田宗成 作品数:47 被引量:119 H指数:8 供职机构: 西北工业大学生命学院 更多>> 发文基金: 国家自然科学基金 西北工业大学基础研究基金 国家高技术研究发展计划 更多>> 相关领域: 医药卫生 农业科学 生物学 文化科学 更多>>
应用RAPD技术对鸡柔嫩艾美耳球虫不同地理株的多态性研究 被引量:9 2003年 利用RAPD技术对鸡柔嫩艾美耳球虫(E.tenella)GZ株、HB株、JL株及HB株与JL株杂交虫株FZ1进行了研究。结果表明:E.tenella不同地理株间及同一地理株亲代与子代间均存在DNA多态性。其中不同地理株间种内变异程度较大(SI=0.6225~0.6977)。而同一地理株子代与亲代间也发生遗传变异,但变异程度不大(SI=0.9813~0.9910)。同时对本室培育的HB株与JL株的杂交虫株FZ1的基因组DNA进行RAPD分析,发现该杂交株与其亲本HB株、JL株的相似值为0.8215,0.7916,大于HB株与JL株间相似值(0.6977),小于传代虫株间的相似值(0.9813~0.9910),且其扩增条带显示出与亲本株间的相似,且又有不同,表明该杂交虫株是1株既具有两亲本株的遗传性状,又发生了变异的虫株。 张伟信 张西臣 李建华 赵权 尹继刚 杨举 田宗成关键词:RAPD技术 柔嫩艾美耳球虫 地理株 MACF1相互作用蛋白的生物信息学研究 被引量:2 2010年 微管微丝交联因子1(microtubule actin cross-linking factor 1,MACF1)是一种细胞骨架交联蛋白,可结合微管及微丝等细胞骨架组分,在协调细胞的发育及维持组织的完整性中具有重要作用。本文对与MACF1相互作用蛋白质的物化属性、亚细胞定位和分子功能进行鉴定,构建蛋白质相互作用网络。共预测出5个MACF1相互作用蛋白的亚细胞定位,网络分析结果提示MACF1可能通过竞争结合机制与SKIL、ATF7IP发生相互作用参与TGF-β信号的传递的调控,进而影响成纤维细胞表型变化;还可能与神经元细胞表面的受体分子发生作用,参与囊泡运输,促进神经元细胞粘附。 刘佳 田宗成 骞爱荣 商澎关键词:生物信息学 GENE ONTOLOGY 蛋白质相互作用网络 隐孢子虫(Cryptosporidium)病毒的鉴定及其特性 被引量:4 2001年 根据已发表的隐孢子虫病毒的序列 ,设计合成 2对引物 ,对小球隐孢子虫 ( Cryptosporidium parvum)、鼠隐孢子虫 ( C.muris)、贝氏隐孢子虫 ( C.baileyi)、火鸡隐孢子虫 ( C.meleagridis)进行 RT-PCR扩增 ,结果发现仅小球隐孢子虫 ( C.parvum)含有大小约为 1 .7× 1 0 3nt和 1 .3× 1 0 3nt2个片段的 ds RNA病毒。将其PCR产物连接到 p MD1 8-T载体上进行克隆测序 ,经与 Gen Bank比较 ,含这 2个片段的 ds RNA病毒与已发表的该虫病毒的同源性分别为 96%和 98%。电泳鉴定发现 ,该病毒对低浓度 RNA酶不敏感 ,且不能被 DNA酶降解。依赖 RNA的 RNA聚合酶活性测定结果表明 ,该病毒具有该聚合酶的活性。电镜观察未发现存在病毒样粒子。 陈建宝 张西臣 田宗成 李建华 尹继刚 杨举 于卫东关键词:隐孢子虫 病毒 RT-PCR 犬贾第虫核糖体16sRNA部分序列克隆及测定 2002年 目的 获取犬贾第虫核糖体 16sRNA基因序列。