廖玲洁 作品数:79 被引量:355 H指数:12 供职机构: 中国疾病预防控制中心性病艾滋病预防控制中心 更多>> 发文基金: 国家科技重大专项 国家自然科学基金 艾滋病和病毒性肝炎等重大传染病防治专项 更多>> 相关领域: 医药卫生 建筑科学 自动化与计算机技术 石油与天然气工程 更多>>
HIV耐药对低病毒载量的AIDS病人治疗预后的影响 被引量:3 2012年 目的探索艾滋病病毒(Human immunodeficiency virus,HIV)病毒载量<1 000拷贝/mL的病人的耐药情况,以及耐药对后期治疗效果的影响。方法从安徽、河南等7个地区选取97例病毒载量大于检测限,同时<1 000拷贝/mL的血浆样本,采用实验室自制(in house)方法扩增pol区的蛋白酶和反转录酶基因区,片段长度1.3kb,测得序列并经编辑后,提交至Stanford HIV Drug Resistance Database(http://hivdb.Stanford.edu),分析耐药位点与耐药程度。结果在耐药毒株出现的初期,非核苷类反转录酶抑制剂是主要耐药药物,特别是对其中奈韦拉平(Nevirapine,NVP)的耐药是导致病人耐药的主要因素。在病毒载量>150拷贝/mL<1 000拷贝/mL的病人中,随着治疗时间延长,其耐药位点增加,耐药谱扩大(耐受药物种类与>1 000拷贝/mL的治疗失败病人相似)。结论在条件允许的情况下,应关注病毒反弹早期还处于低病毒载量的病人,其耐药检测结果可以有效预测后期的治疗失败和耐药发生。 王允琮 邢辉 廖玲洁 马鹏飞 赵全壁 崔卫国 苏斌 阮玉华 邵一鸣我国主要HIV-1流行株耐药基因型检测方法的研究 被引量:2 2012年 目的研究针对中国主要HIV-1流行株优化的实验室自建耐药基因型实验室自建检测方法(in—house)的扩增效果及检测敏感度。方法选取中国主要流行亚型的B、CRF07-BC、CRF01-AE亚型各10份样本,这些样本为2007—2009年本实验室采集采自河南、新疆、湖南三地已接受抗病毒治疗患者的样本,并已确定亚型。选用生物梅里埃公司的NuclisensEasyQ方法对选取的30份样本的病毒载量平行进行3次病毒载量检测,取平均值作为载量数值。对每份样本用HIV阴性血浆进行5个浓度的梯度稀释,稀释为〉1000、401~1000、101~400、50~100和〈50拷贝/ml5个浓度梯度。提取核酸后,进行RT—PCR和巢式PCR扩增,对扩增结果进行统计扩增结果,确定每种亚型的扩增效果和最低检测限。随机选取12份样本的初浓度和最低浓度进行测序,对测序结果进行耐药结果分析和序列一致性分析。结果所选样本的病毒载量介于2.03×102~5.92×104拷贝/ml之间。自建的In—house法对载量50—1000拷贝/ml范围的样本仍可达到较高的扩增效果(86%)。样本稀释前后耐药位点相似,序列一致性在97%以上,在低病毒载量时优势病毒株的检测则更敏感。结论自建的实验室方法的灵敏度较高,对低病毒载量水平的样本仍有较高的扩增效果。 牛建丽 邢辉 廖玲洁 钟平 马鹏飞 王允琮 赵全壁 邵一鸣关键词:抗病毒治疗 病毒载量 基因型 聚合酶链反应 广西2004——2019年初始抗病毒治疗儿童HIV感染者生长发育情况分析 被引量:1 2022年 目的 了解初始抗病毒治疗儿童HIV感染者的生长发育情况及其影响因素。方法 采用回顾性队列研究方法,从国家艾滋病抗病毒治疗信息系统下载广西2004—2019年初始抗病毒治疗儿童HIV感染者数据库。根据中国儿童生长发育标准计算Z评分,趋势性分析采用Cox-Stuart检验,广义估计方程用于分析HAZ(height-for-age Z-score)≥-2和WAZ(weight-for-age Z-score)≥-2的影响因素。结果 共计943例儿童HIV感染者进入队列。