杨永霞
- 作品数:3 被引量:4H指数:1
- 供职机构:中国科学院武汉植物园更多>>
- 发文基金:国家自然科学基金中国科学院“百人计划”湖北省自然科学基金更多>>
- 相关领域:生物学更多>>
- 裸子植物中光敏色素PHY-PAS1结构域的适应性进化被引量:3
- 2009年
- 光敏色素是一类红光/远红光受体,在植物种子萌发到成熟的整个生长发育过程中均起重要的调节作用。光敏色素PHY-PAS1结构域存在于光敏色素基因家族的所有成员中,对调节发色团的光谱特性和光信号转导非常关键。光敏色素基因家族通过基因重复产生,而基因重复可能与物种形成有关。PHYP基因是裸子植物光敏色素基因家族发生第1次重复后产生的,并且以单拷贝形式存在。为了研究不同裸子植物PHYP基因编码蛋白的PHY-PAS1结构域在进化过程中是否受到相同的选择压力以及是否发生了适应性进化,该研究利用分支模型、位点模型以及分支-位点模型对裸子植物31条PHYP基因序列编码蛋白的PHY-PAS1结构域所受到的选择压力进行了分析。结果表明,在由PHY-PAS1结构域序列构建的系统树中,多数分支处于强烈的负选择压力下(ω<1);有14个分支处于正选择压力下(ω>1),其中13个分支发生在属内种间;与之相比,在较为古老的谱系中相对缺少这种正选择压力。
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- 关键词:适应性进化裸子植物
- 水蕨抗人类免疫缺陷病毒蛋白同源物的基因及制备方法和应用
- 本发明公开了一种水蕨抗人类免疫缺陷病毒蛋白同源物的基因及制备方法和应用,步骤:1.总DNA提取:用改良的CTAB法提取总DNA,保存;2.水蕨抗人类免疫缺陷病毒蛋白同源物基因中间片段的扩增;3.水蕨抗人类免疫缺陷病毒蛋白...
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- 文献传递
- 毛柄短肠蕨红/蓝光嵌合光受体基因的克隆和蛋白质结构分析被引量:1
- 2009年
- Phytochrome 3(PHY3)是一种特殊的既能吸收红光/远红光又能吸收蓝光的嵌合光受体,一些隐花植物利用PHY3提高在弱光环境下的光敏感性。但是,有关植物嵌合光受体的序列信息极为匮乏。文章采用反向PCR法分离了蕨类植物毛柄短肠蕨红/蓝光嵌合光受体编码基因的全长序列。序列分析表明:该基因没有内含子,仅包含一个长度为4278bp的开放阅读框,与铁线蕨PHY3的核苷酸序列具有80%以上的一致性。该基因编码一个1425个氨基酸组成的蛋白质,预测分子量为157kDa,理论等电点(pI)为6.29。结构分析表明,PHY3是由光敏色素和向光色素蛋白融合而成,其N端序列与光敏色素N端序列类似,包括PAS、GAF和PHY结构域,负责结合吸收红光/远红光的藻蓝胆素生色团;而C端与完整的向光色素类似,由2个LOV和1个Ser/Thr激酶结构域组成,可结合吸收蓝光/UV-A的生色团黄素单核苷酸FMN。
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- 关键词:克隆