蔡耘 作品数:121 被引量:396 H指数:11 供职机构: 军事医学科学院放射与辐射医学研究所 更多>> 发文基金: 国家自然科学基金 国家重点基础研究发展计划 国家高技术研究发展计划 更多>> 相关领域: 生物学 理学 医药卫生 石油与天然气工程 更多>>
亲和标记-基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱用于蛋白质相对定量方法的研究 被引量:3 2006年 将亲和标记技术和基质辅助激光解吸电离飞行时间串联质谱联用,建立了蛋白质相对定量方法,以牛血清白蛋白为实验对象,考察了该方法的准确度、重现性等指标;又以数种标准蛋白混合物为研究对象,考察了该方法的动态范围及相应的标准偏差,为实际生物样品中差异蛋白质分析奠定了基础。 孟庆芳 张养军 蔡耘 钱小红磁性纳米材料富集结合液-质联用规模化分析磷酸化蛋白质 蛋白质磷酸化修饰是细胞内重要的翻译后修饰过程,对磷酸化修饰的研究已经成为蛋白质组学研究中的一个重要研究方向及研究热点。规模化识别和鉴定生物体内磷酸化蛋白质的表达及其变化, 在技术方法上还存在很大困难,其中磷酸化修饰蛋白质... 卫军营 张养军 谭峰 王京兰 蔡耘 钱小红应用质谱和液──质联用研究抗疟新药苯芴醇在人体的代谢 被引量:1 1999年 Benflumetol was reported as a new antimalarial drug by professor Ron-xian Deng et al. The drug was awarded a first prize of National invention in 1990 for it’s new structure, high effect for The treatment of pernicious malaria and low side reaction and so on. In this paper MS and LC-ESI-MS were applied to identify The plasma drug and drug’s urine excreta of several male health volunteers after The drug oral administration. 杨松成 桑志红 武力民 蔡耘 王杰关键词:苯芴醇 代谢 抗疟药 质谱 麦胚凝集素亲和色谱富集糖肽过程中的肽键裂解 被引量:4 2009年 蛋白质的糖基化是最重要的翻译后修饰之一,与蛋白质结构和功能的关系密切。凝集素亲和色谱是蛋白质糖基化研究中很常用的工具,不同的凝集素可以对不同的单糖或寡糖有特异的富集作用。麦胚凝集素(W GA)由于其特异作用的糖型广泛存在而成为使用最多的凝集素之一。在本研究中,发现将W GA用于糖肽亲和富集会导致部分肽段的降解,从而导致后续的肽段序列分析的失败。本文用4种标准蛋白质对这种现象进行了验证,结果表明肽段的降解可以发生在多个位点,其中较多地发生在酪氨酸、苯丙氨酸及亮氨酸的羧基端。这一结果提示:在糖蛋白质组研究中,如果应用W GA富集糖肽并采用质谱进行鉴定,则采用半酶切或非特异性酶切的检索策略更为合适。 卢庄 王京兰 贾伟 杨兵 蔡耘 邓玉林 张玉奎 钱小红关键词:糖肽 肽键 蛋白质组学 蛋白质组研究中低丰度蛋白质的富集与鉴定技术 被引量:2 2015年 随着分离技术、质谱设备与生物信息学的发展,对复杂蛋白质组的深度覆盖研究已不再是遥不可及,对8 000个基因产物的规模化鉴定已经趋于常规化。然而,更深一步的蛋白质组覆盖,就遇到了低丰度蛋白质分离、鉴定等更高的挑战。