env基因区片段的结果进行亚型和系统进化分析。结果获得NGS结果的376例样本中,单一亚型样本313例(占83.2%),重组率和共感染率分别为8.2%(31例)和8.5%(32例)。313例单一亚型样本中CRF01_AE亚型188例(60.1%),CRF07_BC亚型86例(27.5%),B亚型32例(10.2%),C亚型3例(1.0%),CRF55_01B亚型4例(1.3%)。376例样本中,亚型内重组率为1.9%(7例),亚型间重组率为6.4%(24例);亚型内共感染率为1.3%(5例),亚型间共感染率为7.2%(27例)。多因素Logistic回归分析结果显示,与HIV-1基因多样性相关的影响因素是无工作(P=0.03),过去3个月使用新型毒品(P=0.03),和通过互联网寻找男性性伴侣的方式(P=0.01)。结论北京MSM的HIV感染者中有较高的HIV-1基因多样性,反映了HIV阳性MSM复杂的高危行为。 周知涵 张晶 辛若雷 阮玉华 卢红艳 冯毅 康瑞华 廖玲洁 邵一鸣 邢辉关键词:艾滋病病毒 基因多样性 共感染