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纪蕾: 作品数：82 被引量：320H指数：8; 供职机构：湖州市疾病预防控制中心更多>>; 发文基金：湖州市科技计划项目浙江省医药卫生科学研究基金湖州市自然科学基金更多>>; 相关领域：医药卫生轻工技术与工程农业科学生物学更多>>

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湖州市非细菌性急性胃肠炎暴发中诺如病毒的分子生物学特点初步研究被引量：5: 2011年; 本文初步研究了湖州市非细菌性急性胃肠炎暴发中检出的诺如病毒的分子生物学特征。收集湖州市2008年和2009年2起非细菌性急性胃肠炎暴发疫情中采集的患者粪便标本,采用荧光定量RT-PCR方法对其进行诺如病毒核酸检测,并对核酸阳性标本进行RNA多聚酶部分区域的RT-PCR扩增。选取阳性扩增产物进行纯化及序列测定,结合诺如病毒GI、GII各基因型参考株进行核苷酸序列遗传进化分析。结果2起疫情均同时检出了GI和GII型诺如病毒。随后对其中4份RNA多聚酶区扩增阳性的标本进行测序及序列分析,结果发现2008年检出的2株GI型诺如病毒均为GI/2基因型;而2009年检出的1株GI型诺如病毒为GI/3基因型,另一株GII型诺如病毒则与近些年欧洲和亚洲相继出现的遗传组GII的新基因型GIIb的各代表株同源性最高,为GIIb基因型。这说明湖州地区流行的诺如病毒存在很高的遗传多样性,并且不同时间流行的基因型也存在一定差异。这也是国内首次在急性病毒性胃肠炎暴发中检出诺如病毒GIIb变异株。; 纪蕾吴晓芳徐德顺龚黎明; 关键词：诺如病毒

2023年浙江省湖州市一起食源性疾病暴发事件病原学分析: 2024年; 目的对2023年浙江省湖州市一起食源性暴发事件进行病原菌的鉴定和溯源分析,查明事件暴发的原因。方法采集此次事件中相关人员的肛拭子、粪便和涂抹物等样本进行致病菌分离培养。经FilmArray多病原分子检测系统初筛后,用飞行质谱仪鉴定分离到的菌株,并进行药物敏感性试验。采用脉冲场凝胶电泳(PFGE)法对本次事件的检出菌进行聚类分析,并进行全基因组测序,通过基因注释和序列比对分析病原菌的毒力因子与耐药基因,基于单核苷酸多态性(SNP)构建系统发育树对病原菌进行溯源分析。结果本次共分离出8株副溶血弧菌,均来自患者。8株菌分为O10:K4和O3:K6两个血清型,相同血清型菌株PFGE带型相同,8株菌均对头孢唑啉耐药,且携带相同的耐药基因。相同血清型菌株间SNP变异位点不超过9个,SNP进化分析提示相同血清型菌株同源。结论副溶血弧菌为本次事件的致病菌。全基因组测序技术可作为PFGE分子分型的补充应用于病原菌的监测和暴发事件调查。; 严伟董芬芬纪蕾陈莉萍袁瑞张鹏; 关键词：副溶血弧菌食源性疾病病原学特征

2018—2020年湖州市食源性疾病患者感染沙门菌耐药与分子分型研究被引量：5: 2022年; 目的分析湖州市食源性疾病患者所分离沙门菌的血清型别、耐药状况以及分子分型特征,为沙门菌引起的食源性疾病防治提供科学依据。方法收集2018—2020年湖州市6家食源性疾病监测哨点医院分离到的105株阳性沙门菌株,采用玻片凝集法、微量肉汤稀释法和脉冲场凝胶电泳(pulsed-field gel electrophoresis,PFGE)法,分别进行血清学分型、抗生素最小抑菌浓度测定和分子分型。结果105株沙门菌主要是鼠伤寒沙门菌(37/105)和肠炎沙门菌(19/105)。沙门菌菌株对30种抗生素的耐药率为0%~70.48%,氨苄西林耐药率最高,达到70.48%(74/105),其次为四环素和多西环素,耐药率分别为67.67%(71/105)和65.71%(69/105)。分子分型显示,经XbaⅠ酶酶切后,105株沙门菌产生93个PFGE带型,各带型相似度28.50%~100.00%。结论湖州地区食源性沙门菌耐药情况严重,PFGE带型既有多样性,又具有优势带型。; 严伟查赟峰纪蕾沈月华吴丹青; 关键词：沙门菌食源性疾病耐药性脉冲场凝胶电泳分子分型

