潘玉春
- 作品数：170 被引量：583H指数：12
- 供职机构：上海交通大学农业与生物学院更多>>
- 发文基金：国家自然科学基金国家重点基础研究发展计划国家高技术研究发展计划更多>>
- 相关领域：农业科学生物学医药卫生自动化与计算机技术更多>>
- 一种新的分子遗传相似度计算方法被引量：11
- 2001年
- 指出了Nei氏遗传相似度仅仅是用来描述两个二进制变量差异或相似程度的一种距离系数或相似系数 ,与个体间亲缘程度没有必然联系。根据亲缘系数的定义 ,提出新的遗传相似度计算公式即rA(x ,y) =2N2xyNxNy或rA(x ,y) =N2xyNxNy。并通过实例验证了该公式可用于判断个体间亲缘程度方面。
- 高会江杨运清潘玉春
- 关键词：亲缘系数
- 动物保种群有效含量的估计方法被引量：1
- 2003年
- 针对动物保种群的特点,指出了现行群体有效含量估计方法之不足;提出在估计保种群有效含量时应同时考虑来自群体数量结构与亲缘关系两个方面因素的影响;在改变了理想群体一个条件的前提下,推导出亲缘群有效含量的估计公式:或还给出保种群在两性数目不等情况下有效含量的估计方法,并通过举例演示了运用新公式的具体计算过程。1Ne=23N1+1∑N2Ni=∑12Nj=i+1F()ijNe=1.
- 孙华杨润清潘玉春
- 关键词：亲缘关系估计方法动物
- 基于基因组遗传标记的上海白猪(上系)杂交优势预测分析被引量：4
- 2018年
- 通过基于基因组遗传标记的杂交优势预测分析,筛选上海白猪(上系)最优杂交配套组合,以期促进上海白猪(上系)的保种工作,为优质猪肉的生产奠定基础。基于99头上海白猪(上系)与156头国内主要的引进品种(杜洛克、长白猪、大白猪、皮特兰、巴克夏猪)全基因组简化测序得到的100 120个SNP遗传标记,结合性状特异的杂种优势预测方法,利用二元杂交,三元杂交和四元杂交方式,进行了上海白猪(上系)的杂种优势预测。结果显示:二元杂交杜上(DS)、长上(LS)的杂种优势较高,三元杂交的三元杂种肉猪上长大(SLY)最好,双杂交的四元杂种肉猪杜长大上(DLYS)最优、杜上长大(DSLY)次之。针对繁殖、育肥、胴体与肉质性能等多个指标,综合考虑经营管理、成本及当前市场对优质猪肉的需求,确定上海白猪(上系)与长大二元杂种母猪的杂交组合(S×LY)为最宜的杂交配套系组合。
- 盛中华陈国宏陈国宏潘玉春王起山
- 关键词：猪基因组SNP杂交优势
- 山羊生长激素基因部分序列的PCR-SSCP分析被引量：9
- 2004年
- 以鲁北白山羊、波尔山羊和波尔山羊与鲁北白山羊的杂交一代、回交一代共计 2 74个个体为研究材料 ,对山羊生长激素基因 5′调控区 - 4 0 6～ - 1 93片段进行PCR扩增 ,扩增产物经SSCP分析发现存在多态性。结果表明发现波尔山羊及杂交后代以AA型占多数 ,而鲁北白山羊则BB型个体较多 ,基因型频率在品种间存在显著差异 (P <0 .0 5 )。对该片段的两种纯合型克隆测序发现 :AA型在第 6 0位发生了C→T的突变 ,第 2 1
- 李美玉闵令江潘庆杰潘玉春王天津
- 关键词：兽医科学基础学科生长激素基因PCR-SSCP山羊
- SREBP1及其靶基因在胆固醇生物合成过程中作用机理的研究
- 本文通过荧光定量PCR方法对不同蛋白质营养水平下宁乡猪和杜长大猪7个组织中的基因表达进行检测,分析了SREBP1基因及其三个在胆固醇生物合成通路中的靶基因HMGCR、IDI1和SC4MOL的表达情况。结果表明:①猪群因素...
