孔秀英
- 作品数:83 被引量:408H指数:11
- 供职机构:中国农业科学院作物科学研究所更多>>
- 发文基金:国家重点基础研究发展计划国家自然科学基金引进国际先进农业科技计划更多>>
- 相关领域:农业科学生物学医药卫生更多>>
- 利用改进的Cap-trapper法构建拟斯卑尔脱山羊草(Ae.speltoides Tausch)全长cDNA文库被引量:13
- 2005年
- Captrapper法是目前全长cDNA文库构建的重要方法之一。在引进、消化、吸收的基础上,通过设计引物,同位素检测,对末端转移反应条件控制等方面做了一些切实可行的改进,形成了一套简单易行的技术体系。利用改进的Captrapper方法,成功构建了小麦B基因组的可能供体种拟斯卑尔脱山羊草(Ae.speltoides)的全长cDNA文库。经综合评价,文库的全长比例达到89.6%,重组率为99%,库容量超过3.0×106cfu。
- 毛新国孔秀英赵光耀贾继增
- 关键词:全长CDNA文库
- 几种cDNA差减文库构建方法的比较被引量:36
- 2000年
- cDNA差减文库的构建是研究基因差异表达、缩小目的基因筛选范围的理想方法。近年来报道了多种构建方法 ,并形成了两个发展趋势 ,但目前还无一种方法被普遍认可。现就几种常见方法的原理、思路及优缺点进行了比较 ,以供借鉴。
- 骆蒙孔秀英贾继增
- 关键词:差减文库差减杂交CDNA
- TaRomo1蛋白在调控小麦雄性育性中的应用
- 本发明公开了TaRomo1蛋白在调控小麦雄性育性中的应用。TaRomo1蛋白的氨基酸序列如SEQ ID NO:2和/或SEQ ID NO:4所示。沉默TaRomo1蛋白能够导致小麦雄性半不育,具体表现为穗部的颖壳张开、花...
- 刘杰夏川董慧雪刘盼张立超贾继增刘旭孔秀英孙加强
- 粗山羊草(Ae.tauschii)幼苗和根全长cDNA文库构建及其EST注释与比较分析被引量:6
- 2007年
- 【目的】构建小麦D基因组供体粗山羊草根和叶的全长cDNA文库,探讨利用生物信息学方法分析发掘组织特异性表达基因的可行性。【方法】本研究利用Cap-trapper方法构建全长cDNA文库,利用高通量测序技术获得大批高质量EST序列,在基于Linux系统的本地化生物信息学分析平台上对上述EST进行了电子注释分析。【结果】成功构建了粗山羊草根和叶的全长cDNA文库,测序获得根EST序列6973条和叶EST6616条。利用本地化数据分析平台对其进行功能注释。利用GO-Diff软件,发现了两个文库间表达基因的功能差异,找到组织间表达差异显著的基因和组织内特异性表达的基因。【结论】利用构建的全长cDNA测序获得大量EST序列,通过生物信息学方法挖掘差异表达或特异性表达基因的方法是可行的。
- 赵光耀孔秀英贾继增
- 关键词:粗山羊草表达序列标签全长CDNA文库功能注释
- TabHLH44蛋白及其编码基因与应用
- 本发明公开了TabHLH44蛋白及其编码基因与应用。本发明提供了蛋白,命名为TabHLH44,是如下1)或2):1)序列表中序列2所示的蛋白质;2)将序列表中序列2所示的氨基酸序列经过一个或几个氨基酸残基的取代和/或缺失...
