翟明强
- 作品数：7 被引量：34H指数：4
- 供职机构：安阳市疾病预防控制中心更多>>
- 发文基金：安阳市科技攻关项目河南省医学科技攻关计划项目河南省卫生科技创新型人才工程更多>>
- 相关领域：医药卫生更多>>
- 安阳地区2013年手足口病柯萨奇病毒A6 VP1基因特征研究被引量：15
- 2016年
- 为了解2013年安阳地区手足口病病原谱组成特点及柯萨奇病毒A6(CV-A6)VP1基因特征,采用实时荧光逆转录PCR方法对全年采集的临床手足口病例的479份粪便标本进行检测和分型,统计各型肠道病毒阳性标本数量及比例。对10份CV-A6阳性标本VP1基因进行扩增测序以获得全序列。使用BIOEDIT 7.2和MEGA 5.1软件对获得序列和NCBI数据库中检索到的参考序列进行VP1基因核苷酸、氨基酸相似性及系统发育分析。研究结果显示,检出肠道病毒阳性标本共429份,其中CV-A6阳性标本为90份,占全部阳性标本的比例为20.98%,这是安阳地区首次记录非CV-A16和EV-A71型肠道病毒列居手足口病病原谱第二位,成为手足口病主要病原之一。将成功获得的10条VP1序列与CV-A6原型株Gdula比较,发现安阳序列与Gdula VP1基因的核苷酸、氨基酸序列差异皆较大。与河南历史株HN421(2011)比较,发现有4条本地序列与HN421的核苷酸、氨基酸序列差异较大,其余6条与HN421差异较小。系统发育树显示,全部49条CV-A6序列共形成A、B、C、D四个分支。其中D分支可进一步分为D1和D2两个亚分支。安阳地区获得的10条CV-A6序列中,有6条属于D1亚分支,4条属于D2亚分支。
- 李洋张相萍翟明强黄学勇李懿
- 关键词：手足口病肠道病毒系统发育树
- 2011-2015年安阳地区手足口病相关人肠道病毒B种病原组成及柯萨奇病毒B2、B5 VP1基因特征分析被引量：9
- 2016年
- 目的：调查2011—2015年安阳地区手足口病（ hand,foot and mouth disease, HFMD）相关人肠道病毒B种（HEV-B）病原组成,对柯萨奇病毒B2（CVB2）和柯萨奇病毒B5（CVB5）VP1基因特征进行研究。方法使用实时荧光逆转录 PCR 和半巢式逆转录 PCR 法对柯萨奇病毒 A16（CVA16）、肠道病毒71（EV71）以及其他肠道病毒进行鉴定,以获得完整的手足口病病原组成,统计出HEV-B病原种类及阳性比例。针对HEV-B病原中阳性病例数较多的CVB2和CVB5病原,分别以其VP1基因为靶段设计引物 PCR扩增测序后获得 VP1基因核苷酸序列全长。使用 MEGA7.0和BioEdit7.2软件对本研究获得的CVB2、CVB5序列以及GenBank数据库已收录的全部相关VP1序列构建系统发育树并进行系统发育分析。使用DateMonkey在线分析程序对我国近年来流行的CVB2和CVB5毒株的VP1基因进行选择压力分析。结果2011—2015年安阳地区共鉴定出手足口病相关HEV-B病原14种,HEV-B阳性标本57份。 HEV-B病原占手足口病全部病原种类的比例为56%, HEV-B阳性标本占总肠道病毒阳性标本的比例为3.06%。绝大多数HEV-B病原引起的手足口病呈高度散发,个别病原如 CVB2、CVB5在特定时间内的病例较为聚集。经过测序获得安阳地区8条CVB2和9条CVB5 VP1序列。构建的系统发育树显示,CVB2毒株可分为A-D四个基因型,各基因型的组间平均进化距离介于0.191-0.208,核苷酸序列相似性介于79.7%-85.8%。 CVB5毒株可分为A-F六个基因型,各基因型的组间平均进化距离介于0.170-0.285,核苷酸序列相似性介于76.0%-86.8%。 CVB2 VP1基因氨基酸序列第157、263位,CVB5 VP1基因氨基酸序列第75、90、95位在不同基因型毒株中的残基有较大差异。安阳地区CVB2序列均属于D基因型,且集中于1个分支内；CVB5序列均属于F基因型,分布于其中2个分支内。中国大陆地区近年流行的CVB2（ D基因型）和CVB5（F基因亚型）毒株的进化�
- 李洋张相萍翟明强黄学勇李懿
- 关键词：手足口病肠道病毒系统发育树
- 一种柯萨奇病毒A6型核酸的检测试剂盒及检测方法
- 本发明属生物技术领域，具体涉及一种快速柯萨奇病毒A6型的实时荧光定量逆转录PCR检测试剂盒及检测方法。本发明所述柯萨奇病毒A6核酸的检测试剂盒，包括：核苷酸序列如SEQ ID NO.1所示的柯萨奇病毒A6正向引物、核苷酸...
