薛鹏 作品数:17 被引量:23 H指数:3 供职机构: 中国科学院生物物理研究所 更多>> 发文基金: 国家自然科学基金 国家重点基础研究发展计划 中国科学院仪器设备功能开发技术创新项目 更多>> 相关领域: 生物学 医药卫生 农业科学 理学 更多>>
内质网上的蛋白质RCN2与STIM1-Orai1复合体相互作用(英文) 被引量:4 2008年 膜蛋白质Orai1组成了一类被称为钙释放激活钙通道(CRAC)的离子通道,并且由相互作用的蛋白质STIM1作为其在内质网上的钙感受器.但是这类通道的调节机制还未研究透彻.通过串连亲和纯化STIM1-Orai1复合体,发现与之相互作用的内质网蛋白质RCN2.共聚焦显微术显示RCN2与STIM1在钙库排空前后完全共定位.对RCN2的EF hands结构突变体所作单细胞测钙,结果显示其对钙库操控通道电流特性有微弱影响.全内反射荧光显微术显示,RCN2以花环状围绕包围STIM1聚集堆,这提示RCN2在STIM1聚集中起到一种结构约束作用. 占艺 高尚邦 薛鹏 阳小飞 李正正 徐涛营养型栽培基质-NSR研究与开发 翟永功 冯保华 常智杰 王英典 李毅 赵长琦 王春城 李志丹 李俊全 司瑞新 陈彩霞 刘恺 次向明 于淼 张秋颖 薛鹏 王芳 设施农业的生产在大中城市及郊区发展速度很快,特别是在优质农产品生产和果蔬、花卉、特种经济植物,林木种苗快速繁育与生产等方面发展规模越来越大。设施农业的核心技术是无土栽培,栽培基质是无土栽培的物质基础。由于无土栽培的特殊性...关键词:关键词:栽培基质 无土栽培 设施农业 利用非最大纠缠态实现高效量子密钥分配 薛鹏 李传锋 郭光灿文献传递 凝集素法与酰肼法富集糖肽的方法学比较 被引量:6 2015年 蛋白质糖基化(glycosylation)是最常见和最重要的翻译后修饰之一.大规模N-连接糖基化位点鉴定是糖蛋白质组学研究的重要组成部分,而N-连接糖肽富集是高通量N-连接糖基化位点鉴定的关键步骤.凝集素富集法和酰肼化学法是目前被广泛应用的N-连接糖肽富集技术,有报道认为两种方法具有很强的互补性,联合使用能提高糖基化位点的鉴定数目.本文以Hep G2细胞系为模型,系统比较了这两种方法的富集效率和糖蛋白鉴定数目.结果表明,虽然酰肼法的糖肽富集效率为76.6%,远高于凝集素法的54.6%,但是凝集素法却能鉴定到825个糖蛋白和1 959个N-连接糖基化位点,显著多于酰肼法富集到的522个糖蛋白和1 014个糖基化位点.并且,两种方法并未显示出显著的互补性,仅28个糖蛋白和80个糖基化位点未在凝集素法中鉴定到. 薛鹏 周岳 丁翔 王峻 谢振声 杨福全一种逆流色谱仪及其专用逆流色谱柱 本实用新型公开一种逆流色谱仪及其专用逆流色谱柱。所述逆流色谱柱包括圆盘体、与所述圆盘体密封配合的圆盘盖以及贯穿所述圆盘体和圆盘盖的中心的中空自传轴,所述中空自转轴与所述圆盘体和圆盘盖固定连接;所述圆盘内设有螺旋形刻槽;沿... 杨福全 蔡潭溪 谢振声 薛鹏 郭晓静 陈秀兰 吴鹏文献传递 高通量、高灵敏度色谱-质谱鉴定系统的建立及其在生物医学研究中的应用 杨福全 刘洋 张建中 蔡潭溪 王启辉 王绿娅 张经华 薛鹏 谢振声 陈曌 该成果研制了新型、高效多维毛细管液相色谱柱,设计研制了新型液-质联用接口平台,建立了高通量、高灵敏度的色谱-质谱鉴定系统,并在生物医学研究和临床检测中得到了应用,具有国际先进水平和显著的社会经济效益,科学价值重大,实用性...关键词:关键词:生物医学 质谱检测叶酸缺乏人胚肾细胞中低组蛋白H3赖氨酸79甲基化修饰 被引量:3 2014年 目的:探讨叶酸(Folic acid,FA)缺乏在培养的人胚肾细胞(HEK-293)中对细胞组蛋白修饰水平的影响。方法:人胚肾细胞分两组培养,一组正常培养,一组无叶酸培养。细胞提取组蛋白后通过高效液相色谱一线性离子阱/静电场轨道阱高分辨质谱(HPLC-LTQ/Orbitrap Ms)检测组蛋白的修饰以比较叶酸缺乏对人胚肾细胞组蛋白修饰的影响。