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柳菁筠
作品数:
4
被引量:3
H指数:1
供职机构:
海南师范大学
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发文基金:
海南省自然科学基金
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相关领域:
生物学
理学
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合作作者
李大超
海南师范大学数学与统计学院数学...
刘兵
海南师范大学数学与统计学院
王天明
海南师范大学
李云海
海南师范大学
周新媛
海南师范大学
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海南师范大学
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周新媛
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李云海
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王天明
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海南师范学院...
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海南师范大学...
年份
1篇
2011
1篇
2009
1篇
2008
1篇
2007
共
4
条 记 录,以下是 1-4
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被引量排序
时效排序
一种新的相似性度量及其在DNA序列相似性分析中的应用(英文)
被引量:2
2009年
衡量序列之间距离的传统方法是通过局部比对或者全局比对来实现的,其运算的时间复杂度和空间复杂度随着序列长度的增加而急剧上升.本文提出一种新的相似性度量,它是建立在Lempel-Ziv复杂度基础之上的,不需要通过序列之间的比对来实现,其时间和空间复杂度比传统方法降低了很多.用这种新的相似性度量的方法可以算出序列间的相似性矩阵,以此来刻画不同序列之间的距离.为了说明此方法的可靠性,最后对多个物种DNA序列作了相似性分析.
刘兵
柳菁筠
李大超
计算分子生物学中若干问题的研究
李大超
廖波
王天明
朱雯
周新媛
陈淑贞
李云海
陈继元
伊丽江
柳菁筠
刘兵
该成果建立了一个基于简化网格的序列比对模型,提出了一种蚁群双序列比对算法,并采用智能修正蚂蚁方向的策略对算法进行了改进。根据20种氨基酸的分类方式将蛋白序列转换为编码序列,基于编码序列分别计算蛋白序列的分组重量编码和距离...
关键词:
关键词:
分子生物学
生物序列进化树的构建
随着一些微生物基因组、人类基因组、拟南芥基因组和水稻基因组全序列测定项目的完成和快速进展,以及各种生物的基因和蛋白序列的研究,产生了越来越多庞大的分子序列数据。计算分子生物学是一门崭新的交叉学科,主要是研究分子生物学应用...
柳菁筠
关键词:
分子生物学
基因工程
生物序列
进化树
计算数学
文献传递
用基于模糊聚类的Kruskal算法构建进化树
被引量:1
2007年
对线粒体DNA序列可通过图形表示及计算曲线的散度均值来构造模糊论中的相似矩阵,基于这些,提出一种新的方法:用模糊聚类图论法中的Kruskal算法来进行系统进化树的重构,并选取了8个物种的线粒体DNA序列来说明此方法.
柳菁筠
李大超
关键词:
DNA
进化树
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