基线和治疗后第1、2、5、10年的HAZ中位数分别为-2.47、-2.14、-1.94、-1.55、-1.23,WAZ中位数分别为-1.85、-1.40、-1.30、-1.21、-1.09。经Cox-Stuart趋势检验,HAZ和WAZ随治疗时间均呈上升趋势(P<0.05)。基线和治疗后第1、2、5、10年HAZ≥-2的比例分别为38.1%、46.5%、51.6%、66.8%和74.6%,WAZ≥-2的比例分别为57.1%、76.9%、81.1%、85.8%和89.2%。经CoxStuart趋势检验,HAZ≥-2和WAZ≥-2的比例随治疗时间均呈上升趋势(P<0.05)。多因素广义估计方程分析结果显示,与HAZ≥-2的关联性因素有初始抗病毒治疗年龄为3~7岁(a OR=0.71,95%CI:0.53~0.94)、初始抗病毒治疗年龄为>7岁(a OR=0.66,95%CI:0.47~0.93)、治疗前CD4+T淋巴细胞计数<200个/μL(a OR=0.64,95%CI:0.47~0.87)、治疗前WHO临床分期为Ⅲ/Ⅳ期(a OR=0.74,95%CI:0.56~0.97)以及治疗时间(a OR=1.01,95%CI:1.01~1.01);与WAZ≥-2的关联性因素有男性(a OR=0.72,95%CI:0.53~0.97)、治疗前WHO临床分期为Ⅲ/Ⅳ期(a OR=0.63,95%CI:0.45~0.86)以及治疗时间(a OR=1.01,95%CI:1.01~1.01)。结论 抗病毒治疗有效改善了儿童HIV感染者的生长发育状况,但治疗后第10年仍有较大比例的儿童生长发育迟缓,需加强抗病毒治疗工作人员培训和儿童HIV感染者父母宣传教育以提高抗病毒治疗效果并合理指导儿童营养。 周业胜 罗柳红 林玫 陈宏利 黄精华 朱秋映 陈欢欢 刘秀 沈智勇 李剑军 冯毅 李丹 廖玲洁 邢辉 邵一鸣 阮玉华 蓝光华关键词:儿童 艾滋病病毒 抗病毒治疗 生长发育 山西省太原市MSM人群HIV-1毒株传播与耐药特征研究 被引量:1 2023年 目的了解山西省太原市男男同性性行为(man who sex with man,MSM)人群新报告I型艾滋病病毒(human immunodeficiency virus-1,HIV-1)感染者毒株传播与耐药特征。方法对山西省太原市2016—2021年MSM人群中部分新报告HIV-1感染者进行调查和采样,提取病毒RNA并扩增获得pol区序列,对序列进行亚型判定、耐药位点和分子网络分析,通过SAS 9.4对数据进行分析。结果共获得505条序列,发现流行的主要亚型为CRF01_AE(44.0%,222/505)和CRF07_BC(37.6%,190/505);2019—2021年较2016—2017年CRF01_AE亚型占比下降13.9%(P=0.007)。该人群的治疗前耐药率为4.6%(23/505),针对非核苷类反转录酶抑制剂和核苷类反转录酶抑制剂的耐药位点,2019—2021年种类有所增加。在1.5%基因距离下构建分子网络,入网率为45.9%(232/505),发现一个含耐药位点G190A的传播簇。logistic回归分析显示,CRF07_BC与CRF79_0107亚型、未婚感染者的入网率较高(P<0.05)。结论2016—2021年太原市MSM人群中HIV-1新报告感染者有9种亚型,CRF01_AE、CRF07_BC和CRF79_0107三种亚型占比超过90%;亚型和耐药位点种类均有增加趋势,并且出现本地传播簇,需加强当地MSM人群的监测与干预。 梅林 王栋 郝静静 赵启玉 冯毅 车晓文 阮玉华 王蕾 甘梦泽 郑姗 廖玲洁 邢辉关键词:HIV-1 基因亚型 耐药分析 中国艾滋病病毒耐药监测回顾与展望 被引量:6 2023年 截至2021年底,全球有3 840万存活的HIV感染者,约75%的感染者接受ART[1]。