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杏RAPD两种凝胶电泳指纹特点及PCR扩增片段的序列分析被引量：3: 2010年; 为更好地将RAPD技术应用于杏品种资源鉴定及遗传基础的研究,文章首次在选用11碱基长度引物的优化技术体系基础上,分别使用两种凝胶对16个杏品种RAPD的PCR扩增产物进行电泳检测与DNA指纹比较。结果表明,聚丙烯酰胺凝胶电泳检测出的谱带总数量以及多态性谱带的数量均高于琼脂糖凝胶,前者不存在或很少存在共迁移性的现象。根据两种电泳系统获得的标记信息对16个杏品种的遗传关系的分析发现,两者聚类结果存在一定差异。以此,提出了科学利用两种电泳的RAPD标记技术的策略。对随机挑选的24个片段进行克隆与测序,结果发现24个片段都是对应引物的RAPD扩增产物。在不同的11条序列中有3条是编码蛋白的基因片段,说明了RAPD不仅扩增基因组上的非编码蛋白序列,同时可以扩增编码蛋白的基因片段,能够较全面客观地反映不同杏品种间遗传上的差异。; 郭磊宁宁王玉柱上官凌飞章镇房经贵; 关键词：RAPD 琼脂糖凝胶电泳 PAGE

我国杏核心种质的构建: 我国是世界栽培杏的原生起源中心之一，其拥有的杏种质资源十分丰富，全世界杏品种有3000余个，其中我国杏有9个种，13个变种，约2000个品种和类型。为了更好地保存、评价和利用这些种质资源，我们在多年来杏资源收集、评价的基...; 宁宁; 关键词：核心种质 SSR标记技术; 文献传递

杏SSR反应体系的优化研究被引量：4: 2009年; 研究了杏SSR-PCR反应体系的主要成分对扩增结果的影响,并进行了体系验证。优化后的反应体系为：总体积20μL,1×buffer2、.0 mM/L Mg^2＋0、.25 mM/L dNTP、0.20μM/LPrimer6、0 ng/20μL模板DNA和0.05 U/μL Taq酶。利用32个杏品种验证此反应体系,6%的变性聚丙稀酰胺凝胶电泳检测结果显示,扩增产物在184-267 bp之间,不同品种间DNA谱带具有多态性,且反应体系的稳定性和可重复性好。; 宁宁王玉柱张俊怀杨丽孙浩元章镇; 关键词：SSR-PCR

杏EST-SSR标记的开发被引量：28: 2011年; 利用MISA软件对NCBI上杏的15387条EST序列进行SSR位点查找,发掘出含有SSR位点的序列1073条,共有1353个SSR位点,候选SSR位点出现的频率为8.79%。二核苷酸、三核苷酸和四核苷酸重复是最主要的重复类型,分别占23.50%、38.80%和23.43%。设计了50对EST-SSR引物并进行PCR扩增,发现40对引物能扩增出理想的PCR产物,其中有25对引物能够扩增出多态性带。随机对7对引物的部分杏扩增片段进行了测序分析,发现有57.1%的片段具有相应的SSR位点,对梅DNA指纹中部分谱带的测序结果也证明是杏扩增出的相应的SSR位点。根据推算,从杏EST中开发SSR标记的开发效率为3.98%。进一步选用20对扩增效果最好的引物对24个杏品种,16个花梅品种以及8个果梅品种进行DNA指纹构建与遗传多样性分析,结果表明,来源于杏的EST-SSR引物在梅中有很高的通用性,杏和梅是遗传差异明显的两种植物,果梅与花梅在遗传上是不能分为两类的同种植物。; 上官凌飞李晓颖宁宁王玉柱章镇房经贵; 关键词：EST-SSR

梅、杏、桃EST同源序列特征分析及EST-SNP发掘被引量：3: 2012年; 通过生物信息学手段,下载GenBank数据库中已公布的梅、杏、桃3个物种EST序列各4 660、15 388、82 583条,利用CAP 3软件拼接后序列分别为4 456、5 595和24 243条。经比对发现,同源序列592条,同源序列的总长度为235 576 bp,平均长度和同源性分别为437.67 bp和97.50%;进行Blast比对后发现,所有同源序列中有340个具有相应的功能注释,183个为未知功能蛋白,其余69个为没有相应序列信息的新基因;在所有同源序列中共发现8 818个SNP,总频率为每SNP26.71 bp,并以转换和颠换为主。同时,对3个物种的同源序列进行两两比较发现,SNP数量明显少于这三者比较的结果。利用所有SNP对梅、杏、桃3个特种进行聚类分析,结果表明,梅、杏的亲缘关系较近,而两者与桃亲缘关系较远。; 李晓颖王玉柱上官凌飞宁宁房经贵; 关键词：表达序列标签单核苷酸多态性

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宁宁