焦诗卉
- 作品数：3 被引量：8H指数：1
- 供职机构：中山大学生命科学学院更多>>
- 发文基金：国家自然科学基金广东省科技计划工业攻关项目更多>>
- 相关领域：生物学医药卫生更多>>
- HIV-1辅助受体CCR5与其天然配体结合效果的综合评价
- 2012年
- 【目的】探讨CCR5蛋白与天然配体的结合姿态位置,寻找CCR5的优化对接靶点及与天然配体结合的最优姿态,为HIV-1新型药物研发提供依据。【方法】运用SWISS-MODEL构建天然配体的三维结构,运用Discovery studio软件ZDOCK模块模拟3种天然配体RANTES,MIP-1α和MIP-1β与CCR5对接,分析对接姿态,计算ZDOCK综合得分,评估结合效果优劣。【结果】RANTES、MIP-1α和MIP-1β这3种天然配体主要是在N末端或第二个胞外环与CCR5蛋白结合。并且RANTES较MIP-1α和MIP-1β有更强的抑制作用。【结论】第二个胞外环可能是多肽抑制剂与CCR5结合的主要位点。对于RANTES的分子修饰是未来研发多肽类CCR5抑制剂的首选方向。
- 焦诗卉何淼
- 关键词：DISCOVERYSTUDIOCCR5HIV-1
- HIV辅助受体CCR5常见小分子抑制剂抑制效果的综合评价被引量：8
- 2012年
- 通过系统比较CCR5常见小分子抑制剂的抑制效果,寻找CCR5的优化对接靶点,筛选最优抑制剂,为新型抑制剂的研发提供理论依据。基于Material Studio软件,我们构建了7类29种小分子抑制剂的三维结构,全面模拟了各种抑制剂与CCR5对接的效果;利用分子对接绝对自由能、相对自由能、对接姿态百分比和Lib-Dock综合得分等参数评估小分子抑制剂的抑制效果。研究初步发现,CCR5小分子抑制剂的最优对接位点是第二个胞外环与N末端之间的site4。小分子抑制剂的抑制效果由强到弱排序依次为:抑制剂27(吡咯烷类)、抑制剂8(苯并环庚烯类)、抑制剂12(哌啶类)、抑制剂14(螺环二酮哌啶类)、抑制剂21(4-哌啶-1-丁胺类)、抑制剂5(天然小分子类)和抑制剂17(托品烷类);其研究表明,吡咯烷类抑制剂27可能成为CCR5最优抑制剂候选对象。
- 焦诗卉何淼
- 关键词：DISCOVERYSTUDIOCCR5HIV-1小分子抑制剂
- 基于Discovery Studio评价15种Rho相关激酶Ⅰ抑制剂的抑制效果
- 2013年
- 目的 通过比较分析15种Rho相关激酶（ROCK）Ⅰ常见抑制剂的抑制效果,寻找ROCKⅠ的优化对接靶点,筛选最优抑制剂.方法 使用Material Studio软件构建抑制剂三维结构,并模拟抑制剂与ROCKⅠ对接.利用Excel统计分析模拟对接结果.结果 ROCKⅠ被抑制的优化对接靶点分别为site2（A链）和site20（B链）.抑制剂的抑制效果由强到弱排序依次为：抑制剂12（吲唑类）、抑制剂8（4-氨基吡啶类）、抑制剂5（异喹啉类）、抑制剂13（酰胺和脲类）和抑制剂15（Rockout）.结论 吲唑类抑制剂12可能成为ROCK Ⅰ的最优抑制剂.
- 焦诗卉李前刘箐瞿俊雄何淼
- 关键词：RHO相关激酶类4-氨基吡啶