- 孔秀英翟亦倩张立超夏川符思路赵光耀贾继增
- 文献传递
- 硬粒小麦Glu-B3基因家族新成员的克隆及其分子标记的开发被引量:4
- 2008年
- 获得小麦低分子量谷蛋白基因家族新成员,为深入研究该基因家族的组成及其在染色体上的分布与进化奠定基础。本研究根据已发表的小麦低分子量麦谷蛋白基因序列设计了1对简并引物,以从硬粒小麦品种Langdon BAC文库中筛选的携带小麦低分子量谷蛋白基因的BAC为模板,利用同源序列克隆技术克隆了1个MET类型的小麦低分子量谷蛋白基因LMWLDN-M,该基因编码350个氨基酸。利用LMWLDN-M与本实验室克隆的Langdon品种其他类型的小麦低分子量谷蛋白基因之间的SNP,设计了该类型基因特异的引物。以Langdon代换系和中国春小麦缺体-四体为模板进行PCR扩增,将该基因定位到小麦B基因组上。序列分析表明,LMWLDN-M为Glu-B3基因家族的一个新成员。
- 赵永涛孔秀英詹克慧
- 关键词:硬粒小麦基因家族
- 细菌人工染色体(BAC)文库及其在小麦中的应用被引量:2
- 2006年
- 细菌人工染色体(BAC)具有容量大、遗传稳定、易于操作等优点,在基因组研究和基因功能分析等方面得到了广泛应用。对BAC文库克隆载体的类型、小麦BAC文库的构建及其应用进行了综述,并对其前景进行了展望。细菌人工染色体载体是由大肠杆菌的F-因子发展而来,第一代BAC克隆载体pBAC108l能容纳300kb的片段,但它只具有转化选择标记,没有重组选择标记。第二代载体是将LacZ基因插入到多克隆位点中形成具有重组选择标记类型的载体如pBeloBAC11,在该载体的基础上经过改造和改进又发展了一些特殊用途的载体,如富集基因类型和遗传转化类型的载体。近年来利用这些载体构建了小麦二倍体、四倍体、六倍体基因组BAC文库以及小麦特定染色体BAC文库,并以单克隆或混合池的形式保存。这些小麦BAC文库对于小麦基因克隆、基因组及基因区物理图谱的构建以及比较基因组学等方面的研究具有重要的意义。
- 刘越孔秀英吴佳洁肖建会刘旭
- 关键词:小麦细菌人工染色体文库基因组学
- 一粒小麦抗白粉病和条锈病基因的分析被引量:6
- 2005年
- 一粒小麦是普通小麦抗性改良的宝贵资源。本研究对24份一粒小麦分别进行了白粉病和条锈病混合菌种苗期接种鉴定,进一步分别用一套白粉病菌菌株(15个)对2份乌拉尔图小麦和条锈病菌小种(21个)对1份栽培一粒小麦进行接种鉴定,其中乌拉尔图小麦UR206能抵抗所有供试白粉菌菌株,UR204除对白粉菌菌株E11感病外,对其余菌株表现抗性;栽培一粒小麦MO205对不同条锈菌小种表现出不同的抗性反应,研究表明乌拉尔图小麦UR206、UR204和栽培一粒小麦MO205分别含有与已知抗白粉病和抗条锈病基因不同的新基因。对乌拉尔图小麦UR204、UR206和栽培一粒小麦MO205分别进行抗白粉和条锈病基因的遗传分析,结果表明乌拉尔图小麦UR204和UR206分别含有一对显性抗白粉病基因,栽培一粒小麦MO205含有两对独立遗传的显性抗条锈病基因。
- 邱永春周荣华孔秀英徐世昌张书绅孙晓丽贾继增
- 关键词:基因分析
- 植物耐逆相关蛋白TaMYB30及其编码基因和应用
- 本发明公开了植物耐逆相关蛋白TaMYB30及其编码基因和应用本发明提供的蛋白质,是如下(a)或(b):(a)由序列表中序列1所示的氨基酸序列组成的蛋白质;(b)将序列1的氨基酸序列经过一个或几个氨基酸残基的取代和/或缺失...
- 孔秀英张立超赵光耀贾继增刘旭
- 文献传递
- 小麦TaGA20ox2基因的克隆及分析被引量:9
- 2009年
- 【目的】克隆小麦中的GA20-氧化酶基因并进行遗传定位,为深入研究小麦中的GA20-氧化酶基因作用机理奠定基础,同时为改良小麦的重要农艺性状提供理论依据。【方法】采用同源克隆结合BAC文库筛选的方法克隆基因,利用中国春缺失体以及国际作图群体对该基因进行遗传定位。【结果】从普通小麦中国春中分离得到TaGA20ox2的gDNA与cDNA序列,利用中国春缺失体材料将TaGA20ox2定位于3A、3B、3D染色体上,序列分析表明分别位于3A、3B、3D染色体上的TaGA20ox2-A1、TaGA20ox2-B1和TaGA20ox2-D1与水稻GA20ox2为直向同源基因,具有GA20ox2家族保守结构域;利用国际作图群体W7984×Opata85将位于3D上的基因TaGA20ox2-3定位于xfba330与xgwm664标记之间。【结论】分离获得小麦中分布于第三同源群的GA20ox2;分子标记结果结合QTL作图信息可以初步推测TaGA20ox2-3在小麦中可能是控制株高的基因。
- 武晶孔秀英高丽峰任正隆贾继增
- 关键词:小麦基因克隆