简平
- 作品数：11 被引量：59H指数：4
- 供职机构：四川农业大学动物医学院动物微生态研究中心更多>>
- 发文基金：教育部留学回国人员科研启动基金四川省学术和技术带头人培养资金四川省科技厅科技支撑计划项目更多>>
- 相关领域：农业科学生物学更多>>
- Illumina MiSeq测序平台测定蒙古羊瘤胃液相和固相菌群多样性被引量：19
- 2015年
- 本研究旨在比较蒙古羊瘤胃液相和固相细菌菌群多样性。应用Illumina Miseq测序平台的16S r RNA基因扩增子技术对采集自5只蒙古羊的瘤胃液相和固相样品进行高通量测序,采用UPARSE-操作分类单元(OTU)法和非加权组平均(UPGMA)法分析试验结果。结果表明,共获得91 971条序列和15 321个OTU,平均每个样品有13 138条序列和2 189个OTU。液相与固相样品相比:门水平分类上存在显著性差异的优势菌群为拟杆菌门(Bacteroidetes)和厚壁菌门(Firmicutes)(P<0.05),拟杆菌门在液相和固相样品中的比例分别为67%和45%;属水平分类上存在显著性差异的优势菌群为普氏菌属(Prevotella)和1种未鉴定(unknown)的属(P<0.05),液相样品优势菌群为普氏菌属,所占比例为53%,而固相样品优势菌群来自1种未鉴定的属,所占比例为32%;种水平分类上存在显著性差异的是栖瘤胃普雷沃菌(Prevotella ruminicola)(P<0.05),在液相和固相样品中所占的比例分别为41%和11%。与液相样品相比,固相样品的alpha多样性较好;主成分分析(PCA)和主坐标分析(PCo A)显示来自同一动物个体的瘤胃液相和固相样品聚类在一起。结果提示,蒙古羊瘤胃液相和固相样品均具有丰富的细菌菌群;与液相样品相比,固相样品细菌的多样性更好。
- 曾燕简平倪学勤周毅祝辉曾东
- 关键词：ILLUMINA液相固相多样性
- Illumina MiSeq测序平台测定蒙古羊瘤胃液相和固相菌群多样性
- 本研究旨在比较蒙古羊瘤胃液相和固相细菌菌群多样性。应用Illumina Miseq测序平台的16S rRNA基因扩增子技术对采集自5只蒙古羊的瘤胃液相和固相样品进行高通量测序,采用UPARSE-操作分类单元(OTU)法和...
- 曾燕简平倪学勤周毅祝辉曾东
- 关键词：液相固相多样性
- 文献传递
- 植物乳杆菌BS22对黄曲霉毒素B_1的吸附效果及对肉鸡消化道菌群的影响被引量：8
- 2015年
- 为探明植物乳杆菌BS22对黄曲霉毒素的解毒作用及对肉鸡肠道菌群的影响,设饲料添加不同量的BS22试验(不饲喂)和饲料添加BS22饲喂肉鸡试验。在含有50μg黄曲霉毒素B1(AFB1)的1 kg饲料中加入106、107、108 CFU/g植物乳杆菌BS22,于加入0、15、30 d检测AFB1含量。检测结果:加入BS22后,各组饲料中的AFB1含量均显著下降;同一添加量下,随饲料贮存时间的增加,AFB1含量均有所提高。肉鸡饲喂设3个组:I组(对照组),饲喂基础日粮;II组,饲喂基础日粮+50μg/kg黄曲霉毒素B1;III组,饲喂基础日粮+50μg/kg黄曲霉毒素B1+1.0×108 CFU/g植物乳杆菌BS22。试验期为28 d。采用RCR–DGGE比较4周龄肉鸡嗉囊、腺胃、十二指肠、空肠、回肠及盲肠内容物及黏膜细菌群落的结构。对消化道内容物而言,除回肠外,消化道其他部位的内容物的细菌多样性指数、均匀度和丰富度均是III组的高于II组和对照组;聚类图显示,除腺胃和盲肠外,其他部位均是II组与对照组聚在一起,而III组单独存在。对消化道黏膜而言,除空肠和盲肠外,其他部位的黏膜的细菌多样性指数和丰富度均是II组的均高于III组和对照组,且III组和对照组的细菌多样性指数相近或相同;除回肠和盲肠外,其他部位III组和对照组聚在一起,而试验II组单独存在。综合分析,黄曲霉毒素B1对各肠段内容物菌群的作用不明显,对黏膜菌群有较大影响,尤其是对十二指肠的黏膜菌群影响更明显,植物乳杆菌BS22能调节由于黄曲霉毒素B1引起的肠道黏膜菌群失衡。
