罗涛
- 作品数:11 被引量:28H指数:4
- 供职机构:复旦大学更多>>
- 发文基金:国家科技重大专项上海市科学技术委员会资助项目更多>>
- 相关领域:医药卫生政治法律更多>>
- 结核分枝杆菌北京家族菌株的起源、进化及其与现代人类迁移的联系
- 我国是全球22个结核高负担国家之一,结核病人数位居世界第二。我国的结核疫情主要由结核分枝杆菌北京家族菌株(简称北京菌株)所致。该菌株在东亚各国高度流行,并在全球广泛传播。在表型上,北京菌株通常被认为具有更强的致病性和耐药...
- 罗涛
- 关键词:起源进化耐药
- 文献传递
- 建立适合我国结核分枝杆菌特征的可变串联重复序列(VNTR)分型方法被引量:6
- 2014年
- 建立相对统一的结核分枝杆菌基因分型方法对掌握我国流行菌株的遗传特征及评估各地区结核病的近期传播有重要意义。结核分枝杆菌可变串联重复序列(VNTR)分型在全球范围内得到了广泛运用,Philip Supply等于2006年提出的15/24位点VNTR(VNTR-15/24)是目前应用最多的方案,但该方案对我国高度流行的北京家族菌株的分辨率较低。
- 罗涛杨崇广逄宇赵雁林梅建高谦
- 关键词:可变串联重复序列结核分枝杆菌基因分型方法流行菌株
- 论秘密侦查权的控制
- 秘密侦查权作为一种侦查机关打击犯罪的有力手段,具有价值多元、内容复杂的特性,而相应地,秘密侦查权的控制也成为一个异常棘手的课题。承认秘密侦查权正当性的同时,对秘密侦查权进行一定的法律控制,是法治国家的一致共识。然而,在我...
- 罗涛
- 关键词:价值考量
- 文献传递
- 不同可变数目串联重复序列组合鉴定结核分枝杆菌临床菌株分型的效果被引量:8
- 2015年
- 目的 探讨不同可变数目串联重复序列(VNTR)组合鉴定MTB临床菌株分型的效果并在全国推广使用.方法 连续收集国内5个区县的891株MTB菌株样本,通过计算不同VNTR组合的分辨力指数(HGI),系统评估目前常用的VNTR分型组合,包括国外推荐的12个散在分布重复单位(MIRU)位点组合(MIRU-12)、15/24 VNTR位点组合(VNTR-15/VNTR-24)、24 VNTR位点加4个高变位点组合(VNTR“24+4”)以及国内吕冰等建立的15位点组合(VNTR-L15)和本课题组筛选的VNTR“9+3”组合.结果 分辨力由高至低依次为VNTR“24+4”(0.999 2)、VNTR“9+3”(0.998 9)、VNTR-24 (0.992 9)、VNTR-15 (0.988 4)、VNTR-L15 (0.970 9)、MIRU-12(0.924 8).VNTR“9+3”的分型能力不仅超过VNTR-15,且高于VNTR-24,与分辨力最高的VNTR“24 +4”组合分型结果一致的菌株数为822株,一致率达到96.6% (822/851).结论 VNTR“9+3”的分辨力和分型结果均与VNTR“24+4”相当,且具有位点数少、工作量小,易于推广的优点.建议将VNTR“9+3”组合作为我国MTB基因型分型的推荐方案推广应用.
- 刘梅罗涛杨崇广柳清云高谦
- 关键词:串联重复序列基因型
- 上海地区耐多药结核菌突变特点
- 2010年
- 快速诊断并阻断耐多药结核茵的传播对控制耐多药结核病疫情具有非常重要的意义.结核分枝杆菌生长缓慢,传统的基于固体培养的药物敏感试验非常耗时,新的基于耐药突变的分子诊断方法将是快速诊断的发展趋势.结核分枝杆菌耐药与基因组上特定基因的点突变有关.目前WHO审核通过了2个基于检测突变的快速诊断产品,但由于不同地区耐药突变特点不同,其在不同地区检测的敏感性和特异性有很大差异.我们观察了上海地区耐多药结核分枝杆菌耐药基因突变特点,筛选出一套高敏感耐药突变位点用于耐药结核病的快速诊断.
- 罗涛赵明李霞徐鹏桂晓虹Sam PickerillKathryn De Riemer梅建高谦
- 关键词:耐多药结核菌点突变耐多药结核分枝杆菌耐药突变药物敏感试验耐药基因突变
- 结核分枝杆菌复合群快速鉴定方法及试剂盒
- 本发明属检测试剂领域,涉及核分枝杆菌复合群检测鉴定试剂盒及结核分枝杆菌复合群鉴定的方法,本方法通过序列比对,设计了用于检测结核分枝杆菌复合群的荧光探针及扩增引物,并基于实时荧光定量PCR平台,通过非对称扩增PCR技术和探...