HIV耐药在1989年首次被报道[2],是导致ART失败的重要原因[3]。我国免费ART在2002年开启[4],HIV耐药监测随后在2003年开展,耐药监测为ART的可持续发展、保证艾滋病防治效果提供了科学支撑。 廖玲洁 邢辉关键词:艾滋病 艾滋病病毒 抗病毒治疗 耐药 2018年我国部分省份抗病毒治疗前HIV-1整合酶抑制剂耐药流行情况 被引量:9 2021年 目的了解我国2018年部分省份抗病毒治疗前HIV感染者中整合酶抑制剂的耐药株流行情况。方法在我国不同区域的6个省份,收集部分2018年抗病毒治疗前HIV感染者血浆样本,提取病毒基因组核糖核酸,RT-PCR扩增整合酶基因片段并测序,利用进化树和HIVdb数据库,分别进行HIV亚型及耐药分析,并比较不同亚型间整合酶抑制剂相关的耐药遗传屏障差异。结果共获得序列755条,其中流行重组亚型CRF07_BC占35.9%(271例)、CRF01_AE为34.3%(259例)、CRF08_BC占15.1%(114例)、CRF55_01B占2.8%(21例)和B′_(CN)占1.7%(13例),其他重组亚型占10.2%(77例);整合酶抑制剂相关耐药突变的样本有6例,耐药率为0.8%(6例),其中1例对拉替拉韦(RAL)高度耐药,其余5例均对艾维雷韦和RAL低度耐药。相比欧美B亚型标准株HXB2,我国CRF01_AE、CRF07_BC、CRF08_BC和CRF55_01B亚型共有24个固有突变位点;与欧美B亚型比较,CRF07_BC在T66K位点上具有较高耐药遗传屏障,CRF01_AE、CRF08_BC和CRF55_01B在G140S、G140C位点上具有较高的耐药遗传屏障。结论我国2018年部分省份治疗前人群HIV-1整合酶抑制剂耐药毒株流行水平较低,主要流行重组亚型相比欧美B亚型具有较高的耐药遗传屏障。 宋畅 周佳佳 董敖渤 康瑞华 阮玉华 邵一鸣 冯毅 廖玲洁 邢辉关键词:艾滋病病毒 整合酶 新疆伊犁州未经抗病毒治疗的HIV-1感染者耐药传播水平调查 被引量:1 2018年 目的了解新疆伊犁哈萨克自治州(简称伊犁州)未经抗逆转录病毒治疗的HIV-1感染者耐药毒株传播水平。方法以2013年1—6月和2014年1—6月新诊断的HIV-1感染者为研究对象,抽血分离血浆后检测基因型耐药性,应用Stanford HIV Drug Resistance Database(http://hivdb.stanford.edu)的在线耐药序列分析软件分析病毒亚型和耐药突变情况。结果共收集401例感染者的样本及信息,检测到335份样本的基因序列,扩增率83.5%,335份样本中耐药22例、耐药率6.6%;病毒亚型以CRF07-BC为主(95.8%),其次还有B亚型(0.9%)及CRF01-AE(3.3%)。结论伊犁州未经抗病毒治疗的HIV感染者中有HIV耐药毒株传播;为保证抗病毒治疗的效果,需加强感染者在抗病毒治疗开始前与后耐药基因突变检测,针对HIV耐药传播和发生的原因积极采取措施。 佐合拉.吐尔地 廖玲洁 郑薇薇 王莉 马媛媛 关晓霞 邢辉关键词:HIV 抗病毒治疗 柳州市1998-2012年新发现HIV基因亚型变化及HIV感染者首次CD4^+T淋巴细胞计数比较 被引量:6 2019年 目的分析柳州市1998-2012年新发现HIV基因亚型变化,比较HIV感染者首次CD4^+T淋巴细胞计数(CD4),为艾滋病防治提供参考依据。方法选取我国艾滋病综合防治信息系统中1998-2012年柳州市新发现HIV感染者,对其血浆进行RNA提取、扩增、测序和分型。采用Coharan-Armitage趋势检验法分析HIV基因亚型变化的趋势,采用Wilcoxon秩和检验法分析比较HIV感染者的首次CD4。结果研究对象共有1877例HIV感染者。