陈立凯
- 作品数：20 被引量：49H指数：4
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- 一种水稻稻瘟病抗性基因Pik的分子标记和应用
- 本发明属于植物生物技术领域，具体公开了一种水稻稻瘟病抗性基因Pik的分子标记和应用，所述分子标记由一对外引物Pik-O-F、Pik-O-R和一对内引物Pik-T-F、Pik-C-R组成，引物序列如SEQ ID NO：1～...
- 郭涛肖武名陈立凯黄翠红罗文龙陈志强王慧
- 文献传递
- 水稻花色素苷合成调节基因hrd1(t)的鉴定被引量：3
- 2013年
- 【目的】对籼稻种质hrd1紫叶性状进行遗传分析和基因定位。【方法】在特籼占13与02428杂交后代中获得籼稻紫叶材料hrd1。对hrd1主要农艺性状及表型进行观察;配制hrd1与02428的F1、F2、BC1F1群体,观察紫叶与绿叶性状的分离情况,明确其遗传模式;进一步利用F2群体实现紫叶性状基因的精细定位和候选基因遴选。【结果】hrd1在2叶期的叶尖出现紫色,并逐步扩散至全株大部分组织,成熟期农艺性状与对照(特籼占13)具有较大差异。hrd1叶绿素含量正常,花色素苷含量显著高于对照。遗传分析表明其紫叶性状受1对隐性核基因hrd1(t)控制,该基因位于第4染色体InDel标记HRD10和HRD21之间,物理距离为32.5 kb。对该区域候选基因测序,发现hrd1在LOC_Os04g50660基因(编码WD和G-beta重复域蛋白)的第3外显子发生单碱基突变(A→C),导致其编码的第196位氨基酸由对照的赖氨酸变为苏氨酸。【结论】hrd1(t)编码WD40类转录因子,可能参与花色素合成调控。
- 刘永柱罗文龙黄翠红陈立凯王慧陈志强郭涛
- 关键词：水稻花色素苷
- 水稻开颖半不育突变体的观察、遗传分析和基因定位被引量：4
- 2016年
- 【目的】通过对一份航天诱变水稻（Oryza sativa L.）开颖半不育突变体ohss（open-hull semi-sterility）进行形态特性调查、遗传分析和基因定位,筛选候选基因,为下一步基因克隆和功能分析奠定基础。【方法】以籼稻品种航恢七号为材料,通过＂神舟八号＂飞船搭载,诱变获得一份水稻开颖半不育突变体ohss。对其进行形态特征解剖观察,分析颖花器官发育突变特点。调查突变体和野生型的花粉可育率、自然结实率和套袋自交结实率,对其育性进行鉴定。随机选取5个成熟单株,考察穗部谷粒相关性状并进行统计分析。通过覆盖全基因组的SSR分子标记检测,解析空间诱变的分子变异效应。以航恢七号、Francis和02428与突变体ohss配制杂交组合,观察F1和F2植株的花器官表型,进行χ~2测验,对突变性状进行遗传分析。以02428/ohss的F_2分离群体作为目标基因定位群体,同时利用SSR标记以及新开发的多个In Del分子标记开展基因定位研究。利用RAP水稻基因组注释数据库对定位区间的候选基因进行预测,通过序列比对和基因表达分析筛选候选基因。【结果】开颖半不育花器官突变体ohss与野生型相比,抽穗期穗部明显包茎,颖花发育出现异常,内外稃片瘪弱、扭曲变形且开裂不抱合,颖花内部发育类似内稃状的器官,部分颖花没有内稃的分化。ohss发育异常颖花中可育花粉率58.74%,导致单株结实率、穗重、穗实粒数与野生型相比极显著降低。全基因组SSR标记检测表明突变体ohss总变异频率为0.0336,除了第7、12染色体未检测到突变位点,其他染色体上检测到突变频率范围为0.0143—0.0889。遗传分析结果显示ohss的开颖半不育表型受单隐性核基因ohss（t）控制,并将ohss（t）定位在水稻第3染色体上2个In Del标记In Del6043和In Del6070之间约27.6 kb的物理距离内。该区域有3个预测注释基因,序列比对和表达
- 陈立凯黄明刘永柱王慧陈志强郭涛
- 关键词：水稻航天诱变花器官发育基因定位
- 基于高密度Bin图谱的水稻抽穗期QTL定位被引量：10
- 2018年
