李鑫
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- 新等位基因HLA-B*56∶21的核苷酸序列分析
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- 新等位基因HLA-B* 56:21的核苷酸序列分析
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- 关键词:基因分型SBT
- 文献传递
- 新等位基因HLA-B*56:21的核苷酸序列分析
- 2012年
- 目的确认HLA新等位基因HLA-B*56∶21并分析其有异常反应格局的核苷酸序列。方法标本DNA抽提采用美国Tiangen试剂盒,采用聚合酶链反应序列-特异寡核苷酸探针杂交技术(PCR-SSOP)进行HLA分型,发现1个与HLA-B*56相关的异常基因,使用DNA测序分型技术(PCR-SBT)直接测定其基因序列,并分析其与最接近的HLA-B*56∶05∶02和HLA-B*56∶07基因序列的差异。结果新基因与所有已知的HLA-B等位基因序列均不相同,与HLA-B*56∶05∶02基因序列相比在第2外显子有6个碱基发生替代,导致5个氨基酸发生改变;与HLA-B*56∶07相比,在第2外显子序列仅有2个碱基被替代,第3外显子序列有6个碱基被替代,也导致5个氨基酸发生改变。结论发现1个新的HLA-B等位基因,现已被世界卫生组织HLA因子命名委员会正式命名为HLA-B*56∶21,新等位基因HLA-B*56∶21与HLA-B*56∶05∶02、HLA-B*56∶07均有很高相似性。
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- 关键词:基因分型SBT