1998-2012年,CRF01_AE、CRF01_AE(Cluster1)和CRF07_BC亚型构成比分别从78.4%(76/97)上升至91.5%(1441/1574)、63.9%(62/97)上升至74.0%(1164/1574)和17.5%(17/97)下降至4.6%(72/1574),趋势性检验差异均有统计学意义(Z=4.632,P<0.001;Z=2.455,P=0.014;Z=-5.943,P<0.001)。CRF01_AE(Cluster1)、CRF01_AE(Cluster2)、CRF07_BC和CRF08_BC亚型HIV感染者首次CD4的中位数及四分位数间距分别是230(83~375)、215(48~351)、365(254~503)和334(206~479)个/μl。CRF01_AE(Cluster1)和CRF01_AE(Cluster2)亚型HIV感染者的首次CD4均 曹志强 杨文敏 朱秋映 蓝光华 沈智勇 梁淑家 李剑军 陈欢欢 冯毅 何翔 廖玲洁 邢辉 阮玉华 邵一鸣关键词:HIV-1 基因亚型 CD4^+T淋巴细胞计数 长期ART的AIDS病人更换二线药物的效果及耐药情况 被引量:7 2013年 目的分析接受一线抗病毒治疗(ART)时间较长的艾滋病(AIDS)病人,更换二线药物后的治疗效果及相关耐药位点的变化。方法在河南和安徽采用随访观察的方法,比较更换二线药物前和换药10个月左右,AIDS病人病毒及免疫学指标的变化情况。结果共调查68名AIDS病人,更换抗病毒药物前治疗时间中位数为77个月。病毒载量(VL)≥1 000拷贝/mL组,在换药后病毒抑制率为79.1%(34/43),换药前后的耐药率分别为76.7%和9.3%(P<0.05);CD+4T淋巴细胞中位数分别为186个/μL和320个/μL(P<0.05)。耐药组换药后的耐药率为11.4%(4/35),换药后病毒抑制率由换药前的5.7%上升到82.9%(P<0.05);换药前后CD+4T淋巴细胞中位数分别为187个/μL和325个/μL(P<0.05)。换药前常见的耐药位点包括K103N、Y181C、TAMs、M184V和69位插入复合体,而换药后的蛋白酶抑制剂(PIs)突变位点为M46I。结论对于长期接受一线ART且病毒载量≥1 000拷贝/mL或耐药的病人,更换二线药物后可取得较好的临床效果;而对于病毒载量<1 000拷贝/mL或非耐药的病人,如何换药仍需进一步研究。 王晶 刘佳 吴建军 廖玲洁 崔为国 王允琮 苏斌 赵全璧 王霞 阮玉华 邵一鸣 邢辉关键词:艾滋病病毒 耐药突变 2004-2022年我国HIV-1 CRF08_BC亚型感染者抗病毒治疗前耐药分析 被引量:3 2024年 目的了解我国HIV-1 CRF08_BC未抗病毒治疗感染者对蛋白酶类抑制剂(PIs)、核苷类反转录酶抑制剂(NRTIs)、非核苷类反转录酶抑制剂(NNRTIs)的耐药情况。方法收集2004—2022年全国耐药调查以及Los Alamos HIV基因数据库中未治疗感染者的CRF08_BC亚型序列,利用美国斯坦福大学Los Alamos HIV基因数据库进行耐药判定,采用HIV-TRACE软件进行HIV-1耐药传播网络分析。结果收集HIV-1 CRF08_BC序列4539条,总耐药率为15.27%(693/4539)。PIs、NRTIs和NNRTIs的耐药率分别为1.70%(77/4539)、1.85%(84/4539)、12.91%(586/4539);其中利匹韦林(RPV)的耐药率最高,为11.28%(512/4539)。多重耐药率为0.1%(44/4539)。结论近年来我国CRF08_BC感染者耐药率不断升高,主要由NNRTIs药物耐药率逐年上升引起,其中RPV的耐药率最高,且存在耐药毒株的传播,治疗前耐药对我国抗病毒治疗效果的影响还需进一步监测和分析。 辛沛贤 宋畅 胡婧 刘秀 王栋 李苗苗 李彦潼 冯毅 阮玉华 邢辉 邵一鸣 廖玲洁关键词:耐药突变