邓斐
- 作品数：44 被引量：369H指数：9
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- 相关领域：医药卫生农业科学生物学轻工技术与工程更多>>
- 2017年江苏省H3N2流感病毒血凝素与神经氨酸酶分子特征及耐药性分析被引量：9
- 2019年
- 目的流行性感冒(简称流感)耐药性监测目前已成为流感防控中的一项重要组成部分。文中旨在分析江苏省2017年H3N2亚型流感病毒基因变异及耐药性情况。方法从江苏省13个流感监测点流感毒株中选取17株H3N2亚型毒株,其中12株为2017年夏季高峰期分离株,4株为非高峰期分离株,1株为2016年度分离株(作为1株参考株)。采用逆转录聚合酶链反应(RT-PCR)对H3N2亚型流感毒株进行序列测定,从全球共享流感序列网站GISAID下载构建甲型H3N2亚型流感毒株HA(血凝素)系统进化树的骨架参考序列,使用MAGE7.0软件进行序列比对和系统进化分析。通过神经氨酸酶(NA)抑制试验,分析病毒耐药情况。结果16株病毒HA和NA基因核苷酸相似性分别为98.9%~99.6%、99.2%~99.3%,同源性较高。HA进化树分析显示,16株分离株中15株位于3C.2a分支,13株病毒3个C3.2a1分支关键位点(N171K、I406V和G484E)未发生变化,另外3株毒株关键位点发生变异,1株毒株发生该标志性氨基酸变异,1株毒株发生(N121K、T135K)的免疫相关突变。与2017-2018年度疫苗株推荐株A/HongKong/4801/2014相比,16株分离株抗原位点突变包括:A138S 1株,R142K 2株,R142K、R261Q 9株,R142KS144R、R261Q 1株,R142K、S144K、R261Q 1株。16株病毒的NA片段分析未发现NA耐药位点。基因型和表型分析表明,16株H3N2亚型流感毒株对抗流感药物奥司他韦及扎那米韦均敏感,均发现与M2基因耐药有关A30T、S31N分子位点的改变。结论2017年江苏H3N2亚型流行株HA和NA基因表现出异质性特点及发生基因重配现象,随着H3N2流感病毒变异持续发生,应密切监测病毒遗传进化和耐药基因的变化情况。
- 王慎骄祁贤邓斐彭杰夫余慧燕秦圆方戴启刚鲍倡俊
- 关键词：流感病毒H3N2亚型血凝素神经氨酸酶基因特性耐药性分析
- 江苏省2011年乙型流感病毒血凝素和神经氨酸酶分子流行特征被引量：8
- 2012年
- 目的分析2011年江苏省乙型流感病毒的血凝素（HA）和神经氨酸酶（NA）的分子流行特征。方法选择13株2011年江苏省不同地区、不同流行时间的乙型流感毒株进行全基因组测序，通过生物信息学方法对HA、NA分子流行特征进行分析。结果13株乙型流感毒株中，10株属于Victoria系，3株属于Yamagata系。10株Victoria系毒株的NA基因来源于Yamagata系病毒，是基因重配流行株。与疫苗株相比，10株Victoria系毒株和3株Yamagata系毒株的HA蛋白分别在197和196位增加一个糖基化位点。结论2011年江苏省乙型流感Victoria系和Yamagata系病毒同时流行，其中重配的Victoria系病毒占优势。
- 李伟罗鹏飞邓斐秦圆方资海荣汤奋扬祁贤卫平民
- 关键词：乙型流感血凝素神经氨酸酶分子特征
- 江苏省肠道病毒71型分离株的分子遗传进化特征
- 目的 了解肠道病毒71型(ENTEROVIRUS 71，EV71)江苏流行株的遗传学背景。方法 RT-PCR反应测定江苏株EV71_JIANGSU.P.R.C-07.08_10(以下简称JIANGSU01)的全基因组序列...