- 蒋越何侃高运臻王起山俞沛初潘玉春
- 关键词：胆固醇生物合成基因表达靶基因
- 山羊GH基因5'调控区的单核苷酸多态性研究被引量：5
- 2004年
- 以鲁北白山羊、引进波尔山羊、纯繁波尔山羊以及鲁北白山羊与波尔山羊的杂交一代、回交一代共计274个山羊个体为研究材料,采用PCR-SSCP方法对山羊生长激素基因5'调控区的225～429bp片段进行多态性分析,发现该片断存在多态性。对两种纯合型(CC、DD)个体分别进行测序分析后发现,DD型存在3处突变,分别为264位由t→c,292位由t→a,372位由c→t。
- 李美玉潘玉春潘庆杰闵令江任正友任志强
- 关键词：山羊GH基因单核苷酸PCR-SSCP生长激素基因
- 猪促卵泡激素β亚基基因单体型的分离鉴定方法
- 本发明涉及一种猪促卵泡激素β亚基基因单体型的分离鉴定方法，属于家畜分子生物学技术领域。方法步骤包括，提取猪的基因组DNA，猪促卵泡激素β亚基基因的PCR(聚合酶链式反应)扩增，扩增产物的多态性检测，单体型的构建及其与猪繁...
- 潘玉春王起山李媛媛于丹丹李婧
- 文献传递
- 猪5羟色胺4受体b亚型的基因序列
- 一种猪的5羟色胺4受体b亚型的基因序列。用于基因工程技术领域。从猪的结肠组织总RNA中扩增出的5羟色胺4受体b亚型基因的核苷酸序列，该基因全长1209bp，开放阅读框1bp－1209bp区段，编码有402个氨基酸的蛋白质...
- 潘玉春赵威孟和白春艳李婧
- 文献传递
- 单体型关联分析方法研究进展被引量：1
- 2008年
- 基于单体型的分析方法在当前的复杂疾病和数量性状候选基因的研究中扮演越来越重要的角色。本文综述了开展单体型关联分析研究的动机,单体型的生物功能及单体型的统计优势。介绍了单体型关联分析的回归分析模型,应用的局限和需要进一步的研究的领域。
- 王起山潘玉春胡艳玲
- 关键词：单体型
- 小干扰RNA抑制neuro-2a细胞内源β位淀粉样前体蛋白裂解酶1基因的表达被引量：1
- 2007年
- 目的:分析小干扰RNA(small interference RNA,siRNA)抑制neuro-2a细胞内源β位淀粉样前体蛋白裂解酶1基因(Beta-site APP cleaving enzyme protein,BACE1)的表达情况。方法:实验于2004-12/2006-06在中山大学中山医学院和上海交通大学农业与生物学院完成。①用脂质体将EGFP基因表达载体pEGFP-C1 Vector和体外转录合成的针对EGFP基因的小干扰RNA(siEGFP)分别或同时转染neuro-2a细胞,在倒置荧光显微镜下计算EGFP在neuro-2a细胞中的表达率。②将体外转录合成的siBACE1-1,siBACE1-2,siBACE1-3转染neuro-2a细胞,干扰24,48,72h后分别用Real time RT-PCR定量分析siBACE1对内源BACE1基因表达的抑制率和干扰的时效性。结果:①外源EGFP基因转染neuro-2a细胞后,43%neuro-2a细胞高表达EGFP蛋白。通过转染siEGFP则可有效抑制EGFP基因表达。②3个干扰位点的siBACE1对BACE1基因表达有不同的抑制效率,siBACE1-3使BACE1m RNA表达水平下降60%,siBACE1-1为13%,siBACE1-2对BACE1 mRNA无明显的抑制作用。③siBACE1抑制内源BACE1基因的表达与干扰时间相关,siBACE1干扰24h、48h后BACE1 mRNA的表达与正常组无明显差异(P>0.05),但干扰72h后,siBACE1-3和siBACE1-1均使BACE1 mRNA表达量下降。结论:体外转录合成的siBACE1能有效抑制neuro-2a细胞内源BACE1基因表达,其抑制率与BACE1基因的干扰位点和干扰时间相关。
- 张小勤李峰赵艳彭映基潘玉春崔芳岩孟和
- 关键词：BACE1
