王亚学
- 作品数:2 被引量:2H指数:1
- 供职机构:中山大学化学与化学工程学院更多>>
- 发文基金:国家自然科学基金更多>>
- 相关领域:理学更多>>
- QM/MM自由能微扰法在酶催化高精度能量计算中的应用
- 沈勇吴景恒吴晓天王亚学温斯翔
- 关键词:质子转移
- 16α取代雌二醇衍生物的三维定量构效关系和分子对接研究被引量:2
- 2008年
- 采用比较分子力场方法(CoMFA)及分子对接方法对一系列雌二醇衍生物的3D-QSAR及其与受体作用方式进行研究,建立了3D-QSAR的CoMFA模型,获得了化合物的相对亲合力RBA(Relative Binding Affinity)与静电场及立体场分布之间的关系;CoMFA模型的统计学参数为:q^2=0.667,r^2=0.939,SD=0.280,F=49.033,立体场与静电场的贡献分别为56.8%和41.6%。相对亲合力小的化合物一般带有较大的取代基,其对接能量得分较低;相对亲合力大的化合物一般带有较小的取代基,其对接能量得分较高。化合物的对接能量得分和相对亲合力之间有良好的线性关系,其线性相关系数R为0.890。活性口袋周围的环境也与3D-QSAR的立体场分布相匹配。对接结果还显示这类化合物和雌激素的结合主要是通过氢键作用来实现,即3-OH与R394上的氨基以及17-OH与受体残基H524咪唑环上的氮形成的氢键。
- 钱力沈勇王亚学郑康成
- 关键词:分子对接