- 吴斌田华秦圆方邓斐祁贤朱凤才羊海涛汪华汤奋扬李亮崔仑标王慎骄付建光闫强徐飞海葛胜祥
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- 2011-2012年江苏省职业暴露人群禽流感病毒抗体水平及影响因素被引量：12
- 2013年
- 目的了解2011-2012年江苏省职业暴露人群H5N1高致病性禽流感病毒抗体水平。方法采集职业暴露人群血清样本,分别用湖北株、广东株两种抗原株,采用血清凝集抑制法(HI)测定禽流感H5N1抗体水平,同时对研究对象进行职业暴露情况与方式问卷调查。结果用湖北株抗原检测血清标本679份,H5N1抗体几何平均滴度(GMT)为7.62,95%CI为7.24～8.02;用广东株抗原检测血清标本314份,H5N1抗体GMT为11.00,95%CI为9.92～12.19,两者差异有统计学意义。不同年龄、性别、年份、是否宰杀禽类或接触禽类、是否接种过禽流感疫苗、近一个月是否接触过病死禽,人群GMT差异均无统计学意义;不同监测点、近一个月接触不同种类禽类,人群GMT差异有统计学意义。结论禽流感有经由呼吸道传播的可能性,通风条件差,可能加剧传播。鸭与鹅在江苏禽流感传播过程中的传播媒介作用可能大于鸡与野禽。广东株抗原与江苏职业暴露人群禽流感病毒流行株的特异性抗原更接近。
- 秦圆方许可祁贤潘玉宁李伟邓斐朱叶飞
- 关键词：禽流感病毒职业暴露人群影响因素传播媒介
- 江苏首例甲型H1N1(2009)流感病毒血凝素分子遗传特征分析
- 目的 探讨甲型H1N1流感病毒的遗传特征。方法 2009年6月12日，江苏确诊首例甲型H1N1病例。通过细胞和鸡胚分离系统，分离到一株具有较高血凝活性的病毒，命名为A/JIANGSU／1／2009。为了跟踪病毒的变异情况...
- 祁贤邓斐付建光秦圆方王慎骄霍翔许可朱凤才史智扬羊海涛汪华崔仑标李亮汤奋扬郭喜玲焦永军单军吴斌祖荣强
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- 2017-2019年我国南方地区高致病性H5N6亚型禽流感病毒血凝素蛋白分子特征分析被引量：6
- 2021年
- 【背景】自2014年以来,H5N6禽流感病毒在我国家禽和活禽市场持续进化,成为人类和动物健康的重大威胁。【目的】对2017-2019年中国南方地区93株高致病性H5N6禽流感病毒的HA基因进行分子进化分析。【方法】接种9-11日龄鸡胚分离核酸检测阳性的H5N6标本,运用下一代测序平台对病毒分离物进行全基因组测序,从NCBI和GISAID数据库下载参考序列,利用BLAST、MEGA6.1及Clustal X等软件进行序列分析。【结果】2017-2019年,从189份江苏省H5亚型禽类/环境标本和1名H5N6患者咽拭子标本中共分离到43株病毒,完成了33株H5N6病毒的全基因组测序。下载网上同时期中国其他地区流行的H5N6毒株序列,对总计93株H5N6病毒的HA基因进行分子进化分析。93株H5N6病毒中有78株属于Clade 2.3.4.4h,9株病毒属于Clade 2.3.4.4e,4株H5N6病毒属于Clade 2.3.4.4b,1株属于Clade 2.3.4.4f,1株属于Clade 2.3.4.4g。所有93株病毒HA蛋白的裂解位点含有多个碱性氨基酸,表明它们都属于高致病性禽流感病毒。所有93株病毒HA蛋白的Q222和G224位氨基酸没有发生突变,保留了禽类受体α2-3半乳糖苷唾液酸(SAα2-3Gal)结合特性;158位点丧失糖基化,同时124位出现一个新的潜在糖基化位点。【结论】2017-2019年间中国南方地区H5N6病毒进化活跃,具有明显的基因多样性,需要加强对病毒分子进化的监测。
- 邓斐祁贤余慧燕王慎骄黄昊頔许可鲍倡俊
- 关键词：禽流感病毒血凝素分子进化
- 移动流行区间法在评估江苏省流感流行强度中的应用研究被引量：5
- 2020年
