管天冰
- 作品数:20 被引量:27H指数:3
- 供职机构:重庆科技学院更多>>
- 发文基金:国家自然科学基金重庆市自然科学基金中央高校基本科研业务费专项资金更多>>
- 相关领域:医药卫生农业科学理学化学工程更多>>
- 基于虚拟筛选从中药中发现抗铜绿假单胞菌的活性成分被引量:5
- 2022年
- 针对铜绿假单胞菌的耐药性问题,采用虚拟筛选技术快速筛选出具有抗铜绿假单胞菌活性的中药成分。采用AutoDock Vina程序对铜绿假单胞菌LasR信号受体蛋白的2UV0、3IX3和6MVM三个共晶结构进行方法学研究,然后利用Lipinsky规则对陶术中药数据库进行初步筛选,通过分子对接进行再次筛选,并对满足Lipinsky规则且结合能低于阈值的化合物开展体外抑菌实验。研究结果表明3IX3靶点蛋白分子对接模型具有较强的活性分子富集能力,基于该模型对陶术中药数据库进行虚拟筛选后发现符合Lipinsky规则且结合能低于阈值的化合物7个,目筛后得到潜在活性分子5个,体外抑菌实验发现黄芩素-7-甲醚有明显抗菌活性,其最小抑菌浓度为500μg·mL^(-1)。本研究理论结合实验发现黄芩素-7-甲醚有较好的抗铜绿假单胞菌活性,对抗菌新药的研发具有一定的参考价值。
- 徐明鑫陈双扣管天冰任风鸣任风鸣谭小庆
- 关键词:铜绿假单胞菌分子对接中药成分
- 基于分子对接的DNA拓扑异构酶Ⅳ抑制剂的虚拟筛选研究被引量:1
- 2023年
- 目的基于分子对接的虚拟筛选和体外抑菌实验快速筛选出DNA拓扑异构酶Ⅳ抑制剂。方法采用AutoDock Vina程序对DNA拓扑异构酶Ⅳ的3个靶点蛋白1S16、3FV5和4ZH0进行方法学研究,通过均方根偏差(RMSD)、曲线下面积(AUC)、富集因子(EF)等参数评估对活性分子富集能力较强的分子对接模型,并利用该模型对数据库进行大规模的虚拟筛选,保留结合能低于阈值的化合物开展体外抑菌实验。结果综合回溯性验证结果发现1S16靶点蛋白的分子对接模型具有较强的活性分子富集能力,基于该模型虚拟筛选出22个具有潜在抑菌活性的化合物,体外抑菌实验发现其中8个化合物具有明显的抗大肠杆菌活性。结论本研究发现8个化合物具有明确的抗大肠杆菌活性,有望成为新型DNA拓扑异构酶Ⅳ抑制剂。
- 徐明鑫陈双扣谭小庆任风鸣管天冰
- 关键词:分子对接大肠杆菌体外抑菌
- 精准靶向代谢组学方法的优化建立与多生物基质应用研究
- 代谢组学是继基因组学、转录组学和蛋白组学后出现的新兴学科,是系统生物学的重要组成部分。它通过定性鉴别和定量描述生物基质中小分子代谢物的表达与修饰变化来系统反馈生命体对自身机体调控或者外界环境扰动所做出的代谢应答。当前,代...
- 管天冰
- 关键词:高效液相色谱
- 一种纯天然成分染发剂及其制备方法
- 一种纯天然成分染发剂,配方由:含有染色组合药物、预处理剂和媒染剂;其中,所述染色组合药物包含何首乌、熟地、指甲花、木蓝和旱莲草;本发明制备的纯天然成分染发剂染发效果好色泽自然,长时间洗涤,不褪色,且所采用的染色配方安全无...