- 以粳稻品种02428和籼稻品种玉针香进行杂交,按单粒传法连续自交10代,得到包含192个株系的重组自交系(RIL)作图群体。通过对两亲本重测序及RIL群体简化基因组测序,构建了包含2711个Bin标记的高密度遗传图谱。该图谱各染色体标记数在162~311个之间,标记间平均物理距离为137.68 kb。将亲本及192个株系分别于4个环境下采用随机区组种植,并记录抽穗期。使用Win QTL Cartographer 2.5软件的CIM分析方法,进行抽穗期相关QTL检测及定位。在4个环境下定位到影响抽穗期的QTL共14个,分布于第1、第2、第3、第7、第8、第9和第10染色体。其中,q HD2.2和q HD10.2能在3个环境中被重复检测到,表型贡献率分别为5.14%~11.15%和5.35%~16.97%,分别能缩短抽穗期1.66 d和1.56 d,具有聚合育种的应用价值。通过物理位置比对,14个QTL中有11个与前人定位在相同或邻近区域,q HD1.1、q HD2.2和q HD9.1尚未见报道。经对q HD2.2详细分析,在其染色体区间内找到3个与抽穗期相关的注释基因LOC_Os02g46450、LOC_Os02g46710和LOC_Os02g46940,其中LOC_Os02g46450已被克隆。测序分析发现,这3个基因在两亲本间都存在差异,可作为候选基因。
- 董骥驰杨靖郭涛陈立凯陈志强王慧
- 关键词：水稻抽穗期QTL定位
- 基于“多基因聚合-早世代组配”策略的水稻分子改良研究被引量：2
- 2017年
- 传统水稻育种技术最主要瓶颈是选择效率低和周期长。为了提高水稻优异材料选育和杂交稻组配效率,创新水稻分子育种策略,利用分子标记辅助选择多基因聚合和早世代杂交组配,展开水稻恢复系分子改良和杂交新组合的调查评价。供体亲本H318与恢复系亲本华占进行杂交,通过选择和设计关键有利基因的分子标记,利用毛细管电泳基因分型技术,将Wxb、fgr、Xa23、Pi2、Pi46以及Pita 6个稻米品质、香味、抗白叶枯病和抗稻瘟病相关功能基因进行聚合利用。通过多世代的田间生物学性状调查,米质、抗性等表型鉴定,获得14份以恢复系华占为遗传背景,目标基因纯合的优质、双抗和香型稳定的水稻株系。依据材料稳定遗传特性,将改良后代株系与生产应用的不育系进行测配和组合的调查评价,筛选获得潜在优良杂交稻。在育种进程中采用"多基因聚合-早世代组配"策略,实现多个有利基因快速聚合,定向改良稻米品质和抗病性等关键性状,并且促进杂交水稻组合的高效选育。
- 陈立凯郭涛刘永柱王慧陈志强
- 关键词：水稻分子改良杂交组配恢复系
- “神舟八号”搭载‘航恢173’种子的当代生物效应及SSR分析被引量：5
- 2014年
- 水稻空间诱变的当代效应与地面其他常用的理化诱变方法存在较大差别,并且不同航天器的诱变效应往往也不尽一致。为了探明搭载"神舟八号"飞船的当代效应及其特征,以籼稻‘航恢173’种子经"神舟八号"搭载诱变当代(SP1)为材料,考察其发芽率、苗高、成熟期株高、剑叶长和宽、主穗长和结实率等7个性状,探讨"神舟八号"搭载的当代效应,并与250 Gy60Co-γ射线辐照当代(G1)和1%EMS诱变处理当代(E1)进行对比;进一步利用位于水稻12条染色体的24个SSR标记对100个混合SP1样品(300个单株)进行变异检测,以期从分子水平了解"神舟八号"搭载的诱变效应。结果表明,与对照相比,SP1的发芽率、主穗结实率分别显著和极显著下降,而其余5个性状差异不显著;对比分析表明,与"神舟八号"搭载对植株后期生长无明显影响不同的是,G1和E1的植株其后期生长受到促进,导致G1、E1和SP1在株高、剑叶长和宽上均存在显著或极显著差异。SSR座位的扩增结果表明,仅SSR标记RM267在1个样品中检测到明显的变异条带,变异频率约为0.014%。
- 罗文龙陈立凯王慧刘永柱郭涛陈志强
- 关键词：神舟八号EMSSSR
- 一种稻瘟病抗性基因Pita的分子标记和应用
- 本发明属于植物生物技术领域，具体公开了一种稻瘟病抗性基因Pita的分子标记和应用，所述分子标记由一对外引物Pita-O-F、Pita-O-R和一对内引物Pita-T-F、Pita-C-R组成，引物序列如SEQ ID NO...
