平原 作品数:29 被引量:134 H指数:6 供职机构: 上海市公安局 更多>> 发文基金: 上海市科学技术委员会科研基金 公安部部级科研项目 更多>> 相关领域: 医药卫生 政治法律 生物学 更多>>
STR系统HUMCSF1PO-HUMTPOX-HUMTH01三位点复合扩增在上海地区的频率分布 被引量:6 1998年 平原 顾丽华 陈连康关键词:多态性 尿液及尿斑的DNA分型研究 陈荣华 郑会芬 董研 徐庆文 顾丽华 程莉 张晨 平原 课题来源与背景:尿液作为一种较常见的生物检材,由于其含有少量上皮细胞等,这使得尿液及尿斑的DNA检验成为可能,但由于尿液中含有尿素、尿酸、无机盐类等抑制物,会直接影响到DNA检测,因此有必要探索尿液及尿斑的DNA检测方法...关键词:关键词:尿液 DNA分型 法医学 快速个体识别系统 周怀谷 郑卫国 平原 吴丹 陈新 胡伟 陈荣华 顾丽华 许炎 曹禹 该项目属法庭科学技术领域,主要立足于侦查破案的需求,通过开发血液DNA免提取技术和生物物证常温DNA提取技术、开发快速DNA聚合酶(热启动C-Taq酶)、开发快速电泳胶(EX-Q20),建立2小时内完成一份血样DNA-S...关键词:关键词:刑事侦查 生物样本 PCR扩增循环数与低拷贝模板DNA的STR分型 被引量:20 2005年 目的探讨PCR扩增循环数对低拷贝模板DNA的STR分型的影响。方法模板DNA(9947A)的不同扩增用量(含低拷贝模板量),采用ProfilerPlus试剂盒,扩增循环数分别为28、30、32、34、38次,3100型基因分析仪(ABI,美国)检测结果。结果循环数从28次增至38次,模板DNA量最低检出量可从0.25ng减少至0.0312ng;先循环28次后,每反应加0.3μlAmpliTaqGoldDNA聚合酶,再循环6次较1次34个循环的检测灵敏度高,相当于1次38个循环的效果。结论增加PCR扩增循环数,可能影响低拷贝模板DNA的STR分型。 陈连康 王德明 顾丽华 平原 阎建军 陈松 周怀谷 郑会芬 唐建平 陈荣华 徐庆文 程莉 董研关键词:法医物证学 低拷贝模板 STR分型 灵敏度 基于Ion Torrent PGM^(TM)测序平台的CSF1PO和D18S51基因座分析 被引量:1 2018年 目的应用二代测序(next generation sequencing,NGS)技术对CSF1PO和D18S51基因座进行分析检测,研究CSF1PO和D18S51基因座的序列多态性。方法采集165例中国汉族无关个体外周血样,应用QIAamp DNA Mini试剂盒提取样本DNA,Ion Plus Fragment Library试剂盒构建文库,在Ion Torrent PGMTM测序平台上进行DNA序列测定,针对新发现的等位基因进行Sanger测序验证。应用Torrent SuiteTMv5.0.2和Integrative Genomics Viewer软件分析数据,进行基因型鉴定和频率统计,运用PowerState v12软件对数据进行统计学处理。结果应用NGS技术同时获得了CSF1PO和D18S51基因座长度多态性和序列多态性,在CSF1PO基因座中,发现了1个新的基因型,在D18S51基因座中,发现2个新的基因型。采用Sanger测序法对NGS技术检测新发现的等位基因进行验证,验证结果一致。结论应用二代测序技术可检测CSF1PO和D18S51基因座核心重复序列的结构,提高基因座的识别效能。 杨仪尊 平原关键词:法医遗传学 CSF1PO 应用RNA分析技术推断现场血痕形成时间 被引量:8 2010年 目的检测血痕中β-actin mRNA和18S rRNA在人体死后8~15d期间的表达残留,为推断血痕形成时间寻找新的客观依据。