结果:用高分辨质谱方法成功检测到人胚肾细胞的五个组蛋白变体H1,H3,H4,H2a和H2b上的33个组蛋白修饰位点,其中23个修饰位点为uniprot数据库上已经报道的组蛋白修饰位点,而其余10个为未报道修饰位点。通过质谱比较正常和叶酸缺乏组人胚肾细胞修饰谱发现H3K79me1和H3K79me2在叶酸缺乏培养组中检出率较低。进一步用蛋白免疫印迹的方法也证明了在叶酸缺乏的人胚肾细胞中H3K79me1水平低于正常培养组。结论:细胞中叶酸缺乏影响组蛋白甲基化包括H3K79me2和H3K79me1修饰水平,提示细胞外营养因素叶酸水平可影响组蛋白修饰水平从而参与疾病如神经管畸形(Neural tube defect,NTD)的发生。 张勤 薛鹏 白宝玲 李会莉 杨福全关键词:甲基化修饰 质谱 叶酸缺乏 人胚肾细胞 帕金森病患者脑脊液蛋白质组学分析 被引量:2 2010年 帕金森病(Parkinson′s disease,PD)是一种中枢神经系统慢性进展性疾病.本研究采用双向凝胶电泳(two-dimensional gel electrophoresis,2-DE)分离脑脊液(cerebrospinal fluid,CSF)蛋白,获得2-DE图谱,通过ImageMaster 2D Elite软件分析寻找两组的差异蛋白点.结果显示,PD患者CSF中有4个蛋白点丰度下降,22个蛋白点丰度上升.还利用电喷雾质谱(electrospray ionization-tandem mass spectrometric,ESI-MS)对差异蛋白点进行鉴定,发现丰度上升的蛋白点有电压依赖性钙通道α2/δ1亚基,结合珠蛋白,β2-微球蛋白和阿朴脂蛋白A-IV前体,丰度下降的蛋白点为转铁蛋白和转甲状腺蛋白.研究发现,PD患者与对照组CSF蛋白质表达有明显差异,对差异蛋白进行质谱鉴定并了解它们的功能,为以后进一步研究他们在PD发病机制和病程进展中的作用奠定基础. 孙太欣 彭国光 薛鹏 杨福全关键词:帕金森病 脑脊液 蛋白质组学 双向凝胶电泳 质谱 一种制备组蛋白质谱分析样品的新方法 2013年 目的:质谱技术已经广泛应用于分析组蛋白的翻译后修饰。传统的样品制备是将酸提取的组蛋白混合物在溶液中酰基化并胰酶酶解,不但操作过程复杂,而且难以解释鉴定肽段的最终归属,因此有必要对其进行改进。方法:首先对组蛋白纯化试剂盒提取的组蛋白H3/H4组分进行高效液相色谱分离,然后对纯化的的单个H3.1和H4进行胶内丙酰化衍生和胰酶消化,最后将制备的样品进行质谱分析和数据库检索。结果:鉴定到的组蛋白肽段数目至少提高60%且修饰种类和位点都有不同程度的提高。结论:建立了一种简便有效的基于高效液相色谱纯化和胶内丙酰化衍生的制备组蛋白质谱分析样品的新方法。 赵志强 邱辉华 薛鹏 陈永峰 王晓明 杨福全关键词:组蛋白 翻译后修饰 HPLC 质谱 整合素α6在不同转移潜能膀胱癌细胞中的定量差异表达分析 被引量:2 2015年 整合素是一类跨膜糖蛋白,能够与细胞外基质结合参与许多生物学过程,尤其是与癌细胞的增殖、迁移等密切相关.目前在研究膀胱癌的发生发展过程中,对整合素的关注较少.本研究利用稳定同位素标记技术(SILAC)蛋白质定量技术结合质谱分析技术,对3株不同转移潜能的膀胱癌细胞株中的蛋白质组差异表达进行研究,并通过蛋白质免疫印迹技术、实时荧光定量PCR、细胞免疫荧光照相和流式细胞术等多种技术进行验证.同时使用临床组织基因芯片结果对比分析表明,与正常膀胱表皮细胞HCV29相比,整合素α6在膀胱癌细胞中表达量均有明显的上升,且在非侵染性膀胱癌KK47细胞中的表达量最高,侵染性的膀胱癌YTS1细胞中表达量次之.这一结果说明整合素α6与膀胱癌的发展具有密切关系,并为深入研究整合素α6在膀胱癌发生发展中的作用提供了前期基础. 陆微 杨刚龙 薛鹏 刘昌梅 关锋关键词:SILAC 膀胱癌 整合素Α6