黄莉
- 作品数：14 被引量：43H指数：4
- 供职机构：南宁市疾病预防控制中心更多>>
- 发文基金：广西南宁科学研究与技术开发计划项目更多>>
- 相关领域：医药卫生语言文字更多>>
- 2007年南宁市A(H3N2)亚型流感病毒抗原性及血凝素重链区基因特性分析被引量：2
- 2010年
- 目的:了解南宁市A(H3N2)亚型流感病毒血凝素的抗原性和基因变异情况。方法:对分离到的A(H3N2)亚型流感病毒进行单向HI试验分析抗原性,并按不同时间、不同人群选取35株进行血凝素核苷酸全长序列测定,推导出其氨基酸序列,重点对血凝素重链区进行基因特性分析。结果:单向HI试验表明,2007年度南宁市分离到的A(H3N2)亚型流感病毒抗原性与2004年WHO推荐株A/福建/411/2002(H3)相比,后者HI效价比前者高4倍以上;与2007年国内代表株A/江西东湖/312/2006(H3)相比,HI效价无≥4倍差异。核苷酸和氨基酸序列分析结果表明,与A/福建/411/2002(H3)相比核苷酸和氨基酸同源性分别为97.99%和97.81%,平均替换数分别为19.8个和7.2个,涉及2个抗原决定簇和受体结合位点左侧壁;与A/江西东湖/312/2006(H3)相比核苷酸和氨基酸同源性均为98.40%,平均替换数分别为15.8个和5.2个,涉及2个抗原决定簇。结论:2007年南宁市分离的A(H3N2)亚型流感病毒已发生抗原漂移。
- 秦剑秋刘海燕林新勤范云燕黄莉
- 关键词：流感病毒血凝素抗原
- 南宁市2007～2009年H3N2亚型流感病毒NA基因变异分析
- 2012年
- 目的对2007～2009年度南宁市流行性感冒病毒NA序列分析,阐明NA基因变异和进化特征。方法提取2007～2009年30株（每年10株）H3N2亚型病毒RNA,采用RT-PCR扩增病毒NA基因后进行序列测定,利用VectorNTI9.0对测序结果分析处理,并与WHO推荐疫苗株进行比对,用Mage 4.1构建系统进化树。结果南宁市2007～2009年H3N2亚型流感病毒被分为3个分枝,其中疫苗株A/Wisconsin/67/2005独立形成一个分支（类群Ⅰ）,A/Brisbane/59/2007与2007年毒株（除339外）形成类群Ⅱ,2008和2009年毒株聚集成类群Ⅲ。NA基因在质尾区域、极性跨膜区、柄部区域有个别毒株个别位点发生了替换。抗原区域328～336替换频率较高,2008年毒株抗原位点更活跃。A/nanning/242/2007在酶活性位点发生了D151E替换,可能导致NA对扎纳米韦和奥斯他韦的轻微耐药性;A/nanning/242/2007、A/nan ning/561/2008分别在非活性位点N234D,在G286D的替换则可能影响NA介导的病毒粒子的释放从而影响NA蛋白的活性。结论南宁市2007~2009年毒株NA均发生了较大变异,当年疫苗株均滞后南宁流行株。
- 范云燕刘海燕林新勤秦剑秋黄莉覃巍巍
- 关键词：流感病毒H3N2神经氨酸酶基因分析
- 2008—2009年南宁市人季节性H1N1流感病毒神经氨酸酶潜在的抗原位点和抑制剂耐药位点分析被引量：1
- 2012年
- 目的了解2008—2009年南宁市人季节性H1N1流感病毒神经氨酸酶(NA)基因的遗传进化特征,探讨NA基因潜在的抗原位点和活性位点(抑制剂耐药性位点)变异规律。方法提取2008—2009年20株H1N1流感病毒RNA,采用RT-PCR扩增病毒NA基因后进行序列测定,通过CTLPred软件预测NA基因上潜在的抗原位点,并对NA分子进化和其重要功能位点的遗传变异进行分析。结果将20株H1N1流感病毒毒株与北半球疫苗推荐株A/Solomon/3/2006和A/Bris-bane/59/2007构建进化树,NA进化树共分成3个类群,10株2008年H1N1流感病毒毒株聚集成分支Ⅱ,10株2009年毒株与疫苗株A/Brisbane/59/2007聚集成分支Ⅰ,A/Solomon/3/2006则独立形成1个分支(Ⅲ)。2008年毒株抗原位点替换频率较高,相对于A/Solomon/3/2006氨基酸替换分布在不同的3个区域的3个位点,分别是N64H、Y100H、L367I;2009年度的毒株抗原决定簇位点相对保守。在已知NA的酶活性位点中,2009年所有毒株均在275位点发生了H>Y的突变,而这种变异在2008年的毒株中未有出现。结论 A/Solomon/3/2006落后于2008年毒株,A/Brisbane/59/2007对应的疫苗在2009年能起到较好的保护作用;大量H275Y耐药株的出现提示在流感病毒监测中应密切关注其耐药位点的变异。