方法在上述时段内每天抽提血痕总RNA,利用实时定量RT-PCR技术监测18S rRNA和β-actin mRNA的扩增状况并对产物进行定量分析,通过检测18S rRNA与β-actin mRNA含量在各个时间点的变化趋势来推测血痕形成时间。结果死后8~15 d时段内18S rRNA与β-actinmRNA量的比值呈明显升高趋势,显示出两种不同类型RNA降解的时间差异性。结论一定时段内18SrRNA与β-actin mRNA量的相对变化,可作为推测血痕形成时间的参考指标。 许炎 蒋巍 平原 毕钢 陈连康 周怀谷关键词:法医遗传学 逆转录聚合酶链反应 应用Differex^(TM)法提取混合斑中精子DNA 被引量:4 2006年 董研 陈荣华 平原 郑会芬关键词:法医物证学 混合斑 精子DNA 基于Ion Torrent PGM^(TM)测序系统的人mtDNA全测序分析 被引量:4 2017年 目的应用Ion Torrent PGM^(TM)测序系统对人线粒体DNA(mitochondria DNA,mtDNA)全序列进行分析检测,研究不同组织间mt DNA序列差异情况。方法通过法医尸体检验采集6名无关个体的组织样本,包括胸腔血液、头发、肋软骨、指甲、骨骼肌和口腔上皮。使用4对引物对线粒体全序列进行扩增,应用Ion Shear^(TM)Plus Reagents试剂盒和Ion Plus Fragment Library试剂盒等构建文库,并在Ion Torrent PGM^(TM)测序系统上进行线粒体基因组全序列测序,并针对异质性位点和在HVⅠ区域突变位点,进行Sanger测序验证。结果所有样本的全基因组mtDNA都扩增成功,6名无关个体分属于6种不同的单倍型,同一个体不同组织之间mtDNA存在异质性差异。异质性位点和HVⅠ区域突变位点采用Sanger测序结果均得到验证。通过Kappa统计方法进行一致性检验后发现,相同个体不同组织的mtDNA序列检验结果仍具有较好的一致性。结论本研究所采用的人线粒体基因组全序列的测序检验方法,可以检测出同一个体不同组织间mtDNA的异质性差异,该差异具有较高的一致性,该结果对mtDNA在法庭科学中的应用具有指导作用。 曹禹 邹凯南 邹凯南 黄江平 平原关键词:法医遗传学 遗传异质性 快速个体识别STR分型技术 被引量:3 2010年 DNA-STR分型技术[1]一般包括DNA提取、PCR扩增、电泳分析三个部分,DNA提取需要1 h以上,PCR扩增需要3~4 h,电泳分析需要1 h以上,完整的DNA-STR分型需要6~8 h[2]。进一步缩短DNA-STR分型时间,实现快速DNA分析成为科研攻关的一个新的重点[3-5]。目前,快速DNA分析的研究主要集中在快速DNA提取和快速电泳分型两个部分。 周怀谷 夏子芳 陈荣华 陶莉 杨辉 吴微微 王林生 平原 郑卫国关键词:法医遗传学 核酸扩增技术 STR分型 6+1 STR试剂盒和电泳凝胶EX-Q20用于DNA快速检验 被引量:3 2011年 目的建立快速个体识别STR分型方法。方法取采集于FTA上的血样200份,经打孔仪取等量血痕分别使用6+1 STR试剂盒结合新型毛细管电泳凝胶EX-Q20进行快速电泳分析和使用SinofilerTM试剂盒结合POP4胶进行电泳分析,比较两者所耗费时间和结果的差异。结果 6+1 STR试剂盒结合新型毛细管电泳凝胶能够得到全部分型结果且耗时较短。结论 6+1 STR试剂盒结合新型毛细管电泳凝胶进行STR分型,结果准确可靠,尤其适用于重特大案件中大量人员的排查、比对,能大大提高办案效率。 平原 周怀谷 许炎 夏子芳 郑卫国关键词:法医遗传学 短串联重复序列