刘万飞 作品数:4 被引量:16 H指数:2 供职机构: 中国科学院北京基因组研究所 更多>> 发文基金: 中国科学院知识创新工程 国家自然科学基金 更多>> 相关领域: 生物学 农业科学 更多>>
茶薪菇国内外研究进展及展望 被引量:4 2012年 综述了茶薪菇及相近物种的国内外研究现状,讨论了茶薪菇产业发展存在的问题和发展前景。通过与相近物种比较,为探索茶薪菇菌种退化机制提供研究方向,促进茶薪菇产业可持续发展。 刘万飞 路等学 赵宇慧 宋述慧 耿佳宁 胡松年关键词:茶薪菇 椰枣全基因组测序与分析 椰枣是中东和北非地区广泛种植的作物,具有重要的经济价值和历史文化意义.为了揭示椰枣的生物多样性、地理种群的分布、抗旱和抗逆的分子机理、性别决定(雌雄异株植物)与分子育种研究等,我们开展了椰枣基因组和转录组测序和分析工作.... Al-Mssallem Ibrahim S. 张同武 尹玉新 辛成齐 吴浩 张广宇 Ba Abdullah Mohammed M. 黄大维 方永军 AlnakhliYasser O. 贾善刚 胡松年 殷安 Al-OwayyedSaad A. AlsaihatiBurair A. 赵多军 张笋 Al-OtaibiNoha A. 孙高远 MajrashiMajed A. 李福森 塔拉 张晓伟 AlhuzimiEman M. 王吉祥 云权正 AlnassarNafla A. 王磊 杨猛 Al-JelaifyRasha F. 刘凯 高胜寒 陈开富 谭军 AlkhaldiSamiyah R. 刘贵明 张猛 郭海燕 于军 林强 刘万飞 于晓光 刘久成 潘林林关键词:全基因组 基于第二代测序技术的细菌基因组与转录组研究策略简介 被引量:12 2011年 随着基于第二代测序技术的细菌基因组与转录组研究越来越广泛,选择合适的研究策略变得越来越重要。就基于第二代测序技术的细菌基因组和转录组研究策略进行综述,并简要介绍细菌基因组和转录组研究中的机遇和挑战。综述细菌基因组与转录组研究的常规方法及步骤,并简要地介绍存在的问题。细菌基因组和转录组研究策略为大多数细菌的研究提供了一个相对完整的研究路线,同时也会促进其它领域的研究,如生命形成、生物进化、基础代谢、疾病、药物等。 刘万飞 王西亮 赵宇慧 曾瀞瑶 耿佳宁 胡松年关键词:细菌 基因组 转录组 利用转录组数据鉴定和分析小鼠非编码RNA 2015年 基因转录表达是一个复杂、精确并具有时空特异性的过程.目前对转录组的研究主要集中在蛋白编码基因上.近几年,一个新的转录组研究工具—大规模并行c DNA测序技术(RNA-seq)为更深入地研究转录组带来了希望.利用RNA-seq数据,鉴定出大量的非编码RNA,特别是lincRNA,并且发现这些非编码RNA是多个生物学过程中重要的调控因子.利用深度测序获得的15个小鼠组织RNA-seq数据探索非编码RNA在小鼠不同组织中的多样性和动态变化.依据自定的标准,在这15个组织中共鉴定出16249个非编码基因(对应21569个非编码RNA).研究这些非编码RNA的多种特征,可以发现与蛋白编码基因相比,非编码RNA通常比较短,外显子个数少,表达量低,组织特异性强.而且,这些非编码RNA有明显的转录起始和转录延伸信号(H3K4me3,H3K27me3,H3K36me3修饰,RNAPⅡ结合位点以及CAGE)的富集.基因集富集分析结果表明,lincRNA与多个生物学过程相关,如免疫反应、肌肉发育和有性生殖等.本研究提供了更加全面的对小鼠非编码RNA的注释信息,为小鼠非编码RNA的功能和进化研究奠定了基础. 赵宇慧 刘万飞 曾瀞瑶 刘守成 谈馨煜 HASAN AwadAljohi 胡松年关键词:非编码RNA RNA-SEQ 转录组 小鼠