- 范云燕刘海燕石健秦剑秋黄莉覃巍巍
- 关键词：流感病毒H1N1神经氨酸酶抗原位点
- A(H3N2)亚型流感病毒血凝素基因特性及蛋白结构分析,以南宁市2009～2012年为研究案例被引量：2
- 2015年
- 利用生物信息学软件和数据库研究南宁市2009~2012年度A(H3N2)亚型流感病HA基因的遗传变异规律及蛋白结构变化。通过RT-PCR扩增H3N2病毒HA基因并测序,同源比对统计毒株氨基酸位点的差异、构建系统进化树分析进化规律和同源建模分析蛋白结构的变化。系统进化树表明53株HA基因序列被分为4个类群,呈多侧支流行;所有毒株的二硫键和受体结合位点(RBS)高度保守;部分毒株HA在第45位点增加一个糖基化位点,在第144位点丢失一个糖基化位点;HA抗原决定簇氨基酸累计有30个位点发生变异,涉及5个抗原决定簇;HA晶体结构分析抗原决定簇突变位点主要发生在无规则卷曲处,大多数替换的氨基酸种类和性质相同或相似。南宁市A(H3N2)亚型流感病毒株变异活跃,2012年A(H3N2)亚型流感病毒与当年WHO推荐的疫苗株具有较远的进化距离,多数毒株具备了形成新变种的条件,是否形成新的流行株,有待深入研究。
- 秦剑秋裴建新林新勤王亮黄莉刘海燕
- 关键词：血凝素蛋白结构同源建模
- 南宁市同期两起A(H3N2)流行性感冒疫情中流感病毒血凝素重链区基因特性
- 2011年
- 目的了解南宁市同一时期不同县区发生的两起A(H3N2)亚型流感疫情中流感病毒血凝素基因变异情况。方法从狗肾传代细胞中(MDCK)分离的A(H3N2)亚型流感病毒提取核糖核酸(RNA),进行血凝素核苷酸全长序列测定,推导出其氨基酸序列,重点对血凝素重链区进行基因特性分析。结果两起疫情共分离到A(H3N2)亚型流感病毒5株,核苷酸和氨基酸序列分析结果表明,与2007年WHO推荐的北半球疫苗株A/Wisconsin/67/2005(H3)相比,核苷酸和氨基酸同源性分别为98.58%～98.89%和96.96%～97.87%,替换数分别为11～14个和7～10个,涉及3个重要的抗原位点。结论同期两起疫情分离到的A(H3N2)亚型流感病毒已发生抗原漂移且毒力有所改变,发生在不同县区的疫情所分离到的流感病毒性状不尽相同,同一起疫情中发病时间不同所分离出的流感病毒有一定基因差异。
- 秦剑秋刘海燕林新勤黄莉范云燕
- 关键词：流感病毒血凝素基因
- 南宁市2012—2015年流行性感冒流行特征分析被引量：10
- 2017年
- 目的分析南宁市2012—2015年流行性感冒(简称流感)监测结果,为流感防制策略提供依据。方法采用实时荧光RT-PCR方法对采集的流感样病例(Influenza-like Illness,ILI)咽拭子标本进行流感病毒核酸检测,并运用描述性流行病学方法对流感流行特征进行分析。结果 2012—2015年共采集ILI咽拭子标本共6 664份,经流感病毒核酸检测,阳性标本988份,阳性率为14.83%。4年中流感病毒优势株交替变化,2012年和2014年的优势毒株为甲3型,2013年优势毒株为新甲型H1N1,2015年优势毒株是甲3型和B型;0~<11岁组和21~<31岁组的阳性人数占阳性总数的50.30%。流感暴发疫情61起,其中59起疫情发生在中小学校。结论南宁市2012—2015年流感的流行特征有明显的季节性,主要易感人群为婴幼儿、小学生和青壮年。加强对重点人群的监测及疫苗预防接种工作,对控制流感疫情的暴发具有重要意义。
- 农皓刘海燕秦剑秋尹刘江杨丞詹鑫婕裴建新黄莉
- 关键词：流行性感冒流感样病例病原学监测
- 2013-2014年南宁市A(H3N2)亚型流感病毒病原学特征分析被引量：3
- 2017年