- 罗涛柳清云高谦
- 文献传递
- 可变数目串联重复序列在上海崇明岛地区结核分枝杆菌北京基因型菌株微进化研究中的应用被引量:4
- 2010年
- 本文通过对上海市疾病预防控制中心收集并保存的、来源于上海崇明岛地区痰培养阳性肺结核患者的135株结核分枝杆菌北京基因型菌株进行可变数目串联重复序列(VNTR)和单核苷酸多态性(SNP)基因分型,并构建最小生成树(MST),来寻找适合研究北京基因型菌株微进化的VNTR组合及区分不同亚型的分子标志。结果显示,16位点VNTR与SNP的分型结果最匹配,适合于研究该地区北京基因型菌株的微进化;SNP单倍型主要集中在ST10(42.2%)、ST19(30.4%)、ST22(14.1%)3个类型;4个VNTR位点(Mtub21、QUB26、MIRU16和QUB4156)可能是区分北京基因型菌株不同亚型的分子标志。
- 乔可王辉杨崇广罗涛梅建高谦
- 关键词:结核分枝杆菌北京基因型可变数目串联重复序列单核苷酸多态性最小生成树
- 上海地区肺结核病患者氧氟沙星耐药情况分析被引量:4
- 2011年
- 目的了解上海地区肺结核病患者氧氟沙星耐药的分布情况及可能的危险因素。方法收集2009--2010年上海市各结核病定点医院的447株对任意一种一线抗结核药物(异烟肼、利福平、链霉素和乙胺丁醇)耐药的菌株,同期随机选取151株对上述4种一线抗结核药物全敏感菌株,对这598株结核分枝杆菌菌株进行氧氟沙星敏感性检测,分析氧氟沙星耐药的分布情况。收集肺结核患者的年龄、性别、抗结核治疗史和户籍资料,采用多因素分析研究氧氟沙星耐药可能的危险因素。用DNA测序分析氧氟沙星耐药菌株gyrA、gyrB基因耐药突变的特征。结果447株耐药菌株中,72株(16.1%)对氧氟沙星耐药,MDR(至少同时对异烟肼、利福平耐药)结核分枝杆菌中氧氟沙星耐药44株(39.6%)。在151株一线抗结核药物全敏感菌株中,4株(2.6%)耐氧氟沙星。多因素分析结果显示MDR和多耐药(对一种以上抗结核药物耐药,但不对异烟肼和利福平同时耐药)等与氧氟沙星耐药有关(OR分别为19.5、5.6,95%C1分别为6.4~59.4、1.7~18.1,P均〈0.05)。患者为复治病例与氧氟沙星耐药相关(OR=2.3,95%CI:1.2~4.0,P〈0.05)。氧氟沙星耐药与年龄偏大有关(OR=1.03,95%CI:1.01—1.05,P〈0.05)。76株氧氟沙星耐药菌株的gyrA、gyrB基因序列分析显示62株(81.6%)发生耐药突变。结论上海地区MDR结核病患者中氧氟沙星耐药率高于对一线抗结核药物全敏感的肺结核病患者。MDR、多耐药、复治、年龄为氧氟沙星耐药可能的危险因素,其中以MDR与氧氟沙星耐药的关联强度最大。
- 李静沈鑫张阳奕罗涛杨崇广郭俊涛江渊武洁王莉莉桂晓虹高谦梅建
- 关键词:抗药性多药喹诺酮类氧氟沙星
- 双通道实时荧光PCR熔解曲线法检测结核分枝杆菌药物耐药相关基因突变被引量:6
- 2013年
- 目的基于双标记荧光探针熔解曲线分析技术,建立一种利用实时荧光PCR快速检测结核分枝杆菌耐药突变的方法。方法根据结核分枝杆菌一线药物常见耐药突变位点(包括rpoB81bp耐药决定区、inhA启动子、katG315、ahpC启动子以及embB306)设计6条荧光双标记探针和对应引物,通过PCR扩增耐药突变位点所在基因片段,在扩增完成后通过熔解曲线检测分析实现对耐药突变的快速检测。通过对2008年上海市疾控中心收集的76株临床耐多药(MDR)菌株进行检测,验证本方法的敏感度和特异度。结果本方法成功从76株MDR菌株中检测出相关耐药突变,各种突变对应△Tm值范围为1.8~14.4℃。将检测结果和测序结果对比表明该方法检测敏感度和特异度都为100%(rpoB,80/80;inhA,7/7;katG315,59/59;ahpC,8/8;embB306,27/27)。本方法可以成功从最低浓度为100拷贝/μl的结核分枝杆菌DNA样本中准确地检测耐药突变。结论双通道实时荧光PCR熔解曲线法可以快速灵敏地检测结核分枝杆菌常见耐药突变。该方法具有检测迅速准确、结果易判读、交叉污染概率低等特点,可用于快速检测临床结核耐药相关的基因突变,并对结核耐药情况进行评估。(中华检验医学杂志.2013.36:63-67)
- 柳清云罗涛李静梅建高谦
- 关键词:实时聚合酶链反应分枝杆菌结核
- 锑矿工结核病传播及危险因素调查
- 2015年
- 目的了解锑矿工肺结核感染率及感染的危险因素。方法采用整群抽样方法,对263例锑矿工肺结核患者进行结核分枝杆菌的菌株鉴定和药敏试验。基因分型采用12位点结核分枝杆菌散在分布重复单元和多位点串联重复序列;采用2检验评估结核传播的危险因素。结果锑矿工肺结核的感染率为9.8%(472/4 831);纳入研究的263例患者中,175例成簇,成簇率为66.5%,近期传播率最低估计值为53.2%。治疗失败、工龄大于10年、菌株多重耐药及痰涂片阳性的锑矿工肺结核传播率较高。结论锑矿工结核分枝杆菌具有成簇性,其菌株毒力更强、传播率高,治疗效果、矿龄、菌株耐药性及痰涂片结果是影响肺结核传播的重要危险因素。
- 陈开森刘涛林瑞瑞罗涛杨崇广
- 关键词:锑矿工结核结核分枝杆菌串联重复序列