方法 从犬贾第虫包囊中 ,快速提取DNA ,并以DNA为模板 ,利用热启动PCR技术扩增出一 6 11bp的预计大小的基因片段 ,纯化回收后 ,与PMD18 T载体连接转化到DH5a大肠杆菌中 ,筛选到阳性克隆经PCR、EcoRⅠ和HindⅢ双酶切鉴定 ,并用双脱氧链末端终止法测定DNA序列 ,登陆BLAST进行同源性比较和分析。结果 获得了长度为 6 11bp的基因序列 ,并发现与犬贾第虫核糖体的同源性最高达 99%。结论 获得了犬贾第虫核糖体 16sRNA的部分基因序列 ,为研究其在核酸进化领域中的地位和PCR法快速诊断贾第虫病提供了理想的基因材料。 秦睿玲 张西臣 田宗成 李建华关键词:核糖体 克隆 骨组织中多种细胞在空间失重性骨丢失中的作用 人类在亿万年的进化及每个个体的发育过程中,已完全适应了地面1g的重力环境。空间飞行失重环境引起的骨丢失严重危害航天员的身体健康,这将直接影响中长期载人航天任务的顺利执行。由于空间骨丢失主要发生在承重骨,且这种骨丢失是难以... 商澎 骞爱荣 田宗成 孟芮关键词:骨丢失 骨细胞 文献传递 中国人源蓝氏贾第虫病毒基因组全长cDNA克隆及序列测定 被引量:4 2003年 从中国人源蓝氏贾第虫北京株 ( BEIJ88/ BTMR1/ 1)体外纯培养的电镜负染和超薄切片观察到蓝氏贾第虫病毒粒子。该病毒位于感染早期贾第虫的细胞质中 ,感染晚期的细胞核中。根据国外发表的蓝氏贾第虫病毒序列设计了 6对互相重叠的引物。用这 6对引物对从中国人源蓝氏贾第虫北京株发现的蓝氏贾第虫病毒基因组进行 RT- PCR,将产物连接到 p MD18- T载体中并转化入 DH5 α感受态菌 ,送上海生工测序 ,通过 BL AST对 Gen- Bank进行同源性搜索。结果测得我国人源蓝氏贾第虫病毒基因组全长为 6 2 73bp,与国外报道的蓝氏贾第虫病毒序列同源性为 95 % ,编码的氨基酸同源性为 90 %。 田宗成 张西臣 李建华 尹继刚 杨举关键词:蓝氏贾第虫 人源蓝氏贾第虫(Giardia lamblia)病毒部分基因的克隆及序列分析 被引量:4 2002年 目的 从我国蓝氏贾第虫 (Giardialamblia)中寻找贾第虫病毒。方法 对人源贾第鞭毛虫北京株进行了体外纯培养 ,将其总核酸电泳 ,并用DNA酶和RNA酶处理。根据已发表的蓝氏贾第虫病毒基因序列合成一对引物并进行RT PCR ,将产物回收后连接到Pmd18 T载体上进行克隆并测序 ,通过BLAST对GenBank进行同源性搜索。结果 在贾第虫总核酸电泳图谱上观察到一个分子量约 7 0kb的片段。该核酸不能被DNA酶 (10 0 μg/ml)降解。但可被RNA酶 (10 μg/ml)降解。经RT PCR扩增后得到 1条预计 85 6bp的片段 ,所得序列与蓝氏贾第虫病毒基因同源性为 98%。结论 在我国人源贾第鞭毛虫北京株中发现贾第虫病毒 。 田宗成 张西臣 李建华 尹继刚 杨举关键词:克隆 强磁重力环境对人成骨细胞发动蛋白-2表达和定位的影响 被引量:4 2008年 研究强磁重力环境对人成骨细胞MG-63中发动蛋白-2表达和分布的影响。采用大梯度超导磁体模拟空间重力环境,该超导磁体可以提供3种不同的强磁重力环境(high magnetic gravitational environment,HMGE),即0g(12T),1g(16T)和2g(12T)。将MG-63细胞分别在0g(12T)、1g(16T)、2g(12T)及对照环境(1g,地磁)中培养24h后,采用Real Time PCR、Western印迹以及激光扫描共聚焦显微术等方法检测HMGE对发动蛋白-2的表达及定位的影响。