洪国藩 作品数:56 被引量:104 H指数:5 供职机构: 中国科学院上海生命科学研究院 更多>> 发文基金: 上海市科学技术委员会资助项目 国家攀登计划 国家高技术研究发展计划 更多>> 相关领域: 生物学 农业科学 文化科学 自然科学总论 更多>>
几种生物的基因组分析 被引量:1 1998年 几种生物的基因组分析赵文会洪国藩(中国科学院国家基因研究中心,上海200233)关键词基因组分析E.coliM.jannaschi酵母基因组研究是当今世界生物学中投资最大的两大热点领域之一(另一个是艾滋病研究)。迄今已完成多种生物的基因组测序(表1)... 赵文会 洪国藩关键词:基因组分析 酵母 高温DNA聚合酶I的Klenow片段在乙醇中变性的AFM研究 被引量:1 1997年 本文利用原子力显微镜(AFM),对高温DNA聚合酶I和普通E.coli的DNA聚合酶I的Klenow片段在乙醇中变性的对比研究,发现在两种DNA聚合酶中都存在结构较紧密的“核”。通过对吸附在云母上的两种酶进行1—10个小时的处理发现高温聚合酶大多由3块“核”组成,而普通的DNA聚合酶由2块“核”组成。这些“核”可能与蛋白的折叠过程中存在的相对稳定的结构区域有关,这对直观了解蛋白折叠过程有一定意义。 陈圣福 徐磊 欧阳振乾 张益 李民乾 洪国藩关键词:AFM 乙醇 蛋白变性 DNA聚合酶I 根瘤菌遗传学研究进展 被引量:1 1991年 豆科共生固氮是生物固氮中效率最高的体系,它涉及的植物种类繁多,在农业上用途广泛,而且这个体系又同时涉及高等植物和低等微生物之间信息传递、能量供给及物质交流,有其重要的理论研究价值,所以多年来共生固氮一直是被集中研究的课题,取得了很大的进展。特别是在近十年来,通过研究,科学家们证实了有关共生固氮的基因定位在快生型根瘤菌的巨型质粒上。根瘤菌的遗传学研究发展迅速,这些成就主要集中反映在以下诸方面。 倪福弟 洪国藩关键词:根瘤菌 遗传学 多级PCR检测莱姆病的方法和试剂盒 本发明公开了多级PCR检测莱姆病的方法和试剂盒。本发明方法通过在全封闭体系中,用两对或多对所述病原体特异性引物,通过多级PCR扩增待测样品中的病原体的核酸物质,并通过测序等方法准确地确定病原体的种类或型别。本发明方法实现... 洪国藩文献传递 水稻基因组物理图的构建 被引量:5 1998年 本文试图用比较通俗的语言,来讲述我们在构建水稻基因组物理图时所采用的战略和物理图的意义。有关构建物理图的详细科学内容,如酶解反应及一系列相关生物技术的改进和计算机数据处理等,有兴趣者可见已发表的论文。基因组计划水稻基因组(rice genome)有12条染色体,总长4.3亿个核苷酸,包含着水稻的全部遗传信息。 洪国藩关键词:水稻 基因组 物理图 指纹法 染色体 DNA顺序有序测定中特定亚克隆的简便检出 1989年 在按非随机法测定策略由DNase Ⅰ处理获得大量亚克隆后,随机从中选出一些亚克隆测定其DNA顺序,就可以迅速获得几组彼此不相联的亚克隆组,以这些亚克隆组首尾的克隆作电泳对照,与混合克隆同时电泳,就能方便地检出填平克隆组间空缺的特定亚克隆。用此方法,我们迅速完成了对含有psr基因的4064bp DNA片段的DNA顺序测定。 吕幼仪 倪福弟 洪国藩多级PCR检测HPV的方法和试剂盒 本发明公开了多级PCR检测HPV的方法和试剂盒。本发明方法通过在全封闭体系中,用两对或多对HPV特异性引物,通过多级PCR扩增待测样品中的HPV基因组DNA,并通过测序等方法准确地确定HPV的型别。本发明方法可简便地在多... 洪国藩 李善衡文献传递 高温反向顺序测定 1992年 单链克隆DNA的反向测序是一个简单和快速的方法,这个方法可利用原来的DNA再进行反向顺序测定,从而达到校正和积累DNA数据的作用。由于反向测序的本质是双链测序,所得到的DNA顺序的图谱背景较深,伴有杂带,或在X光显影上是不清晰的。本文报道利用我们实验室所开发的热稳定性的Bst聚合酶系统,进行反向测序克服了这些缺点,获得的图谱可以和单链DNA模板测序的图谱相媲美。我们以nod D 487-mp 8 ss-DNA为模板进行反向测序,证明Bst聚合酶在65℃反应能得到满意的结果。 吕幼仪 叶盛钰 洪国藩关键词:脱氧核糖核酸 一种简便的纯化大质粒DNA作测序模板的方法 1993年 用质粒DNA作模板进行DNA序列分析已成为一种常规的实验方法。与单链模板的测序结果相比,双链的结果背景较深,假带较多.如质粒大于10kb,叉为低拷贝数时问题更严重。用超速离心的方法纯化质粒虽能得到较好的结果,但该方法费时、操作困难、也较昂贵。这里介绍一种用低熔点胶纯化的方法。该方法经济且操作简便,尤其适合10kb以上的质粒的纯化。我们用此方法纯化低拷贝数质粒pMP220,并用BSTDNA高温反应体系进行测序反应,得到了很好的结果。 毛成建 洪国藩关键词:质粒 DNA DNA测序 DNA 纯化 一组高度保守的水稻trs-like基因的鉴定与分析 2004年 基于对水稻基因组序列的注解和同源搜索的结果 ,用RT PCR结合测序的方法证明了水稻中至少有 10个具有转录活性的trs like基因。这 10个基因的编码产物与酵母TRAPP蛋白复合体已知 10个亚基中的 6个分别同源。其中 4对基因是双拷贝的 ,另 2个则是单拷贝的 (基于已知的水稻基因组序列 )。所有这 10个基因均在不同时期的水稻组织中广泛表达 ,并与其他真核生物的trs 胡欣 胡昊 洪国藩 韩斌关键词:水稻 反转录PCR