- 目的分析南宁市2013-2014年A(H3N2)亚型流感病毒的病原学特征及流行趋势。方法通过RT-PCR扩增毒株A(H3N2)病毒血凝素(HA)基因和神经氨酸酶(NA)并进行同源比对,采用Mega5.1(N-J法)构建系统进化树,统计氨基酸位点的差异,同源建模后分析蛋白结构的变化。结果构建系统进化树,20株毒株HA基因与NA基因均分为4个类群,呈多侧支流行;部分毒株的HA蛋白A抗原决定簇144位点及B抗原决定簇156和158位点发生突变,二硫键和糖基化位点高度保守,未发生变化;NA蛋白抗原基本稳定,只有A/Nanning/43/2014(H3N2)毒株抗原决定簇312位点发生突变,二硫键、酶活性位点、糖基化位点及耐药性位点均未发生变化;HA和NA蛋白晶体结构分析显示氨基酸突变位点主要发生在β折叠部位和无规则卷曲处。结论南宁市A(H3N2)亚型流感病毒株变异活跃,在HA基因和NA基因进化树上疫苗株明显滞后于南宁市流行株,抗原决定簇位点出现氨基酸的替换,但关于疫苗的预防效果尚需进一步验证。
- 秦剑秋王亮刘海燕黄莉
- 关键词：血凝素神经氨酸酶蛋白结构同源建模
- 2008～2009年南宁市季节性H1N1亚型流感病毒血凝素HA1基因变异分析
- 2013年
- 目的分析南宁市2008～2009年度流行性感冒的病原学监测结果,探讨其季节性H1N1亚型流感病流行情况和HA1基因变异规律及进化趋势。方法根据流感病原学监测和疫情挑选2008～2009年中分离到的季节性H1N1亚型毒株20株(每年10株),提取病毒RNA,采用RT-PCR扩增病毒HA基因后进行核苷酸序列测定,利用VectorNTI 9.0分析处理,并与WHO推荐疫苗株进行比对,用Mage 4.1构建系统进化树。结果 2008～2009年南宁市季节性流感流行主要集中在夏秋季节,H1N1成为2008年度的优势毒株。进化树分析表明,南宁市2008～2009年毒株被分为2个分支(Ⅰ和Ⅱ),A/Solomon/3/2006和A/Brisbane/59/2007分别分布在分支Ⅰ和Ⅱ内。对H1N1HA1氨基酸序列分析表明,20份毒株二硫键和糖基化位点比较保守,受体结合位点(RBS)和抗原决定簇位点相对活跃,其中RBS 188、189、222、224均发生了不同程度的变异。与A/Solomon/3/2006相比,2008年毒株抗原决定簇存在4个氨基酸的替换并且分布在两个抗原决定簇区域,2009年毒株除A/nanning/473/2009外,抗原决定簇区氨基酸变异未达到4个。结论南宁市2009年H1N1流感病毒HA1基因特性与A/Brisbane/59/2007疫苗株接近,2008年毒株与两疫苗株相比变异较大,这可能是导致2008年南宁市H1N1亚型流感病毒流行强度明显增加的原因。
- 范云燕刘海燕林新勤秦剑秋黄莉覃巍巍
- 关键词：H1N1血凝素类基因变异
- 南宁分离株A(H3N2)流感病毒神经氨酸酶遗传变异及蛋白结构分析被引量：6
- 2015年
- 目的应用生物信息学方法分析南宁市2007-2012年A(H3N2)亚型流感病毒分离株神经氨酸酶NA的遗传变异规律、二硫键、酶活性中心位点、抗原决定簇位点、糖基化位点及蛋白结构变化情况。方法通过RT-PCR扩增H3N2病毒NA基因并测序,运用生物软件对所测序列进行拼接和同源比对;通过构建系统进化树分析进化规律,通过同源建模分析蛋白结构的变化。结果系统进化树将40株NA基因序列分为4个类群,呈多侧支流行;毒株的二硫键高度保守,酶活性中心位点224和位点276出现氨基酸的替换,部分毒株NA抗原决定簇328、332、336、434氨基酸位点发生替换;所有毒株200、329和402糖基化位点全部丢失,部分毒株在367位点增加一个糖基化位点,在234位点丢失一个糖基化位点;HA晶体结构分析氨基酸突变位点主要发生在β折叠部位和无规则卷曲部位。结论南宁分离株A(H3N2)亚型流感病毒变异活跃,抗原决定簇位点、酶活性中心位点、糖基化位点均出现氨基酸的替换。因此应继续加强对南宁市的流感监测,及时了解当地流感的流行趋势和病毒的抗原变异情况,为全国的流感预防、控制、预测及流感疫苗株的开发提供理论依据。
- 秦剑秋裴建新林新勤王亮黄莉刘海燕
- 关键词：神经氨酸酶蛋白结构同源建模
- 南宁市流感病毒HA基因和NA基因的遗传学监测
- 刘海燕秦剑秋范云燕王亮林新勤黄莉覃巍巍石健
- 该课题为南宁市科技局2008年8月下达的南宁市科学研究与技术开发计划项目：人口健康、计划生育、新生儿健康关键技术研究开发（合同编号：200802127C）课题，课题名称为：南宁市流感病毒HA基因和NA基因的遗传学监测。课...
- 关键词：
- 关键词：流感病毒生物信息数据库