- 李洋张相萍徐耀宇翟明强包小兵胡秀杰宋凤燕宋艳文侯晓惠林媛媛张栓虎梁玉清于杰
- 文献传递
- 女性泌尿生殖道支原体检测及耐药分析
- 2012年
- 目的女性泌尿生殖道支原体的检测和药敏分析,为临床选择最佳抗菌药物提供科学依据。方法采用珠海浪峰生物技术公司生产的支原体培养,鉴定药敏试剂盒检测。结果 Uu和Mh共121例,其中Uu81.8%、Mh 12.4%、两者混合感染者7例(5.8%)。结论本地区女性支原体感染者以Uu感染为主,交沙霉素和强力霉素可作为支原体感染治疗的首选药物。
- 宋凤燕宋艳文翟明强
- 关键词：支原体解脲支原体人型支原体
- 柯萨奇病毒A6 TaqMan探针实时荧光逆转录PCR检测方法的建立被引量：5
- 2015年
- 目的设计柯萨奇病毒A6特异性TaqMan探针和引物,建立敏感、特异的实时荧光逆转录PCR检测方法。方法针对CVA6VP1基因,设计荧光探针和引物,优化摩尔配比,建立并优化PCR反应体系。回收PCR产物,构建重组质粒,经梯度稀释后作为模板进行敏感性试验,绘制标准曲线,评估检测方法的敏感性。对包括多种肠道病毒在内的共15种病毒进行特异性实验,评估检测方法特异性。对479份手足口病患者临床标本进行鉴定,检出的CVA6阳性标本再用普通PCR方法复核。随机抽取10份实时荧光PCR阳性产物克隆后测序,评估本方法检测临床标本的准确性。结果建立的实时荧光逆转录检测方法扩增出CVA6VP1基因的目的序列,当探针、引物摩尔配比在1︰2~1︰5时,PCR结果均较为理想,探针、引物摩尔配比为1︰3.5时,荧光强度最大。敏感性试验显示该方法扩增效率为88.9%,可检出低至2.1×102copies/ml核酸模板。特异性试验显示该方法仅能对CVA6实现特异性扩增,其他多种病毒反应均为阴性。从479份手足口临床标本中共检出CVA6阳性标本84份,与普通PCR方法复核结果一致。随机抽取的10份阳性产物克隆测序鉴定后均为CVA6目的序列。结论建立的实时荧光逆转录PCR方法具有特异性强、灵敏度高、准确可靠等优点,可用于CVA6型手足口病检测。
- 李洋张相萍翟明强黄学勇李懿
- 关键词：肠道病毒实时荧光PCR
- 2011-2015年安阳地区手足口病相关柯萨奇病毒A6 VP1基因特征被引量：7
- 2017年
- 目的 对2011-2015年安阳地区手足口病（HFMD）相关柯萨奇病毒A6（CVA6）VP1基因进行研究,以了解本地区CV-A6的分子流行病学特征.方法 使用实时荧光PCR方法对临床病例标本进行肠道病毒型别鉴定.设计引物对CV-A6阳性标本的VP1区进行扩增和测序.构建系统进化树并进行系统进化分析.对近年流行的CVA6中国毒株的VP1基因进行进化选择压力分析.结果 2011-2015年安阳地区检出CV-A6阳性标本365份,占总肠道病毒阳性标本的比例为19.59%.系统进化分析显示,抽样调查的22条安阳地区CVA6 VP1序列中,有5条属于D1基因亚型,另外17条属于D2基因亚型.进化选择压力分析显示,D1、D2基因亚型中国株VP1基因承受的进化选择压力（ω值）分别为0.031和0.075;在D1、D2基因亚型中国株VP1基因上分别发现正选择氨基酸位点1处和4处.结论 2011-2015年安阳地区先后流行有D1、D2两种基因亚型的CVA6毒株.D2基因亚型对D1基因亚型的替代以及D2基因亚型的持续传播是造成安阳地区2013-2015年CV-A6型手足口病疫情的主要原因.
- 李洋包红红张相萍翟明强包小兵黄学勇李懿
- 关键词：手足口病肠道病毒属柯萨奇病毒