- 戴传云唐睿管天冰周雪毅雷鑫邓仁勇张桃源
- 不同添加物对草莓(隋珠)不定芽生根的影响被引量:2
- 2021年
- 以草莓(隋珠)不定芽为原材料,MS为基本培养基,考查不同植物生长素、天然添加物和活性炭对其生根的影响。结果表明:植物生长素促进草莓不定芽生根效果,IBA〉NAA〉IAA,当IBA浓度为0.5mg/L时,不定芽的生根率为84%;天然添加物中香蕉对生根有抑制作用,土豆和椰汁对促进生根无明显作用;添加适量的活性炭能有效促进不定芽生根,最佳浓度为2g/L。最终确定草莓(隋珠)不定芽的最优生根培养基为MS+0.5mg/L IBA+2g/L活性炭+蔗糖30g/L+琼脂粉7g/L,pH值5.8。
- 何平刘成周寰宇蒲泽凤管天冰戴传云
- 关键词:草莓组培不定芽
- 整合代谢组学和生物信息学策略在解析中药系统复杂性中的应用被引量:3
- 2014年
- 中药在化学组成方面的复杂性决定了其作用方式和作用过程的复杂性。传统研究方法缺乏系统性,使得一系列制约中药现代化发展的关键问题一直未能得到很好的解决,包括中药化学物质组表征、中药作用机制、中药方剂配伍规律以及中药毒性机制等中药系统复杂性问题。代谢组学作为一门全新的组学技术,秉承了从机体全局系统出发来考量机体内源性小分子物质与外源性干预物质(如药物)的相互作用的理念,与在中医药理论指导下的中药作用原理思路一致。近年来,人们尝试将整合代谢组学技术和生物信息学策略用于解开上述中药关键问题,并已取得了一定的成果。但其在理论挖掘、策略设计、方法开发和实践拓展诸多方面都有很多具体的工作需要进一步推进。对整合代谢组学和生物信息学策略在解析中药系统复杂性中的应用进行综述。
- 郭晓娟管天冰李强聂文娜闫乐玉吕海涛
- 关键词:代谢组学生物信息学配伍规律
- 紫外光催化合成四氢苯并呋喃衍生物的反应研究
- 2021年
- 四氢苯并呋喃衍生物是重要的医药中间体,目前其合成方法研究具有局限性。为了获得较好的合成方法,本文将对四氢苯并呋喃衍生物的合成方法进行研究。以环己酮衍生物与氰乙酸乙酯、单质硫为模型反应,经紫外催化,通过考察反应用碱、反应时间和反应温度,确定了最佳条件,并对反应条件进行普适性研究。研究发现该反应条件更加温和,副反应较少,产率较高;小位阻的环己酮衍生物对该条件具有更好的适应性,若反应底物的位阻增大会降低收率。本文报道的四氢苯并呋喃衍生物的合成方法将在医药中间体的合成中具有较好的应用前景。
- 杨金华管天冰夏世豪周莉佳李朝政
- 关键词:紫外碱催化
- 群体性肌肉损伤代谢组学研究
- 肌肉损伤是一种普遍发生性健康问题,广泛影响大众的健康,尤其严重影响高强度重体力劳动者的身心健康,其发生会带来经济与健康的双重负担,并会显著消弱个体和群体的生产力。考虑到肌肉损伤的发挥势必会改变机体代谢模式的紊乱,本研究主...
- 李强苏乔管天冰郭小娟郭浩吕海涛
- 关键词:肌肉损伤代谢组学生物标记物代谢表型
- 文献传递
- 基于多维质谱-波谱策略的六种肾病的代谢表型研究
- 复杂性疾病的发生发展会引起多器官和细胞的代谢异常,表现为宿主代谢产物的表达水平的异常改变,其相关代谢通路的活性也会受到显著影响。本研究应用基于气相色谱-质谱和核磁共振联用技术的代谢组学策略,开展肾结石、前列腺炎、良性前列...
- 刘文虎管天冰郭浩郭小娟阙玉梅李强徐广冯孟培苏乔闫乐玉吕海
- 关键词:GC/MS代谢表型
- 文献传递
- 二型糖尿病多维代谢组学研究
- 2型糖尿病是一种典型性代谢类疾病,它的发生发展主要引起机体多器官多系统的代谢紊乱。本研究主要利用基于NMR、GC-MS和LC-MS技术的代谢组学平台对多中心获得的2型糖尿病人群和对应健康人群的尿液和血浆(67例2型糖尿病...
- 郭小娟李强管天冰郭浩徐广苏乔阙玉梅冯孟培贺艳吴霞聂文娜吕海涛
- 文献传递