- 张艳曾东倪学勤王剑曾燕简平
- 关键词：植物乳杆菌黄曲霉毒素B1肠道菌群变性梯度凝胶电泳肉鸡
- 三株益生菌对瘤胃体外发酵的影响
- 2016年
- 通过体外产气法研究三株益生菌(植物乳酸杆菌、枯草芽孢菌、啤酒酵母)对瘤胃体外发酵的影响。试验设乳酸杆菌组、酵母菌组、芽孢杆菌组和对照组,分别在4 h、6 h、9 h、12 h、18 h、24 h、36 h、48 h测定产气量,发酵48 h后检测乳酸杆菌、芽孢菌和酵母菌数量。结果表明:植物乳酸杆菌、啤酒酵母能明显促进瘤胃体外发酵,植物乳酸杆菌发挥作用较快,而啤酒酵母较慢但增殖能力更强。
- 陈泽慧白洁霞简平王跃麟倪学勤曾东
- 关键词：益生菌体外瘤胃发酵产气
- 不同年龄段川金丝猴肠道菌群结构差异分析被引量：21
- 2015年
- 本试验旨在分析幼年、成年、老年川金丝猴肠道菌群结构以及随年龄变化的趋势。将提取的幼年、成年、老年川金丝猴粪样总DNA进行聚合酶链反应-变性梯度凝胶电泳(PCRDGGE),对结果进行UPGMA聚类分析、主成分分析、生物多样性比较。用荧光定量PCR技术检测肠道菌群中真细菌、乳酸杆菌属(Lactobacillus spp.)、肠杆菌科(Enterobacteriaceae)、双歧杆菌属(Bifidobacterium spp.)的数量。结果显示:无论是UPGMA聚类分析,还是主成分分析以及生物多样性比较均表明,不同年龄段川金丝猴肠道菌群多样性存在明显差异;指纹图谱中成年与幼年川金丝猴的优势条带较多,老年川金丝猴的优势条带则较少。各年龄段川金丝猴肠道菌群中真细菌的数量都为同一数量级(1011);幼年川金丝猴肠道菌群中Enterobacteriaceae的数量显著少于成年和老年川金丝猴(P<0.05);成年川金丝猴肠道菌群中Lactobacillus spp.的数量极显著多于幼年和老年川金丝猴(P<0.01);老年川金丝猴肠道菌群中Bifidobacterium spp.的数量极显著少于成年和幼年(P<0.01)。由此得出,川金丝猴肠道菌群随年龄增长,多样性呈幼年到成年增加、成年到老年降低的趋势,老年时期优势菌群显著减少;此外,川金丝猴肠道各菌群的数量在不同年龄段有较大差异。
- 简平王强王剑牛李丽祝辉曾燕倪学勤曾东
- 关键词：川金丝猴年龄肠道菌群荧光定量PCRPCR-DGGE
- 荧光定量PCR检测圈养羚牛粪中三种纤维分解菌被引量：1
- 2013年
- 采用荧光定量PCR技术检测圈养羚牛粪样中3种纤维分解菌:白色瘤胃球菌、黄色瘤胃球菌、产琥珀酸丝状杆菌的数量。提取羚牛粪便中微生物总DNA,分别以3种纤维分解菌特异性引物进行模板片段扩增,10倍系列稀释,检测Ct值,建立标准曲线。提取各待测样品DNA,进行荧光定量PCR反应测定Ct值,并与标准曲线比较得出定量结果。结果显示,所构建的各标准曲线均具有很高的相关性(R2>0.99),说明成功构建了标准曲线。1号牛粪样中白色瘤胃球菌、黄色瘤胃球菌、产琥珀酸丝状杆菌的数量分别为3.09×107、2.24×106、5.13×107拷贝数/g,2号牛粪样中三种菌数量分别为4.57×106、2.24×106、2.88×107拷贝数/g,3号牛粪样中三种菌数量分别为5.12×106、1.86×106、8.91×107拷贝数/g。结果表明,3头羚牛之间的纤维分解菌的数量存在差异,但均以产琥珀酸丝状杆菌的数量最高,为主要的纤维分解菌。
- 王强牛李丽严慧娟简平曾东祝辉倪学勤
- 关键词：羚牛纤维分解菌荧光定量PCR
- 16S rRNA高通量测序分析川金丝猴肠道菌群研究
- 川金丝猴(Rhinopithecusroxellana)是中国特有的珍稀动物,具有极高的生态地位和研究价值,被誉为中国的第二国宝。人工饲养条件下,由于生存环境和食物结构的改变,川金丝猴的生长发育受到一定影响,免疫力下降、...