结果显示,与对照组相比,0g(12T)、1g(16T)、2g(12T)环境处理组MG-63细胞中发动蛋白-2在mRNA上的表达量分别上调6.43、15.57、1.29倍;在蛋白质水平上,0g(12T)、1g(16T)环境处理组细胞发动蛋白-2分别上调89%和7%,而2g(12T)环境处理组则下调41%;在对照组中发动蛋白-2弥散分布于细胞质中,而0g(12T)处理组发动蛋白-2则有从细胞边缘向核周集中的趋势。上述结果说明强磁重力环境影响了发动蛋白-2在MG-63细胞中的表达和定位。 狄升蒙 骞爱荣 田宗成 张维 胡丽芳 尹大川 续惠云 瓮媛媛 商澎关键词:模拟失重 成骨细胞 抗隐孢子虫子孢子表膜单链抗体基因的克隆和核苷酸序列分析 被引量:9 2003年 应用 RT- PCR技术 ,从分泌具有抗隐孢子虫子孢子表膜单克隆抗体 (Mc Ab)的杂交瘤细胞 3D6中扩增出抗体VH 和 VL 基因 ,用 linker(Gly4 Ser) 3基因 ,将 VH 和 VL 基因连接成 Sc Fv基因 ,并将其克隆至 p MD- 18T载体中。经核苷酸序列分析证实 ,VH、VL 基因和 linker基因拼接正确 ,基因全长为 72 0 bp。经计算机分析 ,VH 和 VL 基因均为新发现的基因序列 ,符合功能性重排的鼠抗体可变区基因特征。VH和 VL 基因分别属于鼠免疫球蛋白重链 (A)和轻链 κ 家族。 尹继刚 张西臣 朱平 张国利 李建华 何宏轩 田宗成 杨举关键词:隐孢子虫 子孢子 单链抗体 基因克隆 核苷酸序列 家蚕3-羟基异丁酸脱氢酶基因克隆及其在模拟失重环境中的表达模式分析 被引量:2 2008年 采用RT-PCR和RACE技术克隆了家蚕3-羟基异丁酸脱氢酶(hibadh)基因全长cDNA(GenBank登录号EU719652)并对其序列进行了分析,用RT-PCR方法检测了hibadh基因在家蚕5龄幼虫不同组织中的分布,最后用real-timeRT-PCR方法分析了整个胚胎期家蚕hibadh基因在模拟失重环境中的表达模式。克隆的hibadh基因cDNA全长1074bp,包含1个能编码完整Hibadh长度为969bp的开放阅读框。家蚕hibadh基因与伯霍尔德杆菌、果蝇、蜜蜂、热带爪蟾、小鼠、人类等6个物种hibadh基因推导的氨基酸序列同源性分别达到46%、43%、48%、44%、45%、45%。Hibadh蛋白为分泌蛋白,不存在糖基磷脂酰肌醇锚定位点,分子量和等电点分别为34.1kD和9.14。hibadh基因在家蚕5龄幼虫的头、丝腺、中肠、皮肤、血液、脂肪体、马氏管等组织中稳定表达。模拟失重环境中家蚕hibadh基因在胚胎发育的不同时期表达量不同,胚体突起发生期和反转期hibadh基因表达量分别上调2.3倍(P<0.05)和4.6倍(P<0.01),气管形成期hibadh基因表达量下调7.6倍(P<0.01),其余时间段hibadh基因表达量没有明显变化。整个胚胎发育期内,模拟失重组与对照组相比较hibadh基因总表达量下调2.6倍(P<0.05)。在模拟失重环境中,家蚕hibadh基因的表达模式与家蚕整体的响应模式有相似之处但不尽相同。基因对环境反应的灵敏度高于有机体整体对环境反应的灵敏度。该研究有利于进一步探讨hibadh基因的重力生物学机制。 田宗成 周博 骞爱荣 续惠云 狄升蒙 赵云坡 章玉萍 刘佳 黄勇平 商澎关键词:家蚕 AMPLIFICATION