因此,针对低丰度蛋白质鉴定方法与相关分离分析技术的发展,本文综述了改善低丰度蛋白质鉴定效率的三种方法的最新进展,包括蛋白质的高分辨分离与质谱分析策略、低丰度蛋白质的选择性富集方法和高丰度蛋白质的消减策略等。针对生物体系蛋白质组成的深度鉴定研究,逐步用于探索生命体在不同条件下蛋白质组的表达与修饰的动态变化,并最终发现具备重要生理与病理功能的调控性蛋白质、寻找候选药物靶标。 杨景晶 钱小红 蔡耘 蔡耘关键词:蛋白质组学 质谱鉴定 蛋白质组技术平台的建立和应用研究 钱小红 贺福初 万晶宏 王京兰 蔡耘 张开泰 应万涛 邢桂春 吴德昌 该研究在军事医学科学院科技创新启动基金和国家自然科学基金资助下,及时抓住国际上生命科学领域这一具有战略意义的机遇,在国内率先开展了蛋白质组相关技术的研究,建立了系统配套的蛋白质组研究技术平台,包括:高分辨率、高重复性的二...关键词:关键词:蛋白质组 肿瘤 新型亲水聚合物修饰硅胶颗粒固定化酶的制备及在蛋白质组鉴定中的应用 被引量:4 2013年 采用原子转移自由基聚合法制备了亲水聚合物修饰的硅胶颗粒作为一种新型固定化酶载体,在实现胰蛋白酶高密度固定的同时,显著降低了载体材料非特异性吸附导致的样品损失。因此,该固定化酶材料兼具高酶解效率和高回收率的特性。以标准蛋白质牛血清白蛋白(BSA)为样本,使用该固定化酶1 min即可完成酶解,鉴定到肽段对BSA的氨基酸序列覆盖率可达90%以上。该固定化酶材料成功应用于酵母菌全蛋白质复杂样本的酶解,从3min酶解产物中鉴定到666个蛋白质,超过同样条件下溶液酶解12 h的鉴定结果。 范超 宋子凤 秦伟捷 蔡耘 钱小红关键词:固定化酶 蛋白质组学 超支化聚合物新材料富集糖肽方法的研究 被引量:2 2014年 目的:将自合成的超支化聚合物固定到氨基硅球上形成一种新型的糖肽富集材料,用于糖肽的高效分离与富集。方法:阴离子开环聚合法合成的超支化聚缩水甘油,经高碘酸氧化成为超支化聚甘油醛(hyperbranched polyglycerol-aldehydes,HPG-ALD)后固定于氨基硅球上,再用己二酸二酰肼修饰得到的酰肼材料应用于糖肽富集。结果:经扫描电镜(Scanning Electron Microscope,SEM)、热重分析(thermogravimetric analysis,TGA)等手段证明材料被成功合成。同时,使用制备成功的新材料来富集标准糖蛋白和糖肽都获得了良好的富集效果。结论:实验证明超支化缩水甘油酰肼材料(hyperpolymer-assisted hydrazide functionalized microspheres,HHMs)可用于低丰度糖蛋白/糖肽的富集。 邓珊珊 王明超 曹琦琛 白海红 彭博 应万涛 蔡耘关键词:糖肽 Fe3O4/TiO2纳米粒子亲和富集-MALDI-TOF-MS检测磷酸化肽的研究 蛋白质的磷酸化修饰是生物体内重要的共价修饰方式之一,在生命活动中具有重要的调控作用.对磷酸化蛋白质的分析是蛋白质磷酸化研究非常关键的第一步,也是当前蛋白质组学研究的重要内容之一.由于细胞/组织内磷酸化蛋白质的含量非常少,... 谭峰 张养军 王京兰 蔡耘 钱小红关键词:蛋白磷酸化 共价修饰 文献传递 基于生物质谱技术的磺酸化修饰策略及其在蛋白质组学中的应用 被引量:3 2007年 对近几年报道的磺化修饰策略及其应用进行了评述。通过磺化修饰在肽段上引入带负电荷的磺酸基,不仅可以诱导肽段离子的质谱裂解,得到以y系列离子为主的序列信息丰富的串联质谱图,有利于肽段从头测序,还可以改变被修饰肽段的电荷分布,通过离子交换色谱法分离富集磺化修饰的肽段,有助于蛋白质鉴定。 赵丽艳 周春喜 张养军 蔡耘 钱小红关键词:化学修饰 蛋白质组学 生物质谱