- 祝辉倪学勤简平
- 关键词：金丝猴肠道菌群高通量测序
- 文献传递
- 植物乳杆菌BS22对饲喂含黄曲霉毒素B1日粮肉鸡消化道菌群的影响
- 本试验旨在分析植物乳杆菌BS22对饲喂含黄曲霉毒素B1日粮肉鸡消化道内容物和黏膜菌群的影响.试验分为对照组Ⅰ(基础日粮)；试验组Ⅱ(基础日粮+50μg/kg黄曲霉毒素B1)；试验组Ⅲ(基础日粮+50μg/kg黄曲霉毒素B...
- 张艳曾东倪学勤王剑曾燕简平
- 关键词：植物乳杆菌黄曲霉毒素PCR-DGGE克隆测序肉鸡
- 健康和腹泻川金丝猴粪样菌群比较分析被引量：12
- 2015年
- 通过对比健康与腹泻成年川金丝猴粪便菌群,初步探讨腹泻对川金丝猴粪便细菌区系的影响。采集成年川金丝猴稀软粪样和正常粪样各7份,利用变形梯度凝胶电泳(DGGE)和实时荧光定量(Real-time PCR)技术分别定性和定量检测粪样菌群变化。结果表明,健康与腹泻粪样菌群DGGE指纹图谱形成2个聚类,相似性为0.78,细菌多样性指数差异不明显。健康成年川金丝猴粪样菌群以梭菌属(包括柔嫩梭菌、梭菌clusterⅪVa、梭菌clusterⅣ)、拟杆菌-普氏菌属为主要优势菌群;肠道微生物定植抗力指标B/E值为0.97;腹泻粪样中双歧杆菌数量(P<0.01)、乳酸杆菌数量(P<0.05)显著低于正常粪样,而梭菌clusterⅠ和肠杆菌显著(P<0.05)高于正常粪样,其他菌群差异不显著,B/E值(P<0.01)极显著降低。表明腹泻导致川金丝猴粪样菌群结构失调。
- 王剑王强曾东牛李丽简平张艳倪学勤
- 关键词：川金丝猴肠道菌群腹泻DGGEREAL-TIMEPCR
- 采用PCR-DGGE技术分析蒙古羊瘤胃液相和固相细菌的多样性被引量：2
- 2015年
- 为探讨蒙古羊瘤胃液相和固相细菌的多样性,采用变性梯度凝胶电泳技术结合聚合酶链式反应(PCRDGGE)及条带的克隆测序,比较瘤胃液相和固相细菌的差异,同时采用聚类分析和主成分分析(PCA)方法分析瘤胃液相和固相细菌的多样性。结果表明:1)瘤胃液相和固相样品均含有物种丰富的细菌菌群,但液相比固相具有更高的平均条带数,分别为30条和24条;2)瘤胃液相样品比固相样品具有更高的多样性指数、均匀度和丰富度,其数值分别为3.45、0.90和30.20及3.23、0.84和24.62;3)同一动物个体瘤胃液相样品和固相样品聚类在一起,相似性系数均高达0.81;4)共性条带测序结果表明瘤胃的优势细菌主要是Uncultured rumen bacterium和Uncultured Bacteroidetes bacterium,而特异性条带主要是Alcaligenes sp.。不同动物个体的瘤胃液相和固相均含有丰富的细菌菌群,且物种丰富度均较高;同一动物个体的液相与固相相比具有更高的细菌多样性。
- 曾燕倪学勤曾东简平王剑唐雨蕊
- 关键词：蒙古羊PCR-DGGE液相固相聚类分析
