蔡浩洋
- 作品数：7 被引量：25H指数：2
- 供职机构：四川大学生命科学学院更多>>
- 发文基金：国家自然科学基金四川省科技攻关计划国际科技合作与交流专项项目更多>>
- 相关领域：生物学农业科学轻工技术与工程医药卫生更多>>
- 水稻蛋白质相互作用网络的预测与分析被引量：2
- 2010年
- 通过同源映射的方法,利用6个模式物种的蛋白质相互作用数据预测水稻的蛋白质相互作用网络.预测到水稻中有4483个蛋白质参与了24942个蛋白质相互作用.通过GO注释,结构域相互作用,基因共表达等3个证据评估预测网络的质量,并对网络进行了拓扑属性分析.结果表明水稻的蛋白质相互作用网络符合scale-free属性.通过对网络中功能模块的分析,可以预测蛋白质的功能和亚细胞定位信息.
- 蔡浩洋李校徐加豹张义正
- 关键词：水稻蛋白质相互作用蛋白质功能预测
- 拟南芥蛋白质相互作用网络的性质研究及其预测
- 蛋白质相互作用贯穿于所有的生物学过程,研究蛋白质相互作用网络不仅可以从分子水平揭示蛋白质的功能,而且对于揭示生长、发育、分化和凋亡等生命活动规律至关重要。随着大规模蛋白质相互作用检测技术的发展,已经有很多模式物种的蛋白质...
- 蔡浩洋闵明玮胡函张义正李校
- 关键词：拟南芥蛋白质组学
- 文献传递
- 肿瘤生物信息学数据库被引量：8
- 2015年
- 恶性肿瘤已经成为严重危害人类健康的主要疾病之一。近年来,高通量检测技术迅速发展,成为肿瘤研究的重要手段之一,使得与肿瘤相关的组学数据迅速积累。这些数据对于研究肿瘤的发生发展机制具有重要意义。对海量生物学数据的管理和挖掘已经成为癌症研究的基础与重要方向。主要介绍人类肿瘤研究中经常用到的生物信息学数据库,包括综合性数据库、基因组、转录组、蛋白组、表观遗传组数据库等。在总结国内外肿瘤数据库发展现状的基础上,讨论了目前数据库开发存在的问题,旨为现有的研究提供帮助。
- 杨健蔡浩洋
- 关键词：生物信息学数据库肿瘤
- 基于微量元素指纹图谱对黑水凤尾鸡进行产地溯源的研究被引量：15
- 2018年
- 黑水凤尾鸡是国家地理标志产品,而白羽肉鸡是目前市售最多的品种。该研究以市售白羽肉鸡和黑水凤尾鸡的鸡胸肉和鸡腿肉为研究对象,从营养成分氨基酸和矿物质元素两方面探讨二者之间的差异。结果表明:黑水凤尾鸡与市售白羽肉鸡均检测到17种氨基酸和15种矿物质元素。在氨基酸检测中,黑水凤尾鸡的鸡腿肉中丝氨酸和精氨酸含量均显著高于市售白羽肉鸡(p<0.05);黑水凤尾鸡的鸡胸肉中谷氨酸、甘氨酸和丙氨酸含量均显著高于市售白羽肉鸡(p<0.05)。同时,在矿物质元素检测中,通过对15种矿物质元素进行主成分分析、聚类分析和判别分析可知,其中Mn、Mo和Cs 3个元素可将这两个品种100%区分开来,从而有效地进行产地溯源。
- 白婷蔡浩洋邓银华徐小芳张国建周宇孙群
- 关键词：白羽肉鸡矿物质元素氨基酸
- 染色体粉碎——基因组灾难性事件产物
- 2017年
- "染色体粉碎"是最初在肿瘤细胞中发现的一种复杂的基因组重排现象.在该事件中,细胞的一条或几条染色体在短时间内发生大量的DNA双链断裂,形成小的DNA碎片,之后这些碎片被细胞的DNA修复机制随机地拼接起来,形成新的染色体.染色体粉碎事件会造成大量的基因组重排,引起DNA拷贝数的变异和基因融合,从而导致正常细胞向肿瘤细胞的快速转化.这与传统的癌症发生理论不同,传统理论认为肿瘤的发生是由基因突变逐步积累而导致的,因此染色体粉碎现象可能揭示了一种肿瘤发生的新机制.目前,该现象的内在机制还不完全清楚,其判别标准也存在争议.本文综述了近年来关于染色体粉碎现象的判别标准和产生机制,探讨了该现象与肿瘤发生发展的关系,为进一步研究染色体粉碎事件提供参考.
- 杨健蔡浩洋
- 关键词：DNA断裂基因组重排肿瘤
- 麻疯树胚乳ESTs序列的克隆和生物信息学初步分析
- 2009年
- 基于 Linux 操作系统,利用 Phrap/Consed、cross_match、blast 等软件和自主开发程序,构建了批量 ESTs 序列的检测系统,对麻疯树胚乳 cDNA 文库部分测序结果进行生物信息学分析,包括载体序列的去除、序列格式的转换、重复序列鉴定、序列的同源性比对、GO 生物学过程以及 GO 细胞组分分类.
- 熊瑛朱勋路徐莺蔡浩洋陈放
- 关键词：麻疯树生物信息学
- 基于基因网络预测哺乳动物线粒体蛋白质的功能
- 线粒体是细胞内重要的细胞器,线粒体的功能涉及产生 ATP,体内离子自稳、凋亡、碳水化合物和脂肪酸的氧化及许多其他合成代谢和分解代谢通路。线粒体发生改变会引起各种线粒体疾病如阿斯海默症,糖尿病等等。通过预测线粒体蛋白质功能...
- 徐加豹蔡浩洋张义正李校
- 关键词：线粒体蛋白质功能模块
- 文献传递