- 王加峰陈立凯罗文龙黄翠红郭涛陈志强王慧
- 文献传递
- 水稻矮秆基因iga-1的序列变异和表达分析被引量：3
- 2016年
- 该研究以水稻矮秆突变体cha-2为材料,对控制其表型性状的iga-1基因进行候选基因筛选,利用基因注释数据库对定位区间进行候选基因预测,通过ORF及其上下游调控区域的测序、序列比对及关键元件分析进行序列变异研究,半定量PCR检测目标基因的表达模式,明确其在基因序列、表达模式的变异,探讨其分子遗传调控机理。结果显示:(1)在隐性核基因iga-1精细定位基础上预测得到3个ORF,其中2个编码dnaJ分子伴侣(含有dnaJ结构域的蛋白),分别是LOC_Os05g26902和LOC_Os05g26926;另外1个为已克隆的水稻矮秆基因RGA1(LOC_Os05g26890)。(2)ORF序列分析表明矮秆突变体cha-2与野生型仅在RGA1基因座存在SNP变异,但未造成氨基酸编码的改变。(3)表达模式分析发现,矮秆突变体cha-2的RGA1基因在种子萌发期、二叶期、四叶期和分蘖期等4个发育时期均不表达,且在‘中花11’、‘石狩白茅’的遗传背景下稳定遗传,均显现出失活状态,初步确定RGA1为iga-1的候选基因。(4)对RGA1基因上游和下游调控转录关键区进行测序结果表明,突变体cha-2存在865bp的大片段缺失,包括第1外显子、部分第1内含子和转录起始上游区域。研究推断,突变体cha-2的矮秆基因iga-1正是没有活性的RGA1基因,其转录关键区域的大片段缺失,导致无法正常转录表达。
- 陈立凯卢苏龙刘永柱王慧陈志强郭涛
- 关键词：水稻矮秆基因缺失突变
- 基于籼粳杂交重组自交系的水稻籽粒性状的遗传变异研究被引量：5
- 2016年
- 为研究多环境条件下籽粒性状的遗传变异及性状间相关性,解析籽粒性状遗传规律.以细长型籼稻品种‘玉针香’和短圆型粳稻品种‘02428’为亲本构建的含192个株系的RIL（重组自交系）群体为研究材料,在4种环境下分别对籽粒相关的16个性状进行相关性分析和遗传变异解析.结果表明,两亲本的粒型、垩白性状存在显著差异,其中,‘玉针香’精米长宽比、垩白粒率和垩白度分别为4.03、1.00％和0.18％,‘02428’精米长宽比、垩白粒率和垩白度分别为1.45、87.40％和52.21％.RIL群体各性状的平均值介于两亲本之间,分布频率呈趋于单峰的正态分布,符合数量性状遗传规律.多环境下变异分析表明,大部分籽粒性状受环境及环境与株系互作不同程度的影响;而谷粒面积、谷粒圆度2个性状受环境、环境与株系互作的影响均不显著.遗传群体各性状变异系数为6.34％～84.55％,广义遗传力为4.26％～70.67％.粒长、粒宽、垩白粒率、垩白度间呈明显互作关系.在RIL群体中筛选获得4个在穗部性状、粒质量和稻米外观品质等方面综合表现较为优良的株系,具有较高育种价值.说明：基于遗传背景明确的重组自交系群体,可解析籽粒性状的遗传变异规律,并有效创制优异育种材料.
- 高维维陈立凯胡朝旭黄钰婷黄明郭涛王慧陈志强
- 关键词：水稻重组自交系籽粒性状
- 一种鉴定水稻垩白主效基因的基因型的分子标记及其应用
- 本发明属于植物生物技术领域，具体公开了一种鉴定水稻垩白主效基因的基因型的分子标记及其应用；所述分子标记由一对外引物Chalk5-O-F、Chalk5-O-R和一对内引物Chalk5-C-F、Chalk5-T-R组成，引物...
- 郭涛陈立凯黄翠红周丹华罗文龙陈志强王慧
- 文献传递