一种引物及利用该引物检测GⅠ型GⅡ型诺如病毒的方法: 本发明涉及一种引物及利用该引物检测GⅠ型GⅡ型诺如病毒的方法，属于生物检测技术领域。一种引物，它的序列如下：Nov-F：5-GTGAATGAWGATGGCGTCKA-3，Nov-R：5-GTHAGWATCCAGGGGTC...; 韩建康张红河吴晓芳纪蕾徐德顺汤仁树; 文献传递

湖州市严重急性呼吸道感染儿童病例中人偏肺病毒的流性特征分析: 2023年; 目的为了解湖州市严重急性呼吸道感染(SARI)儿童住院病例中人偏肺病毒(hMPV)的流行特征。方法收集2021年1月-2022年12月湖州市第一人民医院SARI儿童住院病例的咽拭子标本,采用多重荧光PCR的方法进行hMPV及其他常见呼吸道病毒检测。hMPV阳性样品进一步对其F基因进行测序已确定其基因型别。结果共收集629例SARI儿童住院病例标本,病毒检出阳性率为20.03%(126/629)。其中呼吸道合胞病毒RSV检出阳性率最高,为9.38%(59/629),人偏肺病毒hMPV检出阳性率为2.07%(13/629)。hMPV感染在各年龄组儿童均有发现,其中>1岁~3岁组检出阳性率最高。hMPV的检出高峰主要集中在冬季和春季。基于F基因的系统进化分析显示湖州地区流行的hMPV包括A、B2个基因型,其中B1基因亚型4例,B2基因亚型2例,A2c基因亚型4例,未检出A1基因亚型。结论湖州地区hMPV感染呈季节性流行,存在A2c基因亚型、B1基因亚型和B2基因亚型共流行。; 纪蕾徐德顺卢忠豪; 关键词：人偏肺病毒基因分型

光滑假丝酵母菌ITSⅠ区PCR-SSCP分子流行病学分析: 2008年; 目的建立基于聚合酶链反应的单链构象多态性分析(PCR-SSCP)技术,对引起常见医院感染的光滑假丝酵母菌进行基因多态性分析,并探讨改善其灵敏度和分辨率的优化条件。方法采用PCR-SSCP技术对临床分离的19株光滑假丝酵母菌以及1株标准株ATCC90030的rDNA的ITSⅠ区(引物ITS1/ITS2)和ITSⅡ区(引物ITS3/ITS4)多态性进行分析,并对PCR-SSCP的条件进行优化。结果ITSⅠ区较ITSⅡ区保守性低,变异性较强,较为适合SSCP分型。针对ITSⅠ区,SSCP电泳在无甘油时,4℃和15℃均将菌株分为6型,但各型所含菌株不同;存在5%甘油时,SSCP电泳分辨率明显增高。结论在15℃及5%甘油存在的条件下,针对ITSI区的PCR-SSCP分型是一种快速、简便的适合于致医院感染光滑假丝酵母菌分型的新流行病学研究手段。; 王菡于仁涛刘建玲纪蕾韩黎; 关键词：光滑假丝酵母菌 PCR-SSCP 流行病学研究真菌

2021-2022年湖州市监测哨点医院感染性腹泻病例沙门菌病原学特征分析: 2024年; 目的分析湖州市感染性腹泻患者分离沙门菌的血清型分布、耐药情况及分子分型特征,为沙门菌引起腹泻性疾病的防控、预警、溯源及临床治疗提供科学依据。方法湖州市2021-2022年6家监测哨点医院分离出126株沙门菌,采用玻片凝集法、微量肉汤稀释法和脉冲场凝胶电泳(PFGE)法,分别进行血清学分型、抗生素最小抑菌浓度测定和分子分型。结果 126株沙门菌可分为28种血清型,优势血清型为鼠伤寒沙门菌单相变种(32.5%,41/126),肠炎沙门菌(24.6%,31/126)及鼠伤寒沙门菌(15.1%,19/126)。不同血清型沙门菌对15种抗生素存在不同程度的耐药性,鼠伤寒沙门菌单相变种对四环素耐药率较高,分别为73.3%(44/60)其次氨芐西林和磺胺甲噁唑的耐药率为56.7%(34/60),鼠伤寒沙门菌对四环素和磺胺甲噁唑的耐药率较高,分别为68.4%(13/19)、52.6%(10/19),肠炎沙门菌对氨苄西林/舒巴坦的耐药率最高为54.8%(17/31),其他沙门菌对四环素的耐药率最高为51.4%(18/35),总体多重耐药率达62.7%(79/126),呈现出20种多重耐药谱。鼠伤寒沙门菌单相及鼠伤寒沙门菌、肠炎沙门菌经XbaⅠ酶切后分别获得46种和15种不同PFGE指纹图谱。结论湖州市沙门菌感染优势血清型以鼠伤寒沙门菌单相变种和肠炎沙门菌为主,沙门菌多重耐药现象严重,PFGE带型既有多样性又具有优势带型。; 沈月华纪蕾徐德顺吴晓芳严伟; 关键词：沙门菌血清分型分子分型感染性腹泻