- 目的探索移动流行区间法(moving epidemic method,MEM)在评估江苏省流感流行强度中的应用,为流感分级预警提供科学依据。方法基于2010-2017年每年第39周至次年第21周江苏省流感病毒的核酸阳性率数据进行建模,采用灵敏度、特异度、约登指数作为评价指标选择最优模型,并以此评估2017年第39周至2018年第21周江苏省流感的流行强度。结果选择2010-2017年每年第39周至次年第21周(经交叉验证,剔除2012-2013和2016-2017两个流行季后,最终实际纳入5个冬春流行季)的江苏省流感病毒核酸阳性率为评估基线,参数δ取值为2.2时,建立的MEM模型表现最优,合计灵敏度、特异度及约登指数分别为0.9465、0.8632及0.8097。2017年第50周我省进入流感流行期,于2018年第13周结束流行,期间流行持续达15周之久,其中高强度流行3周、中强度流行7周、低强度流行5周。结论MEM可作为江苏省识别流感流行和评估流行强度的方法。
- 钱程戴启刚戴启刚许可邓斐
- 关键词：流感
- 我国长三角地区首例人感染H5N6禽流感病毒的分离、鉴定与进化特征被引量：7
- 2021年
- 目的对我国长三角地区首例人感染H5N6禽流感进行病毒分离、鉴定和进化分析。方法通过荧光定量RTPCR法进行流感病毒分型检测,阳性标本用SPF鸡胚进行病毒分离,对病毒分离物进行全基因组扩增测序,利用Blastn、ClustalX和Mega 6.1等软件进行序列比对和系统进化分析。结果2019年11月禽流感患者标本中分离到1株H5N6禽流感病毒毒株,该病毒属于clade 2.3.4.4h,其HA蛋白裂解位点含有多个碱性氨基酸,为高致病性禽流感病毒。病毒HA蛋白的Q222和G224位氨基酸未发生突变,保留了禽类受体α2-3半乳糖苷唾液酸结合特性;AA158位点丧失糖基化,但AA124出现1个新的潜在糖基化位点。结论长三角地区首例人感染的H5N6禽流感病毒是1株新基因重配的高致病性禽流感病毒,与近年来家禽中流行的病毒高度同源,提示应该加强对禽流感病毒的监测和跨种传播的研究。
- 王慎骄余慧燕祁贤邓斐许可黄昊頔鲍倡俊
- 关键词：禽流感病毒
- 南京市首例甲型H1N1(2009)流感病毒分离及其血凝素基因遗传变异分析
- 2011年
- 对南京市首例甲型H1N1(2009)病毒进行细胞分离,获得一株具有较高血凝活性的病毒,命名为A/Nanjing/1/2009。在全基因组测序的基础上,对分离株的血凝素基因(haemagglutinin,HA)的遗传特征进行了详细研究。分离株HA蛋白不具有多碱基HA裂解位点,具有低致病性流感病毒特点。与参考株A/California/04/2009相比,分离株A/Nanjing/1/2009HA蛋白的有5个氨基酸发生了突变,其中一个位于Ca抗原位点208位氨基酸(R→K),这一突变虽然还不会影响抗原性的改变,但预示了新甲型H1N1(2009)抗原漂移的启动。分离株有5个潜在糖基化位点,这与近年来古典猪H1N1和北美三源重配猪H1病毒完全一致,保留了古典猪H1病毒的特点。与禽H1病毒相比,分离株HA蛋白受体结合位点上的190(E→D)和225(G→D)位点发生突变,这可能成为新甲型H1N1(2009)在人际间传播的一个重要分子基础。此外,其它受体结合位点上相关氨基酸同时具有人和猪流感病毒的特点。本研究对南京市早期流行的甲型H1N1(2009)流感病毒的HA蛋白的分子遗传特征进行了详细研究,对进一步监测病原变异具有重要指导意义。
- 梁立敏邵卫星范伟兴祁贤崔仑标吴斌邓斐付建光秦圆方王慎骄
- 关键词：病毒分离血凝素
- 江苏省2010-2014年流感流行特征分析被引量：45
- 2016年
- 目的 分析江苏省2010-2014年间流感样病例的流行病学特征,揭示流感流行特点并制定防控策略。方法 依据《全国流行性感冒（甲型H1N1流感）监测工作方案》,采集流感哨点医院流感样病例（influenza-like illness,ILI）就诊数,对病例咽拭子进行流感病毒核酸检测和病毒分离,结果录入国家流感网络监测系统,利用Excel2007和PASW 18.0对数据进行统计分析。结果 2010-2014年间共报告ILI病例123330例,分离14238株流感病毒,分离阳性率为11.54%。职业分布以托幼儿童及散居儿童为主。年龄分布以0~4岁组所占比例最大。结论江苏省流感每年有两个高峰期,分别是1~3月和7~10月。2010-2012年,B型和季节性H3N2是主要流行亚型。2013-2014年,甲型H1N1和季节性H3N2成为主要流行株亚型。
- 邓斐资海荣余慧燕王慎骄祁贤戴启刚鲍倡俊汤奋扬
- 关键词：哨点监测流行病学方法