湖州市食源性腹泻病例中诺如病毒感染现状与特征被引量：11: 2014年; 目的调查食源性腹泻病例中诺如病毒感染情况、病毒基因型及其分布，为制定预防和控制对策提供依据。方法对湖州市第一人民医院内科肠道门诊2013年1—9月接诊的食源性疾病主动监测病例的454份粪便标本进行诺如病毒实验室检测和分析。结果454份粪便标本中，检出诺如病毒91份，病毒分型以G11型为主，占94．51％。诺如病毒8月份为发病高峰，在20—29岁（28．57％）和50～59岁（21．98％）人群中有较高分布。结论初步掌握了食源性腹泻病例中诺如病毒的基本特征和感染现状，建议采取相应的预防与控制措施。; 胡菊妹薛涛董旭沈志昊纪蕾张颖温晓红; 关键词：食源性腹泻诺如病毒

一对引物快速检测并区分诺如病毒GI型和GⅡ型的探讨被引量：5: 2013年; 目的设计一对引物并利用该引物建立同时检测、区分诺如病毒GI型和GⅡ型的RT．PCR检测方法。方法参照已发表的GI型和GⅡ型诺如病毒全基因组序列，针对其衣壳蛋白基因保守区设计一对引物，提取病毒的RNA，进行RT-PCR扩增，对该方法的特异性及敏感性进行评价，并对临床粪便标本进行检测。结果实验结果表明，该检测方法特异性强，对GI型、GⅡ型诺如病毒、轮状病毒、肠道腺病毒、甲型肝炎病毒进行检测，均无交叉反应；对GI型和GII型诺如病毒核酸的最低检出限分别可达100pg／ml和10pg／ml。对101份临床标本分别用已有的单一RT—PCR方法和本研究建立的RT—PCR方法同时进行检测，结果完全相符。结论本研究建立的RT-PCR方法能利用一对引物同时对GI型和GⅡ型诺如病毒进行快速检测和分型，并且灵敏度高，特异性好，可用于感染性腹泻暴发中诺如病毒的快速检测。; 韩建康吴晓芳徐德顺陈莉萍纪蕾; 关键词：诺如病毒逆转录聚合酶链反应

基于全基因组测序的高毒力肺炎克雷伯菌病原学特征: 2025年; 目的了解湖州地区医院来源的肺炎克雷伯菌的分子流行病学特征,为肺炎克雷伯菌感染的临床诊治提供理论依据。方法收集2022-2023年湖州市6家哨点医院临床分离的肺炎克雷伯菌,进行耐药性检测、拉丝试验筛选、脉冲场凝胶电泳(PFGE)分子分型及全基因组测序分析。结果共收集阳性菌株106株,主要来自50岁以上患者的痰液标本(66.04%),拉丝试验筛选出39株高毒力肺炎克雷伯菌(hvKP);耐药结果显示敏感率最高为替加环素和多粘菌素E,均为100.00%,耐药率最高的是氨苄西林(94.88%);PFGE分析显示相似度为51.56%~100.00%;通过全基因测序分析,共检出109种毒力基因和16种耐药基因,毒力基因rmpA、iucA、iroB在hvKP中的携带率分别为41.03%、69.23%、100.00%;检出3种不同亚型的β-内酰胺类耐药基因,且携带率达到100.00%,碳青霉烯类耐药基因bla_(KPC-2)携带率为7.69%;ST1049和ST23为主要的多位点序列分型(MLST)型别,单核苷酸多态性(SNP)发育树显示为3个进化分支。结论湖州地区hvKP的检出率较高,通过拉丝试验可筛选出高毒力株,hvKP主要MLST型别为ST1049,检出耐碳青霉烯hvKP,需引起临床高度重视。; 严伟沈月华查赟峰纪蕾徐德顺; 关键词：耐药全基因组测序病原学特征

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